Lottia gigantea (owl limpet): LOTGIDRAFT_212836 Help Entry LOTGIDRAFT_212836 CDS       T03273                                  Name (RefSeq) hypothetical protein   KO K05641   ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 1 Organism lgi  Lottia gigantea (owl limpet) Pathway lgi02010   ABC transporters lgi04148   Efferocytosis Brite KEGG Orthology (KO) [BR:lgi00001]  09130 Environmental Information Processing   09131 Membrane transport    02010 ABC transporters     LOTGIDRAFT_212836  09140 Cellular Processes   09141 Transport and catabolism    04148 Efferocytosis     LOTGIDRAFT_212836  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02000 Transporters [BR:lgi02000]     LOTGIDRAFT_212836 Transporters [BR:lgi02000]  ABC transporters, eukaryotic type   ABCA (ABC1) subfamily    ABCA1, 2, 3, 4, 7, 12, 13 subgroups     LOTGIDRAFT_212836 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  ABC_tran ABC2_membrane_3 R1_ABCA1 AAA_21 DUF4162 AAA_15 ABC2_membrane_2 AAA_23 Motif Other DBs NCBI-GeneID:  20246388 NCBI-ProteinID:  XP_009047928 JGI:  212836 UniProt:  V4ABB8 LinkDB All DBs Position Unknown AA seq 2278 aa AA seqDB search MGFGTQLRLLLWKNFMLRKRHPLRVIIELCWPLCLFLILVLVKTRPDLEENVPECHFDGK AMPSSGLLPFLQSYLCTYNNTCHMKVTEDETAGDVTGFNNSLLTRFVNDIETILSSNIDR NEIARALEDLSNLQKLLSMIRNGEIKLGNLLVDPDRLREQVANQSIDLSEESLDLLLNGS ISLDKVNSFLLICNLTQLQAQELYDDFMAEYNSTYAFNEVSFLSYIIFQIMKLESLSYNI FQIMKLESLSYNIFQIMKLESLSYNIFQIMKLESLSYNIFQIMKLESLEFILNDYERIQN DFRNSNMTGGNGTRNLLESMGTLLCGRSQTFVNLNNADRLGGSNNFFGEIFNAYCVILAP FCQDVFVSIESNNLFSIVWRYLKPIVLGVIPYTPDTPRVQEIIRLANQTFLDISELINLA DDWDRLLPQIYNYLNGPNIDFIRVRLMGDRFNLSGIPTLNRDFKICEYIGRFIYNGEDES GYDWRDSLNYTDIQLQTLKKYLQCFKFDKFIPYKDETSLTIDSVKLTSNNTLLAALVFNE IDDNTTHIKYKIRMNSDNVDSTKNIQDRYWRPGARASPTQDLKYVMFGFAFIQDMVDHAI IQVQTGEPSRIGVVLQQFPYPCYINDKFTRTISRTIPLFMVISWIYTVAMLVKGIVYEKE ERLKEVMKIMGLSNGVHWLAWFINAFIMMFITVVILVLILKYGGILEYSDPTVILVFLLA FTFSTIMLCFFISTLFSKANLSAVCGAFIYFMLYLPYTFITRWEEIMTTSQKAALSLANC VPLGFGCSYISRYEEQAIGIQWSNIASSPMVDDGFNMQYCIGMMIIDGILYGILTWYIEA VFPGQFGIPKKFYFFIQKSYWFGAQYNVDSESPVEAMQLGSEPRDKSVGVGIRNLRKVYS TGKKVAVDGLSLNFYEDQITSFLGHNGAGKTTTMSILTGLFPPTEGTAYIYGKDIRTDMD DIRNSIGMCPQHNVLFDRLTVEEHIWFYASLKGCTKQQVQTEMPKIIEDVGLVNKTKEMS RNLSGGMKRKLSVAIAFVGGSKTVILDEPTAGVDPYARRAIWELLLKLRKGRTIILSTHH MDEADILGDRIAIISHGKLCCCGSSLFLKSKFGSGYYLTLVKQDGNGAVNVDDDDDEDGL KKALNDDDGLRPSTADVDEGFGESNGSTTGSLSVGRITGFVQKYVKNAQLVEDNSTELCY QLPTEAMSSGDFEALFTQLERSHHELGIDSFGLSDTSLEEVFLAVADETNVDDLTDEATR NNFRKKKKFNFLRNRRSRIEHTELVEDTDDNVSIASSTLENRVGFANSGVQKLHGWSLIF NQFLALFIKRFHHVRRSKKGFVCEIILPAGFVALAIAFSLILPPLVTEPPLELHPWLYVP KKSEPNLYMFYSNDNPRSTLANSLEQALLSKPWVGTRCMNPDVYSIDGYPCEGSSNSQYL