Pseudoleptotrichia goodfellowii: JCM16774_0575
Help
Entry
JCM16774_0575 CDS
T06508
Name
(GenBank) fusobacterium outer membrane protein
Organism
lgo
Pseudoleptotrichia goodfellowii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBM35650
UniProt:
A0A510J8L6
LinkDB
All DBs
Position
542002..548301
Genome browser
AA seq
2099 aa
AA seq
DB search
MSNNLKKMEKDLRAFAKRSKDVKYTKGLLFSFLLMGMLTFSDTLTSPEVKSTENAINQTR
KELNTSINDLHVAFKQAKRDNNRLLKRANLELIQLMEQGDHVVKSPWSSWQMGMNYFYSD
WRGTYKGRGDKAEKYPYEGIFQRDKDEFNRYIAPNSENYGLLPTSTNPRSAASNQRTNLN
GYGIASTQPVPEPPAVTEVNAGINPKSVNKVPLNIAAKTANSPTLPEAVKFAPIDPKIVI
PADPDLPEAPKFSVVLGADCNEGCDSSASTPRQNTKGNFLGSEENQSKQNIDTILHYTWP
NNTGAEKSYAFKMYKEGDTTNLPAPSSGNTYYFNSYNFGGTKEFANGVVASQGDNKNNQR
FFIGGSRFWEIDNISSGTFEFPNGKKLNLGGILTLGLVSQENGTELKNSGTITDEEEKDE
KWIKEMPYDPGKDYLTIKGPTEDYKVKRSGEGYVGYKVGIAQVQENGSNSYGAINQKMTN
SPTGKINFFGERSIGMYVYLPGSTTYAIMKNEGEINLRGSESYGMKIAAKSADRAEMVNA
STGKITLGKNGKDSASNSIAMALTADNTVANGVSLKRGNARNEGTITLKDVQNSIGTYVN
VDSNITNTSTGKININSTIAKLTEAEKNAGKKQAFNMGMRADSHAGAEIINNGEITIDGS
YAIGMLAKGSKLVNTKTISSTNVKNGIGIVGMNGATVENRGTVKVVGTGNTNNIGVLINS
GSTGTVGTMAPGASAPSVEVSGDNSTGVLVTGAGSSLTLKGNVKVSGNSITGIVADGTNV
KLEDDATVTVDDNGSEAGEIDKKGSYGIVVRGSAGKFEGTGTTVNAKVKTDKSIGLYSEG
NLTVKKANITATDGAINFFAKDGKINITGGGTTVTGQKSLLFYTSGTGKVTLGGAMTSTI
KGGTTPNTRGTAFYYVSPTRYGTFDKTAIQNYFNNTFGNGTSTLNNLTLNMEQGSRLFVA
SNVGMNLSDTSATNLMSGITNAPTINGSNYKTFMLYLSKLTINQPVDLNDSNSNYAQLEI
ANSSIDNANQMTGSQNRQVAMAQENGNDTSGNGYNPGEVTLTNTATGTINLTGEETTGIY
AKRGIIRNEGTISVGKKSTAIYLVEDDRGPADGSKAANDATGTIKLGENSTGIFYKVNSA
GTHTGTAGGVSNAGRIESTANNVTGISIDNPHSTARIFRNESSGVIDLQGQESTGIFATG
TGTYEASNEGKINLASSTNINKPNIGMYTDKSSITLNNNGTITGGNKTVGIYGYNVNLGS
TSVAKTGTGGTIVYSKGGNVVANGKLSVGEDGAEGANDAVGVYYVGQGGTVTSNASEINI
GNSAYGFVIQNEHGAGVTLTTNTANVTLKNDSVYSYSNNRAGTVINNTVLNSTGNGNYGI
YSAGTVTNNRDINFGTGIGNVGMYSIFGGTGTNNATITVGASDTAREKFGIGMAAGYKTR
DSANIINSPTGVINVNGKNSIGMYATGASSTAINKGTINLRGENSVGMYLDNGATGINEG
TITTVGSPKGAKGVVLSNNSKLINRAGAKININSAEGFGIYRVNSEETNITIANYGDITV
SGGATASGKFDPTGGKELEKTAGGVTLKAPKGTTDVNITSKGKPVPNVEKITDPIGHRGN
ALISRLGMYVDTLRGTNPINGLEKLNVKKAELLYGVEAAQNSNSKYFEVSGKILKPYQDA
VKKATGMKWSHNSASFTWMALPSVDGNGVPLKVGMAKIPYTEFAGKKPTPVEVTDTYNFL
DGLEQRYDKNALESREKLLFNKLNGIGKNEAVLFYQAVDEMMGHQYANVQQRIYGTGRMI
DKEISHLSKEWDTKSKQSNKIKLFGMRDEYNTDTAGVIDYTSNAYGIAYLHEDETVKLGN
