Paucilactobacillus hokkaidonensis: LOOC260_115720
Help
Entry
LOOC260_115720 CDS
T03598
Name
(GenBank) glycerophosphodiester phosphodiesterase family protein
KO
K01126
glycerophosphoryl diester phosphodiesterase [EC:
3.1.4.46
]
Organism
lho
Paucilactobacillus hokkaidonensis
Pathway
lho00564
Glycerophospholipid metabolism
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lho00001
]
09100 Metabolism
09103 Lipid metabolism
00564 Glycerophospholipid metabolism
LOOC260_115720
Enzymes [BR:
lho01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.4 Phosphoric-diester hydrolases
3.1.4.46 glycerophosphodiester phosphodiesterase
LOOC260_115720
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GDPD
GDPD_2
GPDPase_memb
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAP86082
UniProt:
A0A0A1GUY5
LinkDB
All DBs
Position
complement(1528149..1529627)
Genome browser
AA seq
492 aa
AA seq
DB search
MTKRIELTGIMWVLVIINNWLLANIKLATWIKISCLFCSLLIVIAWVSYQLKAQENIGKT
SWIVGLSLLIGWIMLLPLGGLGLTSHVINLIYIPQTALRVLYLRRILIVPVIAICYCSLL
VLWWRQLRGWILRSLNPHFATGSLFTNQFFKSFGIQLLVTIVGFGLMYLCVNWIAKANDF
LGGAMLLLIGTWILANWISFLITQYFQLQLTSEPNVIIGIGLMVASVLLVIGWTQSLNYS
SQLKTPEIISHRGVDGHNGVQNTVQSLHKTSEKKPAAIEMDIQETEDKSFVCFHDVNLKG
LARRNTTVHNLRIARLQRISLSEHGFKTPVSTFNQYLKRARQQHLIVEIKPQHVSPTQVA
QTFGSHYADKLESRHDKVHSVDDQIIAQLHRSYPRLSVGLIRPFVISRLATKDVNFYSLD
YRTVNQQTVQFLHAHHKKVYVWTVDKPQVAQRMLQLGVDGIITDRLSLIRAKINVMKAPV
TTRVTNVLWQLI
NT seq
1479 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacgaaacgaatcgaattaactgggatcatgtgggtgttggtaatcattaataattgg
ttattggcaaatattaaactagcaacttggataaaaatcagttgcttattttgtagcctg
ttaattgttattgcgtgggttagttatcagttgaaggcacaagaaaatattgggaagacc
tcatggatcgtcggacttagtttgttaatcggctggattatgttgttgccattgggtggt
ttaggattaactagtcatgttatcaatctaatttatatcccacagacagccttgcgggtg
ctgtatctgcgacgtattttgattgtaccggtgattgcaatctgttattgcagtctgttg
gttttgtggtggcggcagctacgaggatggatacttcgatcattaaatccgcattttgcc
accggtagtttatttactaatcaatttttcaagtcatttggcattcagctactggttacg
atagttggtttcgggttaatgtatctatgtgtcaattggattgctaaggctaatgatttt
ttaggtggcgcgatgttgctgctaatcggtacatggatattggctaattggattagtttt
ttgattacccaatattttcagttacaattgacaagtgagcctaatgtgattattggtata
ggcttgatggtggcgagtgtgctactagtaattgggtggacccagagtctaaattattcc
agtcagttgaaaacaccagaaattatctctcaccgtggtgttgatgggcataatggggtc
caaaatacagtccaaagtctccataaaactagcgagaaaaaaccggctgcaattgaaatg
gacattcaggaaacagaagataaatcatttgtgtgttttcatgatgttaatttaaagggc
ttagctcggcgaaacactactgtgcataatttgagaattgcacggttacaacgaattagc
ttgagtgaacatggctttaagacgccagtatcaacctttaatcagtatttaaagcgtgct
cgacaacaacatctgatagttgaaattaagccgcagcacgttagtccaacccaagtagca
cagacgtttggatcgcattatgcagacaagcttgagtcccgacacgataaagttcactca
gtggatgatcaaattattgctcagttacaccgaagttatcctagactatcggtggggtta
attcggccgtttgtaattagccggttagcaactaaggatgttaatttttattcgctggat
tatcgtactgtgaatcaacaaacggttcagtttttacatgcacatcataaaaaagtatat
gtttggacagttgataaacctcaagtagcacaaagaatgttacagctgggagtcgatgga
attatcaccgatcgattaagtttaatccgtgctaaaataaatgtgatgaaagcgccagtt
acaacgagagtaacaaatgttttatggcagttaatctaa
DBGET
integrated database retrieval system
