Lachnoanaerobaculum gingivalis: QJR73_05805
Help
Entry
QJR73_05805 CDS
T09491
Name
(GenBank) RICIN domain-containing protein
Organism
lgg
Lachnoanaerobaculum gingivalis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RicinB_lectin_2
Ricin_B_lectin
Choline_bind_3
Flg_new
Choline_bind_1
Inhibitor_I66
Flg_new_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WHE88513
LinkDB
All DBs
Position
1242950..1245778
Genome browser
AA seq
942 aa
AA seq
DB search
MDRRIRLKRYISLCCSFFLVLFNLNSYIVASANALDNTNVNNEIYVATSSNARIADEFYF
DSIFEGYRIILQADKNVVPPDTVVKIKKVEKLNGESINKIVNSNVDYDEGEVLDVVAFDI
SLWLNGIEIQPENGNVNVSIEPLLSNNKSKENIAEVFHITEDGDISKIANDSLDDGKIDF
VAEHFSVYGFAMLGAAGGHTQADAEAWIDSMHGTAIDYDGAYGVQCVDLISSYYRYLGYN
IFNYVAGNGYAYTFNYSPLPPGWQRFGNNVDPRPGDIVVFGAHQYGMYGTGHIGIVRAVD
STSYKYLDYNGTGNYDAGTWRWKPLRNFTSIIRPDFVIPPVIPDHIPGPVGGSDDDIADG
DYTIRSDVAEGRSLGWEGDGNTNGQNVCLKDYFKNGDYVWTLERQSDDSFIVKTKQGGKL
LDILGGPYSYGNEKNAIMWDYVQGNDNQRWYIVRNGSGYRFIAKHSGYSLDVRNGDTTDG
NNIYQYYPNESTAQRFYLEKHDFPNVEETSADDLKDNATYIIRSKLDVSKVITTESDSSG
ANGKNIYLYDYNSPNLPSTQIWKLEKQSEGTFLIKNTYNNKYMDVVWYSLSNRANIYSWE
RHYNPSESWYIVKNNDTEGTYRIVNKNSGKVVDITGGQTANGTNVQQYIWHEHPAQMFFF
ERVPAPVEYTVTFKENNGNIISTKIVEEGESAVAPQAPSKEGYVFVGWEGEYSNVHANIF
VTAKYNKLPDSNSGSNNNGINIGNNGSNAGNTGSNIVNSNSQNNNTIGSTSGNGSHSGGG
SGSRSGGGGGGGSHSGGGGGGGSRSGGGGGGGSRSGNAGTKTLQNSSSVSNGSILWQRDN
KGWWIKNSDGSYPRNEWKLVNNSWYFFDSQGYMFTGWLNSNGSWYFMNTDEGSDNGKMVT
GWRVVSGKWYYLSTATDGSGGKMLLNTTIDGYRLGADGVWVK
NT seq
2829 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatagaagaatacgattaaaaagatatatttcactttgttgttccttttttctagta
ttgtttaatcttaattcgtatattgttgcaagtgcgaatgcattagacaatacaaatgtt
aataatgaaatttatgtggcaacatcaagtaatgcaagaatagcagatgaattttatttt
gattcaatatttgaaggatacagaataatattacaagcagataaaaatgtagtaccgccg
gatactgttgtaaaaattaaaaaggtagagaagctaaatggagagtctattaataagata
gtaaactcaaatgtggattatgatgagggagaggtacttgatgtagttgcatttgatatt
tcactttggctaaacggcattgaaatacagcctgaaaatggcaatgtaaatgtaagcata
gaacctttattaagtaataataagagtaaagaaaatatagcagaagtattccatataact
gaagatggtgatatttcaaaaattgcaaatgatagtttagatgacggaaaaatagacttt
gttgcagaacacttttcagtatatggttttgcaatgcttggtgctgcaggtgggcataca
caggcagatgcagaagcttggattgatagcatgcatggaacagcaatagactatgatgga
gcctatggtgtacaatgtgttgatttaatctcatcatattacagatatctcggatataat
atatttaattatgttgccggtaatggatatgcatatacgtttaattattcaccattaccg
ccgggatggcaaagatttgggaataatgttgatccaagacccggagatatagttgtattt
ggggctcatcaatatggaatgtacggaaccggccacataggtatagtgcgtgctgtagat
tcaacatcgtataaataccttgattataacggtacaggaaattatgatgccggtacgtgg
agatggaaaccactcagaaattttacaagtattattcgtccggattttgtaatacctcct
gtaatacctgaccatataccgggacctgtaggtggaagtgatgatgatatagctgacgga
gactataccatacgttcagatgtggcagaaggtagaagcttaggttgggaaggtgacgga
aatacaaacggacagaatgtatgcttaaaagattattttaaaaatggtgactatgtgtgg
acacttgaacgtcaaagtgatgacagttttatcgtaaaaacaaagcaaggtggaaaactc
cttgatatattaggtggaccatattcatatggaaatgaaaagaatgccattatgtgggac
tatgtacagggaaatgacaaccaaagatggtacatagtaagaaacggtagcggatataga
tttattgctaaacattcaggatattcattggatgtaagaaacggagatactactgacggc
aataatatataccaatactatcctaatgaatctacagcacaaagattctatcttgaaaag
catgattttccaaatgtagaagaaacaagtgcagatgatttaaaagataatgctacttac
ataattcgatcaaaactggatgtatcaaaagttatcactaccgagtctgattcaagtggt
gcaaacggtaaaaatatatacctctatgattataattcacctaatttaccttcaacacag
atttggaagcttgagaagcagtcagaaggaacatttcttataaagaatacatacaataat
aaatatatggatgtagtatggtattccttgagcaacagagcaaatatatatagctgggaa
aggcattataatccaagtgagagttggtatattgtgaaaaacaatgatactgagggaaca
tatagaattgtaaataagaattcaggtaaagttgtggatataaccggaggtcaaacagca
aacggtactaatgtgcaacaatatatttggcatgaacatccggcacaaatgttcttcttt
gaaagagttcctgcacctgtagaatatactgtaacatttaaggagaataatggaaatata
atatctacgaagattgtagaagaaggagagtcagcggttgcaccacaggctccttccaaa
gaaggttatgtatttgtaggttgggaaggtgaatatagtaatgttcacgcaaatattttt
gtaactgcaaagtataataaattgcctgacagtaacagtggaagtaataacaatggaata
aatataggaaataacggaagcaatgccggaaataccggttctaatattgtaaacagtaat
tcacaaaataataatactatcggttcaacatccggtaacggttcacactccggcggtggc
agcggttcacgttccggtggaggcggtggcggtggctcacactccggcggaggaggcggc
ggcggttcacgctccggtggaggcggtggaggcggttcacgctccggtaatgccggtacc
aagacattacagaactcatcttcagtatccaatggaagtatattatggcaaagagacaac
aaaggatggtggataaagaacagtgacggctcatatccaagaaatgaatggaagcttgtt
aacaacagttggtatttctttgattcacaaggatatatgttcacaggttggttaaattca
aatggaagttggtacttcatgaatacagacgaaggtagtgacaatggaaagatggtcacc
ggttggagagtagtatcaggaaaatggtattatctaagcaccgctacagacggtagtgga
ggaaaaatgcttttgaatacaacaatagacggctatagattaggggctgacggtgtatgg
gtaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system