Lottia gigantea (owl limpet): LOTGIDRAFT_238600
Help
Entry
LOTGIDRAFT_238600 CDS
T03273
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K04859
voltage-dependent calcium channel alpha-2/delta-2
Organism
lgi
Lottia gigantea (owl limpet)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lgi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
lgi04040
]
LOTGIDRAFT_238600
Ion channels [BR:
lgi04040
]
Voltage-gated cation channels
Calcium channel, voltage-gated (Cav)
LOTGIDRAFT_238600
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
VGCC_alpha2
VWA_N
VWA
VWA_3
dCache_1
VWA_2
Cache_3-Cache_2
MCP-like_PDC_1
Sgf11
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
20250801
NCBI-ProteinID:
XP_009048997
JGI:
238600
UniProt:
V4B1U9
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1119 aa
AA seq
DB search
MAVRKKYRLLEMYSICVISVLISVVNCSKLPPSLDQVSEWGVELSTHLNFTVSRLSALNI
LQLNYQQASLIQNQGTDVHVNFEPVDSRSIVSDMSLSLSHMLGKKMDALKRSVEIAEKAA
GNHTWNQTLQKEDVEYFNANMPTDIPLAYNERFKQDVSFNLSSVHIPVEIYNGDIQILNG
LRWSASLDEIFEKNYEEDEEILWQYFGSQSGFMRTFPASRWIKHGDVDLYDVRRQSWYTQ
GSSSPKDMMILVDTSGSTHGQALQLMKVAVKSILDTLGENDFVNIASFSQEASFVSDCFN
HTSFVQANYRNKKKLARDVDGLVAYGMANFKVGLRFAFEQFQLFERNNTNGMGATCNKVI
MLLTDGGTDNAEDIFKEYNWPKNKSLKAEVRVFTYAVGPTANPTNAIRWMACANRGYFSQ
IPAMGAIRARVQGYTKYLATSFQYADVREHSTVITRDIREYIPVLSRPQVLKNVKQCKWG
NIYADHLGLGMMTTVTLPVYNKSEGSSNQTILGVMGIDVTTKDLEKKAPKNKLGPNGYAF
AINPNGYVIFHPNLRVSETYLEDPPDVDLLEVEINNPDKLKLRNKMIDEEDDKMEIRTLV
LSPSLKYVSWSNLTYAFTPIKNTSFSLGVSIPAYQSTYPKFLGNINSFNQSVFKTNNDYQ
RKIAPWDYYKNMSLFENMTQTVDDIYKLCLQKDSNDDNWNKELLYQLYWDLKVISSIDKY
YETIATDANTREDLEGLMIAFVATNGGLTQIYQHDKMENETFDSEELELDTWKADYYKRA
LNSEKFLFVPPEPQDVTKNYTDNPSIMVAHSISLRDLPYRIKYKPAVAGVKISHQKLQTE
MVAISAKRDKAFPFALHCNDTESLFCYLLDDGGFLVSTNQEELVPQVGQFFGNVDPSVMH
VLFNQSIYKRNRYFNYQASCIINTDKNVNAGPSAFKIPSINLFFDFLSVNWWSSKFSWLY
VNFNIYNWLVSETTTYAKEKEDKIVIKSCVKMMYQYYFGEKEKFEDKFHCDNCTRSVRAV
RLQVGNLLLVVTTPSCDECLDFYEPLPQHPIPVTEEIEDEAICSLSEEPRYRRHRMNCYD
EDEREDDTKCGSGSILLYSKSYLTILSLVLICLGQLLTS
NT seq
3360 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggccgtcagaaaaaaatatcgactgcttgaaatgtattctatatgtgtgatttcggtg
cttatttctgtcgtaaattgctcaaaattaccgccgagtttggatcaagtatcagaatgg
ggtgtggaattaagtacacatttaaattttactgtctccagattatcagctctgaatata
cttcaattgaattatcagcaagcatcattaatacagaaccaaggtacagatgttcatgtt
aattttgaaccagttgacagtcgatctattgtgtctgatatgtcattaagtttatcacac
atgctgggaaaaaagatggatgccttaaagagatcagtagaaatagcagagaaagcagca
ggaaatcatacctggaaccaaacattgcagaaagaagatgtagaatattttaatgccaac
atgccaactgatataccattagcatataatgaaagatttaaacaagatgttagttttaat
ctatctagtgttcatataccagttgaaatttacaatggagatatacagatattaaatgga
ttaagatggtcagcttcactagatgaaatatttgaaaagaattatgaagaagatgaagaa
atattgtggcaatattttggaagtcaatctggtttcatgagaacatttcctgctagtaga
tggataaaacatggagatgttgatttgtatgatgtaagacgccagtcttggtatacacaa