KWTERPKMTGNLTIDSPSCDCSRGFPDCPKGAGGPTPSMSYLPTTDYLYNMTARNISDWL LAHIPSFSICFDMFIFHYRYAGISFGDINPLADVNSSQIVDIINRLSEAANGGQPIVNNS FLTDIDTLARGFLTRNVAKVWYNNKGWASSVSYMNVLNNMILRSKLPANKDPADYGITTI NHPMAYNQKQFSAEAILTSVIDLIVAICVIFAMSFIPASFLIFLIEERVSDSKHMQFVSG INPTIYWISTFAWDMVNYLVPATLCVLIFLAFDQESYVSASNFPCLLALLFLYGWAIIPL MYPFSRLFSVSSSAFVTISCANVFLGVVSTLSTFIVELLEQSDKELADINTILKSVFLVL PHYCLGRGLIDMTRNQLQYDLTKQFFPDAKPSNILAWDLVGRNLFSLAMLGIFFFILNWL IEYRFFIKPRYVKESEDTNEDIDVSREKQRVLSGEADNDVLVLKNLSKVFYGARRKKLKA VDNLCVGVPRGQCFGLLGVNGAGKTTTFKMLTGDVPITGGAAHICQKSVLKEKNDVRQLM GYCPQFDALDSLLTGREHLEFYARVRGIDRSDVKQVADWAIRKLGLVQYADKSAGTYSGG NKRKLSTAISLIGNPQIIFLDEPTTGMDPKARRFLWNCITDIVKDGRSVILTSHSMEECE ALCGRLVIMVNGKFKCIGSTQHLKNRFGDGYTLTIRISGQTPNMEPIKQYIMEHFSQAVL LEQHNNMVQYQLKTSSLSLAKLFSSLQSAKQEYHIEDYSVTQTTLDQVFINFAKKQTDIE ETVDNELDIELREPRSNAMYDEYSLTGSTAELVRPDNFRSSIRSSDSRGSQMADVSVA NT seq 6837 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgggttttggaactcaattacgtttgttattatggaagaattttatgctgaggaaaaga catcctttaagagtgataatagaactatgctggccattgtgtttatttcttatcttagtc ttagtgaagaccagaccagatttagaagagaatgtaccagaatgccattttgatggaaag gctatgccttcatctggattacttccatttctacagtcctatttatgtacctacaacaac acttgtcatatgaaagtaacagaagatgaaacagctggtgatgtcactggttttaacaat tcattgttgacacgatttgttaatgatatagaaactattctgtctagtaatatagataga aatgaaatcgctagggctttagaagatttgagtaatttacagaaactcttgtctatgata agaaatggtgaaataaaactagggaatctattggttgatcctgatagattacgagaacaa gtagccaatcagagcatagatttatcagaagagtctttagatcttttgttaaatggatcc atatccttagacaaggtaaactcttttttattgatctgtaacttaactcaactacaggct caagaactgtatgatgactttatggctgaatacaactcaacatatgcctttaatgaagta agttttttatcatacattatctttcagattatgaaattagaaagtttatcatacaatatc tttcagatcatgaaattagaaagtttatcatacaatatctttcagatcatgaaattagaa agtttatcatacaatatctttcagatcatgaaattagaaagtttatcatacaatatcttt cagatcatgaaattggaaagtttagagtttattctgaatgattatgaacgaatacagaat gattttagaaatagtaatatgacagggggtaatggtactcgaaatcttctggaatccatg ggaacactattatgtggacgctctcaaaccttcgtgaatttaaataatgctgaccgcctg ggtggttctaataatttctttggtgagatatttaatgcctattgtgttattttagctcca ttctgtcaagatgtgtttgtatctatcgaaagcaacaatttattcagcattgtatggagg tatttgaaacctattgtattaggtgttataccttatacccctgatacacctcgagttcaa gaaattattagactggccaatcagacatttttagatatctctgaactgattaacctagct gatgattgggataggttattaccacagatatataactacttaaacggtccaaatatagat tttatcagggtaagactaatgggagacaggtttaacctgagtggtattcccactttaaat cgtgactttaagatatgtgaatatattggaaggtttatatataatggagaagatgagagt ggttatgattggagagattctctcaactatactgacatacaactacagactttaaagaaa tatctacagtgttttaaatttgataagtttataccatataaagatgagacatctctaact atagattcagttaaactaactagtaataatacattattggctgctttggtatttaatgaa attgatgataacacaacccacattaagtataaaatacgtatgaactcagataacgtagat