Lottia gigantea (owl limpet): LOTGIDRAFT_232356
Help
Entry
LOTGIDRAFT_232356 CDS
T03273
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
lgi
Lottia gigantea (owl limpet)
Pathway
lgi04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lgi00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
LOTGIDRAFT_232356
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
lgi00536
]
LOTGIDRAFT_232356
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
lgi00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
LOTGIDRAFT_232356
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
hEGF
EGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
EGF_MSP1_1
Cadherin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
20248890
NCBI-ProteinID:
XP_009054809
JGI:
232356
UniProt:
V4BZF3
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2945 aa
AA seq
DB search
MCILLGYRNTLLSVFILVSVVLLTNAARGRQRTHRSFLQRDQPRGPNVCGSRFRRVCCSG
WLRPRGSRHCNIQLNLKTNDVQRPDMQNSSSSHMLISYRQRSSKCSGGCNGGRCMKPNLC
FCPNRQISRTCSSRDKSTVKCTQGCENGGRCTGAERCSCPYGFSGNRCEQDYRTGPCFTQ
ISNNMCRGQLTGVVCTKILCCSTIGIAWGQPCEQCPAQRHPCRRGYIPNPQTNSCQDVNE
CEAIPGLCVGGNCVNTQGSYRCGCKEGQIQNPVTQVCEDINECRLNPGICRVGTCTNTEG
SYFCTCPPGFETSPDRSRCTSIRRGFCYRSVVGSNCRNRIQEQTSLKDCCCTIGKGWGQG
QVCQPCPLKGQDIDMEEVNPNVLRLGCISLINVNWKDAWERLCRSTEPLTEFVDECSIFD
KLCQNGRCIDTPDSFRCECNPGFKSNAAGNCIDIDECLLPGTCNNGRCVNTPGSFTCRCP
DGFTLDKSGLFCSDMDECKKDGMCPNGICINMDGSYKCQCKPGYRQSSNRQICYDLNECT
ENGRLCVNGECRNTEGSYYCECNPGYKLSPDGAFCSDYDECRTTGMCTNGMCINMDGSFK
CICKVGFTLAPGGEVCIDINECIVNRDSCVNGQCINNQGSFRCDCADGFTLGPDGRTCLD
TKRDFCFPEIRSGRCVNPVEATVTKSVCCCSMVRPGVAWGLACDRCPSMNDPDYKLLCPN
GNGMDHDGKDINECIMFPGICENGNCENVKGDYRCICNNGYEITRGGKKCRDINECERDR
SICDGGKCRNTPGSYRCICPPGLIFDSTSRMCVDVNECRENPCIKGQCINVAGSFKCKCL
TPGTILDPTGRICLDNKRGACWRTIKNGVCEDNIESMLLKGECCGSIGKAWGSPCVPCPT
QSELACPRGYANRLGLNCVDINECELFPGICEGGGTCVNLEGSFKCTCDFGLTLDPTGLR
CVDMRRDRCYQDYNRGFCVRPLMGAYLRSDCCCSIGGAWGDPCEPCPTRQTDAYEKLCSM
IPGREGTIPGVEINECMMFPGLCMNGRCRDTIGSFQCTCDSGFALDDMGTNCTDIDECRI
SLTGVCANGQCENTLGGFRCICDPGYEGVMMDTMCMDINECDQDSTLCRGGACVNTPGSY
RCDCPDGHQLSEDGLSCTDVDECGTDSSICSNGHCVNFMGGYQCICSQGFVPNELKTTCI
DADECRDRNGGCADRCINTPGSFNCACENGYTLMIDGRTCIEWSPVRSCPVPSRIPDRRI
IRNISVVERDTGVIYLVASGYPIVTGFVFFHSVDIDECKDRDTCKGGKCINQPGTYRCSC
DGGLTMSIDQQQCLDIDECFLNRNLCLSGYCQNTHGSFICKCENGFGVDGKDNNAGCTDI
DECVTGESACDENSRCINTKGSYKCDCLPGFTGDGYTCRDINECVRDNGGCNRDATCVNG
PGSFRCVCDDGFNGDGFECRDVDECSVDPNLCENGQCMNFPGLFRCECDMGFAPTEDERA
CVDINECDMFHNLCVNGRCENVFGMFRCICNQGYQLDFTGGNCTDIDECLNPDNCQYGTC
INRRGSYVCQCSANYELNPTGTGCVDKRRGTCYMTAPFSTRGRLGVCRDEIASNVARATC
CCSVGRGWGDVPGFCEDCPRNGTSEYNSLCPGGPGFRPNTLTLVLEDINECEEIDDLCKG
