Pseudoleptotrichia goodfellowii: JCM16774_1937
Help
Entry
JCM16774_1937 CDS
T06508
Name
(GenBank) outer membrane protein
Organism
lgo
Pseudoleptotrichia goodfellowii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBM36991
UniProt:
A0A510JF09
LinkDB
All DBs
Position
complement(1949815..1956078)
Genome browser
AA seq
2087 aa
AA seq
DB search
MSNNLKKMEKDLRAFAKRSKDVKYTKGLLFSFLLMGMLTFSDTLTSPEVKSTENAINQTR
KELNTSISEMHTAFKQAKRENNRLLKRANLELIQLMEQGDHVVKSPWSSWQMGMNYFYSN
WRGTYKGRGDKAEKYPYEGILERDSNEFNRYVSPDSKFYGSLPTSSNPRSAASNARQGLS
TQYGIASTQPVPEPIVDLQLSAGINPKIVNKADLNLVPKSANVPNLPEPVKFQPINPKIT
IPADPPLPTPPNFAIVLGGDCNSGCDSYDWRNGGGTTPRQNTKSGFTPPAGTNQNVTNIL
HYTWRDGLATPAERSYAFKMLWEAPNGSTTSYKLEDKPQEIFFNSYNYGYGRAANGGEWA
SDVADSQNIPSDTQEKNHQYFLIGGSRVLEVDNVYSTNTEYGVASGRTLQLGGIFTLGVV
SQENGTILVNEGTITDEKENQDSYIRNMPTDPGKDYLTIHGPTQDYQISKNGNGYVGYKV
GIAQVEENEGVSQFHMDQQRLQNRSGGKINFFGNRSIGMYVYLPRHTTYAKMENQAGAEI
NMSGAESYGMRIAAKSDDAATMLNAGTINLRKINNQGADTSAGMALMLDSSVVNGVSLKR
GNAKNTGKITLTGVKNSIGAYVNIDSDITNEGTISINSTIAKNNDPTKQEVNVGMRADKT
ATAEVINEGTGKITMDGSYAMGMLANGSKLVNKGTISSTNVLNGVGIAGINNAKVKNSGS
IKVLGSGNTNNIGVFLKTNSEGEIGTPAAGVNQEVEVTGDNSTGVLVSDNSKLTMNGNVT
VSGKSVSGVVVNNGSQVTSNGGTVKVDNSGNHAEPIGDKGSYGIVVKGATSKYTGATTEV
TAKVTSDKSMGLYSEGKLEVNKANIDAKDGAINFYANGGEIKINNGGNSVTGQKSLLFYT
AGAGKFNLAGGTLSATIKGGTTPSTRGTAFYYEHTGPTYGSFDTAALTNFASTKFQNTLN
HLNLTMEAGSRLFVASNVEMNLSDTNPSGLVGALNLGGITGSDYKVFMLYLSRLKVNQAA
NLDDANDLYNKLEIANSSITNENTMTGSQNRQVAMAQENGSNPSGTPYAANKVTLINEAN
GKINLTGEETTGMYAKRGVIENNGEISVGKKSTAIYSEDDDAITAGTSATAENKGKITLG
EDSTGIYYKNGVSAAGGGAYNQGKIESSANNVIGMTFDTGSNSKVFRNHGNGEINLTGDK
STAMYATGNGTYTAENNAKITLGNSSDANNPNVGMFTDKSQITLKNTGTIAAGDKTAAMY
GYGINTDASSDISVGSGATGIYSKGGNVHLRGKLATGGNEAVGVYTVGAGQTITNDATNV
NIGDGSYGFVIKNAAGGNNFTSNTANVTVGNNVVYAYSTDTTGTMTNNTKLNSTGNENYG
LYGAGTITNNADIDFGSGIGSVGIYSIKGGTATNTAGKTITIGASNVSGQKYGIGMAAGY
ENSDTGKIINKGTINVNGKNSIGMYATGNGSVATNDGTINLGADGTQGMYLDNGAKGINN
GTITTVGNPTGAIGVTVRGGAEITNNGTININSSNGYAFALLKGGIIKNYGTFTVGNGAQ
KLYEPKAKPTGKGVAGVEISAPAGASNATITVNGKPVTPVTISSTAGQRAPLTSSIGMYI
DTLRGTNPIGGLIPSGEADLIIGSEAAQKTNSKYIEVNGDIIKPYNQAITNNPQIKKWNI
YSGSFTWIATATIDTGAATIRNIYLAKKPYTAFAGKEPTPVEVTDTYNFLDGLEQRYGVE
GLETREKTLFNKLNGIGTNEQLLFYQATDEMMGHQYANVQQRMNRTGTLLDKEFTHLRKE
WDNKSKQSNKLKVFGMRDEYKTDTAGIIDYTSNAYGVAYIHEDETIKLGNSSGWYAGAVN
