KEGG   Lactobacillus helveticus DPC 4571: lhv_1623
Entry
lhv_1623          CDS       T00625                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K07012  CRISPR-associated endonuclease/helicase Cas3 [EC:3.1.-.- 5.6.2.4]
Organism
lhe  Lactobacillus helveticus DPC 4571
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:lhe00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:lhe02048]
    lhv_1623
Enzymes [BR:lhe01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     lhv_1623
Prokaryotic defense system [BR:lhe02048]
 CRISPR-Cas system
  Type I CRISPR-Cas system
   Type I signiture cas proteins
    lhv_1623
SSDB
Motif
Pfam: Cas3-like_C_2 DEAD ResIII HD Helicase_C Cas3_HD AAA_22 ATPase PhoH
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABX27539
UniProt: A8YWF3
LinkDB
Position
complement(1594754..1597288)
AA seq 844 aa
MVGNFIGHTKKLKNNTIETQSLRDHLLNTQKYAEKYASDLSLEHVAGLAGILHDLGKYQS
KFQEYIIESTRKGDQSKKGSIDHSSFGAIFLRDFISENFSEKENYYDFLDFGGILENAIF
SHHNYLGLKDYINPDLMSPFLNRIEKFKDDEEKKRQLKKCKELFYKDVITEEKFTKYFQL
AFDEYEAFISKIRNKVTLKTEQILNENAKNNKQVMLELQAKYFLSEYVYSCLLDADRTDA
TAFKLSKNPNFSDNTELFEKYYSKLVGKLHKLNKNDNSKINQLRAEISEECDQAAERPSG
IYTLSASTGSGKTLTSLRFGLKHAKLYHKKHIIYVLPYITIIEQNSEVIRKFLNDNKDDS
QNILEFHSNVSQKVADKSEETTNTLDLTEDSWDSPIIVTTMVQFLDSIFASGTKHRRRFH
NLCDSIVIFDEVQKVPIKCLDMFNEAVNFLKNFGNTNVLLCTATQPALEEVKQKLDLNID
HEIIPNLIEHEQQFKRVEFIDKTQNDDGIDLVLNSIQAAELIFKKSQNFKSILGIFNTID
VTKKIYSNLKNKFDSISDQIKLEYLSTNMCPADRKERIKNVLNLVKEGKRVICISTPLIE
AGVDASFECVFRSLSGLDSLVQAAGRCNRNNELKLGKVYLLNMDPSEEHIAKLNEVKTGK
DQVLELLSEGIKADDFLNANVIKKYFEMFYSKLASTMSYPTNGINLENYIDGIKNVHELA
YQSKRKDASKFEKLTQFSGSETIAKYFQVIKNNTKSVLAPYGDKGEKLIADLNGNQDINS
LIMLVKDAQPYIVNLYDNKFNQLFEEGDIYTLCQVGNEVIYAFRPYAYNKLVLGDRKQIE
KSIF
NT seq 2535 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggtgggaaattttattggtcataccaaaaaattaaaaaataataccatagagacacag
tctctcagagatcatcttttgaatactcaaaagtatgcagaaaaatatgcatcagattta
tcacttgaacatgttgctggcttggctggaattttacatgatcttggtaaatatcaaagt
aaatttcaagaatatatcattgaatctactagaaaaggtgatcaatcaaaaaaaggtagt
attgatcattccagttttggtgcaatttttttaagagattttattagtgaaaatttttct
gaaaaagagaattattatgattttttagactttggaggtattttagaaaatgctattttt
tctcatcataattatttagggttaaaagattatataaaccctgacttaatgagtcctttt
ctaaatagaatagaaaaatttaaggatgatgaagaaaagaaaagacaattaaaaaaatgt
aaagagttattttacaaggatgttataactgaagaaaaattcactaagtattttcaatta
gcattcgatgagtatgaggcatttatttcaaaaatacgtaacaaagtaacattaaaaaca
gagcaaattttgaatgaaaatgcgaaaaataataagcaagtaatgttggaattacaagct
aaatactttctttccgaatacgtatattcatgtcttctagatgccgatagaacagacgca
acagcatttaaactttcaaaaaatcctaacttttcagataatactgaactgtttgaaaaa
tattattcaaaattagttggtaaattacataaattaaataaaaatgataatagtaaaatt
aatcaattgcgagctgaaatatctgaagaatgcgatcaagcagctgaaaggccatcggga
atatatactttgtcagcttcgacaggttctggtaaaacgcttacctcactaagatttgga
ttgaaacatgccaagctttatcataaaaaacatattatttatgtacttccatacataacc
atcattgaacaaaattctgaagttataagaaagtttttgaatgataataaagatgactca
caaaatattctggaatttcatagtaatgtttctcaaaaagttgctgataagagtgaagaa
acaacgaataccttggatcttactgaagacagctgggattcaccgataattgtaactact
atggttcagttcctagattctatttttgcctcagggacaaaacataggagaagatttcat
aatctttgtgattcgattgttatctttgatgaagttcagaaagtaccaattaagtgtctt
gatatgtttaatgaggcagttaatttcttaaagaattttggtaatacaaatgtattactt
tgtactgcgacacagccagctcttgaggaagttaaacaaaagctagatttaaatatagat
catgaaattatacccaatttaattgaacatgagcagcaatttaaacgggtggagtttatc
gataaaacacaaaatgatgatggcattgatctagtattaaattcgattcaagctgctgag
ttaatttttaaaaagtcacagaacttcaaatcgatattaggtatttttaatacgattgat
gttactaaaaaaatatattcaaatttaaaaaacaaatttgatagtatcagtgatcaaatt
aagcttgaatatttgagtactaatatgtgtcctgccgatagaaaagaaagaattaaaaac
gttcttaatttagttaaggaaggcaagcgagtaatttgtatttcaactccactaatcgaa
gccggtgttgatgctagttttgaatgtgtatttagatcactttctggtttggattcactt
gttcaagctgcaggacgatgtaatagaaataatgaattgaaactcggaaaagtttattta
ctcaatatggatccttctgaggaacatattgctaaacttaatgaagtcaaaacaggtaaa
gatcaagtgcttgaattacttagtgagggtataaaagccgatgattttctaaatgcaaat
gtgattaaaaagtattttgaaatgttttactcaaagcttgcaagcacaatgtcatatcca
actaatggcattaatctagaaaattatattgatggtattaagaatgtacatgaacttgca
tatcagagtaaaagaaaagatgcctccaagtttgaaaaactcacgcaattttcaggcagt
gaaacaatagcgaaatactttcaagttattaaaaataatactaaatcagttctagcaccg
tatggtgataaaggggaaaaattaatagctgatttaaacggaaatcaagatatcaatagc
ttaattatgctagttaaagatgcacagccttacattgttaatttatacgataacaaattc
aatcaactatttgaagaaggtgatatatacacattatgtcaagtaggaaacgaagtgatc
tatgcttttagaccatatgcatacaacaaattggtcttaggagatagaaaacaaattgag
aaaagtattttttag

DBGET integrated database retrieval system