Paucilactobacillus hokkaidonensis: LOOC260_111860
Help
Entry
LOOC260_111860 CDS
T03598
Name
(GenBank) GTP-binding protein LepA
KO
K03596
GTP-binding protein LepA
Organism
lho
Paucilactobacillus hokkaidonensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GTP_EFTU
LepA_C
EFG_C
GTP_EFTU_D2
EF-G_D2
RF3_C
EFG_III
MMR_HSR1
Ras
MMR_HSR1_Xtn
SRPRB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAP85725
UniProt:
A0A0A1GUS4
LinkDB
All DBs
Position
complement(1183172..1185046)
Genome browser
AA seq
624 aa
AA seq
DB search
MLMNTEKVSTTMNLDEMKERQKHIRNFSIVAHIDHGKSTLADRILELTDTVSKREMQDQL
LDTMDLERERGITIKLNAVALKYHAEDGETYIFHLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGAIL
VVDAAQGVEAQTLANVYLAIDNDLAIIPVINKIDLPSAEPEKVRKEIEDEIGLDASDAVL
ASAKTGIGIEEILEQVVKNVPAPDGDLDKPLKALIFDSIYDDYRGVVLSVRVFEGTVKPG
DRIKLMNGGTEYEVTEVGVNSPKPLARDILMAGDVGYITGSIKDIQDTQVGDTVTSADNP
TAKPLEGYRKMNPMVYSGLYPTDNAKFVDLREALEKLQLNDASLTFEPESSQALGFGFRC
GFLGLLHMDVVQERLEREFNLDLITTAPSVTYRVDLVDGSEKKVENPAEMPDAATIKAIN
EPFVKAQIMVPNEYVGAVMELCQRKRGIFDTMDYLDDIRVNIIYHIPLSEIIFDFFDKLK
SNTRGYASLDYEIEDYRPSNLVKIDILLNSEKVDVLSFIAHVDFAEQRGRDITAKLKTII
PRQNFEIPIQAAIGSKIIARTNIKAYRKDVTSKIHTGDPDRRAKLLDKQKRGKKRMKSVG
VVDIPQEAFMAVLQTGEEETHKKK
NT seq
1875 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaatgaacacggagaaagtgagcacaactatgaacttagatgaaatgaaagaacga
caaaaacatatccgtaatttttcaattgtggcccatattgatcacggtaaatcaacgtta
gctgatcggattttggaactgacggatacagtttccaaacgtgaaatgcaagatcagtta
ttagacacaatggatttggaacgcgaacgtggaattacaatcaagttaaacgcggtggca
ttaaaataccatgctgaagatggtgagacctatatttttcacttaattgacactccagga
cacgttgatttttcttatgaagtgtctcgttcgttagctgcttgcgaaggggctatttta
gtagttgatgctgcgcaaggtgttgaagcccaaacgttggctaacgtctatttggcgatc
gacaacgatttggcgattataccagtgattaataaaattgacttaccctcggccgagcca
gaaaaagtccgcaaagaaattgaagacgaaattggattggatgcttcagatgctgtatta
gcgagtgccaaaaccggaattggaatcgaagaaattttggaacaagttgtaaaaaatgtg
cctgcgccagatggtgatttggataagccgctaaaagctttaatttttgattcaatttat
gatgattatcgtggtgtggtcttaagcgtccgcgtatttgaaggaactgttaagccggga
gatcggatcaagttgatgaatggcggaactgaatatgaagtcacagaagttggcgttaac
tcacccaaaccattagctcgtgatatcttgatggccggggatgttgggtacatcactggt
agtattaaggatattcaagatacgcaagttggtgatacggtgactagcgcagataatcct
actgcaaagccactagaaggatatcgtaaaatgaatccgatggtttattctgggttatat
ccaactgacaatgctaaatttgttgatttacgagaggccttggaaaaactacagttaaac
gatgcttcgctaacctttgaacccgaatcatcacaagcattaggttttggattccgttgt
gggttcttaggattacttcacatggatgtggttcaagaacggttggagcgagaatttaac
cttgatttgatcaccacggcgccttcagtaacatatcgagttgatttggttgatggcagt
gaaaagaaagttgaaaatccagcagaaatgccagatgctgccactatcaaagcaattaat
gaaccgtttgttaaggcccaaattatggtgccaaatgaatatgtgggtgccgtaatggaa
ttgtgtcaacgcaagcgggggatctttgatacgatggattatctggatgatattcgcgtt
aatattatttaccatatcccattgtcagaaattatttttgatttctttgacaaacttaag
agtaatacgcgcggatatgcatcactagattacgaaattgaagattatcgtcccagtaac
ttggttaaaattgatatcttgctaaatagtgagaaagttgatgtattaagttttattgcc
cacgtggactttgcagaacaacgtggtcgtgatattactgctaaattaaagacaattatt
cctcgccaaaattttgaaatcccgattcaagcggcaattggttccaaaataattgcgcgt
actaatatcaaggcttatcggaaagatgtgacttcaaagattcatacaggagatcctgat
cgacgtgccaagttgttagataaacaaaagcgtggtaaaaagagaatgaagtcagttggg
gtggttgatatcccccaagaagcctttatggctgtgctgcaaactggggaagaagagacc
cacaagaagaagtga
DBGET
integrated database retrieval system