Pseudoleptotrichia goodfellowii: JCM16774_0236
Help
Entry
JCM16774_0236 CDS
T06508
Name
(GenBank) autotransporter beta-domain protein
Organism
lgo
Pseudoleptotrichia goodfellowii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_C97
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBM35329
UniProt:
A0A510J7U5
LinkDB
All DBs
Position
256613..263617
Genome browser
AA seq
2334 aa
AA seq
DB search
MSNELTRLEKELRNFAKRCKNIKYTGGLLLSFLFAGMLTFSVNVDSNIVNARKDLNTSIN
DLHVSFKQTKRENNRLLKNANLELIQLMEQGDHVVKSPWSSWQIGMNYFYSNWRGAYKGR
GDKAQKYPYEGIFERSTNAFERYTSPLSPSYEELNGMSNIRNGLNQGYGIASTTPKQEPL
AILNVDASIKPKDVFRDAVNAPTVSVQAPNLPPLNVPSLTPPPVSVPTPNVPEKTVSIVK
PNASPFTGFFFDGSANAITKDNSQGLIPTGADVTYVATQGVTLYSGVEPSDINANKSADQ
MTPAAKTGYIKSDRTIVDVSNTNTSQGNKVGRTTNILYRSGYTNGTPLTLKDLTLHVRGN
FDGTDSGGTGTGPTDSYTDVGRGAEGGADTGGPTRGTMGIHTLLNVNIENATANLYGRAG
FVTSETWRNGVVNIVGNNNKVNVYGSENSVFYIMPSAYGTITYGYSNSNRWAFYLGKITG
KTNIDIFGTGNNVYLSSGISGARHIENDGVINSYGASNIVYSGMSYVPDWSKSAYQTMGP
HPDKMQSKIQLSKVNLYGDENVGMFFGSKMGGNNPKSWEPGHRISEDGAGYIRKASYIGI
YQGEIDFAAKIGTQLGANASDTAQASVGNLTGNSDKWVEGGVGVFAQSGQREGIDPIKDL
GVPSGLGGDYAQAPTIANDKIHALQVRKLDITFGKNSKNGFMLISKLGSVIDVGNPASSN
DYVTGISSTITDGVNGANTNETDASTGTVIAYAEGTWDQAKHQLGSKAAEKTQNDNDAVA
VNNGTARKPLTDIAASTAAKLQGLASEINVYPDVVLASKEGIAYMGDNQGIVNAKKTTVA
VSHSAIIGFARNKGTVNIDGDITALDAKVTNADDKYKNIAGLATLNTTALSGATVGGTVN
INGNVNVNGMGALASGNGSTVNLNKTGNIINIGKEGGLAAVKGGKVNFAGGTINVGADRS
SSTPVYADEDPNSSVTFKDGATPTSKPTTINMSSGILMTGEDTDYSAAATGVGKYKGMKN
VKVVLQADGVVLKTSNGKTVTWNGSTAGSTAVKNAMKLGELDTNNKKFKIFYINGTFNLA
TNLNLDDATDEFNKSLGLSNEVFNIGSGVTVSSAAGKGLAMGSNDTATSNASNAYNNDGT
INITSGTANTSALNISYGTVDNRNIINVDKGIGVYGINGSRLVNNTNGTITVGTEGVGMA
GFSSASTLQIYGTDKKIKDGTLASTDKTLELLNKGTITVNGNNSVGMYGETNKAAGAHAS
TNIAASNGLITNSGKITMTGDNAVGIVSKGFGNKIDLSGTGSSDIVTGVNGIGVYAEKSN
INLLSNYGMEVKDQGTGIFVKDGSSVSAGTLELKYNGSNTGTGVGIFYEGSSTANMLNKT
NVNLVDNTGTTGGLVGLFANNGGILTNTGNIAGDKGYGIITSETEIVNNGNITLNNPVDN
ATKKASVGIYTQGSDKITNNGIITAGENSVGIFGYTVVNTSTVNVGNGGTGIYSTGGNVD
LLLGAINTGTNKAVAVYTKGNGQTVTAHNGSTLNIGDNSFGFINEGTGNTINSNISSQSL
GTDTVYIYSTDRTGTVTNNTALTSTGSYNYGMYSAGTVTNNADINFGAGLGNVGIYSTHG
GTATNSAGRTITIGKSFIDPDDVEKNRYGVGMAAGFTPTDLERLAGKTDYTGNIVNNGTI
NVTGQYSIGMYGTGAGTKVYNGTAIGSVATINLGASNTTGMYLDNGAYGYNYGTIKTVGT
GLEKVAGVVVRNGSTIENHGDIILDAKSAVGLLAKGDVLGNNLGIIKNYKNMTITGEGSV
NQQEDTNNSSFGKGMGGVSIDVPKGSSTGTINVNGKPVVPTLATTTREEYQDMNVSRIGM
YIDTSNKRFTRPIAGLSNLSSLRKADLIIGVEAAKNTTSKYIQLDKKILDPYNDMIKRNT
QIKDWKIYSGSLTWMATVAQNQTDGTMENAYMAKIPYTQWAGKEPMPVEVTDTYNFLDGL
EQRYGVEGLGMREKTLFDKISSIGKNEQRLFYQAIDEMMGHQYANVQQRIHGTGVLLDKE