GDCQNMFGSYICVCPPGYHLDGTMHKCVDIDECQVDAALCGRGTCINREGNYTCICPEGY
MPMDGGRDCMDMRKEGCFMEYLNTTRRPYRTICENQISSNLTKRQCCCTVGAAWGNRCEI
CPRERSLQYKVLCESGAPDIKGDVNECELIPNLCENGRCINTIGSFRCECYRGFNYNANL
HICEDENECRRSLPPCMGNSVCTNTPGSYQCSCPDGYKLTSDRRRCQDINECEELPGVCA
NGNCLNLIGSFSCICRDGFRLSPKRDSCIDVNECTSRPGMCRNGTCKNKMGDYVCLCDPG
FERTSRGDCVDIDECRTMLGICLNGRCANKIGSFTCMCQEGYVLSNDGLNCRDIDECSTR
RGICRHGTCQNSEGSFFCTCFDGYKLDRSRDRCIGNVPPPNVDECRVIPGLCFNGRCQNT
AGSFRCMCPAGFVLTTDGRECRDMRKGNCYRRFENGRCLEPRPVNTTRDQCCCTKGEAWG
GYNCEICPSEGDPGFRHLCPEGYGYVKIMPGEIMSDVNECLIHRGICEDGVCVNTDGSFR
CECRPGYTLDITGTKCVDANECIDRNMCGNGTCTNMIGGFECDCRPGFTPGTSGKCEDVN
ECVTSANQCAFRCVNIPGSFKCVCPMGYKIAADNIHCEDVDECLTRTNRCKYACKNIMGS
FLCVCPEGYRSVGADECQDIDECRATPGLCTNGRCRNTQGGYRCDCNRGYDLSPDGKRCF
DGRSGYCYPTLLNNRCERTRTSQIATKSECCCGLAAAWGPRCERCPRMGTVGFKQLCPSG
PGFTPDGKDIDECIGMPGACTNGRCFNTMGSYRCVCNPGYKADPSGKMCTDIDECALVPP
KCDGNCRNTIGSFICSCEKGYSLSIDGHTCQDVDECLMNLHNCRNVKCINTVGGFDCECP
EGYRRGSTGNCEDIDECFEKVDLCSPGTCRNTPGGFKCICPRGYRLDKTGQKCLDLDECV
YDLDECVYDENECADEYLCGFAICINLPGSFDCECSGSGVYDFEHGSCENVNACGGSPCL
FTCSASLNGFQCGCPSGFQPMGPGHCISTITPPVGGGIPTYPGGVQLPHVPAPEGKLPGG
EGCYHCDKDFGDIPLSKRNRRSTEEEDDDLNMLINKHYIKQRAEKYSRTKRDTLKREHLK
RHREMSGNTTRQATPIHSQNSTEGPLELIIDRKQTRPKARVLKVLPSLTALNNNVRYKII
KGNVDGLFSMHKKKGISSLHFTRRLHKSTVFNLDILCSPIISDLDIDETFVHLQSFVIHL
KIRVQ
NT seq
8838 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgtatattattaggatatagaaacacattgttaagtgtatttatattagtaagtgtg
gtactattgactaatgcagcaagaggtagacagcgaacacatagatcatttttacaaaga
gaccaaccacggggaccaaatgtgtgtggctcaagatttcgacgagtgtgttgttcgggc
tggttaagacctcggggaagtcgtcactgcaatattcaacttaatcttaaaacaaacgat
gtccaaagaccagacatgcaaaatagctcctcaagtcacatgctaattagctatagacag
agatcttcaaaatgctctggaggttgtaatggtggaaggtgtatgaaaccaaatctctgt
ttttgtccaaacagacaaatatcaagaacatgtagttctagagacaaatcaactgttaaa
tgtactcaaggctgtgaaaatggagggcgatgtactggtgcagagcgatgttcttgtccg
tatggtttttcaggaaatcgatgtgaacaagattatcgaactggaccctgcttcacccag
atctctaataatatgtgtcgtggacaactcactggtgttgtttgtactaagattctatgt
tgttctactattggtattgcctggggtcaaccctgtgaacaatgtcctgctcaacgtcat
ccatgtagacgaggttacattccaaatccacagaccaattcttgtcaagatgtgaatgaa
tgtgaagctatacctggactctgtgttggtggtaactgtgttaatactcaaggatcttat
agatgtggttgtaaagaaggtcagatccagaatcctgtcactcaagtttgtgaagatata
aatgagtgtcgactgaatcctggtatatgtagagtaggaacctgtaccaacaccgaagga
agttatttctgtacctgcccaccaggatttgaaacatcaccagatagatctcgctgtacc
agtattcgaagaggattttgttatagaagtgtagtcggtagtaattgtcgaaatagaata
caggaacaaacttcactaaaagactgttgttgtacaattggaaaaggatggggtcaaggt
caagtttgtcaaccttgtccattaaagggtcaagatatagatatggaagaggtaaatccc
aatgtacttcgtcttggctgtatttctctcatcaacgtgaattggaaagatgcttgggaa
agattatgtaggagtacagaaccactaacagagtttgtagatgaatgttctatatttgat
