Lottia gigantea (owl limpet): LOTGIDRAFT_113757
Help
Entry
LOTGIDRAFT_113757 CDS
T03273
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K06671
cohesin complex subunit SA-1/2
Organism
lgi
Lottia gigantea (owl limpet)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lgi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
lgi03036
]
LOTGIDRAFT_113757
Chromosome and associated proteins [BR:
lgi03036
]
Eukaryotic type
Sister chromatid cohesion proteins
Cohesin complex
LOTGIDRAFT_113757
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
HEAT_SCC3-SA
STAG
SCD
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
20231006
NCBI-ProteinID:
XP_009050389
JGI:
113757
UniProt:
V4ANK7
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1042 aa
AA seq
DB search
EGDGSLFDIVRLGRASLQAVVDDWIETYKANRDTALLELIQFFIQCSGCKGKITPYMYGN
MEHAEIIRKMTEEFDEESGDYPFISSGPQWKKFKTNFCEFVQVLVRQCQYSIIYDQYMMD
NIISLLTGLTDSQVRAFRHTSTMAAMKLMTALVDVALNLSINLDNTQRQYEAERAKQQNK
RASERLELLMTKRQELEENQAEIRNMLTYIFKGVFVHRYRDTQPEIRKICMGEIGVWMKK
YPNMFLDDSYLKYVGWTMYDKGGDVRLCCLKTLSPLYYSNDLSPKLELFTNRFKDRIVEM
TLDKEYEVAVAAVKLACSILKFSDNVLADKDCENVYELVYSSHRQVAQAAGDFLNTKLFS
RDEEENKHLKSLKGKKLSPNTPLIRDLVQFFIESELHEHGAYLVDSLWEINEMMKDWECM
TDLLLEDPCKGEEPLDDRQETSLIEIMVCCVKQAATGESPVGRGPTNKRLTAKEQKQVSE
DKTKLTEHFIVTLPQLLLKYLMDAEKVANLLQIPQYFELEIYTSSRQEKHLDSLLRYLHE
IVEKHTDTEVLEAASKCFEALCNEEYAIAGKCDVARKTLIDSLVVKYREAMQDFFTEGDE
PDDDEAFALLASLKRIHAFYSCHDLGNWDLWDDLFHIIRCANENSAIPEEIITRAVASCS
SALLWYFNKIDDKNPDKDKLRYIKKRLNNLMRHCSNLLLHQLDKVVEEAYITICDLLIVF
SKNLCDTNPELKTLVFEPDKNLQNELSNFLSEKVFVEDDDGNLYVILKTEDVDENVKIEE
LHKRRNFLASFCKLVVFNVINIRTGANMFKHYMKFYNDYGDIIKATLSKSREINKVMTAK
TLALSLTQLYKELQNEQGVIERSSDVFQSIKELSRRFALSFGLDQVKNREAVAAMHKEGI
MFSVQANERDPEGVPPNLPFLEVLCEFTNKLMKQDKKVVLAYLDNHIPGGLTGARGEEWQ
PYYTYRNSLTQGEGEINPITLKQATQKRFGKRKADSKFTLFVKVYSCLVSAQFHFPIELF
TEKNILFLQWNQILPKCFPFMF
NT seq
3129 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gaaggggatggaagtttgtttgatattgtgagactaggtcgtgcatcattacaggctgta
gtagatgattggatagagacctataaagctaatagagatacagccctattagaattgatt
cagttttttatacaatgttctggttgtaaaggaaagattacaccttatatgtatggtaac
atggaacatgcggaaattatcagaaaaatgactgaagaatttgatgaagaaagtggtgat
tatccatttatcagtagtggaccacagtggaagaaatttaaaactaatttctgtgaattt
gtacaagtattggtgcgacagtgtcaatatagtatcatttatgatcaatatatgatggac
aatattatctcattattaactggtctcactgattcacaagtacgagcttttagacacact
agtactatggctgctatgaagttaatgacagctctagtagatgtagctttaaatctgagt
attaacttagataatacacagagacagtatgaagctgaaagagctaaacaacaaaataaa
cgagctagtgaaagattagaattattgatgactaaaagacaagagctggaagagaatcaa
gctgaaattagaaacatgttgacctatatatttaaaggtgtatttgtccatagatacaga
