Lysinibacillus varians: T479_02495
Help
Entry
T479_02495 CDS
T03062
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
lgy
Lysinibacillus varians
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen_bind
SpaA
CarboxypepD_reg
SdrD_B
Big_1
Ig_DR_A0283-like
Gram_pos_anchor
Ig_ILCR1
Y_Y_Y
bMG10
bMG3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHN23937
LinkDB
All DBs
Position
508871..514312
Genome browser
AA seq
1813 aa
AA seq
DB search
MKKLNLAIITLLLVFQTVLSPISVFAEDTGSSVPPAVEAGNGETNSNSPDTGNPDAAVPT
PGDAGNPDATVPTPGDTGNPDATVPTPGDTGEVDGTDANTGGTDNSTVTPPDESDKVDGA
EGEAKPSEEATDATTPEIAPMNIAPLALTAGDMQGDVSGLSAGIRLTGPTGEVIENSSQI
PADAAPKKGDTVYLNYVFEVKPTQGYGVGSTFTFDLPQYMIEQVGNSFSGSKTTEYATYS
YSYSAGKILVTLESDIEDGVDGEIEFDFMAKFGNFQDESKLDQELVMPVLGKADITLPFI
FQPTGSGEPITKSSGAITREADGAEIDWTVWVNTEGKPIVSGATVDDTPDANHAFIAGSL
VVEKYPIGLNGINKSNPGAPVSYDSGSTAFPVNLDAGGFAYKLTYKTKVTADPTSSNMTY
TNTAELTNNGVPKTSPGQVNIPYGPALLKTITSNNKYEASWEIKYNWLGEDLSKKSSQSL
TDTIPANNNGAKHDIQYDANFQVYRVTLNDDGQTAASETLLTKDTDYALSDDTAQGFTID
FSKDVAANPRAAYLIKYNTEFDQEFVTDANAGSITNTVKRLDDDSSSSDTVSIVSNIFSK
ERGAIDYVNKTITWKLTINAEKPLTNFVIADTISTKNASGKTLKHKLTSWDGSSKVFHVT
NSSAPTINNGGEIGDEAFTMTFPSIPSGTVTIEYKTKFDIESNGGVAQSYDNVADATWDG
QTSTNNKAQKNASYKPSATSPTGKNGYKDNAIVDNSKQEFSWKIGININKQNIEGAKLID
TLGTGHHIIVPDGQSLKDAITVNLLKLGVNDERGTKDAPLDPTKWDVKSVTQDAQGNVTS
YELTFTGLTAAENNEAYLIEYKSKDSDDVYGNGSTDARKYTNSAVLDTPDNGKYSYDAIA
TITDKANKLITKTASPQPTSDTIEWTVTINESNSKLGNITLTDTPSANQKLLTNTFTKQE
IKLNATGKSQNVGTATVISPSDIQVQPDGTFTLDLGNVDGKGYIIKYKTYFMGDPNTGEN
VSNNASINYAGATSAGTSATGGDNKLFKYSTSDTNASAKKGTFKIKKQGVNPNTGATTTL
DGVEFKLYNRDKSIVLAEGSTVDGELSFENLRYGIYKLEETTPAGYKAVSTVEVRFNDSN
NFEVTKKPYTIVNVEDIAPPANACKEFELTIKDLDGSAIADQNVTFKDANGTVKYTSATT
NGVVKVPNTVLAGQYDVYDANDTKIGNVTVKYTDGCKDEIAPIPACPAFTITLNEKKAGV
DVPRAGVTVTLKDSTGSEIVTVTTDKDGKFTVPSIQDVNGVKAGEYYLYEGNQFLSTVDI
SYKGNCETAITQAPKCETFKLTVKDVDGNLVADGTSVTVKDADDKIVATKTTTNGVLELT
NLQPGIYKVEVNGKENGSFQSNVDCAATVQPAPSCPIFTLTVKDENGNVRPNVSNIMIKD
KNGATIASNKTTDALGQVTMPSQDIPSGDYSVYQGDLFIGQITVQYSVNCHAEIVAAPTC
PSFTLTVQTAFGTPLANATVTVKDVKGNTIKDANGNDKLTTTVAGTIVLPDKAIQQGTYN
VYEGSRLIGSFVVKDTCSALVKPSLPGDNGGGGGGGSTPPEPGKPVEPNKPTPEPGKPVD
PNKPTPEPGKPVDPNKPTPEPGKPVDPNKPTPEPGKPVDPNKPTPEPEQPVNPENPSTNT
EEPSNPGNPSTDSKDPTAPGKTDTSKPSVQDVIDQGKNLPSINTSTANKDTLDAYKDFID
NYNQLSKEEQEEIAKSLDVDKIKADAKRLETQLQAQGKLPQTDGANQTALTLTGVALVLG
ALFFLRRRKAEMK
NT seq
5442 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaattaaatttagcaatcattacattgttgctagtgttccaaacggtactgtca
ccgatttccgtatttgcagaagatacaggttcttctgtacctccagcagttgaagctgga
aatggtgaaactaattctaattcgccggacacaggcaatccagatgcagcagtgccgaca
cctggtgacgcaggcaatccagatgcaacagtgccaacacctggtgacacaggtaatccg
gatgcaacagtgccaacacctggtgatacaggggaagttgatgggacagatgctaatacg
