Leuconostoc gasicomitatum: LEGAS_0537
Help
Entry
LEGAS_0537 CDS
T01267
Symbol
srr-2
Name
(GenBank) Serine-rich repeat protein
Organism
lgs
Leuconostoc gasicomitatum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Drf_FH1
KxYKxGKxW_sig
Gram_pos_anchor
DUF3659
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBL91185
LinkDB
All DBs
Position
547773..552128
Genome browser
AA seq
1451 aa
AA seq
DB search
MKKRVQKNYRETKLVTRFKMYKDGKNWVTSGVSKLLSWVKSTQDNELSLNSKKSKHTEGT
IFKAVASISALIGGSAIVSQEAFADTDNTATEKNIDNVGTVVNKDQVVLPNQTVSNQDSV
LNKTSTSENKSFSVSSSESVSTSELISDSESISTSESISDSESISTSESINNSESTSESA
SHTKVASASDSTSNSVPASTSEKTSDTQASAISESASNSESVSTTELVSSSESISSSSSS
NRSATDTPATTRSHTTTYATEANSTGFAVNDPQYPNSMPRNSDNVNRYDFEWLTVYNGST
KVGDISISIDRNGSGQLYIQEISTNGTTKNLTLSQSTASISSLSFSGTTYYYDGIDGNYS
LVIKRLSGTLKTNYVGFVADSSGNAYGTVTNFVPKNVNQNTTYVDEEGQVINNSDNVTQN
GWTGQTYTTSSGHVINGYYSDDVNDNGNGTMSQFGKIGAKYEKNYHDGTSVIYTQLDSIG
TMQADVYRNGVKSVTYTIPVGQTVQYVNGNTTYNIRNPYIQQTQDIQYQYKKLGNLIIKN
EDGTIVNETQYVNDSTDAAKAYYPTNTVPDKPGYIITAKDSNGNTIDINTIRNGAMPNDL
SIDTIVTYEKDPVSISASESISGSESVSTSESISGSESASTSESVSGSESISTSESTSGS
ESVSTSESISGSESVSTSESVSGSESVSTSESVSGSESVSTSESVSDSSSVSTSESISGS
ESASTSESVSGSESVSTSESTSGSESVSTSESASGSESVSTSESVSGSESVSTSESISDS
SSASTSESVSGSESVSTSESVSGSESVSTSESVSDSSSVSTSESISGSESVSTSESTSGS
ESVSTSESISGSESVSTSESVSGSESESVSTSESISDSSSASTSESVSGSESVSTSESVS
DSSSVSTSESVSDSSSVSTSESISGSESVSTSESISGSESVSTSESISGSESVSTSESIS
GSESVSTSESISGSESVSTSESTSGSESVSTSESTSGSESVSTSESISGSESVSTSESVS
GSESVSTSESISGSESVSTSESISDSSSASTSESTSGSESVSTSESVSDSSSVSTSESVS
GSESVSTSESISGSESVSTSESISGSESVSTSESISGSESVSTSESVSDSSSVSTSESIS
GSESASTSESVSGSESVSTSESTSGSESVSTSESASGSESVSTSESVSGSESVSTSESIS
GSESVSTSESESISGSESVSTSESTSGSESESVSTSESISDSSSASTSESVSGSESVSTS
ESVSDSSSVSTSESVSDSSSVSTSESISGSESVSTSESISGSESVSTSESVSGSESASTS
ESVSGSESVSTSESVSGSESVSTSESVSGSESVSTSESTSGSESASTSESVSGSESVSTS
ESMSTSDSTSESMSESLVQSSFKTQKVSKDSVLPSTGINSNNSNNISALLGLGVLSTAAI
IKKSKKNKNTK
NT seq
4356 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaagagttcaaaaaaattatagagaaacgaaactagtgactcgttttaaaatg
tataaagatgggaaaaattgggttacttctggtgtttcaaagttattaagttgggttaaa
tcaactcaagataatgaactatcattaaattcaaaaaaaagcaagcatactgaaggaaca
atatttaaagcggtagcctcgattagtgccctaataggtggttcagctattgtttcgcaa
gaagcttttgcggatactgataatacggctactgaaaaaaacatcgataatgttggaaca
gttgttaataaggatcaagttgttttaccaaaccaaacagtatctaatcaagattctgta
ctcaacaaaacaagtactagtgaaaataaatcattctcagtcagtagtagtgaatcagtt
tcaacatcagagttaattagtgatagtgaatcaatttcaacatcagagtcgattagtgac
agtgaatcaatttcaacatcagagtcgattaataatagcgaatcaacatcagaatcagca
agtcataccaaggtcgcatcggcttctgactcaaccagtaatagtgtaccagcttcaact
tcagaaaaaactagcgatactcaagcttccgcaatttctgaatctgcaagtaatagtgaa
tcagtttcgacaacagagttggtgagtagcagtgaatcaatctcgagttcaagttcgtca
aataggagcgcaacagacacgcccgctaccactcgatcacataccacaacatatgcaaca
gaagcaaattcaactggttttgctgttaatgatccgcaatatccaaatagtatgccacga
aattctgataatgtgaatagatatgactttgaatggttgacagtttataatggtagtaca
aaagttggtgatatttctatctcaattgaccgtaatggatctggtcaattatatattcaa
gaaataagtacaaacggtacaacgaaaaacttgacattgagtcagagtacagcaagcatt
tcctccttatcattttcaggaacaacatattattatgacggaatagatggaaactattca
ctggttataaagagattaagtggaactttaaaaacaaattatgttggatttgttgcagac
agttctggtaatgcttacggtacggtcactaatttcgtgcctaagaatgtaaatcaaaat
acaacttatgtggatgaagaagggcaggttattaacaattctgataatgttacccaaaat