gatacacagccagagatccgtaagatatgtatgggagaaattggtgtttggatgaaaaaa
taccctaatatgtttttagatgacagttatcttaaatatgttggttggaccatgtatgat
aaaggtggtgatgtaagattatgttgtttaaaaactctctccccattatactattctaat
gacttatcacctaaattagaattatttaccaacagattcaaggatagaatagttgagatg
acattagataaagaatatgaagtggcagtagctgctgttaaactagcctgtagtatcttg
aagttcagtgataatgtattggctgataaagattgtgaaaatgtatatgaattggtctat
tcatcacatcgtcaagtagctcaagctgctggtgattttctcaataccaagttatttagt
cgagatgaagaggaaaataaacatctcaaatcattgaaaggaaagaaattaagtcctaat
acacctttaattagagatctagttcaattctttattgaaagtgagttacatgaacatggt
gcctatttagtggacagtttgtgggaaatcaatgaaatgatgaaggattgggaatgtatg
acagatttattattagaagatccttgtaaaggagaagagccactagatgatcgtcaagaa
accagtttaatagaaataatggtatgttgtgttaaacaggctgctactggtgaatcacct
gttggtagaggtcctactaataaacgattaacagctaaagaacagaaacaagtatcagaa
gataaaacaaaattaacagaacattttattgttacattaccacaattacttctcaagtat
ttgatggatgcagagaaagtagctaacttattacaaattccacaatattttgaattagaa
atttatacatctagtcgtcaagaaaagcatttagattcattgttacgttatttacatgaa
atagttgagaaacatacagatactgaggtgttagaagcagcatctaagtgttttgaagca
ttatgtaatgaagaatatgctatagctggtaaatgtgatgtagctagaaagacactaata
gatagtttagttgttaaatatagagaggctatgcaagatttctttactgaaggtgatgag
ccagatgatgatgaagcctttgctctattggccagtttaaaacgtatccatgcattttac
tcgtgtcatgatttaggaaactgggatctatgggatgatttgtttcatattataagatgt
gctaatgagaattcagctattccagaagagattataacaagagctgtagcatcatgttct
agtgctttattatggtattttaataaaatagatgataaaaaccctgataaggataaatta
agatatatcaagaaaagattaaataatttaatgagacattgtagtaatcttctcttacat
caattagataaagttgttgaagaggcctatattactatttgtgatctgttaattgtgttc
agtaaaaatctatgtgataccaatcctgaattaaaaacattagtatttgaaccagataag
aacctacagaatgaactaagtaattttctatcagagaaagtttttgttgaagatgatgat
ggtaatctttatgttattttaaaaacagaggatgtagatgaaaatgttaagatagaagaa
ttacataaaagaaggaattttttggctagtttctgtaaattagtggtgtttaatgttatc
aatatccgaactggtgctaatatgtttaaacattatatgaagttctacaatgattatggt
gatattattaaagctacactgagtaaatcaagagaaatcaacaaagtgatgacagctaaa
acattagctttaagtcttacacagttatataaagagttacagaatgaacaaggtgttata
gaaaggtcatctgatgtcttccaatcaatcaaggaattatcaagaagatttgccttgtca
tttggtttggatcaggtgaagaatagagaggctgtggcagccatgcacaaagaaggtatt
atgttcagtgtacaagctaatgaaagagatcctgaaggtgtaccacccaatttacctttc
ttagaagtactgtgtgaatttaccaataaactgatgaaacaagacaagaaagttgtgctg
gcctatttagataaccatataccaggtggtttaacaggtgctagaggtgaagaatggcag
ccctattatacctatagaaatagtttaacacaaggagagggagaaatcaatcctattaca
ttaaaacaagctacacagaaacgatttgggaagaggaaggctgatagtaagtttacttta
tttgtcaaggtttatagttgtcttgtaagtgctcaatttcactttcctatagaacttttt
acagagaaaaacatattgttccttcaatggaatcaaattctcccaaaatgtttccccttc
atgttttag
DBGET
integrated database retrieval system