NRFRFKDIGRSKENTTMLKLGLFKSKAFDDNGSLNWTISGEGYIARSNMHRKFLVVDEIF
EGKSDYTSYGAALKNEISKEFRTSERTSIKPYGSLKLEYGRFNTIKEKTGEVRLEVKGND
YYSVKPEVGIEFKYKQPMAVRTTFTTTLGLGYETELGKVGNVKNKGRVAYTDADWFNIRG
EKDDRRGNFKADLNLGIENQRFGVTLNAGYDTKGKNIRGGLGFRVIY
NT seq
6264 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaataacttgaaaaaaatggaaaaagacttaagagccttcgctaaaagatctaaa
gatgtaaaatatacaaaaggcttattgttcagtttcctattaatggggatgttgacattt
tcagatacattgacatcacctgaagttaagagtacagaaaatgcaataaatcagactaga
aaagaattaaacacatcaataagtgaaatgcacacagcatttaaacaggcaaagagagag
aataacagattattgaaaagagcaaatttagaattgattcagttaatggaacagggagac
catgtagtaaaatcaccatggagcagctggcaaatgggaatgaactacttctacagtaac
tggagaggaacatataaaggaagaggagataaggcagaaaaatatccttatgaaggaata
cttgaaagggatagtaacgaatttaacagatatgtttcgcctgacagtaaattttacggc
agtttgccaacatcttcgaatccgcgttcggcggcatcaaatgcaagacagggattaagc
actcaatatgggatagcaagtacacaacctgtacccgaacctatagtagatttgcagtta
agtgcaggaataaatcctaaaatagtaaataaggctgatttgaatttagttcctaaatcc
gcaaatgtgccgaatttacctgaacctgttaagtttcagccgataaatcctaagattacg
attccggcggatcctccactacctacaccgcctaattttgctatagtgttaggaggagac
tgtaactcgggatgtgacagttatgattggagaaatggaggtggaacaactccaagacaa
aatactaaatcaggttttacaccacctgccggtactaatcaaaatgtaactaatatatta
cattatacttggagagatggacttgcaacacctgctgaaagatcttatgcatttaaaatg
ctttgggaagcaccaaacggatctacgacttcttataaattagaagataaaccgcaagaa
atattttttaattcatataactacggatatggaagagctgccaacggtggtgaatgggct
tctgatgttgcagattcacagaatattccgagtgatacacaggaaaaaaaccatcaatat
ttcttgataggtggttcaagagttttagaagtggataatgtttacagtactaatactgaa
tatggagtagcttcaggaagaacattacaattaggaggtatttttacattaggagttgtt
tcacaggaaaatggaacaattttagtaaatgaaggaactattactgacgaaaaagaaaat
caggattcttatataagaaatatgccgacagatccaggaaaagattatttaactattcat
ggacctactcaagattatcaaatttctaaaaacggaaacggatatgtagggtataaagtc
ggtattgctcaagttgaagaaaatgaaggagtttcacaattccatatggatcaacaaaga
ttacaaaatagaagcggtggtaaaattaacttttttggaaaccgttccataggaatgtat
gtttatttaccaagacacactacttatgctaaaatggaaaaccaggcaggagcagaaatt
aatatgagcggtgctgagagctacggtatgagaattgctgcaaaatcagatgatgctgca
acaatgttgaatgcaggtacgataaacttacgcaaaatcaataatcagggagcagatact
tcagcgggaatggcattaatgttagacagctctgttgttaacggagtaagtttaaaaaga
ggaaatgctaaaaatacagggaaaataactcttacaggtgttaaaaactcaataggtgct
tatgttaatattgacagtgatataacaaatgaaggaactatcagtataaattcgactata
