Lactobacillus helveticus DPC 4571: lhv_0979
Help
Entry
lhv_0979 CDS
T00625
Name
(GenBank) putative surface protein
Organism
lhe
Lactobacillus helveticus DPC 4571
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pectate_lyase_5
Muc_B2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABX27061
UniProt:
A8YUX3
LinkDB
All DBs
Position
959137..961713
Genome browser
AA seq
858 aa
AA seq
DB search
MNSIGDQQVQAADNNPAVKPDDAKVAQSESGTKDTTEVTKNDGSVESLEENPDVKKVAAT
IKPIKKTEETSSTGNENNVEANKSVDQNANSVNKTSEQVAAPNQEEKKATQKPVTSQNQA
QSESIQNKKNNTKTDQTGKIKETKTVKLPDTPKTLSLADFTKETKELETKLPNMSEAERK
AVADKLLADQKTLSAADQAKLATMISEQADISNGQTEHAHDYSSFLSALRNANASTIVLD
NDIDFSNANLKHGLLNLQGGNWERLNNKGIARTVTIQGSKKADGTITELKFGDRYIAFTD
DNQSNGQGWHIKLSDLTLQTENVYGPLYFALVGVTNAGQDYVEYHNVTTTTDTKRVFNSD
AANVQFSGANVLNSSPENGGAAIYANSVEALDGNTIVNALPDAKTTAGSDGNAAILISAY
KSHGNVVIDESANLTVNTDGHYGKQSDNTYDPNRNHDMLGIRYQGAGAQGKSIDEATGGV
VRVKKNGSLTINTGTGGSTAIEAGHLDVQDGANVTINSKHDTHLGHAGDHWGPIMLGYAD
GDNNAEARIGKGANLTIKRISSEAYASMISFGSGMANNGKTFRVEVNGGTLDLQDSAKDV
ATWQKSWVTNAPRAGMITMWDMVVTTLSSNPEYINLQRKNANQAGSMFRMEGSQNHFYIN
DPSADYYQKDGNTAATVPVFIITMKMPIIRVDADHPNELVDPSAYSRQINFVVKYDGAGE
LTPKDNVQTIDFKRTVTASPITGKIIEDGKYTTPWQSDQESFSDVVVPVVPGYHADKKMI
NGIKSIDSIEKTVNYAPNGRIIPVDPDNKELKDVKQPIYKTSATDATQVESGILLPKVKG
YNCNYYARRSRQGYQGNL
NT seq
2577 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaactctataggtgatcaacaggttcaagctgcggataataatcctgcggttaaacca
gatgatgccaaagttgcacaatcagaaagtggtactaaggatactacggaagttaccaag
aatgacggcagtgtagaaagtttggaagaaaatcctgacgtcaagaaagtagctgcaact
attaaaccaattaaaaagactgaagaaacaagctcaacagggaatgagaataatgttgaa
gcaaataaatcagtcgatcaaaatgctaattctgtaaataaaacgtcagagcaggtagct
gctcctaaccaagaagaaaagaaagctacgcaaaagcctgtaacgtctcaaaatcaggct
cagtctgaatcaattcaaaacaagaagaataatactaagactgatcaaacaggcaagata
aaagagactaagacggttaagttgccagatactccgaagactctttctttagctgatttt
actaaggaaactaaggagttagagactaaacttcctaacatgagtgaggctgaacgtaaa
gctgttgcagataagctccttgctgatcaaaagactttgtctgccgcagatcaagccaaa
cttgctactatgattagtgagcaagctgatatttctaatggtcaaactgaacacgctcat
gactacagttcattcttaagtgcgttgcgtaatgctaatgcaagtaccattgtcttagat
aacgatattgactttagtaatgctaatttaaagcatggtcttcttaatttacagggtggt
aactgggagagacttaacaataaaggcatagctcgtacagttacaatccaaggtagtaag
aaggcagacggcaccattactgaattaaaatttggtgatcgttacattgcctttaccgat
gataaccaaagcaatggtcaaggttggcacatcaaattaagtgatcttacgcttcaaact
gaaaatgtttatggtccactttactttgcacttgtaggtgttacaaatgctggacaagat
tacgttgaatatcataatgttactactacgactgatactaaacgagtctttaattctgat
gctgctaatgttcaattttcaggtgctaacgttctcaactcaagtcctgaaaacggtggt
gcagcaatttatgctaatagtgtcgaagctttagatggtaacacaatcgttaatgctttg
ccagatgctaaaactactgctggtagtgatggtaatgctgccatcttaatcagtgcttat
aaatctcatggtaatgttgtcattgatgaaagtgctaatttaactgttaacacagatggg
cactatggtaaacaatcagataatacttacgatcctaacaggaaccatgatatgttgggc
attcgctaccaaggtgctggtgctcaaggtaagtctattgatgaagctactggtggtgta
gtccgcgttaagaagaatggtagcttaaccattaatactggtactggtggttcaactgca
attgaagccggacaccttgacgtacaagatggcgcaaatgtaaccattaatagtaagcat
gatactcacttaggtcacgccggcgatcactggggtcctatcatgcttggttacgcagat
ggtgataacaatgccgaagctcgtattggcaagggcgctaacttaaccattaagcgtata
agttctgaagcttatgcatcaatgatcagttttggtagtggtatggccaataatggtaag
acctttagagtcgaagttaatggcggtactttagacttacaagatagtgctaaggacgta
gcaacttggcaaaagagttgggtaactaatgctccacgtgcaggtatgatcactatgtgg
gatatggtggtaacgacactatcgagtaaccctgaatacatcaacttgcaacgtaagaat
gcaaatcaagctggtagtatgttcagaatggaaggttcgcagaaccatttctacattaat
gatccatcagctgattattatcaaaaagatggcaatactgccgccactgttccagttttc
atcattacaatgaaaatgccaattattcgcgttgatgccgatcatcctaatgaattggtt
gatccaagtgcatattctcgtcaaatcaattttgtcgttaaatatgatggtgcaggtgaa
ttaacacctaaggacaatgttcaaaccattgactttaagcgtaccgttaccgctagtcca
atcaccggcaagatcatcgaagatggcaagtacaccactccttggcaatcagatcaagaa
tcatttagcgatgtggttgttcctgtcgtgcctggataccatgccgacaagaagatgatt
aatggcattaaaagtattgattcaatcgaaaagaccgttaactatgcaccaaacggccgc
attattccggtagatcctgataacaaggaacttaaggatgttaagcaaccaatttacaag
accagtgcaaccgatgctacccaagtagaaagcggaattcttttgcctaaggttaagggc
tacaactgtaactattacgccagaagatccaggcaaggataccaaggtaacctataa
DBGET
integrated database retrieval system