agtaccaagaatattcaagacagatattggagaccaggagctagagctagccctacacaa gatttaaaatatgttatgtttggtttcgcctttatacaagatatggtggaccatgctata atacaagtacagactggagaaccatctagaatcggtgttgttttacaacagtttccatat ccatgttatatcaatgacaaattcactcgtacaatatctagaactataccattatttatg gttattagttggatctatacggtagccatgttggttaaaggtattgtgtatgagaaggag gaaaggttaaaggaggtcatgaagattatgggactaagtaatggagtacattggttagct tggtttattaatgcctttataatgatgtttataactgtagtcatactggtacttatttta aagtatggtggtatattagagtactcagatccaactgtaatactggtgttcctattggcc ttcaccttctctaccataatgctgtgtttcttcatcagtactttgttctcgaaggccaat ttatcagctgtctgtggtgcctttatatacttcatgttatatcttccctacacatttatt actagatgggaagaaattatgaccacttctcaaaaagcagctctgtctctcgctaactgt gtaccactaggatttggatgtagttatatatctagatatgaagaacaagctataggtata caatggagtaatattgccagtagccctatggtggatgatggttttaatatgcagtattgt attggtatgatgattatagatggtatattatatggtattttaacatggtatattgaggcg gtattccctggacaatttggtattccaaagaaattctatttcttcatacagaaatcgtac tggtttggtgctcagtataatgtggattctgaaagtcctgttgaagccatgcagttaggc tcagaacccagagataaatcggtgggtgtaggaatacgtaatctgagaaaagtttactcc actggaaagaaagttgctgttgatggtttgtcattgaatttctatgaagaccaaatcaca tctttcttaggacataatggtgctggtaaaaccacaacaatgtcaatattaactggtctg ttcccaccaactgaaggtacagcctatatttatggtaaagatattagaactgatatggat gatattagaaacagtataggaatgtgtccacaacataacgtcttatttgacagattgact gtagaggaacatatttggttctatgccagtttaaagggttgtactaaacagcaagtacag actgaaatgcccaaaattatcgaagatgttggtttagttaataaaactaaagaaatgtcc aggaacctatcaggtggtatgaaaagaaagttatctgtagctatagcgtttgttggggga tctaaaactgtgatattagatgaacctactgctggtgttgatccatatgctagaagagcc atctgggaattacttctaaaactaagaaaaggacgaactataatcttgtctacacatcat atggacgaagctgatattctgggagaccgaatagccatcatctcccatggtaaactgtgt tgttgtggctctagtttgtttttaaagagtaaatttggcagtggttattacctgacactg gtaaaacaagatggaaatggtgcagtcaatgttgatgatgatgatgatgaagatggtttg aagaaagctttaaatgatgatgatggattgagaccttctactgctgatgttgatgaaggt tttggtgaaagtaatggaagtacaacaggaagtttgtctgtcggtagaataacaggattt gtacagaaatatgtcaagaatgctcaactggtagaagataattctacagaattgtgctac caactacctactgaagccatgtcttctggtgattttgaggctttatttacccaacttgaa agaagtcatcatgaattgggaatagacagttttggtttgtcagacaccagtttagaagag gtatttttggcagtagctgatgagaccaatgttgatgatttaactgatgaagctacaaga aacaactttaggaagaagaaaaagtttaattttctacggaacagaagaagtcgtattgaa catactgaactagtagaagatactgatgataatgtttctattgcctccagtaccttagag aatagagttggatttgctaattctggtgttcagaaacttcatggctggtctcttatattc aatcagtttctggctttatttatcaaacgattccaccatgtcagacgcagcaagaaaggt tttgtttgtgagatcattctaccagctggatttgttgctctagctatagcttttagttta attctaccaccattggtaacagaacctccattagaactacatccatggttatatgtacct aaaaaatcagagccaaatctctacatgttttattcaaatgataatccaagaagtacctta gctaatagtttagaacaggcattactaagtaaaccctgggttggtactagatgtatgaat cctgatgtttattctatagatggttatccatgtgaaggttcttctaattcacagtacctc