ggatcaagttcacctaaagatatgatgatattagttgatacgagtggaagtacacatggt
caagccttgcagttgatgaaagttgctgtgaagtctattctagatactcttggtgaaaat
gattttgtcaatattgcttctttttctcaggaagcttcatttgttagtgattgttttaat
catacttcatttgttcaggctaattatagaaacaaaaagaaactagctagagatgtagat
ggattggtagcctatggaatggccaattttaaagttggattacgctttgcttttgaacaa
tttcaattgtttgagagaaacaatactaatggtatgggagctacctgtaataaagttatt
atgttattaactgatggtggtacagacaatgctgaggatatttttaaagagtataactgg
cccaaaaataaatcattgaaagctgaagtaagagtatttacgtatgctgtaggaccaaca
gctaatcctactaatgctattagatggatggcttgtgccaatagaggttatttttctcag
atccctgctatgggagccattagagctagagttcagggttatacaaaatatctagctaca
agttttcagtacgctgacgtgcgtgaacactctactgtcataactcgcgatattcgagag
tacataccagtattatctcgacctcaagtgttaaaaaacgttaaacaatgtaaatggggc
aacatatacgctgatcatctgggcctaggaatgatgactactgtaactctacctgtttat
aacaaatcagagggatcgtctaaccaaactatattaggtgtaatgggaatagatgtgaca
actaaagatttagagaagaaagcccctaaaaataagctgggaccaaatggctacgccttt
gctattaatccaaatggttatgttatttttcatcctaatcttagagtcagtgaaacttat
ctagaagatccaccagatgttgatttattagaagtagagattaataatccagataaatta
aagttaagaaataagatgatagatgaagaagatgataaaatggaaataaggacactagtt
ttatcacccagtttgaaatatgtcagctggtcaaatttaacatatgcttttaccccaatc
aaaaatacatccttcagtttgggtgtttctataccagcttatcaatcaacttatcccaag
ttcttaggcaacatcaactcattcaatcaatcagtgtttaaaactaacaatgattatcag
aggaagatagctccatgggattactataaaaacatgagtctatttgagaatatgacacaa
actgttgatgatatttataaattatgtttacagaaagattccaatgatgacaattggaat
aaagagttgttgtatcagttgtactgggatttaaaagttataagtagtattgataaatat
tatgagacaattgctactgatgctaatacaagagaagatttggaaggattgatgattgca
tttgtagcaacaaatggtggccttactcagatctatcaacatgataaaatggaaaatgaa
acatttgattcagaagaacttgaattagacacttggaaggcagattattataaaagagcc
ttgaattcggaaaagtttttgtttgttcctccagaaccacaagatgtaactaagaactac
acagacaatccttctattatggtggctcattccatatctcttagagatttaccttataga
atcaaatataaaccagctgtggctggagtaaagatatcacatcagaaacttcaaacagaa
atggtggctatatctgctaagagagataaggcatttccattcgctcttcattgtaatgat
acagaatctctgttctgttatttactggatgatggaggctttttagtctcaactaaccag
gaagaacttgtaccacaggttggacagttttttggcaatgttgatccaagtgtgatgcat
gtcctgtttaatcaatctatatataaaagaaaccgttattttaattatcaagcatcctgt
attatcaatacagataaaaatgttaacgctggaccatctgcttttaaaattccctccatt
aacctgttttttgattttctctctgtgaattggtggtccagtaaattttcatggttatat
gtaaatttcaacatctacaactggttggtttcagaaacaactacctatgcgaaagagaaa
gaagataagatagtcattaagagttgtgttaaaatgatgtatcagtattattttggtgaa
aaagagaaattcgaagataaatttcactgtgataattgtacaaggtctgtacgagctgta
agactacaagttggtaatttattattagtagtaacaacaccttcctgtgatgaatgtcta
gatttctacgaaccattaccacaacatcctatacctgtcactgaggaaattgaagatgaa
gctatttgctcactgtcagaagagccaagatatcgtagacatcggatgaattgttatgat
gaagatgagagagaagatgacacgaaatgtggtagtggttctatattattatattctaaa
tcatatttaacgatattatctttagttttaatttgtctaggtcagctcttaacgagttga
DBGET
integrated database retrieval system