Lysinibacillus varians: T479_23270
Help
Entry
T479_23270 CDS
T03062
Name
(GenBank) C4-dicarboxylate ABC transporter permease
Organism
lgy
Lysinibacillus varians
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DcuC
SCFA_trans
ABG_transport
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHN23807
UniProt:
A0A806LNT0
LinkDB
All DBs
Position
complement(4573854..4575266)
Genome browser
AA seq
470 aa
AA seq
DB search
MANLQENHNVEEPKIKGINAFVLMFIIILVMSVLTYIIPAGQYDRVEINGRMVVDPESFH
YIDSSPVGFLEIFNSVHLGMLEGASIILFVFLFGGALGIMQKTGAIDSFIKVMASKFGQK
EYVLIPILILIFGSLGTLIGSAEDTLVYIAIIIPLTMALGMDAITGFAIVMLGTLATGFT
SGITNPFNIGVAQTIAELPMYSGMSYRIIVFVVFYLLTVIYIIRHAKKVKEDPAKGIYGK
FKREETVELSLDFKMSGRHLLALLVLLANFVALIVGVIKFQWYISEIGGVFLLSSIIMSV
ICKMSPNQMAEGFISGARDMVEGALIIGFAQTILVITTSGGLIDTILHFVANAVSVLPAS
INAVGMFLLQLCLNFLVPSGSGQAALTMPIMTPLADLIGVTRQTAVLAFQFGDGISNMVI
PTSGVLLAGLAIAGIPFSKWFKWVFPYFVIQTTLAIILLVIAHVMNYGPF
NT seq
1413 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaatctacaagagaatcataatgttgaagagccgaaaatcaaggggattaatgcg
tttgttttaatgtttattattattttagttatgagtgtccttacgtatattattccagct
ggtcagtatgatcgagttgaaataaacgggcgtatggttgtagaccctgaatcatttcac
tatatagattcgagtccagtcggtttccttgaaatattcaatagtgtccatttagggatg
ctagaaggtgcttccattattttatttgttttcttatttgggggagcgcttggtattatg
caaaaaacgggagcgatcgattcatttattaaagtaatggcttctaaatttggtcagaag
gagtacgtgttaattccaattctgatattaatctttggtagtttaggaacattaatcggt
tcagcagaggatacacttgtgtatattgccatcattattccattaacgatggctctagga
atggatgccattacaggctttgcaattgtcatgctagggacattagcaactggttttaca
tctggcattaccaatccatttaacatcggcgttgctcaaacgatagctgaattgccaatg
tattcaggtatgtcttatcgcattattgtatttgttgtgttctatcttttaacagtaatt
tatattattcggcatgcaaaaaaagtgaaagaagacccagcgaaaggaatctacggaaag
tttaagagagaagaaacggtggaactatctttagactttaaaatgagcggtcgtcattta
ttggctttgctggtgttgttagcgaattttgttgcattaattgtcggggttattaagttt
caatggtatatcagtgaaattggtggcgtattcttattaagcagcattattatgtcggta
atttgtaaaatgagtccaaatcaaatggctgaaggctttatttcaggagcgcgagatatg
gtggagggtgctttaattattggctttgctcaaacaatcctcgttattacgacatcgggt
ggcttaattgatactattttacattttgtagcgaatgcagtcagtgtactacctgcttct
attaatgcagtaggtatgttcttgctacaactgtgtttaaatttcttagtgccatcaggt
agtggacaagctgctttaacaatgcccattatgacaccattagctgatttaattggtgta
acaagacagacagccgtattggctttccaatttggagacggtatatcgaatatggtcatt
cctacaagtggtgttttgttagcaggtttagcaatcgcaggtattccattttccaaatgg
tttaaatgggttttcccatacttcgttattcaaacgacgttagccattattttattagtt
attgcgcacgttatgaattacggcccgttttaa
DBGET
integrated database retrieval system