Lottia gigantea (owl limpet): LOTGIDRAFT_233338
Help
Entry
LOTGIDRAFT_233338 CDS
T03273
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K11491
condensin-2 complex subunit D3
Organism
lgi
Lottia gigantea (owl limpet)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lgi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
lgi03036
]
LOTGIDRAFT_233338
Chromosome and associated proteins [BR:
lgi03036
]
Eukaryotic type
Chromosome condensation proteins
Condensin II
LOTGIDRAFT_233338
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Cnd1
HEAT
Cohesin_HEAT
HEAT_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
20249230
NCBI-ProteinID:
XP_009057415
JGI:
233338
UniProt:
V4AEG2
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1517 aa
AA seq
DB search
MIDSDRIIAAFSALPINSINQDWVKDVWTADFTDLGEIPEETVTIVSNDRYNISQLEDCC
KLLVKEKDGRLWTLLVDNDISLKSTVVLLYYLLDIGTKVNSNYVMKEASILAASVYIKLL
ALPGSGAFKVFHPEIIVKCVEILKFFDNVGSTKRKVSSDSGGSKKKKGQKKRKRKNTAEE
DSSLNNDEDVSINDDDDIDEELTPSQVNRLMKLLLNLLKDLTHLFEGFSLKSSYSTAHRL
ISYFVQLTRQEMVDVDFYSWPSIENMSVPCLAYRCLDLMCTVPSLNITILTAVCKYILPN
LLMAGKSVVRADTKIVDQTVEFLRYIMKTGGETTIPVISTLIQHMSTKVLDKSDFRLTVA
KAIVTLLQDFPAPSYSKVLEWLLKLSQHAKMSHRIFALEVVTLLLGRKEPESIDDVNDET
VLITKHKSLMSVILARCSDLSPSVRSKAILGFSQCFVSLNTDVVSAMREIVTPRANASRQ
KHPPHLIPTPDLQNRVETRITPESISKDGENETPLVTPSDSDVNVTVGNTTSTSRNRTVF
PFTPFVGVQLTPGFNPDLTDNEGVISMLRRRSSDENAGVRKAAVQALQNIILFEKPNFRK
ENLIMINERCCDPSLSVRKQSIQCLTRYITQIWLDGALPLVMDRENTLQDKCCELVEDVI
FGNLTTYHKHYLQLACQTLARSKKIKLSYMKNLETHIDTENNKGAWLLIYIIAQFVPKIN
AQFVIDYWEKHSQSLKDEEEDTFERVLNVICYTAEHLLSTVRLDMIDDLNNRLKRFDSPP
GLVAVIVKTLSKLSECQATSEGDTTRSQKETWGVQLLKSCDEYLSKVIFEDKLEGEVDED
KIVCYLSTIGEIVQLCPAKTPQRIYLLVQSIVAGSELPSEHHSQISDTSHTSSQNSSQNS
SQSSQGTQQAIPPSQPFSQFKGFNTSNRVRTFAFITLGKLLLQNERLAKKCIPALARELE
TCSDIVLRNNIVIIMCDLCIRYTTVIDSYVPNIAVCLKDRAPLIRKQTLTLLTRLLQEDF
IKWKGVLFFRFITTLLDSDSDIQDFAEFCMINILLHRQPNMFFNHFIECIFHFNGYTESS
VYNKFTQTDREKSLFNMKGEHAASKRLKLYLFMLEHTNDQHKFQLTSKLCQDILGGVVDN
ILPLNEKSLPLLKDSLAILSSKEIKISSMKAKPTAQDDDEQQPDMAAVVLATAKKHLITQ
VVKKNVIENIVPIVTSLKYILEKEKSPVLKDLMIYLQVLMKDFKTEIEEILASDKQLLKE
LNFDIKRFEEQQENESNNITTDTIPMASQTGTPVATPVTIVTEPSSDNNTDTTVNSPSRT
DSTTTQTSTVGTPKQDKITGPRPPLLSAAILNSAKKNIERLKELKEARNTPSKTKKTPKG
KTPSNKSKGGTPVSDKERRKSGVTWADENSKDPIGSSSNTNEASSTSSATILIKTPNHRV
TRAISTPSGALGNITFAIDQNTSMIPLSPIEGSDESALQISKQPEFDSDDVVFLMSPERP
LPKPKKWNIKSVKTEAS
NT seq