aaactatgtcagaatggaagatgtatagatacacccgattctttccgctgtgaatgtaat
cctggttttaaaagtaatgctgctggaaattgtatcgatatagatgaatgtctactaccg
ggaacctgtaacaatggtcgctgtgtaaatacacctgggagttttacctgtcgatgtcca
gacggttttactttggacaaatctggattattctgttcagatatggatgaatgtaaaaaa
gatggaatgtgtcccaatggtatatgtattaatatggacggaagttataaatgtcaatgt
aaacctggatatagacagtcgtctaacagacaaatttgttatgatctgaatgaatgtaca
gaaaatggtagattatgtgtcaatggtgaatgtagaaatacagagggtagttattactgt
gaatgtaacccaggttataaactctcaccagacggcgccttctgttcagattatgatgaa
tgtagaacaactggaatgtgtaccaatggaatgtgtattaatatggatggaagttttaaa
tgtatctgtaaagtgggatttactttagctcctggtggagaagtttgtatcgatattaac
gaatgcattgtaaacagagatagttgtgtcaatggacaatgtattaataatcaaggtagt
ttcagatgtgactgtgctgatgggtttacattaggtccagacggtagaacctgtcttgac
accaaaagagacttctgtttcccggaaataagaagtgggcgatgtgttaaccccgtggaa
gctactgtaaccaagtcagtatgttgttgtagtatggtcaggcctggagtagcatggggt
ttagcatgtgaccgatgtccaagtatgaacgatccggactataaactattgtgtcctaat
ggtaacggtatggaccatgatggaaaagatataaacgaatgtatcatgttccctggtatt
tgtgaaaatggtaattgtgaaaatgtgaaaggagattatcgatgcatttgtaacaatggt
tacgaaataaccagaggaggcaagaaatgtcgagatatcaatgaatgtgagagagacagg
agtatatgtgacggtggtaaatgtagaaatacaccaggaagttatagatgtatctgtcct
cctggtttaatctttgattctacatcaagaatgtgtgtagatgtaaatgaatgtcgtgaa
aatccgtgtataaagggtcaatgtataaatgtagctggaagttttaaatgtaaatgttta
acacctggtactattttggaccccacaggaagaatttgtctggataacaaacgaggagcg
tgttggagaactattaaaaatggtgtatgtgaagataacatagaatctatgttattaaaa
ggagaatgttgtggtagtattggtaaagcatggggtagtccttgtgtaccatgtccaaca
caatctgaactggcctgtcctagaggttacgctaatcgacttggattgaattgtgttgat
ataaacgaatgtgaactgttccctggtatctgtgaaggtggtggaacatgtgttaattta
gaaggatcatttaaatgtacatgtgattttggtttaactttagatccaactggactgcga
tgtgttgatatgagaagggatcgctgctatcaagattataacagaggattttgtgttcga
ccattaatgggagcttacttacgaagtgattgttgctgtagtattggtggagcctggggt
gatccatgcgaaccatgtccgacaagacaaactgatgcctatgagaaactatgttctatg
ataccaggccgggaaggtactatcccaggagtagaaataaatgagtgtatgatgtttcct
gggttatgtatgaatggacgatgtagagatacaattggaagtttccagtgtacctgcgac
tcgggcttcgctttagatgacatgggtaccaactgtacagatattgatgaatgtagaata
tctttaaccggtgtatgtgctaatggtcaatgtgagaacacattgggaggatttagatgt
atttgtgatcctggatatgaaggggttatgatggatactatgtgcatggatatcaacgag
tgtgaccaagattctacattatgtcgtggtggtgcatgtgttaatactcctggtagttat
agatgtgattgtccagacggtcatcagttaagtgaagatggattatcttgtacagatgta
gatgagtgtggaactgacagcagtatatgttctaacggacattgtgtcaactttatggga
ggttaccaatgtatttgtagtcaaggatttgttccaaatgaactaaaaactacatgtata
gatgctgatgagtgtagagatagaaatggtggttgtgctgatagatgtatcaatacacca
ggaagttttaattgtgcttgtgaaaatggttacaccttgatgatagacggtagaacatgt
attgaatggtctccggtacgatcttgtccagtaccaagtcggataccggataggcggata