gggggcacggataattcaaccgtgacaccaccggatgaatctgacaaagttgacggagct
gaaggtgaagcaaagccaagtgaagaggcgactgacgcaacgacaccggaaatagcacct
atgaacatagcaccattagcgttaactgctggtgatatgcaaggtgatgtaagtggatta
tctgcgggtattcgactaactggtccaacaggcgaggtaatcgagaactcatcacaaatt
ccagccgacgctgcaccaaaaaaaggtgacacagtttatctaaactatgtatttgaagtg
aaacctacgcagggttatggtgtaggttctacatttacgtttgatttaccacaatatatg
attgagcaagtaggtaactcgttttcaggttcgaaaactacggaatacgctacatattcg
tatagctattctgctggtaaaatactcgtaacattagagagtgacatcgaagacggtgtt
gatggagagattgaatttgattttatggccaagtttggtaatttccaagacgagtctaaa
cttgatcaagaattagtaatgcctgtgttaggcaaagcagatattacgttaccgttcata
tttcagcctactggtagtggtgagccgatcactaaatcttccggtgcaattacacgtgaa
gcggatggcgctgaaattgattggacagtctgggtcaacacagaaggtaaaccaattgtt
tcaggtgctacagtagacgatacgccagatgcaaatcatgcatttatagcaggtagttta
gtagttgagaaatatccaatcggcttaaacggtattaacaaaagtaatccaggagcgcca
gtaagttatgacagtggttcaacagcattccctgtcaatttggatgcgggaggttttgcc
tacaaactaacgtataaaacgaaagttacagcagatccaacaagctccaatatgacgtat
acgaacactgcggaattgacaaataatggcgttcctaagacaagtccaggacaagtaaat
atcccgtatggacctgccttactaaaaactatcacgtcgaataataaatacgaagcatct
tgggagattaagtataactggttaggagaagatcttagcaaaaaatcttcccaatcatta
actgataccattccagcaaacaataatggggcaaagcacgatatacaatatgatgctaat
ttccaagtgtatcgtgtaacgttaaatgatgatggtcaaacagcagcgtcagaaacactg
ttaacgaaagatacagattatgcattaagtgatgatactgcgcaaggattcactattgat
ttttctaaagatgttgctgctaatccgcgtgcagcttatttgattaagtataatacagag
tttgatcaagaatttgtcacagatgcaaatgcagggagtatcacaaatactgtaaagcgc
ttagatgatgatagttcgtcatcagatactgtaagcattgtatcaaatatctttagcaaa
gaacgtggcgcaattgactatgtcaacaaaacaattacttggaaactaacaattaatgct
gaaaaaccattaacaaactttgtcattgcagatactatttctacgaaaaatgcgagcggt
aaaacgttgaagcataagttaacatcgtgggatggttcgagtaaagtattccatgttaca
aatagtagtgcaccaacaattaataatggaggagaaatcggagacgaagcatttacaatg
acattcccatcgatcccttcaggaactgtaacaattgaatacaaaacaaagttcgatatt
gaatcaaacggtggcgtggcacaaagctatgacaatgtagcagatgctacgtgggatggt
caaacaagtacaaataataaagcacaaaaaaatgctagctataaaccatccgcaacatcg
cctacaggtaaaaatggttataaagacaatgcaattgtcgataatagtaaacaagaattt
tcttggaaaattggtattaacattaataagcaaaacatcgaaggtgcaaaactaatagat
acattaggtacaggacaccatattattgttccagatggtcaaagtttaaaagatgctatt
actgtaaatcttttaaaattaggtgtgaatgatgaaagaggaacaaaagatgcgccatta
gatcctactaaatgggatgtgaaatctgttacacaagatgcccaaggcaatgtgacaagt
tatgaacttacatttacagggttaacggctgcagaaaataatgaagcgtacttgatagag
tacaaatcaaaagattcagatgatgtttatggaaatggaagtacggatgctcgaaaatat
acgaatagtgccgttttagatactccagataatggtaaatattcgtatgatgcaatcgca
acgattacagataaagcgaacaagttaattactaagacagctagtcctcaaccaacatca
gatacgattgaatggacagtcacgattaacgaatccaactcaaagctaggtaatattacg
ttaacggatacgccttcagctaaccaaaagctattaacaaacacatttacaaagcaagaa