4554 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgattcagatcgtattattgcagccttttcagctctgccaatcaattcaatcaat
caagattgggtgaaagatgtatggacagcagattttacagatttaggtgaaataccagag
gaaactgtaactatagttagtaatgatagatataatatttcacagctagaagattgttgt
aaattattagtgaaggaaaaagacgggagactatggactttattggtagataatgatata
tcattaaaatctacagtagtattattatactatctactagacattggtaccaaggtaaat
tctaactatgttatgaaagaagcctctatattagcagcctcagtctatatcaaattatta
gctcttcctggaagtggagcctttaaagtttttcatccagaaatcattgtcaagtgtgtg
gaaatattaaaattctttgataatgttggttctactaaacgtaaagttagttctgatagt
ggtggcagcaagaagaaaaaaggtcagaaaaagaggaaaagaaagaacactgctgaagaa
gacagttcactgaataatgatgaggatgtgtctattaatgatgatgatgatattgatgag
gagctaaccccatctcaagtcaacaggctaatgaaactattactcaatttgttgaaggat
ttaactcacttatttgaaggattttctttaaagagctcatattctacagctcacagactg
atatcctattttgtacagttaacaagacaggaaatggtggacgttgacttttattcatgg
ccatctatagaaaacatgtcggtgccatgcttggcttacagatgtttagatttaatgtgt
acagttccaagtcttaatataactattcttacagcggtgtgtaaatatattctgcctaat
ctattgatggctggtaaatcagtagttagagctgataccaaaatagttgatcaaacagta
gaatttctcagatatataatgaaaactggaggagagactactataccagtaataagcaca
ttaattcagcatatgagtactaaagttttagataaatcagatttcaggttgactgttgcc
aaggctatagtaacgttgcttcaagatttcccagctccatcctactctaaagtattagaa
tggttacttaagctttcacaacatgccaagatgagtcacagaatatttgctttagaagtt
gtaactttgttattaggaagaaaggaaccagaatctatagatgatgtgaatgatgaaaca
gtgttaataaccaaacataaatcattaatgagtgttatattagctagatgttcagattta
tctccttcggttcggtctaaagctatattaggattttcacaatgttttgtatctctgaat
actgatgtggtatcagctatgagagagatagttacaccaagagcaaatgccagccgccaa
aaacatcccccacacttgatacctacacctgatttacagaatagagttgaaaccagaatc
actccagaaagtataagtaaagatggagagaatgagacaccactagtgactccctcagat
agtgatgttaatgttactgttggaaatactacctctactagtagaaacagaacagttttt
ccttttacaccttttgttggtgttcagctaacacctggttttaatccagatttaacagat
aatgaaggtgtgatatctatgctgcgtagaagatctagtgatgaaaatgctggtgtaaga
aaagctgcagtacaagccttacaaaatatcattttgtttgagaaaccaaacttcagaaaa
gagaatttgatcatgattaacgagagatgttgtgatccttccttatctgtaagaaaacaa
tctatacagtgtttaaccagatatattacacaaatttggttagatggtgcccttcctcta
gtgatggatcgagagaatactctacaagataaatgttgtgaattagtcgaagatgtaata
tttggaaacttgacaacctatcacaaacattacctacagcttgcctgtcaaacattagct
agaagtaaaaagatcaagctatcatacatgaaaaatctggagacgcatattgatactgaa
aataataagggcgcatggttattaatctatataatagcccagtttgtacccaaaataaat
gcacaatttgttatcgattattgggaaaaacattcacagtcattaaaagatgaagaagaa
gatacgtttgaaagagtattaaatgtaatatgctatacagctgaacatctgttatctact
