Lottia gigantea (owl limpet): LOTGIDRAFT_192968
Help
Entry
LOTGIDRAFT_192968 CDS
T03273
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K05749
cytoplasmic FMR1 interacting protein
Organism
lgi
Lottia gigantea (owl limpet)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lgi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
lgi03019
]
LOTGIDRAFT_192968
Messenger RNA biogenesis [BR:
lgi03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
eIF4F and regulatory proteins
LOTGIDRAFT_192968
Factors involved in mRNA localization
Other mRNA localization factors
LOTGIDRAFT_192968
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
FragX_IP
CYRIA-B_Rac1-bd
BP28CT
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
20245007
NCBI-ProteinID:
XP_009059833
JGI:
192968
UniProt:
V3ZYL0
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1262 aa
AA seq
DB search
MAAGEKITLTDALQNVDVLDELPLPDRQPCIEALNKSIHYQANFDTNFEDRNAYVFGVAK
YIEQATIHADMNKLLEEGKEYAVMLFTWRCCSRALPQVKSNDQPNRTQIYQKIVEVLEPQ
VSKLVRFMHFQNRAISRFSEEVKRLCHKEKRNDFVSEAYLLTLGKFMNMFAELDELKNMK
SSVRNDYAAYRRAAQFLRVLSDPVALQESQTLSINMATQNKIRDTLKEAMLQIPGYEELL
ADIVCLCLSMYETRMYLEPEEKYMLVKVMAFGLNLMDSTTSNIYKMDAKKRINISKIDKI
LKTLEIVPLYGDMQIAPYHYIKCSPNFDGSKWPLCERNEPSPQSNLLANLEAIREDHMEY
ISQLSRHSNEAITTMRDQPRSDIENKELFDLALKGLQLLSAWTQQVMELYSWKLLNPTDP
HQNPDCPKDAEEYERATRYNYSSDEKFALIEVIAMIKGLQLLMARMESVFMDAIRRHIYQ
ELQDFVQLFLRDPLRKAIKKKSDVIKGIIMAVRDTCVDWLRGVEPHDDPALRGKKDPDDG
FFIKVPRRNVGPSSTQLYMVRTMLESLTAEKSGGKKTLRKDIDFSHLQTIDNFHKTSFFW
NYLINFNETLFNCCDLSQLWYREFYLELTMGKRIQFPIEMSMPWVLTDHILETKEPSMME
YILYPLDLYNDSAHYALTKFCQQFLYDEVEAEVNLCFDQFVYKLSDQVFAYYKHLSGSIM
LDKRFRSECASHGAKINYPTANRYQTLLKQRHVSILGRSIDLNRLIGQRINAALQKALDV
AIARFEAGDITGIVELEGLLECNRLTHKLLSEYLTLNDYDAMLREANHNVSAPYGRITLH
VFWELNYDFLPNYCYNAATNRFVKHDKLTFVTDAKREKAPNPSPHYIWGTKTLTTAYSTI
YSLYTRFVGTPHFHSIVRLLGYQGIAVVIEELLKTIEGFLKGTTLEYVKMLMKVLPPTCK
LLRFDYGSPGVLAYYNANLVDLIQYPDLRMEVFQSFREIGNAILFTVLLEQAMTQEEVCD
LKHAAPFQNIIPKPHIPIKEGDNRKDKEAELKLFMKQLEKKYAALQVVSVIKKLGNQTQA
DIAAEGDLLTRERLCCGLSMFEIVLTRMKSFLTDALWHGEPPTNGVINIDKCTEFHRLWS
AIQFVFCMPMRENEYTIEELFGEGLNWAGCSIIMLLGQQRRFEALDFCYHILKVNRVDMK
DENVKGIQLKKMVDRIRKFQILNNQIFSVLNKYMKTTDAESMPVEHVRCFPPPIHQSLAT
TI
NT seq
3789 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgccggggagaagataacgttgacagatgcattacagaatgtagatgtgctggat
gaattgccactacctgatcgacagccctgtatcgaggccctcaataaatcaatccactac
caagctaattttgatactaattttgaagatcgtaatgcctatgtttttggtgtggctaag
tatattgaacaagctactattcatgctgatatgaataagttgctagaggaaggtaaggag
tatgctgtaatgttatttacctggagatgttgctcccgagctctaccacaagttaaaagt
aacgatcaacccaacagaactcagatttaccagaaaatagtagaagttttggaaccacaa
gtcagtaagcttgtcagattcatgcactttcagaatcgagctatcagtcgtttttcagaa
gaagttaaaagactatgtcataaagaaaagaggaatgattttgtatcagaggcgtattta
ttaactctaggaaagtttatgaatatgtttgctgaattggatgagttaaagaacatgaag
tcaagtgtcaggaatgattatgctgcttatagacgagctgctcagttcctgcgagtatta
tcagacccagtggcactacaagaatctcagacattgtctatcaacatggctacacagaat
aagatacgagacacattaaaagaagcgatgttacagatacctggttatgaagaattacta
gctgatattgtgtgtttatgtctcagtatgtatgagactagaatgtatcttgaacctgaa
gagaagtatatgttagtcaaggtgatggcatttggtttgaacctaatggactctacaact
