Lysinibacillus varians: T479_20370
Help
Entry
T479_20370 CDS
T03062
Name
(GenBank) multidrug ABC transporter ATP-binding protein
KO
K24708
ATP-binding cassette, subfamily B, putative efflux pump [EC:7.6.2.-]
Organism
lgy
Lysinibacillus varians
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lgy00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
lgy02000
]
T479_20370
Transporters [BR:
lgy02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
T479_20370
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
ABC_ATPase
RsgA_GTPase
Peptidase_M23
AAA_29
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHN23313
LinkDB
All DBs
Position
complement(3994870..3996615)
Genome browser
AA seq
581 aa
AA seq
DB search
MGSVKRYMRFVKPYTWEILLTVFIGIVKFAIPLFIPLLIKIVLDDIIGADDLTDTEKTKE
LFYWLGGTIIVFFVIRPPIEYYRQYFAQHVSNKVLFDIRKEIYAHLQRLSLKYYANTRAG
EVISRVINDVEQTKNFVMTGLMNVWLDFATIVIAVGIMLAMDVKLTLVALIAFPFYAISV
KFFFGKLRTLTRNRSQALAGVQSYLHERVAGMSIIKSFTLEKHEQQLFDEANGEFFEKAL
DHTRWNAKSFAVVNTITDVAPLLVIAYAGYQVINGSLSLGTMVAFIAYIERLYGPLRRLV
SSSTTLTQSIASMDRMFELMDEPYEVKNKENALPLPRATGEVRFENVAFQYEVDGSPILK
NMNFTIKPGETVAFVGMSGGGKSTIISLIPRFYDATAGAVFVDGHNVKDVTIHSLRSQIG
IVLQDNILFSDSVKENILMGKPGASDEEVMAAAKAANAHDFIMNLPNGYNTKVGERGVKL
SGGQKQRVAIARVFLKNPPILILDEATSALDLESEALIQESLDALVHDRTTIIIAHRLST
ITHADNIFVIEHGQLIEEGNHEQLMKKQGTYYNLFQVQHLD
NT seq
1746 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgggtagcgtaaagcgttatatgcgttttgtaaaaccatacacatgggaaatactttta
accgtattcattggtattgtgaaatttgcgattccgttatttattccattgcttataaaa
atagtacttgatgatattattggtgctgatgatttaacggatacagaaaaaacaaaggaa
ttgttttattggctaggtggaacaattattgtatttttcgtgatacgaccaccaatagaa
tactaccgtcaatactttgcacagcatgtgagtaataaggtactttttgatatccgaaaa
gaaatttatgcccatctacagcgactaagcctgaagtattacgcaaatacaagagctggc
gaggtcatttcacgtgttattaacgatgtggaacaaacgaaaaactttgttatgactggt
ttaatgaatgtttggcttgattttgcaacaattgtcattgcggtcggtattatgctagca
atggatgtcaaactgacgcttgttgcactaattgcattcccattctatgcaattagtgta
aagttcttctttggtaaactacgaactttaacacgtaaccgttcacaggcacttgcaggt
gtgcaaagttatttacatgagcgagtggctgggatgagtattattaaaagctttacgcta
gaaaagcatgaacaacaactattcgatgaagccaatggtgagttttttgaaaaagcgcta
gatcatacgagatggaatgccaagtcctttgcagtagtcaatacaattacggacgtggca
ccattgcttgttattgcttatgccggctatcaagtgattaatggctcattatcgcttgga
acaatggttgcttttatcgcttatattgagcgactctatggaccgcttcgtcgattagta
agttcatccacaacgttaacacaatctatcgcttcgatggatcgtatgtttgaattaatg
gatgagccttatgaggtaaaaaacaaggaaaatgcccttccattaccgcgagcaacaggt
gaagtgcgatttgaaaatgtagcctttcaatatgaagtggatggttcgccaattttaaaa
aatatgaactttaccataaaaccaggggagacggttgcatttgtaggaatgagtggtggt
gggaaatctactattattagtttaatcccccgtttttatgatgcgacagctggagcggtt
tttgtagatggacataatgttaaagatgtcacaatccattcattgcgctcacaaattggt
attgtgcttcaagataatattctctttagtgattcagttaaggaaaatattttgatgggg
aaaccaggtgcgtctgatgaggaagtaatggcggctgcaaaagcagctaatgcacatgac
tttattatgaacttaccaaatggttataacacaaaggtaggagagcgaggcgtaaaatta
tcaggtggtcaaaagcaacgagtggccattgcccgtgtatttttaaaaaacccaccgatt
ttaattttagatgaagcgacatcagcgctagatttggaaagtgaagcacttattcaagaa
tcattagatgcccttgtgcatgatcgcacaacgattattatagcgcaccgactttcaacc
attacacatgctgataatatttttgttattgagcatggacaattaatagaagaaggtaat
catgaacaactaatgaagaagcaaggcacttactataatttattccaagtacaacattta
gattaa
DBGET
integrated database retrieval system