attaagttaaatgccacaggaaaatcacaaaacgttggtacagcaactgtgattagtcct
agcgatattcaagtacagccagatggtacctttacattagatttaggaaatgtcgatggt
aagggctatattattaaatacaaaacgtactttatgggtgacccaaacacgggtgaaaat
gtatcgaataatgcatccattaactatgcaggtgctacttccgcaggtacatccgctaca
ggtggagataacaagttatttaagtacagtacatctgatacaaatgcgtcagctaaaaag
ggtacgtttaaaattaagaaacaaggtgtaaatccgaatacaggtgcaacaacaacactt
gatggcgtagaattcaagttatataaccgtgacaaatccattgtcttagcagaagggtcg
acagttgatggtgaactttcattcgaaaatttacgctacggtatttataaactagaagaa
acaacacctgcaggctataaagcagtttcaacagttgaagtaaggtttaatgatagcaac
aacttcgaggttacaaaaaaaccttatacaattgttaacgttgaagatattgcaccacca
gcaaatgcgtgtaaagaatttgaattaacaattaaagatttagatggttctgctatagca
gaccaaaatgtaacatttaaagatgcaaacggtacagtgaaatacacgagtgcaactact
aatggtgttgtaaaagtgccgaacactgtattagcaggacaatacgatgtttatgatgcg
aatgatacaaaaattggaaatgtaactgtgaaatatacagatggctgtaaagatgaaatt
gcgccaataccagcttgtccagcatttacaattacattaaatgagaaaaaagctggagtt
gatgtacctcgtgcaggagtaactgtcacgttgaaagattcaacgggtagcgaaattgta
actgtaacaactgataaagatggtaagtttacagtgccgtcaattcaagatgtaaatggt
gttaaagcaggagaatactatttatatgagggcaatcaatttttaagtacagttgatatc
tcatataaagggaattgtgaaactgcgattacacaagcaccaaaatgtgaaacgtttaaa
ctaactgttaaggatgttgatggcaacttagttgcggacggtacttctgtaacagtgaaa
gatgcagatgataaaattgttgcgacaaaaacaacaacgaatggtgtgctggaattaaca
aatctgcaaccaggtatttataaagttgaagtcaatggcaaagaaaatggtagcttccaa
tcgaatgttgactgtgcagcaacagtgcaaccagcaccgtcttgtccaatctttacatta
acggtgaaagatgaaaacggtaatgttcgcccgaatgtaagtaatattatgattaaagat
aaaaatggcgcaacaattgcttcaaacaaaacaacagatgcattaggtcaagtgacgatg
ccatctcaagatattccttctggggactatagcgtgtatcaaggcgacctatttattggt
caaattacagttcaatattccgttaattgtcatgcggaaattgtagcagcacctacatgt
ccttcgtttacattgactgtacaaactgcatttggtacgccgcttgcaaatgcgacagtc
actgtgaaagatgtgaaaggaaatacgattaaagatgcgaatggtaacgacaagttaaca
acgactgttgctggaacaattgttttaccagataaagcaattcaacaaggaacgtataat
gtatacgaaggaagtcgtttaattggctcattcgttgtaaaagatacatgttctgcactt
gtaaaaccgtcattaccaggtgataacggtggaggcggtggcggtggttcaacaccacca
gaaccaggtaaaccggtggaaccaaataaaccaacaccagaaccaggtaaaccggttgat
ccgaacaagccaacaccagaaccaggtaaaccagtggatccaaacaagccaacaccagaa
ccaggtaaaccggtggatccaaacaagccaacaccagaaccaggtaaaccggttgatccg
aacaagccaacaccagaaccagaacaaccggtgaatcctgaaaatccatcaacaaataca
gaagagccaagtaatccagggaatccttcaacagattcaaaagatccaacggctcctgga
aaaacagatacgtctaaaccatctgtacaagatgttattgatcaagggaaaaacttgccg
tcaattaatacttctactgcaaataaagatacgctagatgcgtataaagatttcattgat
aactataaccaattatcaaaagaagagcaggaagaaattgcaaaatcacttgatgtagat
aaaatcaaagcagatgcaaaacgtttagaaacgcaattacaggcacaaggtaagttgcct
caaacagatggagccaatcaaacagctcttactctaacgggtgtagcgcttgttttaggc
gcattgttcttcttacgtcgtcgtaaggcagaaatgaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