agtaatatatataaaatggatgccaagaaaagaatcaacattagtaaaattgataaaata
ttgaagacattagaaatagtaccactatatggtgacatgcagatagcaccctaccattat
attaaatgtagtcctaattttgatgggtctaagtggccactgtgtgaacgtaacgagccc
agtccccagtctaacctgttagctaatctagaggctatacgagaagaccatatggaatat
atcagtcagctatctagacacagtaatgaggctataaccacaatgagagaccaacctcga
tctgatatagaaaataaagagctatttgatttagctttaaaaggtctacagttactttct
gcttggactcaacaagttatggaattgtattcttggaagttattgaaccctactgaccct
catcagaatcctgactgtcctaaagatgctgaagagtatgaaagggcaacacgttataac
tacagtagtgatgaaaaatttgcgttgattgaggttatagctatgataaaaggcctccag
ttattaatggctagaatggaatcggtcttcatggatgccatcagacgtcatatttaccag
gaactacaagactttgttcagttgttcctccgtgatccattgcgtaaagccattaagaag
aaaagtgacgtcattaaaggtataataatggcggtaagagatacatgtgttgattggttg
agaggagtagaaccacacgatgacccggcgttacgtggtaaaaaagaccctgatgatggt
ttctttatcaaagttccaagacgaaatgttggtccttcaagtacccagttatatatggta
agaacgatgttagaatctctgacagctgagaagagtggaggaaagaaaacactacgtaaa
gatattgacttcagtcatcttcaaactattgataacttccataaaacttctttcttctgg
aattatcttattaattttaatgagactctgtttaactgttgtgatctatctcaactatgg
tatcgagaattttatcttgaattaaccatgggaaagagaattcagtttcctattgagatg
tctatgccgtgggttttaactgatcatattctagaaactaaagaaccctcaatgatggag
tatatcttatatcccttggatttatacaacgattctgcccactacgctctgactaaattc
tgtcaacaatttctttatgacgaagtcgaggctgaggttaacctatgttttgatcagttt
gtctataaacttagtgatcaagttttcgcttactataaacatctctcgggcagtattatg
ttggataaaagattccgatctgaatgtgctagtcatggagctaaaattaactaccctact
gccaatagatatcaaacattactcaaacaacgacacgtttcgattttgggaagatcaata
gatttaaatagattaataggacaaagaatcaatgctgctctacagaaagctttagacgtg
gccatagctcgatttgaggctggagatattactggtatagtggaattagaaggattatta
gaatgtaacaggctgactcataaactactgagtgaatatctaacattgaacgattacgat
gccatgctccgtgaagccaaccataacgtatcagctccgtatggacgtattacactacat
gtattctgggaattgaattatgatttcttacctaattattgttacaacgctgctaccaac
agatttgtaaaacatgataagttgacatttgtaacagacgccaagcgagagaaagcaccc
aacccttctcctcattatatctggggtacaaagaccctgacaacagcctatagtacaata
tacagcctgtatacccggtttgtgggtaccccccactttcattctatagtacgattacta
gggtatcaaggtatagctgtcgttatagaggaactccttaaaaccattgagggcttcttg
aaaggtactacacttgaatatgttaaaatgttaatgaaagttttaccaccaacttgtaaa
cttctaagatttgattatggttcaccaggtgtgctggcatattataacgccaacctagta
gacttgatccagtatcctgatttaagaatggaagtcttccagagtttcagagaaattgga
aatgccattttattcacagtacttcttgaacaggccatgacccaagaagaagtatgtgat
ttaaaacatgctgcaccatttcaaaatataattcctaaaccacatattcctataaaagaa
ggtgataatagaaaagataaagaagcagaattaaaattatttatgaaacaattagagaag
aaatatgctgcattacaagttgtttctgttattaaaaaacttggcaatcagacgcaagct
gatatagcggcagaaggtgatttattaacaagagagaggctatgttgtggactgtctatg
tttgaaatagtattaactagaatgaaatcattcctgactgacgcactatggcacggtgaa
ccccccactaatggtgttataaatatagataagtgtacagagtttcaccgactatggagt
gctatacagtttgtattctgtatgcctatgagagaaaatgaatacactatcgaagagttg
tttggagaggggttaaactgggctggatgttctattattatgttgctaggacaacagaga
agatttgaagctctagacttctgctatcatatactgaaggtcaacagagttgatatgaag
gatgaaaacgtcaagggtattcaattgaagaaaatggtggatcgaatccgaaagtttcag
attttaaacaatcagatattttcagtattaaataaatacatgaagaccacagacgccgag
agtatgccagtcgaacatgttcgttgttttcctccccccattcaccaatctctagctact
actatataa
DBGET
integrated database retrieval system