gcaaaaaataatgatcctactaaacaagaagtaaatgtaggtatgagagctgataaaact
gctactgccgaagtaataaatgaaggaacaggtaaaattacaatggacggttcttacgca
atgggtatgcttgctaacggttctaaacttgttaataaaggtactatatcaagtactaat
gtacttaatggggtcggaatagcaggaataaacaatgcaaaagtaaaaaatagcggttcg
ataaaagttttaggaagtggtaataccaataatataggggtgttcttaaaaacaaattca
gaaggagagattggaactccagctgcaggtgtaaaccaagaagttgaagttactggagat
aattctactggagtgcttgtatctgataacagtaaacttacaatgaacggtaacgtaaca
gtttcaggtaagagtgtttcaggagtagttgtaaataatggcagccaagttacttcaaat
ggaggaacggtaaaagttgataattcaggtaatcacgcagaacctattggagataaagga
tcttacggaatagttgtaaaaggagcaacatcaaaatatacaggagcgactacagaagta
acagcaaaagtaacttccgataaatcaatgggactttattcagaagggaaattggaagta
aataaagcgaatatagatgcaaaagacggagcaataaacttctatgcaaatggaggagaa
atcaaaataaataatggaggaaattctgtaacaggacaaaaatcattattgttttataca
gccggtgcaggtaaatttaatcttgccggaggaactctaagtgcgacaataaaaggagga
acaactccaagtacaagaggaacagctttctattatgaacatacgggaccaacttatgga
tcgtttgatacagctgcattgactaattttgcttctacaaaattccaaaatactttaaat
caccttaacttaacaatggaagcaggatcaagattatttgtggcttccaatgtagaaatg
aatcttagcgacactaatccttcgggacttgtaggagcattaaatttaggaggaattaca
ggttctgattataaagtatttatgctttatttgagtagattaaaagtaaatcaagccgca
aatttggatgatgctaatgacttgtacaataaattggaaatagcaaattcgtctattaca
aatgaaaatacaatgacaggaagtcaaaacagacaggttgcaatggctcaggaaaacggt
tctaatccttcgggaactccatatgctgcaaataaagttactttaataaatgaagcaaac
ggaaaaattaatttgaccggagaagaaactacaggaatgtatgctaaaagaggtgtaata
gaaaataacggtgaaataagtgtaggtaaaaaatccacagctatatattctgaagatgat
gatgcaattacagcaggtacttctgcaactgcagaaaataaggggaaaataacattaggt
gaagattctacaggaatttactataaaaatggagtttctgctgcaggtggaggagcatat
aaccaaggaaaaatagaaagttctgcaaataatgtaataggtatgacctttgatacaggt
tcaaacagtaaagtattcagaaatcacggaaacggtgaaataaatcttacaggagataaa
tcaacagcaatgtatgctacaggaaatggaacatacacagctgaaaataatgcaaaaata
acattgggaaattcaagtgatgcaaataaccctaatgtgggaatgtttaccgataaatct
caaataacattgaaaaatacgggaactattgcagcaggagataaaacggcagcaatgtac
ggatacgggatcaatacagatgcaagttccgatattagtgtaggatcaggagcaacagga
atatactctaaaggtggaaatgttcatttaagaggaaaactagctacaggaggaaatgaa
gcagtaggagtgtacactgtaggtgcaggtcaaacaataacaaatgatgcgacaaatgtt
aacataggtgacggttcgtatggatttgttattaaaaatgctgcaggaggtaataatttt
acaagtaatacggcaaatgtaacagtaggaaataacgtagtatatgcttattctacagac
