Lysinibacillus varians: T479_21845
Help
Entry
T479_21845 CDS
T03062
Name
(GenBank) oligoendopeptidase F
Organism
lgy
Lysinibacillus varians
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_M3_N_2
Peptidase_M3
DUF6279
Peptidase_M54
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHN23573
UniProt:
A0ABY2T959
LinkDB
All DBs
Position
complement(4309993..4311690)
Genome browser
AA seq
565 aa
AA seq
DB search
MTTFKDYVYSRPNVEAMKEQQLALIEQFKEAQSVEAQSELIEKLNELSNEYATMANLVYI
RASIDTHDSFYQEERDYFDEVGPELEEITTEYYKALIASPFREQLEEKWGQQLFDLASYQ
IKGFSPKVIDLMQKENKLVSEYNKLVASAQIDFNGETLTLAQLGPYTESTDRAMRKAATE
ARFGFFAEHEAEFDRLYDELVKVRHEIAVKLGYKNYVELGYIRMNRIDYNAEMVKKFRDQ
VRDLIVPVATKLFERQAKRIGISDLKFYDEALNFLTGNATPKGDANWIVANGKKMYEELS
PETGEFFNFMIDHDLMDLVAKKGKESGGYCTFIENYHSPFIFSNFNGTSGDIDVLTHEAG
HAFQVFSSRDIGIPEYLWPTYESCEIHSMSMEFFTWPWMELFFKEDTEKYKFTHLSSGLL
FLPYGVAVDEFQHVIYENPEMTPAERKAAWKKIEQTYLPHRDYDGNSYLESGGIWQRQAH
IYASPFYYIDYTLAQICAFQFWKRSREEFDAAWKDYIHLCGLGGSMSFTKLVKEAGLISP
FEDGCVESVIGVIEDYLNSVDDTKL
NT seq
1698 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaacgtttaaagattatgtatacagccgtccgaacgtggaggcgatgaaagagcaa
cagttagctttaatcgagcaatttaaagaagcacaatcggttgaggcacaaagcgaacta
attgaaaaattaaatgaactgagtaatgaatatgcgacaatggcaaacctcgtctacatt
cgagcatcgattgatacccacgattcattttaccaagaagaacgtgattattttgatgaa
gtaggccctgagcttgaagaaattacaaccgaatattataaagcattaatcgcttcacca
ttccgcgagcagttagaagaaaaatgggggcaacagttatttgatttagcatcctatcaa
attaaaggattttcaccgaaagtcattgatttaatgcaaaaggagaacaaactagtatca
gaatataataaactagttgcttcagcacagattgactttaacggtgaaacattaacgcta
gcacagctaggaccttatacagaatcgacagatcgagcaatgcgtaaggctgctacagaa
gctcgatttggcttttttgctgagcatgaagcggaatttgatcgcttatatgatgagcta
gttaaagtgcgtcatgaaattgctgtaaaattaggctataaaaattatgtagagcttggc
tatatccgtatgaaccgaattgattataatgctgaaatggtcaagaaattccgtgaccaa
gtacgtgatttaatcgtgccagttgcaacaaaactatttgagcgtcaagcaaagcgaatc
gggatttcagacttaaaattttatgatgaagctttaaacttcttaacaggtaatgctacg
ccaaagggtgatgcaaattggatagtggcaaacggtaaaaaaatgtatgaagaactatct
cctgaaacgggtgaatttttcaactttatgattgaccatgacctaatggatttagttgcg
aaaaaggggaaagaaagtggcggctattgtacgtttattgaaaattatcattcgccgttt
attttctcgaactttaacggtacatcaggtgatattgatgtgttaacacatgaggctgga
catgccttccaagtattctcaagccgtgatattggcatcccagaatatttatggccaaca
tatgaatcatgcgaaatccattcaatgagtatggagtttttcacatggccttggatggaa
ttattcttcaaagaagacaccgagaaatataaatttacacatttaagcagtggcttatta
tttcttccttacggtgttgctgttgatgaattccaacatgttatttacgaaaatccagag
atgacacctgctgagcgtaaagctgcatggaaaaaaatcgagcaaacctatttaccacac
cgtgactatgatggtaatagctatttagagtcaggtggtatatggcaacgtcaggcacat
atttatgcaagcccgttctattatatcgactacacgttagcacaaatttgtgcgttccaa
ttctggaaacgctcacgtgaagagtttgacgcagcatggaaggattatatccatttatgt
ggcttaggcggttccatgtcatttacaaagcttgtgaaggaagcgggcttaatttctccg
tttgaggatggctgtgtagaatcagtaatcggtgtgattgaggactacttaaattcagtg
gatgatacaaagttgtag
DBGET
integrated database retrieval system