Lysinibacillus varians: T479_05885
Help
Entry
T479_05885 CDS
T03062
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
lgy
Lysinibacillus varians
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Condensation
AMP-binding
PP-binding
CurL-like_PKS_C
RhiE-like_linker
AMP-binding_C
Acyl_transf_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHN23991
UniProt:
A0ABY2T4M2
LinkDB
All DBs
Position
1263366..1269131
Genome browser
AA seq
1921 aa
AA seq
DB search
MQRDNISYILPFSAKSWEALNNTSAQVMSYLKELHQIDLADASWTLQKGRRALEHRKVFV
TSRKDMESSTFHVCSNNGKRKRNLVLILPGVQDVNILWRKSGTVEGLYPLLKGYERTIEQ
LLKMLPQQTAEKVINIENDDNEVKCYRALLGGYACVQMLRELGVQPSALVGEGIAELVSM
VCAGAVTLRDAISIIQTYGQLATYEAIYEKYDLRKKQIPLIKKPGIKAKQHIEDALVIKL
GSSDLENSITKRCMTNVEAENVLNLIENSSDSFINNVYRLIGDLWCRGLKIDWDMISAAT
TSSLKRVALPTYVFDKKEYDSDVVNSINPLPSNNSIHSTIEKVEMEQLDPAVVLRKLWEE
VIGVTDIQKTSDFFEMGGDSLNAIMLSSKIKETLKIEFPVSDVFIHSTFGKMEQYIDAHL
DQKSVDVIEKLGVQKYYEASSAQKRMYIMNELVEDAIPYNFAAVYHVKGRLEHTKIQQCF
SKVVERHEAFKTRFDMVDGEIVQIIEDNVDFKVKFQTSEKERLEEAITANLKPFNLENAP
LLRVTFISLNEEEHVMVLDMHHIISDQSSLDILLKEIGCMYQGEELPDLEIQYKDFAKWQ
NDFYNSGKVQKQLDYWKNEFKEGVPVLDLYTDYDRPEFISYEGGKIHYSFERDINQGILA
FTKKHGITPYMFIMAALNIMLWKYTNQKDIVIGTVISGRNHAKLESIVGMFVNTLAIKSE
LDEDIPLEEFLQYTKNKLVKSYDNQDCQFELLVEELGIPKSVSRNPLFDILFNYINIGTD
EVNIEGLSLTPYENNEMNVKFDISFTLEEKNQQFYMDIDYSKALYKEDTIRIMGERLIYI
ISQMLKDVNVKLKDIDMMTVEERNWLIETVNQTTTDYPAHKTVLTIFEDYARDTPNAIAI
EWLEDKISYKQLNNMANQLAEKLKDRNVGYQDKVAILLDRGYMQIVSMLGIMKLGAVYVP
IDPKFPQERIDYILEDCHSKVIVTDYSLEEKISVNIEKFLIDKDENTLNREQDMGIESTY
TSQYFNSDDLIYVIYTSGSTGKPKGTLIKHKNVVRVVKNTNYIDINENDRIMQISNYVFD
CSVFDIYGALLNGANLVIIPRETSLDIPLLAEFIEKKEISVFCISTALFHMLVDGKVEFL
KNVRKIIVAGEQISLTHAQQTVNQIGKGKLINAYGPSESAVFATYYPIDDIEDVSIIPIG
IPISNTTVYVVDEKKQLVPMNVAGELCLGGDGVGVGYLNREDLTNEKFITLDAVGGKRVY
CTGDKVMWNSRGQLVFLGRKDFQIKLRGFRVELGEVERHIKNIDGIKNVIVTAERDHLDT
LYMTAYYTVNENHHIEKYDGEYVRNHLNNRLPEYMIPSKFVVLKEFPLNFSGKVDRKALV
NAEQYSQKVMVQDEPRTTLEKTVLKTMQMILDVKEFGLKDNFFHFGGQSIKAIALVKALS
NKGVDLKINEIFQYQTAEKIAASIEPLAEVSPPMIDKIRTSKDIELNAKQITSLVKNVIA
RIEGLSDIITASDTRMAFSLSPIQKGHMSKGSNYSGFISHFDGIISKNRIKNTIADVISN
NQLLRCSLVETNGEKKWCEYEVLKLETIMSNYLTYVDISMYTESVKTTIINKLSEEILLR
TYSNNELLWRMCVLKESDTRHLIIWGADHLIFDGMSAEIIKTQIEQGLKGTTSMENTIRS
FKEYVDVLNEGPLGISEKELIEKFHLVKWSENNRKVMAQPKGNATLQNNIEIIIPLSDIE
HLDIWWYAFDFVSDILRDYTNTEVIPFAVLEYARSYQGKDFYNSVGEFLDIVPIISEKGN
RTSVETAIQLCKDHSINYLALLGEERFSKDYPKLNQLLRKYYFNDKQYCNFILYNFQGFV
KAEEKQAFSHNNTENSLARMSVTLNYDSDHLYIEIEDVIGIDEKRFRTIVEKRSEQGRVS
Q
NT seq
5766 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaagagacaatatttcatacattttacctttctctgcaaagagttgggaggctttg
aataatacctctgcgcaagtgatgagttatttaaaggaactccatcaaattgatttagca
gatgcctcctggacccttcaaaaagggagaagagcattagaacatagaaaagtgtttgtt
acgagcagaaaagacatggaaagtagtactttccatgtctgcagtaacaatgggaaaagg
aaacgaaaccttgtattaatattacctggtgtacaagatgttaatattttatggagaaaa