RSGWYAGAVYNRFKFKDIGRSEENQTMLKLGIFKTMSPVADHNGSLQWTISGEGYVSRND
MHRKYLVVDEIFNANSDYTTYGVAVKNELGYNIRTSERTSIRPYGSLKLEYGRFNTIKEK
TGEVRLEVKGNDYYSVKPEVGIEFKYKQPMAVRTTFTTTLGLGYENELGKVGNVKNKGRV
AYTDADWFNIRGEKDDRRGNFKADLNLGIENQRFGVTLNAGYDTKGKNIRGGLGLRVIY
NT seq
6300 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaataatttgaagaaaatggaaaaagatttaagagcttttgctaaaagatcaaaa
gatgtaaaatatacaaaaggtcttctattcagctttctattaatgggaatgttgacattt
tccgatacattgacatcacctgaagttaagagcacagaaaatgctataaatcagacaaga
aaagaattgaatacatcaataaacgatttacatgtggcgtttaaacaggccaaaagagat
aacaacagattattgaaaagagcaaatttggaattgattcagttaatggaacagggagac
catgtagtaaaatcaccatggagcagctggcaaatgggaatgaactacttctacagtgac
tggagaggaacttacaaaggtagaggagataaggcagaaaaatatccttatgaaggtata
tttcaaagagataaagatgaatttaatagatatatagcaccgaacagtgaaaattatgga
ttattacctacatcaactaatcctagatctgctgcttctaatcaaagaacaaatttaaat
ggctatggtattgctagtactcaacctgttcctgaaccacctgctgtaacagaagtaaat
gctgggataaatcctaagagtgtaaataaagtgcctttaaatattgctgctaagactgca
aactcaccaacattgccagaagcagtaaaatttgcacctatagatccaaaaatagttata
cctgctgatccagatttaccggaagcacctaaattttcagtagtactaggagcagactgt
aatgaaggatgtgacagttctgcttctacacctagacaaaatacaaaaggaaactttcta
ggatcggaagaaaatcaaagtaaacaaaatatcgatacaatcttacattatacttggcca
aataatacaggtgcagaaaaatcctatgcatttaaaatgtataaagaaggagatacaaca
aatttaccagctccttcaagcggaaatacatactattttaattcatataattttggtgga
acaaaggaatttgcaaatggtgttgtggcttctcaaggagataataaaaataatcaacgt
ttctttataggagggtccagattctgggaaattgataatattagctcagggacattcgaa
tttccaaatgggaaaaaattaaatcttggtggaattcttactcttggtcttgtatctcaa
gaaaatggaacagaattaaaaaattctggaacgataactgatgaagaagaaaaagatgaa
aaatggattaaagaaatgccttatgatcctggaaaagattatttaactataaaaggtcca
acggaagattataaagtaaaaagaagtggagagggatatgtaggttacaaggttggaatt
gcacaagttcaagaaaatgggtcgaattcatatggtgcaatcaatcaaaaaatgacaaac
tctccaacaggaaaaattaatttctttggagaaagatctattggtatgtatgtatactta
ccaggaagtacaacttatgcaataatgaaaaatgaaggagaaattaatctaagaggaagc
gaaagctatggtatgaaaatagctgcaaagtctgctgacagagcagaaatggtaaatgcc
tcaacaggaaaaattacattaggtaaaaatggtaaagatagtgcaagtaactcaattgct
atggcattaactgctgataacactgttgctaatggcgtaagcttaaaaagaggaaatgca
agaaatgaaggtacaataacattgaaagatgttcaaaattcaataggaacatatgtaaat
gtagattctaatataacaaatacttctaccggtaaaattaatattaattcaactatagca
aaattaacagaagctgagaaaaatgccggaaagaaacaagcttttaatatgggaatgaga