actacgggaactatgacaaataatacaaaattaaattctacaggaaatgaaaattacgga
ttatacggagcgggaacaataacaaacaatgccgatattgacttcggttcaggaatagga
agtgtaggaatttacagtataaaaggcggaacagcgacaaatactgcgggaaaaactata
acaatcggagcatcaaatgtaagtgggcaaaaatacggaataggaatggctgcaggatat
gaaaacagcgacacaggtaaaattattaacaaaggcacaataaatgtaaacggtaaaaac
agtatcggtatgtatgcaacaggaaacggttcggtagcaacaaatgacggaacaataaat
ctcggagcagacggtactcagggtatgtatcttgataacggagcaaaaggaataaataac
ggaacaataacaacagtaggaaatcctacaggagcaatcggagtaactgtaagaggcggt
gctgaaataacaaacaacggaacgataaatattaattcatcaaacggatatgcttttgca
ctcttaaaaggcggaataatcaaaaactacggaacatttacagtaggaaacggtgctcaa
aaattatatgaacctaaggctaaaccgacaggaaaaggagttgcaggagtagaaataagt
gcacctgcaggagcatcaaatgccacaataacagtaaatggtaaacctgttactcctgtt
acaatttcaagtacagcaggacaacgtgcaccgttgacatcatcaataggaatgtacata
gatacattaagaggaacaaatcctatcggaggattaataccttcaggagaagccgacttg
ataataggctccgaagctgcacaaaaaacaaacagtaaatatattgaagtaaacggagat
ataataaaaccttataatcaagcgataactaataatcctcaaataaaaaaatggaatata
tattcaggatcatttacatggattgcaacagctacaatagatacaggtgcggcaactata
agaaatatatatttagctaaaaaaccttatactgcatttgcaggaaaagaacctacacct
gtggaagtgacagatacatacaacttccttgacggattggaacaaagatacggagtggaa
gggttggaaacaagagaaaaaactttatttaacaaattaaacggtataggaactaatgaa
cagttgttattctatcaggcaacagatgaaatgatgggacaccaatatgcaaatgtacag
caaagaatgaacagaacaggaacattattggataaagagttcactcatctgagaaaagaa
tgggataataaatccaaacagtcgaataaattaaaagtattcggaatgagggacgaatac
aaaacagatacagcaggaataatagactatacaagtaatgcttacggagtggcttatatt
catgaagatgaaacaataaaactcggaaacagttcaggatggtatgcaggagctgtaaat
aacagattcagatttaaagatataggaagatcaaaagaaaatacaacaatgttaaaactc
ggattgtttaaatcaaaagcatttgatgataatggaagcttgaactggacaatatccgga
gaaggttacatagcaagaagcaatatgcatagaaaattccttgtagtagatgaaattttt
gaaggaaaatcagattatacaagctatggagcagcattgaaaaacgaaataagcaaagag
ttcagaacaagcgaaagaacaagcataaaaccatacggaagtttaaaacttgaatacgga
agattcaatacaataaaggagaaaacaggagaagtaagacttgaagtaaaaggaaatgat
tattactctgtaaaacctgaagtaggaatcgaatttaagtataaacaaccaatggcggta
agaacgacatttacaacaacattaggcttaggatatgaaacagaattaggaaaagtcgga
aatgttaagaataaaggaagagtggcatatactgatgcagactggtttaatataagagga
gaaaaagacgatagaagaggaaactttaaagcggacttgaatcttggaatagaaaatcag
agatttggagtaacattgaatgcaggatatgacacaaaaggtaaaaacataagaggagga
ttaggattcagggttatttattaa
DBGET
integrated database retrieval system