FTHLRKEWDTKSKQSNKIKVFGMRDEYKTDTAGIINYTSNAYGFAYLHEDETIKLGNSSG
WYAGAVNNSFKFKDIGGSKENTTMLKLGIFKSTAFDNNGSLKWTVLGEGYVARTSMHRKY
LVVDEIFEGKSDYNSYGAAIKNEISKEFRTNERTSIKPYGSLKLEYGRFNTIKEKTGEVR
LEVKGNDYYSVKPEVGIEFKYKQPMAVKTTFVTTLGLGYENELGKVRDVKNKGRVAYTDA
DWFNIRGEKDDRKGNFKADLNIGIENQRFGVTLNGGYDTKGKNVRGGLGFRVIY
NT seq
7005 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgagtaatgagctgacaagattggagaaggaattgagaaattttgccaaaagatgtaaa
aatataaaatacacaggcggacttcttttgagttttctttttgcaggaatgcttactttt
tctgtaaatgttgacagcaatatcgtaaatgcaagaaaagatttgaatacgtcaataaat
gatttacatgtgtcatttaaacagacgaaaagggaaaataacagattgttgaaaaatgcc
aatttggaattgattcaattaatggaacagggagaccatgtggtaaaatctccgtggagc
agctggcaaatagggatgaactacttctacagcaattggagaggggcatataaagggaga
ggtgataaagcccaaaaatatccttatgaaggaatatttgaaagaagtaccaatgctttt
gaaagatacacatctcctttaagtccgagttatgaagagttaaacggaatgtcgaatata
agaaacggattaaatcagggatacggaatagccagtacaactccgaaacaggaacctctg
gcaattttaaacgtggatgcttcaataaaacccaaagatgtattcagagacgcggtaaat
gcaccgacagtcagtgtgcaggctccaaatctgccaccgttgaatgtacccagtttaaca
ccgccccctgtcagcgttcctactcctaatgtaccggaaaagacagtaagtattgttaaa
ccaaatgcaagtccgtttactggtttcttttttgatggaagtgcaaatgctattactaaa
gataatagccaaggtttaatacctaccggagctgatgtaacatatgttgcaacacaaggt
gttacactatattccggagtggaaccgagtgatataaatgcaaataaatctgcagatcaa
atgacacctgctgcaaaaacaggttatataaaatcagacagaactattgtggatgtttct
aatacgaatacatcccaagggaataaagttggccgtacaacaaatattttatatagaagc
ggatacacaaatggaactcctcttacattgaaagatttaacactgcatgttagaggaaat
tttgacggaactgatagcggaggaacaggaacaggcccaactgacagttatacagatgtc
ggccgtggagcagaaggaggagcagatacaggaggtcctacccgtggaacaatgggaata
cacactttattaaatgttaatatagaaaacgccactgcaaatctatacggaagagccgga
tttgtaacttctgaaacttggcgtaacggtgttgttaatatagtaggaaataataataaa
gtaaatgtatacggttcggaaaactcggtattctacataatgccttcagcttacgggaca
ataacttatggatatagcaattctaatagatgggctttttatcttggaaaaattacagga
aagactaatatagatatattcggtaccggaaataatgtctatctgtcttcaggaatatca
ggggcaagacatatagaaaatgatggagtaatcaattcttatggagcttcaaatatagtt
tattcaggaatgagctatgttccggactggtcaaaatcagcttaccaaactatgggacct
catcctgataaaatgcaatcaaaaatacaactatcgaaagttaatctttacggagatgaa
aatgtcggaatgttttttggtagcaaaatgggaggaaataatcctaaatcttgggaaccc
gggcatagaatctctgaagatggtgcaggttatataagaaaagcctcatatataggaata
tatcagggagaaatagattttgcggctaaaatagggactcaattaggagctaatgcaagt
gatacggcacaagcttcagtggggaacttaacaggaaatagtgataaatgggttgaaggc
ggagttggagtatttgctcagtcagggcaaagagaaggaatagatcctataaaagattta
ggagtaccttcaggacttggaggagattatgcacaagcaccaacaattgcaaatgataaa
attcatgcactgcaagtaagaaagttggatataactttcggtaaaaattctaaaaacgga
