Lottia gigantea (owl limpet): LOTGIDRAFT_125515
Help
Entry
LOTGIDRAFT_125515 CDS
T03273
Name
(RefSeq) hypothetical protein
Organism
lgi
Lottia gigantea (owl limpet)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
FancD2
FANCI_S2
T3SS_SCTL
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
20232506
NCBI-ProteinID:
XP_009060534
JGI:
125515
UniProt:
V3ZCS3
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1428 aa
AA seq
DB search
MLLTKANLFWIGILILKTHVQQIHSILQISINLRHFNSVLFNLVSSTKKRKVRDNNYNEK
SVFTELVSTCGIILKDGSANNEISIDQAMFQKNLVVAMKAHETYPETVNELLEGLQNYMS
EDKRFHKVLMPTITSTDCDNARASIQDSVVRILMGVDMLQNDVMNMLLEKLPEFIGDAEY
NGEKLFVPHLLLSQFRWLDRIIDCKKLSKKLIEMISITSLDIQREIITCLPEIIEDSEHA
TVANTLRDVLLEGNQLTVAVLDALSNLNLTSELLLEVRGSVIQTLKSVELEDLPVVIKFL
LQTVTNQDSLEVRQFIGNISDLNIDILYISFYLFQASLQYMSRTSEKDCETLTLDAIKSG
IHFQRTVAEAFIKAIDNVKAAGEQKVLDLFVLLILYNTSRKKTVESLFRNKIRSGCFSEN
FLQSSFSSYSQILRDYFTSILSLCEVLLRSPEPVVSYFACSLYKHCFLYFDSFCKQEIVS
SLVTHIGSGLDSEMDSSLHILVDLVENNLKAMVPFAIFVKGVLDYLDNLSVCQIRQLYSM
LSRLAFYDTDEGGMIQDDLHIIIRKQLSSSNPKYKRMGVIGAIMIVKSMAVSKNDTEELE
DDIFRQVISLLQLVRNSCSNNPQSSALFMDELSSVINKGRLATNIENWISENVTSDFQDD
FVVDIEEGKDWLVPLELSFGLNDEEESAIAIDLLPLIIHTSDRKKSTLPKQPRSPQPLCL
SPHFRLVQICEYKQQDGNLEGIDALIGCPIYTVKRDVIDKISSLSQKEKEIICTTLFYEI
NWFIEMVNGFATQTDAEMKGKVICRLINITDSQRLLEKCLAETTNYIPPLANFDLEDKPQ
NTSTASTFKESKKSTKKQGKKLKGDKVNLDDSDETSRGSTQSEKSQVKDNKENKNKAVVS
LSSYTKYFRELDIHVFTMLTTSLITKSALDSQQNTKLTEELKLQPAQLNFLLEDLVQKLS
HSLLSTTNKRRTFLKTKVDKNIGYSHLDQLSSNEIIANIISLLPSLCDHLEKISSYFQKE
VEDNDGVIDSINMSTDESKYMMCIFKHLLQCFLSVFSWNGFLMHCNNDILKQSLQVLISR
IKTGDSTRTQSTFQELIRGSFKYLQNFSNTILNLESGVLLIKVLIVIAKKYENTELQQKI
ATLACDLLKREWRTVDGEREKGQKHNELLQIVIRTYIVHSEEQLSAIETLTTKGIPELID
ADKNGSSNTFPSLTRNSFAVYFRVIFNQLIDSIKSISPYKQTDTKQSKMDKLIQWNMAVR
IHHVLVNLLKVFDGRAILGTVLKYGRQFVEVFYRQAMPLLDSMFRFHREDVQSILKTFQL
STRTLHHLCGHTKIIKDISLTNQVPLLKKALEAFVYRVMLMLTVNKCPEAFWMGNLKNRD
LQGCEILSQVSEHSSASDGGGQGKGSDEEADDVPDEDDDESEVVSIPF
NT seq
4287 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgttaacaaaggcaaacttgttctggataggtattttgattcttaaaactcatgtc
caacaaattcattcaatactacaaataagcattaatctaagacattttaattctgttttg
ttcaatttagtttcgagtacaaagaagagaaaggtacgagataacaactacaatgaaaaa
tcagtatttactgagcttgttagtacttgtggtatcatactgaaagatggatcagccaat
aatgaaataagtattgatcaggccatgtttcaaaagaatctagttgttgcaatgaaagca
catgaaacatatccagaaactgtaaatgaattgttagaaggtttacagaattatatgtca
gaagataagaggtttcataaggtattgatgccaactataacaagtactgattgtgataat
gctcgagcttctatacaagatagcgtagttcgtatattgatgggtgtggacatgctacag
aatgatgttatgaatatgctattagagaaattaccagaattcattggtgatgctgagtac
aatggtgagaaattatttgtacctcatctattactgagccagtttcgatggttagatcgt
attatagattgtaagaaattgagtaagaagttgatagaaatgataagtataacatcatta
gatatacagagagaaataataacatgtttaccagaaataatagaagattcagaacatgca
acagtagctaacaccttgagagatgtattattagaagggaatcagttaacagtagctgta
ttagatgcattatcaaatttaaatctgacatcagagttacttcttgaagtaagaggatca
gttatacaaacattaaaatctgtagaattagaagatttaccagttgttattaagtttctc
ttacaaactgtaactaatcaagattccttagaggtgaggcaatttattggaaatatttct
gatctaaatattgatatattatatatctctttttatcttttccaggcttcattacaatat
atgtcaagaaccagtgaaaaagattgtgaaactcttacattagatgccatcaaatcagga
attcattttcaaaggactgtagctgaagcatttataaaggctatagacaatgttaaagca
gcaggagaacagaaagtattagatttatttgtattattaatattatataataccagtaga