agcgggacggtagaaggtctctatcccctattaaaaggttatgaacgtacaatagagcaa
ctattaaaaatgttaccacagcaaactgcagaaaaagtaataaacattgaaaatgatgat
aatgaggtcaagtgttatagagcattgctaggtggatatgcatgtgtccagatgctaagg
gagcttggcgttcaaccatccgcattagttggggaagggattgctgaacttgtatctatg
gtttgcgcaggtgcagtgaccttgagggatgcaattagcataattcaaacatatggacaa
cttgctacgtatgaagccatttatgaaaaatatgatttaagaaaaaaacagattccgtta
ataaaaaagcctggtataaaagctaaacaacatattgaagatgcacttgtcataaaactt
ggcagtagtgatctagaaaattcgattacaaaacgatgtatgacaaatgttgaagctgaa
aatgtcttgaatctgatagaaaattcgagtgatagctttatcaataatgtttaccgcctt
atcggggacctatggtgtagagggctgaaaattgattgggatatgatcagtgctgctact
acttcttcgttaaaaagagttgcactaccaacatatgtcttcgataaaaaagaatatgat
agtgacgtagtgaattccataaatcctttaccaagtaataattcaatacattctactata
gaaaaagttgaaatggagcaactcgaccctgctgttgtattaaggaagctttgggaagaa
gtaattggtgtaacagatattcagaaaacgagtgatttctttgaaatgggtggagattca
ctgaatgcaattatgctttcttcgaaaatcaaggaaacattaaaaattgagtttccagtg
tctgacgtatttattcattcaacatttggcaaaatggaacaatatatagatgcgcattta
gatcaaaaatcagtagatgtaattgaaaagctgggcgttcagaaatattatgaagcatcc
tctgcacaaaagagaatgtacataatgaacgaattggtggaggatgcaatcccgtataat
tttgcagccgtctatcatgtcaaaggaagattagagcatactaaaatccaacaatgcttt
tctaaagtggtcgaaagacatgaggcattcaaaactcggttcgacatggtcgatggtgaa
atagttcaaattattgaagacaatgtcgatttcaaagtaaagtttcaaacgtctgaaaaa
gagcggttagaagaagcaataacagcaaatttaaagccatttaaccttgaaaatgcacca
ttattgcgcgtaacttttattagcttaaatgaggaagaacatgtcatggttctggatatg
catcatattatttcggaccagagttctttagatatcctgctaaaagaaatcggctgtatg
tatcagggtgaggagcttccagatttagagattcaatataaagattttgctaaatggcaa
aacgatttttacaacagcggaaaagtgcaaaagcaactggactattggaaaaatgaattt
aaagaaggtgttccagtactagatttgtataccgattatgacagaccagagtttataagc
tatgaaggcggtaaaattcactattcttttgaacgtgatataaatcaaggaattcttgct
ttcactaagaagcatggaatcacaccatacatgtttattatggcagcccttaatatcatg
ctctggaaatatacaaaccaaaaagatattgtcattggtacagttatttcaggcagaaac
catgcaaaattagaatcgattgtcggtatgtttgttaatactttggctattaaaagtgag
ctcgatgaagatataccactagaagaatttcttcagtatacaaaaaataagctagtcaaa
tcttatgataatcaagattgtcagtttgaattgctagtggaggaacttggtataccaaag
agtgtatctagaaatccgttatttgatattttgtttaattatataaatattggtacggat
gaggtcaatattgaaggactttccttaacaccatatgaaaataacgaaatgaatgtgaaa
tttgatattagttttacattagaagaaaagaatcagcaattttatatggatattgactat
tcaaaagcattgtataaagaagatacgattcgaatcatgggcgagcgacttatttatatc
atttcgcaaatgctcaaggatgtaaacgtaaagcttaaagatattgatatgatgactgtg
gaagagcggaactggcttattgaaacagtaaatcaaacgactacggattatccagcacat
aaaacagtgttaactatttttgaagactatgctagagatacgccaaatgctattgctatt
gaatggttggaagataaaatttcttacaaacagttaaataatatggcaaatcagttagct
gaaaaacttaaagatagaaatgttggataccaagataaggtggccatacttttagaccgc
ggttatatgcaaattgtcagtatgttgggcattatgaaacttggcgctgtctatgtgccg
attgatcctaaatttcctcaagagagaattgattatattctagaggattgtcacagcaaa
gtaatcgttacagattattctttggaagaaaaaataagtgtaaatattgaaaaattccta
atcgataaagatgaaaatacactcaatcgagaacaagatatgggcatagaatccacctat