tttatgctaatttcaaaattaggaagtgtcatagatgtcggaaaccctgcttcttcaaat
gattatgtaacaggtataagttctacaattactgatggagttaacggtgccaatacaaat
gaaactgatgcttcaaccggaacagttatagcctatgctgaaggaacttgggatcaggca
aaacatcaattaggctctaaagctgcagaaaaaactcaaaatgataatgatgcagtagct
gtaaataatggaacagccagaaaaccgttgacagacattgctgcttcaacagcagctaaa
ctccagggactggcttctgaaataaatgtctaccctgatgtagtcttagcttctaaagaa
ggaattgcatatatgggtgataatcaggggattgtcaatgccaaaaagacaacagtagcc
gtaagtcacagtgcaattataggatttgcaagaaacaaaggaacggtaaatattgacgga
gatattaccgcattggatgcaaaggtcactaatgctgatgataaatataaaaatatagca
gggttggcaacattaaatacaactgcattatcgggagcaacagtaggtggaacagttaat
ataaacggtaacgtaaatgtaaacggtatgggtgcacttgcttcaggaaacggttcaaca
gtaaacttaaataagacaggaaatataattaatataggtaaagaaggcggacttgctgca
gtaaaaggaggaaaagtcaattttgcaggaggaacaataaatgtgggagctgatcgttcg
agttccacacctgtgtacgcagatgaagatccgaattcatctgttacttttaaagacgga
gcaactccgacaagtaaaccgactactataaatatgtcaagcggtattttaatgacagga
gaagatactgattattctgctgcagcaacaggtgtcggaaaatacaaaggaatgaaaaat
gttaaagtagtattacaggcagacggagtagttttaaaaacaagtaacggtaaaacggtg
acttggaacggttcaacagcaggatcaacagccgtaaaaaatgcaatgaaacttggagaa
ttagatacaaacaataaaaagtttaaaatattttatataaacggaacttttaatctggca
actaatttgaatcttgatgatgctactgacgaatttaataaaagtttaggtttgtctaat
gaagtgtttaacataggaagtggagttactgtaagttctgcagcaggaaaaggactcgca
atggggtcaaatgatacggcaacttccaatgcaagtaatgcgtataacaatgacggaaca
ataaatataacaagcggaacagcaaatacatcagctttaaatatcagctacggaactgtt
gataatagaaatataataaatgttgataaaggaataggagtttacggaataaacggaagc
agacttgtaaacaatactaacggaacaataactgtcggaactgaaggagtaggtatggca
ggattttcatcagcctcgactttacagatttacggaactgataaaaaaataaaagacggt
acgttggcttcgacagacaaaactttggaattgttaaataaaggaactattaccgtaaac
ggaaataattctgtaggaatgtacggagaaacaaataaagctgcaggagctcatgcaagt
acaaatatagcggcaagtaacggacttataacaaatagcggtaaaattactatgacgggt
gataacgctgtcggaatcgtatccaaaggattcggaaacaaaattgatttaagcggaacg
ggaagctcggatatagtaaccggagtgaatggaataggagtgtatgctgaaaaatccaat
atcaatttattgtcaaattacggaatggaagtaaaagatcagggaacaggaatttttgta
aaagacggcagttctgtaagtgcgggaactttagaactgaaatataacggttcgaataca
ggaacaggagtaggaatattctacgaaggttcgtcaactgcaaatatgcttaacaaaacc
aatgtaaatcttgtagataatacaggaacaacaggaggactggtaggtctgtttgcgaat
aacggaggcattttaacaaatacaggaaatattgcgggagataaaggatacggaattatt
acaagcgaaactgaaatagtaaataacggtaatataacattgaacaatcctgtagacaat
gcaactaaaaaagcgagtgtaggtatttatactcaaggaagtgacaaaataacaaacaac
ggaataataactgcaggagaaaactctgtagggatattcggatacactgtagtaaataca
agtactgtaaacgtagggaacggaggaacgggtatttacagtacgggaggaaatgttgat
ttgcttttgggtgcaataaatacaggaacaaataaggctgtggcagtttatacaaaagga