attagaaatattagcgttgtggaaagggatacaggggtgatatacctagtggcgtcagga
tatccgatagtgacaggctttgtatttttccactctgtagatattgacgaatgtaaagat
agagatacctgtaaaggcggtaaatgtatcaaccaaccaggaacttatagatgttcttgt
gatggtggattaacaatgtctattgatcaacaacagtgtctagatattgatgaatgcttc
ttgaacagaaacctgtgtttaagtggatactgtcagaatacccatggatcttttatttgt
aaatgtgagaatggttttggtgtagatggcaaagataataatgctggttgcacagatatt
gatgaatgtgtaacgggagaatcggcttgtgatgagaattctagatgtatcaatactaaa
ggttcctataagtgtgattgtttaccgggttttactggtgatggttatacttgtagagat
ataaacgaatgtgtgcgagataatggtggttgtaatagagatgctacatgtgtcaatggt
cctggtagtttcagatgtgtctgtgatgatggattcaatggtgatggatttgaatgtaga
gatgttgatgaatgttctgtggatccaaacttatgtgaaaacggacagtgtatgaatttc
ccaggtctatttagatgtgaatgtgatatgggatttgctcccactgaagatgaaagagct
tgtgttgatataaatgaatgcgacatgttccataatttatgtgtaaatggacgatgtgaa
aatgtatttggtatgttcagatgtatatgtaatcaaggttatcagttagattttactgga
ggcaactgcacagatattgatgaatgtttgaatccggacaattgtcaatatggtacctgt
attaatagacgaggaagctatgtttgtcaatgttcagctaattacgaactgaatccaact
ggtactgggtgtgtcgataagagaagaggaacatgttacatgacagcacctttctcaacc
cgtggtagactaggtgtttgtcgagatgagatagctagtaacgtagctagagccacgtgt
tgttgttctgtgggacgaggttggggtgatgttcctggtttctgcgaagactgtcctcgt
aatggaacaagtgaatacaattcattgtgccctggaggtccaggcttccgaccaaatact
ctcaccttggtgctagaagatatcaatgaatgtgaagaaatagatgatctatgtaaaggt
ggcgattgtcagaatatgtttggaagttatatatgtgtttgtccccctggctaccatctt
gatggcactatgcacaaatgtgtcgatattgacgaatgtcaagttgatgccgcattgtgt
ggtcgaggaacctgcataaatagagaaggaaactatacttgtatctgtccagaaggttat
atgccaatggacggtggaagagattgtatggatatgagaaaagaaggatgttttatggaa
tatttgaatactacaagaagaccttatcgtaccatctgtgaaaatcaaatatccagcaat
ttaaccaaacgacaatgttgctgtacagttggtgctgcctggggtaacagatgtgaaata
tgcccacgagaacgatccttacaatacaaagtattatgcgagagtggggctccagacatt
aaaggtgatgtcaatgaatgcgaactgatacctaatctctgtgaaaatggacgatgtatc
aacacaattggaagctttagatgtgaatgttatagaggatttaattataatgctaaccta
catatttgtgaagatgaaaatgagtgtcgacgatcgttaccaccatgtatgggtaattct
gtctgtaccaatacaccaggcagttatcaatgttcttgtcctgatggttataaattaaca
tctgatagacgacggtgccaagatataaatgaatgtgaagaattacctggtgtttgtgct
aatggaaattgtctcaatttgatcggaagttttagttgtatctgtagagatggctttaga
ttgtcaccaaaacgtgactcttgtatcgatgttaatgagtgtacgtctagacctggtatg
tgtagaaatggaacatgtaaaaataaaatgggagactacgtgtgtctgtgtgatcctggt
tttgaacgaacctctcgcggagattgtgtagatattgatgaatgtaggactatgttgggt
atatgtcttaatggtagatgtgccaacaaaatcggttcatttacttgtatgtgtcaagaa
ggctatgtattatctaatgatggactaaactgtagagatattgatgaatgttctacaaga
aggggtatttgtcgacatggtacttgtcagaattcggaaggaagtttcttctgtacatgt
tttgatggttataaattagacagatctcgagatagatgtatcggtaatgtacctcctcca
aatgttgatgaatgtcgagtgatacctgggctatgtttcaatggtagatgtcagaatact
gctggaagttttaggtgtatgtgtcctgctggatttgttttaacaactgatggtcgagaa