acatcgcaatatttcaatagtgatgatctgatttatgttatctatacgtccggttctaca
ggaaaaccgaaaggaacattaattaagcataaaaatgtcgtgcgtgtcgtgaagaatacg
aactatatcgatattaacgaaaatgaccgaattatgcagatatctaattatgtatttgac
tgttctgtatttgatatttatggcgctttactgaatggtgccaatcttgtcattattcca
agagagacctcccttgatattcctttgctagcggaatttatagagaagaaagaaattagt
gttttttgtatttcaaccgctttattccatatgttagttgacggaaaagtcgaatttttg
aagaatgtacgtaaaatcattgtagcgggagagcagatttcgctcacacatgcgcaacaa
acagtaaatcaaattggcaaggggaagcttattaatgcctatggtccaagcgaatcggca
gtatttgcaacatattacccgatagatgatatagaggatgtttccattattcctattggt
attccaatatcgaatacaacagtttatgttgtggacgaaaagaaacagttggtaccgatg
aacgttgcaggtgaattatgtttaggtggagatggggtaggagtagggtatctaaataga
gaagaccttacaaatgaaaaatttattacccttgatgcagtaggcggtaaaagagtgtac
tgtaccggtgataaagtgatgtggaacagcagaggccaacttgtatttttaggtcgcaaa
gattttcagataaaactaagaggattcagagtcgagcttggtgaagttgagcgacatata
aaaaatatcgatggaataaaaaatgtcattgttactgccgaaagggatcatctagacacg
ctatatatgacggcttactatacggtgaatgaaaatcatcatatagaaaaatatgatgga
gagtatgtgcgcaatcatttaaataatagattacctgaatatatgattccatctaaattt
gtggtcttaaaagaatttcctctcaactttagcggaaaagttgatcgaaaagcgcttgta
aacgcagaacaatattctcaaaaagtgatggtgcaggatgagccaagaacaactttagaa
aaaacggttctgaaaacaatgcagatgatactggatgttaaggaatttggattgaaagac
aacttctttcatttcggtggtcaatcaattaaagccattgctttagtaaaggcattgtct
aacaaaggtgtggacctcaaaattaatgaaattttccagtaccagacagcagaaaaaatt
gctgcatccatagaaccgcttgcggaagtatcgccgcctatgattgataaaataaggaca
agcaaagatatagaattaaatgcgaaacaaattactagtctcgtaaagaatgttattgcg
cgtattgaaggtctctctgacattattactgcatctgatacgagaatggcgttttctctt
tccccaattcagaaaggtcatatgtcaaaggggtcgaactatagtggatttataagccat
ttcgatggaataatttcgaaaaatagaataaagaatactattgcagacgtaataagtaac
aatcagttgctgcgttgttcattggtggaaaccaatggcgaaaagaaatggtgtgagtat
gaagtactcaaattagaaaccattatgagtaattatcttacatatgtagatatatctatg
tataccgagagtgtaaaaacaactatcatcaataagcttagtgaagaaatacttttaaga
acctactcaaataatgaactactatggcgaatgtgtgtattaaaagaaagtgatacgaga
catctcattatctggggtgccgatcatttgatattcgatggcatgagtgccgagattatc
aaaactcagattgaacaggggttaaaaggtacaacgagcatggaaaatactattcgaagt
tttaaagagtatgttgatgtgctaaacgaagggccattagggattagtgagaaggagcta
attgaaaaatttcatttggtgaagtggagtgaaaataatcgtaaggtaatggcacaacca
aaaggtaacgcaaccttacaaaataatatagaaataatcattcctttatcagatatagag
catttagatatttggtggtatgcgtttgattttgtatctgatattttaagagattacaca
aatacagaagtcattccctttgcagtgctggagtatgcaagaagttatcaggggaaggat
ttttataatagcgtaggcgagtttttagatattgtaccgattattagtgaaaaaggaaat
agaacatcggttgaaacggccattcaactttgtaaagatcattccatcaattatctcgca
ttacttggggaagaacgatttagtaaggactatccaaaattaaatcaactccttagaaaa
tactatttcaatgataaacagtactgtaatttcatcctctataatttccaaggatttgtt
aaagcggaggagaaacaagcatttagtcataacaatactgaaaacagccttgcccgtatg
tctgtaacattaaattatgatagtgaccacctttacattgaaattgaagatgttattgga
attgatgagaaaagatttagaactattgtagaaaaaagaagcgaacaagggagggtatca
caatga
DBGET
integrated database retrieval system