aagaaaacagtagaaagtttatttagaaataaaattagatctggatgtttctctgagaat
ttcttacagtcttcattttcatcttattctcaaattttgcgagattattttaccagtata
ctatcattatgtgaagtattattaagatcaccagaaccagttgttagttactttgcatgt
tcactgtataaacattgttttctctattttgattccttctgtaaacaggaaattgttagt
agtttggtaacacatattggaagtggtttagatagtgaaatggattcctcactacatata
ttggttgatttagtagaaaataatctgaaagctatggtaccatttgctatatttgtcaag
ggtgttttagattatttagataatctatcagtatgtcagataagacagttatattctatg
ttaagtcgtttagctttttatgatactgatgaaggtggcatgatacaggatgatttacat
attataataagaaaacagctatctagtagcaatccaaagtataaacgtatgggtgttatt
ggtgctattatgattgttaaaagtatggctgtatcaaaaaatgatacggaagaattagaa
gatgatatatttagacaagttataagtttattacagctagtaagaaatagttgttctaat
aatcctcaatcatcagctttatttatggatgaattgtcttctgttattaataaaggtcga
ctagcaaccaatatagagaattggatatcagaaaatgttactagtgactttcaagatgat
tttgttgttgatattgaagaaggaaaagattggttagtaccgctggagttaagttttggt
ttgaatgatgaagaagagagtgctatagccattgatttattaccattaataatacatact
agtgaccgtaaaaaatctacactaccaaaacaacctagatcaccacaacctttatgtcta
tcaccacattttcgtttagttcagatatgtgaatataaacagcaagatggtaatttagaa
ggaatagatgccttaataggttgtccaatatatactgtgaagagagatgtcatagataaa
atctcctcattatcacagaaagaaaaggaaattatttgtactacattattttatgaaatt
aattggtttattgagatggtgaatggtttcgcaactcaaactgatgctgaaatgaaagga
aaagtgatctgtagattgataaatattactgatagtcaaagattattagagaaatgttta
gctgaaacaacaaactatattccacctttggctaattttgatttggaagataaaccacag
aatacctcaacagcatcaacatttaaggagagtaaaaaatctactaaaaaacagggcaag
aagttaaaaggtgataaagttaatctagatgattcagatgaaacaagtagaggctcaact
caaagtgaaaaatctcaggtaaaagataacaaagaaaacaagaataaagcagttgtatca
ttgtcatcttacacaaaatattttagagaattagatatccatgtttttaccatgttaaca
actagtttaattactaaatcagctctagattctcaacaaaatacaaagttaacagaagag
ttaaaattacaaccagcacagttgaattttttattagaagatttagtacagaaattatca
cactcattattatctacaaccaataaacgacgtacatttctcaaaactaaagttgataaa
aatattggatattctcacctagatcaactatcatctaatgaaataatagcaaatataata
tcattattaccatcattatgtgatcatttggagaagattagttcatatttccagaaagag
gtagaagacaatgatggagtgatagatagtattaatatgtcaacagatgaatcaaaatac
atgatgtgtatatttaaacatttattacaatgttttttatctgtatttagttggaatgga
tttttaatgcattgtaataatgatatattaaaacagagtttacaagttttaattagtaga
ataaagacgggtgattcgactcgaactcagtctacatttcaagaattgattaggggaagc
ttcaagtatctacagaatttctcaaatactatattaaatttagaaagcggtgttttatta
attaaagtattaatagtcattgctaagaaatatgaaaatacagagttacaacaaaaaata
gctactctagcctgtgatttattaaaaagagaatggagaacagtggatggggaaagagag
aaaggacagaaacataatgaattattacaaatagttatcagaacatacatagtacattca
gaggagcagttatcagccatagaaacattaacaactaaaggtataccagagttaatagat
gcagataaaaatggttcttctaatacttttccatcattaacaaggaattcgtttgcagta
tattttcgtgtaatttttaatcagttaatagatagtatcaagtctattagtccttataaa
caaacagatactaaacagagtaaaatggataaattgatacagtggaatatggctgttaga
atacatcatgttttagtcaatttattaaaagtatttgatggtcgtgctattctaggtaca
gtattgaaatatggacgccagtttgttgaagttttctatagacaagctatgccattatta
gatagtatgtttagattccatagagaagatgttcaaagtatattaaagacatttcaactt
agtacaagaacattacatcatttatgtgggcatacaaagatcattaaagatatttcttta
accaatcaagtaccattgttaaagaaagccttagaagcctttgtatacagagttatgtta
atgttaacagtcaataaatgtcctgaagctttctggatgggaaatttgaaaaatcgagat
ttacaaggatgtgaaatattatcacaagtatcagaacatagttcagccagtgatggtggt
ggtcaagggaagggaagtgatgaagaagcagatgatgttcctgatgaagatgatgatgaa
agtgaagtggtcagtattcctttctga
DBGET
integrated database retrieval system