tgtcgagatatgagaaaaggcaactgttaccgccggtttgagaatggtagatgtttagaa
ccgcgaccagtaaatacaaccagagatcagtgttgttgtacaaaaggagaagcttgggga
ggctacaattgtgaaatctgtccatccgaaggggatcctggatttagacatctatgccct
gaaggttatggttatgttaagatcatgccgggagaaataatgagtgatgtaaatgaatgt
ttgattcatcgtggtatatgtgaagatggtgtttgtgtcaatactgatggctctttccgc
tgtgaatgtagaccaggttatactctggacatcactggtaccaaatgtgtcgatgccaac
gaatgtatagatcgtaatatgtgtggaaatggaacatgtaccaatatgattgggggtttt
gaatgtgactgtaggccaggattcactccaggaacgtcagggaaatgtgaagatgtcaat
gaatgtgtaacatcagcaaaccaatgtgctttcagatgtgtcaatatacccggatctttt
aaatgtgtatgtccaatgggatataaaattgcagctgacaatattcactgtgaagatgta
gacgaatgtttgacgagaaccaatagatgtaaatatgcctgtaagaatattatgggttct
ttcctgtgtgtctgtcctgaaggctatcgttctgtaggagcagacgagtgtcaagatatt
gatgaatgtagagctacaccaggtttatgtaccaatggtcgatgtagaaatacacaaggt
ggctatcggtgtgattgtaatagaggttacgacctcagtccagatggaaaacgatgtttt
gatggtagatcaggatattgctatcccacactgctcaataatagatgtgagagaaccagg
acctctcagatagctactaaatcagaatgttgttgtggacttgctgctgcctggggacca
cgttgtgaacgatgtcctagaatgggaacagttggttttaaacagttatgtccgagtggt
ccaggttttactccagatggaaaagatattgatgaatgtattggtatgcctggtgcctgt
actaacggtagatgttttaacactatgggatcatatcgatgtgtttgtaatcctggttac
aaagctgacccatctggaaagatgtgcacagatattgatgagtgtgctcttgtgccacct
aaatgtgatggtaactgtaggaacactattggaagttttatatgctcatgtgaaaaggga
tactcactgtcgattgatggacatacatgtcaagatgtcgatgaatgtctgatgaatcta
cacaattgccgcaatgttaaatgtataaacacagtgggtgggtttgattgtgaatgtcca
gaaggatatcgacgtggttcaactggaaactgtgaagatatcgatgaatgttttgagaag
gtcgatctatgttccccaggaacatgccgtaatacccctggtggttttaaatgcatttgt
cctagaggctataggctagacaagacaggacaaaaatgtttagatctagatgaatgtgtt
tatgatctagatgaatgtgtttatgatgaaaatgaatgtgctgatgaatatctgtgtgga
tttgctatctgtatcaatttaccaggttcatttgattgtgaatgttctggtagtggggtt
tatgattttgagcatggatcgtgtgaaaatgtaaatgcttgtggtggaagtccatgtcta
tttacatgttcagcatctcttaatggattccagtgtggttgtccttctggattccaaccc
atgggtcctggacactgtatatcaactataacgccacccgtaggaggtggaatacccacc
tatcccggcggtgtacagttaccccatgtacctgcacccgaaggaaaactacccgggggt
gaaggatgttatcattgtgataaagattttggtgatataccactgtctaaaaggaataga
agaagtactgaagaagaagatgacgatctcaatatgttaatcaataaacactatatcaaa
cagagagccgagaaatactccagaactaaacgagatacgctgaaaagagaacatttaaag
agacacagagaaatgtctggaaataccactagacaagcaacaccgattcactcacagaat
tcaaccgaaggaccattagaattgattatagatcgaaaacaaacgagacctaaagcccga
gtacttaaagtattaccgtcgctcactgccttaaataataatgttagatacaagataatt
aaaggcaatgtagatggtttattttccatgcataaaaagaagggaataagttctcttcac
tttacaagacgccttcacaagtcgacagtattcaatttagatatattatgtagccccata
atcagcgacttggatatcgatgaaactttcgtgcatttacaatcatttgttattcattta
aaaattcgtgttcaataa
DBGET
integrated database retrieval system