Paucilactobacillus hokkaidonensis: LOOC260_109290
Help
Entry
LOOC260_109290 CDS
T03598
Name
(GenBank) penicillin-binding protein
KO
K21465
penicillin-binding protein A
Organism
lho
Paucilactobacillus hokkaidonensis
Pathway
lho00550
Peptidoglycan biosynthesis
lho01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lho00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00550 Peptidoglycan biosynthesis
LOOC260_109290
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01011 Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:
lho01011
]
LOOC260_109290
Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:
lho01011
]
Peptidoglycan biosynthesis and degradation
DD-Transpeptidase (Class B PBP)
LOOC260_109290
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Transpeptidase
PBP_dimer
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAP85469
UniProt:
A0A0A1GX50
LinkDB
All DBs
Position
947635..949698
Genome browser
AA seq
687 aa
AA seq
DB search
MKFSTRVKSIFKSRAKKRTVQSEIPFRLNFLLWTVGILLLILTARLFYLQVLNGDSYKAE
VNRSDTTTETNSVQRGMIYDSTGKVLVGNQAHQAVTYTKDSSATTADIYKTAKILGKYLT
VSTAKLTKREQKDYFLADSSNLKKMIKKIPGASKLSDSDQYTKVIDYLGKHPSEYKLSDA
QKNKAMIYASMSGAYSLSTTYIKETGVTSKEIAEVGEHLNEMTGVKVGTSWSRNYPSGSA
IQSLTGSVSNQKTGLPSDEVNMLLSEGYSRNDSVGQSYLEKEYQSTLAGSKSQTEVSSSS
SKQITKAVTKYAGKKGDNLVLTINAKFQKQVQKIVKSDYSSFGGNGNSTGAYAVVMNPNT
GAIYAMGGVDRDLKTGKITSDQIGSINHPIVMGSVVKGATVLGALMDGVITPSSNTLNDQ
PIKVAGTASKSSWWNRTGSVPITAEEALEVSSNSYMMQLAMKEAGTKYVAGSSLNMPTSI
FSKLRGYFNQFGLGVKTGIDLPGETTGYTGPTNVIGKALDLAYGNYDSYTVMQLAQYAST
IANGGYRMKPYVVQQVRGTNKDGSLGKVESTTQPTILNTINATQAQWKVVRSGMNMVVHG
SSAYKTGSAFSSLSPSVSAKTGTAETFRGTTSTLTHSVIMFGPSSDPQVVIAIAVPGAST
SSAAVSSTMGKEIYEAYWKTVQSSSGY
NT seq
2064 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaaattttcgacacgagtaaaatctatttttaaatcacgcgctaagaagagaacagtt
caatcagaaattccatttaggttgaactttttattgtggacagttggtattttgttatta
attttaacagcacggcttttctatctgcaagtgttaaatggtgacagttataaagcagaa
gtcaatcgctcagatacgacgactgaaactaacagtgttcaacgtggtatgatttatgat
tccacaggtaaagtcttagttggtaaccaagcacaccaagcggtgacctataccaaggat
tctagtgcaactacagctgatatttataaaacagctaaaatacttggaaaatatttaact
gtttcgacagccaaattaactaagcgcgagcaaaaagattattttttagctgactcaagc
aatttaaaaaagatgatcaagaaaataccaggcgcttcaaaattgtctgacagtgatcaa
tataccaaggtaattgattatctggggaagcatcccagtgaatataaactaagcgatgca
caaaaaaataaagcgatgatttatgcatctatgagtggtgcttattcattatcaacgact
tatatcaaggaaactggcgttactagcaaagaaattgctgaagttggggaacatcttaat
gaaatgaccggtgtgaaagttggtactagttggtcacgaaattatccttccggatcagcg
atccagtcgttaactggatcagtttctaatcaaaaaaccggattaccaagtgatgaagtt
aatatgctattgtcagagggttattcacgaaatgatagtgttgggcaaagctaccttgaa
aaagaataccagtcaacattagctggttcaaagtcgcaaacggaggtatcgtcatctagc
tcaaagcaaatcacaaaggctgttactaaatatgccggtaaaaaaggtgataatttagtc
ttaacaattaatgctaaatttcaaaaacaagttcaaaaaattgttaaatctgattatagt
tcgtttggtggtaacgggaattccaccggtgcctacgcagtggttatgaatcctaataca
ggtgcaatttatgccatgggtggagttgatcgagacttgaaaactggcaaaattactagt
gaccagatcggatcaattaatcatcccattgtcatgggatctgtggttaagggtgcaacg
gtgctgggtgccttgatggacggggttatcacaccatccagcaatacacttaatgatcag
ccaattaaagttgccggaactgctagcaagagttcatggtggaatcgaactggatcagtt
ccaatcaccgctgaagaggcgctagaagtgtcatcaaactcatacatgatgcaactagca
atgaaggaggctggtaccaaatatgttgctgggtctagcttaaacatgcctacaagtatt
ttctcaaaattacgcggttactttaatcaatttggtttgggtgttaaaactgggattgat
ttaccgggtgagactactggatatacggggcctactaacgttattgggaaggcattagat
ttggcctacggtaactatgatagttatacagttatgcaactggctcaatatgcttctacc
attgctaatggtggttatcgaatgaaaccatatgttgttcagcaagtcagaggaactaac
aaagacggttccctgggaaaagttgaatctactacgcagccaaccattcttaatacgatc
aatgctacgcaggctcagtggaaagttgtccgttcggggatgaacatggtggtacatggt
tcgagcgcatataaaaccggaagtgcgttttctagtttatctccatctgtttcagctaag
acaggaactgccgaaacgttccgaggaactacatcaacgctaacgcatagtgttattatg
tttggtccttctagtgatccgcaagtagtaattgcgatcgctgtgccaggagcatctaca
agtagtgctgcggttagttccacaatggggaaagaaatttacgaggcttattggaaaaca
gttcaatctagcagtggttactaa
DBGET
integrated database retrieval system