Lactobacillus helveticus KLDS1.8701: HUO_04690 Help Entry HUO_04690         CDS       T03777                                  Name (GenBank) CRISPR-associated protein   KO K07012   CRISPR-associated endonuclease/helicase Cas3 [EC:3.1.-.- 5.6.2.4] Organism lhd  Lactobacillus helveticus KLDS1.8701 Brite KEGG Orthology (KO) [BR:lhd00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02048 Prokaryotic defense system [BR:lhd02048]     HUO_04690 Enzymes [BR:lhd01000]  5. Isomerases   5.6  Isomerases altering macromolecular conformation    5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation     5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase      HUO_04690 Prokaryotic defense system [BR:lhd02048]  CRISPR-Cas system   Type I CRISPR-Cas system    Type I signiture cas proteins     HUO_04690 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  Cas3_HD Cas3-like_C_2 Cas3_C DEAD ResIII Helicase_C AAA_19 HD AAA_22 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AJY61224 LinkDB All DBs Position 891865..894606 Genome browser AA seq 913 aa AA seqDB search MQLSNKTLSLWGKKNVNDDNEKLWLPLIAHLIDTKNVINWLYNHWINDGQRHILQRNFED EDIVQNLVKFLGYIHDIGKATPAFQIKQSYINNEDLDQNLVEKLLQNGFDGLDNSKINTS KTPHALAGEVILENNGLNESIGAIIGGHHGKPQEEYFDYEDQLNNWTSNYYQSDSGSETS VGANWKQVQNELINYGLGLCHFNNLEDIPDVTEPQAVILEGLVIMADWLASGEYLVKDNQ RIPLFPLISVDQDFASINTDERYRQGISVWADLFDPWEPEVINNPQRVYKERWKITPRQI QEKMSETIGASLDPGIIIVEAPMGIGKTEIALTAVEQLAAKTGMNGLFFGLPTQATANAM FNRVDKWLSEIATDQKEKLQIKLMHGKAQFNEEYRNIPNADNIEDDSGSVVVNEWFNGKK SILSSFVIGTVDQLLLMGLKQKHLALRHLGMSGKVVVIDEVHAYDIYMDSYLEKAVQWLG AYHVPVIALSATLPVAKRNSLLQAYCVGKYGNKRFKTTNEDWKTCHSYPLLSILDGKTLK QVSDFSDELKNTSIEITRLNIEDSELIKTINQKISDGGVAGVIVNTVRRAQELARLAESK MPSDVNILVLHSAFLATDRRKLENKLQDAIGKNKKRPYKMIVIGTQVLEQSLDIDFDVMY TDIAPMDLILQRIGRLHRHQIQRPKKLEKPQLYIMGINEFGNYGDANESIYAKYLLTKTD YFLKDKVNIPSDISDLVQKVYSEITDSEIKNLRESKQIFEINQKKSKHKANGYQIEAPDD EETLHGWLDNDSGTDLKDSKAEAAVRDTKESIEIVLLYQDDKGFNLLNGQSIEDVYDNII AQQLIRLPHALTINIDRSIEELEKITTKHFPQWKDSNWLKGSLALVLDKNKETEFNGYSV KYSRNLGLIYKKE NT seq 2742 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgcaattatctaataagactttatccttatggggtaagaaaaatgttaatgatgacaat gaaaaattgtggttaccattaattgcgcatttaattgatacaaaaaatgtgatcaattgg ctatataatcattggatcaatgatggtcaaagacatattttgcaacggaattttgaagat gaagatatagttcaaaatttagtgaagtttttgggatatatacatgatattggaaaggca acacctgcttttcaaattaaacagtcatatatcaataatgaagatttagatcagaattta gtagaaaaattattgcaaaatggctttgatggtctagataattcaaaaattaatacaagt aagacgcctcatgcattagctggagaagttattctagaaaacaacgggttaaatgaaagt ataggtgcaattattggagggcaccatggaaaaccacaagaagaatattttgattatgaa gatcagctaaataattggacttcaaattattatcaatcagactctgggagtgaaacctct gtgggagctaattggaaacaagtccaaaatgaattgatcaattatggcttaggattatgt cattttaataatctcgaagatattccagatgtaactgaaccacaagcagttattttagag gggcttgttattatggcggattggttagcttctggtgaatatcttgtaaaagataaccaa cgtattcctctttttcctttaatttctgtagatcaagatttcgcatctattaatactgat gaaagatatcgtcaaggaattagtgtttgggccgatctttttgatccatgggaaccagaa gtaataaataatccacaaagggtatataaagaacgttggaaaattactccaagacaaatt caagaaaaaatgtcagagacaatcggggcatctcttgatcctggtattataattgttgaa gccccaatgggaattggaaagactgaaattgctctaacagctgtagaacagttggcagct aaaaccggtatgaatggacttttctttggcttaccaactcaagctacagctaatgcaatg tttaatcgggtagataaatggttaagtgaaattgctactgatcaaaaagaaaagctgcaa atcaaattaatgcatggtaaagcacaatttaatgaagagtatcgtaatattccaaatgca gataatattgaagatgatagtggttcggtagtggtcaatgagtggtttaacggtaaaaaa tcaattttatccagttttgtaataggcacagtggatcaattacttttaatgggactaaaa caaaaacatttagctttaagacatttaggaatgagtggcaaagtcgtagtaattgatgaa gttcatgcgtatgatatttatatggattcctatttagaaaaagcagttcaatggttggga gcatatcacgttccagtaattgcattatctgctactttacccgtagcaaaaagaaatagt ctattacaagcatattgtgtaggaaaatatggaaataaacgatttaaaactaccaacgaa gattggaaaacatgccattcatatcctttattgagcattttagatggaaaaacgttaaaa caggtgtcagatttttctgatgaactgaaaaatacatctattgaaataacacgattaaat atcgaagatagtgaattgataaaaactattaaccaaaaaataagtgatggtggtgtagca ggtgtcattgttaatacagtgagaagagcacaagaattagcacgtttagctgaaagtaaa atgcctagcgatgtgaatattttggtattacattcagcttttttagctactgatcgtcgc aaattagaaaataaattacaagatgcaattggcaaaaataaaaagcgcccttataaaatg attgtaattggtacacaagttttagaacaatctttagacattgattttgacgttatgtat actgatattgctccaatggatttaattttgcaaagaatcggccggttacatcgccatcaa attcagcgtcctaaaaagttggaaaaaccacagttatatattatgggcattaatgaattt ggtaactatggggatgctaatgagtcgatttatgcaaaatatttgttaactaagacagat tatttcttaaaagataaggttaatattccaagcgatatttctgatttagttcaaaaagta tattctgaaattactgattctgaaattaaaaatctcagagaatctaagcagatttttgaa attaatcaaaagaaatctaaacataaggctaacggttaccaaattgaagctccagatgat gaagaaacattgcatggctggttggacaacgatagtggtactgatttgaaagacagtaaa gctgaagctgctgtaagagatactaaggaaagcattgaaattgttttactatatcaagac gataaaggatttaatttattaaatggtcaaagtattgaggacgtttatgataatattatt gctcagcaattgatcagattaccacatgctttaacaataaacatagatcgctcaattgaa gaattagaaaagataactacaaagcattttccacaatggaaagatagtaattggttaaaa ggttcgcttgctttagtattggataaaaataaagaaactgagtttaatggttatagcgta aaatattcgagaaatttaggtttaatttataaaaaggagtag

DBGET integrated database retrieval system