Lysinibacillus varians: T479_00620
Help
Entry
T479_00620 CDS
T03062
Name
(GenBank) iron ABC transporter permease
KO
K02011
iron(III) transport system permease protein
Organism
lgy
Lysinibacillus varians
Pathway
lgy02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lgy00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
T479_00620
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
lgy02000
]
T479_00620
Transporters [BR:
lgy02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Mineral and organic ion transporters
Iron(III) transporter
T479_00620
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BPD_transp_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHN20153
UniProt:
A0ABY2TDC4
LinkDB
All DBs
Position
complement(137685..139406)
Genome browser
AA seq
573 aa
AA seq
DB search
MEKPPVHSYQSNVWTRLTQSKWFVYILISPLFLVLFAYVIYPFYQTFLQSFSGEHALSHY
QKFFSLASPANLEALWTSLYISIISVICCALVGVTMAFLLERYEFPGRRILSILVLVPMA
LPPLVGVLSFTFLYGESGIFPRAIQHLFGLKQVPFSLKGIWGVIVVHTFTMYTYFYLTAS
AAIKGLDPSLEEAATSLGAGRIRVWTKVILPMLTPSIIASALLVFMVSMASYTAPLMFGV
ERTMTMQIYLSRTNGNLEMAATQSMILSFVSISFLIVMRWYQNRRNYQNLSKGISVHRSE
VSSKFMKIIATIASFGGTLILILPILVLILISFSVDGAWKTQILPTDYTVDHYVALFTDE
RTWRPIWNSIQMGIVATFGNVLFGVAAAYAMVRLNFKGKTLLDILIMVPWALPGTVVAVN
LIAAFSTENIFAFNQVLIGTFWILPLAYFIRHLPLVFRSTSASLVQLDQSIEEASRSLGA
NWWYTFRRIILPLTFSGILAGTLLALVQSLGEFVASILIYSTSTIPLSVAIFQKLYAFKF
GTACAYGVLQICLILIVLIISEKLSKGSAGSAI
NT seq
1722 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaaaccacctgtacattcttatcaaagtaatgtttggacacggctaacgcaatct
aaatggtttgtctatattttaatttcgcctttgtttttagtattgtttgcttatgtcatt
tatcctttctatcaaacttttcttcaaagtttttcaggagagcacgcacttagtcattat
caaaagttttttagccttgctagccctgctaatcttgaggcgctatggactagtttatat
atatccattattagcgtgatttgctgtgcacttgttggtgtaacaatggcatttttattg
gaacgctatgagtttccaggaagacgcatattatctattttagtattagtgccaatggct
cttccaccgcttgttggcgtactctcttttacattcctatacggggagagtggcattttt
ccacgcgcaattcagcatttattcggcttaaagcaagtacccttttctttaaaaggtata
tggggtgtcatcgttgtccatacatttaccatgtacacctacttctatttaaccgcttcg
gctgctattaaaggacttgatccatcattagaggaagcagcaactagtttaggtgcaggg
cgtattcgtgtatggacaaaggttattttaccgatgttgacaccttctattattgcatct
gccttgctcgtctttatggtatcaatggcatcttatacggcaccattaatgtttggtgtc
gaacgaacgatgaccatgcaaatttacttatcacggacaaatggtaatttagaaatggcc
gctacacagtcaatgattttatcgtttgtatccatttcatttttaattgttatgcgctgg
taccaaaaccgtagaaattaccaaaatttgagtaaaggcattagtgttcatcgctcagaa
gtatcttcaaaattcatgaaaataattgctacaatagcttcttttggcggaacactgatt
ttaattttacccattttagtgctgattttaatttccttttcagtcgatggtgcatggaaa
acccaaatactgcccaccgactacaccgtcgatcattatgtggcactctttactgatgag
cgaacgtggagacctatttggaactccatccaaatgggtattgtcgcaacgtttggtaat
gtactttttggtgtcgctgcagcctacgcgatggtgcgtctcaactttaaagggaaaaca
ttgctcgatattttaattatggttccttgggcactgcctggaactgttgttgctgtcaat
ttaattgctgcctttagcactgaaaatatatttgcctttaaccaggtactgattggtacg
ttttggattttaccgcttgcttattttattagacatttaccacttgttttccgttcaaca
tcagcctctcttgtgcaattagatcagtcgattgaggaggcgtcacgaagcttaggtgca
aattggtggtatacgtttcgacgtataatcctgccgctaactttttcgggcatattagca
ggaacattactagcgcttgtccaaagtttaggtgaattcgtagcttctattcttatttat
agcacttctacgattccgctatctgtggctatatttcaaaaattatatgcctttaaattt
ggaactgcttgtgcctatggtgttttacaaatttgcttaattttaatagtacttattatt
tcggaaaagctatcaaagggcagtgctggctcagccatataa
DBGET
integrated database retrieval system