aacggacaaacagtaacggctcataacggaagtactttgaatataggagataattcgttc
ggatttattaatgaagggacagggaatacaataaacagtaatatttcaagtcaatcgttg
ggaactgacacagtttatatttattcgactgacagaacaggtacggtaacaaataatacc
gcattgacttcaacaggatcctataattacggaatgtattcggcaggtacggtaacaaac
aatgccgatataaatttcggagcaggattgggaaatgtaggaatatacagtacacatggc
ggaacggcaacaaactcggcaggaagaacaattacaataggaaaatcatttatagatcct
gatgatgtagagaaaaaccgttacggagtgggaatggcagcaggatttacaccgactgat
ttggaaagactggcaggaaaaaccgattatacaggaaatatagtaaataacggtacgata
aatgtaacaggacaatacagtatcggaatgtatggaacaggagctggaacaaaagtttat
aacggtactgcaatcggttccgttgcgacaataaatctcggagcaagtaatactacggga
atgtatctggataatggagcatacggatataactacggaactataaaaacagtcggaacg
ggactggaaaaagtagcgggagttgttgtcagaaacggttccacaatagaaaatcacgga
gatataatactggatgctaaatcggcagtgggattattggctaaaggagatgttttagga
aataatttaggtataattaaaaactataaaaacatgacgataacgggagaaggctcggtc
aatcagcaggaagatactaataacagcagtttcggtaaaggaatgggaggagtttccata
gatgtaccgaaaggttcaagtacaggaacgataaacgtaaacggaaaacctgtagtaccg
acattggcaacgactactcgggaagaatatcaggatatgaatgtctcaagaatagggatg
tatatagatacctcaaataaaagatttacaagacctatagccggattgagcaatctcagc
agtttaagaaaagccgatttgataataggagttgaagctgctaaaaatactacaagtaaa
tatattcagctggataaaaaaatactggatccgtataacgatatgataaaaagaaataca
caaataaaagattggaaaatatattcgggatcgcttacatggatggcaactgtagctcaa
aatcagactgacggtacaatggaaaatgcttatatggctaaaataccttatactcagtgg
gcagggaaagaaccgatgcctgtggaagtaaccgatacgtataatttccttgacggattg
gaacaaagatacggagtagaggggttaggaatgagagaaaaaacattgtttgataaaata
agcagtataggaaaaaatgagcagagattattctaccaagctatagacgaaatgatggga
catcagtatgcaaatgtgcagcaaagaatacacggaacaggagtattgttggataaagag
ttcactcatttaagaaaagaatgggatactaaatcaaaacaatcgaacaaaataaaagta
ttcggaatgagagatgagtataaaacagatactgcaggaataataaattacacaagtaat
gcttacggatttgcatatttacatgaagatgaaacaattaagcttggaaacagttcagga
tggtatgcaggagctgtaaacaacagctttaaatttaaagatataggcggatcaaaagaa
aatactactatgttaaagttgggaatatttaaatcaacagcttttgataataacggaagc
ttgaaatggacagttttgggagaaggctacgtagcaagaacaagtatgcacagaaaatat
ttggtagtagatgaaatctttgaaggaaaatccgattataacagttatggagcagcaatt
aaaaatgaaataagcaaagaattcagaacaaatgaaagaacaagtataaaaccttacggg
agtttaaaacttgaatatggaagatttaatacaatcaaagaaaaaacaggagaagtaaga
cttgaagtaaaaggaaatgattactattctgtaaaacctgaagtcggaatagagtttaag
tataaacaaccgatggctgtaaaaacaacttttgtaacaactcttggattaggctatgaa
aatgagcttggaaaagtgagagatgttaaaaataaagggagagtggcttataccgatgca
gactggttcaatataagaggagaaaaagacgacagaaaaggaaactttaaagcggacttg
aatatcggaatagaaaaccaaagattcggagtaacattaaacggaggttatgacacaaaa
ggtaaaaatgtaagaggaggattagggtttagggtgatttattaa
DBGET
integrated database retrieval system