aaatggacagaaagacctaaaatgactggtaatctgactattgattcaccatcatgtgat tgttcgcgaggttttccagactgtccaaaaggtgctggtggtccgacaccctctatgagt tatttacctacaactgattacctgtataatatgacagcacgtaacattagtgactggcta ctggcacacattccctctttttcaatttgctttgacatgtttatctttcattatagatat gctggtatttcatttggtgacatcaatcccttagcagacgtcaactccagtcaaattgtt gatattattaatagactatctgaagcagctaatggcggtcaacctatagtgaataattca tttttaacagacatagacacactggctagaggctttttaacaagaaatgtggctaaggta tggtacaataataagggttgggcatcatctgtatcctatatgaatgtattgaataacatg atattaagaagtaaactaccagcgaataaagatccagcagactatggtatcaccactata aatcatcccatggcatacaatcaaaaacaattcagtgctgaagctatattaaccagtgta atagatctgatagtggctatctgtgtgatatttgccatgtcttttataccagccagtttc ttaatattccttattgaagaaagagtcagtgatagtaaacatatgcagtttgttagtggt attaatcctactatatattggatatcaacgtttgcctgggatatggtgaattatttagta ccagccacattatgtgtgttaatatttttggccttcgaccaggaatcatatgtttctgct tctaatttcccatgtttactggctttgttgttcttatatggttgggctattattccattg atgtatccattctcaagactgttcagtgtgtctagttcagcttttgtaacaatatcatgt gccaacgtattccttggtgtagtgtccaccttgtctactttcatagtagaattactagaa caatcagataaggaattggctgatattaatacgatattaaaatcagtatttctagttcta ccacattattgtctaggccggggtttgattgatatgacacgtaatcaactacagtatgat ctcaccaaacaattctttcctgatgccaaaccttccaatatcttagcttgggatttagtt ggtcgtaatttatttagtttagccatgttaggtattttcttctttatcttaaattggctt attgaatacagattctttatcaaaccaaggtatgtaaaagaaagtgaggataccaatgaa gatatagatgtctcaagagaaaaacaaagagtgctatcaggagaggcagacaatgatgtt ttagttctgaaaaacctttcaaaggtattttatggagcaaggaggaagaaattgaaggct gtagacaatctatgtgttggtgtaccaagaggacaatgttttggtttattgggtgtcaat ggagcaggaaagaccacaacatttaaaatgttaacaggagatgtccctattactggtgga gctgctcacatctgtcagaagagtgtattaaaagagaagaatgatgtaagacagcttatg ggttattgtccacaatttgatgctctagatagcttattgactggtagagaacatctagag ttttatgctagagttcgtggtattgatagatctgatgttaaacaggtagctgattgggcc attagaaagctaggtttggtacagtatgctgataagtcagctggtacatactctggtggt aataaacgtaaactctctacagctatatcattgattggtaatccacagataatattcttg gatgaaccaacaactggtatggatcctaaagctagaagattcttatggaattgtataact gatattgttaaagatggtagatctgttatattaacatctcatagtatggaagaatgtgaa gcactatgtggtagattagttattatggttaatggtaaatttaaatgtattggtagtaca caacatctcaaaaatagatttggtgatggttatactctaacaataagaatctcaggtcaa acaccaaatatggaacctataaaacaatatatcatggaacacttctcacaagctgtgctc ctagaacaacataataacatggttcagtatcaactaaagaccagctccctatcattagcc aaattatttagttctctccaatcagccaaacaagaatatcacatagaagattattctgtt acacaaaccaccttagatcaagtatttattaactttgccaagaaacagacagatattgaa gagactgttgataacgaactagatatagaactcagagaaccaagatctaatgcgatgtat gatgaatacagtttaactggtagtactgcagaattagtacgtccagataactttagaagt agtattcgttcctcagatagtagaggttctcagatggctgatgtctcagtcgcctaa

DBGET integrated database retrieval system