gttagactagatatgatagatgatttgaataacagattaaaaagatttgattcgccacca
ggattagtagctgtcatagttaaaacattatcaaagttgagtgaatgtcaagctacatct
gaaggagatacaacacgaagtcagaaagaaacttggggagtacaactgttaaaatcttgt
gatgaatatctttctaaagttatatttgaagacaaattagaaggtgaagtagatgaagat
aagatagtgtgttatttaagtactataggagaaatagttcaactctgtcctgctaaaaca
ccacaacgtatatatttattagtacaaagtatagtagcaggaagtgaattacccagtgaa
catcattctcaaatctctgatacttcacatacttcctctcaaaactcttcccagaactca
tcacaaagttcccagggtacacagcaagcaatacctccttcccaaccattttcacagttt
aaaggttttaatacatcaaatagagttcgcacctttgcatttatcacactaggtaaatta
cttttacaaaatgaaagactagctaagaaatgtatcccagctttagctcgtgaattagag
acctgtagtgatatagtattacgtaataatattgttattataatgtgtgatttgtgtata
aggtatacaactgtaattgatagttatgtaccaaatattgctgtttgtcttaaagatcgg
gctcctttgattcgtaaacaaactttaacattgctgacacgtttactacaggaagatttt
atcaaatggaaaggagttttattctttagatttattacgacattattagactcagactca
gatattcaagattttgctgagttctgtatgatcaatattttactacatagacaacctaat
atgttctttaatcattttattgaatgtatttttcactttaatggttacactgaaagttca
gtttacaataaatttacacagacggaccgggagaaatcattatttaatatgaaaggtgaa
catgctgccagtaagagattaaagttgtatttatttatgttagaacacacaaatgatcag
cacaaatttcaacttacttcaaaactctgtcaagatatactaggtggtgttgttgataat
attttaccattgaatgagaaatcattaccgttattaaaagattcattagctattttgagt
agcaaggaaataaagatatctagtatgaaagctaaaccgacagcacaagatgatgatgag
caacaaccagatatggctgccgttgtcttggcaactgctaaaaaacatcttataacacag
gtagttaagaaaaatgtaatagaaaatattgtaccaatagttacatcactaaaatatata
ctagaaaaggaaaaatcaccagttttaaaagatctcatgatttatttacaagttttaatg
aaagattttaaaacagaaattgaagaaattcttgcaagtgataaacagctattgaaagaa
ttgaattttgatataaaaagatttgaagaacaacaggaaaatgaaagtaataatataaca
acagatactataccaatggctagccagactggtacacctgtggctactcctgtaaccata
gtaacagaaccttccagtgacaataatacagacaccactgttaacagtccttctagaact
gacagtactacaactcagacatctactgtaggaactcctaaacaagacaaaataactgga
ccaagaccaccactgttgtcagcagccattttgaattcggctaaaaagaatattgagaga
ttaaaagagttaaaggaagctagaaatacacccagtaaaactaagaaaacacctaaagga
aaaacccccagtaataagagtaaaggtggaacaccagttagtgataaagaaaggagaaag
tctggtgtaacttgggctgatgaaaattctaaagatcccattggaagttcaagcaacact
aatgaggcttccagtacatcatcagcaactattcttattaaaacaccaaatcatcgtgta
acaagagctattagtaccccatcaggagctctaggaaatataacctttgctatagatcag
aatacatcaatgatacccttatcccctatagaaggtagtgatgaatcagctcttcaaatt
tctaaacaaccagaatttgatagtgatgatgttgtgtttttgatgtctccagaaagacca
ttaccaaaaccaaaaaaatggaatattaagagtgtgaaaactgaagcatcctga
DBGET
integrated database retrieval system