gggtggactggccaaacatacacaacatcctcaggacatgtaattaatggatactattct
gatgatgtcaatgataatggtaacggaacaatgtctcagtttggaaaaattggtgccaaa
tatgaaaaaaattatcatgatggtacgagtgttatttatacacaattagatagcattgga
acaatgcaagctgatgtttataggaatggtgttaaatcagtaacctacactattccggtt
gggcagactgttcaatatgttaatggcaatacaacctataatattagaaatccatatatt
cagcaaacacaagatatacaatatcagtataaaaagttgggaaatcttattattaagaat
gaagatggaacaattgttaatgaaactcagtatgtaaatgactcaacagatgcggcaaaa
gcatattatccaacaaacacagttccggataagccaggttatataattacggcgaaggat
agtaatggaaataccattgatattaataccattagaaacggtgctatgccgaatgacttg
tctattgacacaatagttacttatgaaaaagatcctgtttccataagtgcaagcgaatca
atctccggatcagaatccgtaagtacgagtgaatcaatttctggttcagaatcagcaagt
acgagtgaatccgtttctggatcagaatcgataagtacgagtgaatcaacttccggttca
gaatcagtaagtacaagcgaatcaatttctggttcagaatccgtaagtacaagcgaatcc
gtttctggatcagaatccgtaagtacaagcgaatccgtttctggatcagaatcagtaagt
acgagtgaatcagtttctgattcatcatcagtaagtacaagcgaatcaatttctggatct
gaatcagcaagtacgagtgaatcagtttctggatcagaatcagtaagtacgagtgaatca
acttctggatcagaatcagtaagtacgagtgaatcagcttctggatcagaatcagtaagc
acaagcgaatccgtttctggatcagaatcagtaagtacaagcgaatcaatttctgattca
tcatcagcaagtacaagtgaatccgtttctggatcagaatcagtaagtacaagtgaatcc
gtttccggatcagaatcagtaagtacgagtgaatcagtttctgattcatcatcagtaagt
acaagcgaatcaatttctggttcagaatcagtaagtacgagtgaatcaacttccggatca
gaatcagtaagtacgagtgaatcaatctccggatcagaatcagtaagtacaagcgaatcc
gtttccggttcagaatctgaatcggtaagtacaagcgaatcaatttctgattcatcatca
gcaagtacgagtgaatccgtttctggatcagaatcagtaagtacaagcgaatccgtttca
gattcatcatcagtaagtacaagcgaatccgtttcagattcatcatcagtaagtacgagt
gaatcaatctctggatcagagtccgtaagtacgagtgaatcaatttctggatcagaatca
gtaagtacgagtgaatcaatttctggatcagaatccgtaagtacgagtgaatcaatctct
ggatcagaatcagtaagtacgagtgaatcaatctctggatcagaatccgtaagtacaagc
gaatcaacttccggatcagaatccgtaagtacgagtgaatcaacttccggatcagaatca
gtaagtacaagtgagtcaatctccggatcagaatcagtaagtacgagtgaatccgtttct
ggatcagaatcagtaagtacgagtgaatcaatctctggatcagaatcagtaagtacaagc
gaatcaatttctgattcatcatcagcaagtacgagtgaatcaacttctggatcagaatca
gtaagtacgagtgaatcagtttctgattcatcatcagtaagtacaagtgaatcagtttct
ggatcagaatcagtaagtacgagtgaatcaatctccggatcagagtctgtaagtacgagt
gaatcaatctccggatcagagtccgtaagtacgagtgaatcaatttctggatcagaatca
gtaagtacaagtgaatcagtttctgattcatcatcagtaagtacaagcgaatcaatttct
ggatctgaatcagcaagtacgagtgaatcagtttctggatcagaatcagtaagtacgagt
gaatcaacttctggatcagaatcagtaagtacaagcgaatcagcttctggatcagaatca
gtaagcacaagcgaatccgtttctggatcagaatcagtaagtacaagtgaatcaatttct
ggatcagaatcagtaagtacgagtgaatctgaatcaatttctggatcagaatcagtaagt
acgagtgaatcaacttctggatcagaatctgaatcggtaagtacaagcgaatcaatttct
gattcatcatcagcaagtacgagtgaatccgtttctggatcagaatcagtaagtacaagc
gaatccgtttcagattcatcatcagtaagtacaagcgaatccgtttcagattcatcatca
gtaagtacgagtgaatcaatctctggatcagagtccgtaagtacgagtgaatcaatttct
ggatctgaatcagtaagtacaagtgaatccgtttctggatctgaatcagcaagtacgagt
gaatcagtttctggatcggaatcagtaagtacgagtgaatccgtttccggatcggaatca
gtaagtacgagtgaatccgtttccggttcagaatcagtaagtacaagcgaatcaacctct
ggatcagaatcagcaagtacaagtgaatcagtctccggatcagaatcagtaagtacgagt
gagtcaatgtcaacttcagattcaacatcggaatcaatgagcgaatcattagtacaatct
agctttaaaactcaaaaagtttcgaaagattctgtactaccaagcacaggaattaattca
aataattcaaacaatattagcgcattacttggtctcggtgtactgtcaaccgccgcaatc
attaaaaaatctaaaaaaaataaaaacacaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