gcagattctcatgcaggtgcagaaattataaataatggagaaataactattgatggatct
tatgctattggaatgttagctaaaggttctaaattagtaaatactaaaacaataagcagt
acaaatgtaaaaaatggtataggtattgtaggtatgaatggagcaactgttgaaaacaga
ggaactgttaaagttgttggaacaggaaatactaacaatataggagtacttataaattct
ggttctacaggaactgttggaacaatggcaccaggagccagtgcaccatcagtagaagtt
tcaggagataattctactggagttcttgtaacaggtgctggcagttcattaactttaaaa
ggaaatgtaaaagtatctggaaatagtataacaggtatagtggcagatgggaccaatgtt
aaattagaagatgatgcgactgtaacagttgatgataatggctcagaagcaggagaaata
gataaaaaaggctcttatggtatagttgtaagaggctcagcaggaaagtttgaaggaact
ggtacaacagttaatgcaaaagtaaaaacagataagtctataggattgtattctgaagga
aacttaactgtaaaaaaagctaatataactgcaacagatggtgcgataaatttctttgca
aaagatggaaaaataaacataacaggtggaggaactactgtaacaggacaaaaatcatta
ttattttatacaagtggaactggaaaagttactcttggtggagcaatgacatcaacaata
aaaggtggaactactccaaatacaagaggaacagctttttattatgtatctccaacaaga
tatggaacttttgataaaacagctattcagaattattttaataatacttttggtaatgga
acaagcacattaaataatttaacattaaatatggaacaaggttcaagattatttgttgct
tccaatgttggaatgaatttgtcagatacatcagcaacaaatttaatgtcaggtataaca
aatgccccaacaataaatggttcaaattataaaacattcatgttgtatttgagtaaatta
actataaatcaacctgttgatttaaatgattctaatagtaattatgcacagttagaaatc
gcaaattcatctattgataatgctaatcagatgacaggaagccaaaatagacaagttgcg
atggcacaggaaaacggaaatgatacaagtggaaatggatacaaccctggagaagtaacg
cttacaaatacagcaacagggacaataaatcttactggagaagaaacaacagggatatat
gcaaaaagaggaattataagaaatgaaggaacaataagtgtaggtaaaaaatctacggct
atatatcttgtagaagatgacagaggtcctgcggatggatcaaaagctgcaaatgatgca
acaggaacgataaaattaggagaaaattcaactggaatattctataaggtaaattctgca
ggtacacacacaggaacagcaggaggagtgtctaatgcaggtagaatagaatctacagca
aataatgtaacaggaatatcaattgacaacccacatagtacggcaagaatattcagaaat
gaatcatcaggagtgatagacttacaaggacaggaatcaactggaatatttgcaacagga
acaggaacatatgaagcatcaaatgagggtaaaataaaccttgcatcatcaacaaatatt
aataaacctaatataggaatgtacactgataaatcatcaataacattaaataataatggt
acaataacaggtggaaacaagacagtaggaatatatggatacaatgtcaatcttggaagt
acttcagttgctaaaacaggaacaggaggaacaatagtatattcaaaaggtggaaatgtt
gttgcaaatgggaaactttcagtaggagaagatggagcagaaggagcaaatgatgcagta
ggagtttactatgtaggacagggaggaacagtaacaagtaatgcaagtgaaataaatata
ggaaatagtgcatatggatttgttatacaaaatgaacacggtgcaggagtaacattaaca
acaaacacagctaatgtaacactaaaaaatgattcagtttattcttattcaaataataga
gcagggacagttataaacaatacagttttaaattctactggaaatggaaactatggaatc
tatagtgcaggaacagttacaaataatagagatataaattttggaacaggtataggtaat
gtaggaatgtatagtatatttggtggaacaggaacgaataatgcaactataacagtagga
gcctctgatacagcgagagaaaaatttggaataggaatggctgcaggatataaaacaaga
gactcagcaaatataataaatagccctacaggagtaataaatgtaaatggtaagaacagt
attggaatgtatgcgactggagcttcatcaactgcaataaataaaggtacaataaatctt
agaggagaaaattcagtagggatgtatctggataatggagcaacaggaataaatgaagga
acaataacaactgttggttctcctaaaggagctaaaggagtagttttaagtaataattcg
aaattgataaatagagcaggagctaaaattaatataaattctgcagaaggatttggaata
tacagagtaaattctgaagaaacaaatattactatagcaaactatggagatataacagta
agtggtggagcaacagctagtggaaagtttgatccaacaggaggaaaagaattagagaag
acagcaggaggagtaacattaaaagcacctaaaggtactacagatgttaatataacatca
aaaggaaaacctgtaccaaatgttgaaaaaataactgatccaataggacatagagggaat
gctttgatatcaagattaggaatgtatgttgatactttaagaggaactaatcctataaat
ggattagagaagttaaatgttaaaaaagctgaattattatatggagtagaagctgcgcaa
aattcaaactctaaatattttgaagtttctgggaaaattttaaaaccatatcaggatgct
gtaaaaaaagcaacaggaatgaaatggagtcataattctgcttcttttacatggatggca
ttaccttcagttgatggaaatggagtacctttaaaagttggaatggcaaaaataccatat
acagaatttgctgggaaaaaaccaacaccagttgaggtaactgatacatataatttctta
gatggtttagaacaaagatatgataaaaatgctcttgaatctagagaaaaattattattt
aataaattaaatggaataggaaaaaatgaagcagttctattctatcaggcagtagatgaa
atgatgggacaccagtatgcaaatgtacagcagagaatatatggaacaggaagaatgata
gataaggaaatcagtcatctgtctaaagagtgggatactaagtctaaacagtcaaataag
ataaaactatttggaatgagagacgaatataatacagatacagcaggagtaatagattat
acaagtaatgcatatggaattgcatatctgcatgaagatgaaacagttaaacttggaaac
agatcaggatggtatgcaggagcggtatataacagattcaagttcaaggatattggaaga
tcagaagaaaatcagactatgttaaaacttggaatcttcaagacaatgtcaccggtagca
gaccataacggaagtcttcaatggacaatatcaggagaaggatatgtatcaagaaacgac
atgcacagaaagtatcttgtagttgatgaaatcttcaatgcgaattcagactatacaaca
tatggagtggcagttaagaacgaacttggatataatataagaacaagtgaaagaacaagc
ataagaccatacggaagtttaaaacttgaatatggaagattcaatacaataaaggagaaa
acaggagaagtaagacttgaagtaaaaggaaatgattattactctgtaaaacctgaagta
ggaatcgaattcaaatataaacaacctatggcagtaagaacgacatttacgactacatta
ggtttaggatatgaaaacgaacttggaaaagtaggaaatgtaaaaaataaaggaagagtg
gcatatactgatgcggactggtttaatataagaggagaaaaagacgacagaagaggaaac
tttaaagcggatttgaacctcggaatagaaaatcagagattcggagtaacattgaatgca
ggatatgacacaaaaggtaaaaacataagaggcggattaggacttagagttatttactaa
DBGET
integrated database retrieval system
