Lactobacillus helsingborgensis: DLD54_03450
Help
Entry
DLD54_03450 CDS
T06906
Name
(GenBank) ABC transporter permease
KO
K02004
putative ABC transport system permease protein
Organism
lhs
Lactobacillus helsingborgensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lhs00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
lhs02000
]
DLD54_03450
Transporters [BR:
lhs02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
ABC-2 type and other transporters
Putative ABC transporter
DLD54_03450
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsX
DUF4407
Exonuc_VII_L
HrpB7
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWN33265
LinkDB
All DBs
Position
complement(689719..692511)
Genome browser
AA seq
930 aa
AA seq
DB search
MNNVILKDFWRSIKHTKGQFISIMGLMMIGAFALVGLMVTGPDMRDTGNHYAQKLNTADL
TVICNYGLDHKDTQKIKQTKGLQDVEFGYMTDTVIKHSHESFRIFSKPKLVGKYEVRQGH
LPAKQNEIALADHYSSRYKIGQKISFTEKKNILGTTLLKRKSFKITGFVRSSQILSNVNL
GQSNSGTGELKGYAVVSPKAFDQTVYTTANLRYKDLRGLDSYGKTYTSKVKKHKKVLQNA
LKNSAHQRKQRILNSAQEKLAPQEKKIQRAEQKIKVANQQINAAEKQLATQKAKLNTQIA
QAKNAGTNLPATARMQLERAQQEIAAGEQKLQQEKRQFSHQSAVATEKIKAGKNKINKIK
SKLKKLELPNYSVYNRREVPGGEGNLVYTTVAQVVEDLAKVFPIFLYFVAALVTFTTMNR
FIDEERINSGTMKALGYDDYVIINKFIAYGFISGTIGTILGVYLGHTLMPQIVYHAYYKS
ITIPPIELHFHWQISIIALLLSWISSVLPAYLTAKNEFREKPAALLLPKPPAAGSTILLE
KISFIWNHLSFTHKVTARNIFRYKKRMLMTIFGVCGAATMLFAGFAVKNSITNMNNRQFN
DLIHYNMIVAEKPGISDQQEKSLSKKLQAGSIKSETPIYYESLSKTAGKTGDTQDITLIA
PSSSKVLKDYVHLNNRKTKQTLHLSNNGVIISERLSTLLNVSEGGYISITDKDNHVRKMK
VAGITEMYMGHFVFMNKTEYQRVFKRNFKSNAYLVNLKNSSRKNTRKMAAQFMALNGVAG
VVQNTAVSQELDVVVQSLNLIMVVLIVVAGLLAIVIQYNLTNINIAERIRELSTIKVLGF
YDNEVTMYIYRETILLTVIGILVGYLTGDLLYRYILYVVPPDNVMFNPALSTSSFLWPLG
VIGTITIVLGFIVNRKLKNLDMLEALKSVD
NT seq
2793 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataacgtaattttaaaagatttttggcggtcaattaaacatactaagggacaattc
atatcaattatgggcttaatgatgattggtgcatttgccctagtgggcttgatggtcact
ggtcccgacatgcgtgacactgggaatcactatgcgcaaaaattaaataccgctgactta
actgttatttgcaactatggtctggatcacaaggatactcaaaaaattaagcaaactaag
ggtctgcaagacgttgaatttggctatatgacagatacggttatcaaacatagccatgaa
agttttcgcattttttcaaagccaaaattagtaggtaaatatgaagtgcgtcaaggtcat
ttacctgccaagcaaaatgaaattgctttggccgatcactattcttcccgctacaaaatt
gggcaaaaaattagtttcactgaaaagaaaaatattttagggaccacattactaaaacgt
aaaagttttaagatcactggtttcgtgcgctcaagccaaattttatccaacgttaattta
ggccaaagtaatagtggtacaggtgaacttaaaggatacgctgtagttagccccaaggca
tttgaccagacagtttatactactgccaatttaagatataaagatttacgtggacttgat
tcatacggtaaaacttacaccagtaaagtcaaaaaacataaaaaagttttgcaaaacgct
cttaaaaatagtgctcatcaaagaaaacaaagaattttaaattctgcgcaagaaaaatta
gctcctcaggaaaagaaaatccaacgtgccgagcaaaaaataaaagtggcaaatcaacaa
attaatgcggctgaaaaacaattagcaactcagaaggctaaactaaatacgcaaatagca
caggcaaaaaacgcaggtacaaatttaccagccactgccagaatgcagcttgaacgagct
caacaggaaattgctgcaggcgaacaaaagctgcagcaagaaaaaaggcaattttcccat
caatcggccgttgccactgagaaaataaaagctggcaaaaataagatcaataagataaag
agtaagttaaaaaagctagagctaccaaactacagcgtatataacaggcgtgaggttccg
ggtggtgaaggaaatctagtctacacaactgttgcacaagtagtagaagatctggctaaa
gtgttcccgatttttctctactttgttgctgctcttgttacctttaccaccatgaaccgt
tttattgatgaggaaagaattaactccggtacaatgaaagcattgggctatgacgattat
gtcatcatcaataaatttattgcctatggctttatttccggcacaatcggtactatttta
ggcgtttatttaggtcatactttgatgccccagattgtttatcatgcctattacaaatct
atcacgataccgccaatcgaattacactttcattggcaaattagtataatcgctcttttg
ttatcctggatcagttcagttttgcctgcttacttgactgctaagaatgaatttagggaa
aaaccagctgcactgctattgccaaagccgccagcagccggttctacaattctactggaa
aaaatttcttttatttggaaccatcttagttttacccataaggttactgcgcgtaatatt
tttaggtataagaagcgcatgttaatgacaatttttggcgtttgtggtgccgctacaatg
ctatttgccggatttgcagttaaaaattcgatcactaatatgaataacaggcaattcaat
gatcttattcactacaacatgattgtggcagaaaaacctggcatttccgatcagcaagaa
aaaagtttaagtaagaaattacaagctggcagcattaagtcggaaacccctatttattat
gaatccttgtctaaaactgctggtaaaaccggtgacactcaagatatcacgttaattgct
ccttcttccagtaaagtcttaaaggattatgttcatttaaataaccgtaaaacaaaacag
acccttcatttaagtaataacggcgtaatcatttctgaacgcctttctaccctgcttaat
gtgagtgaaggcggctatatctcaatcacagataaagataaccacgttagaaaaatgaaa
gtagctggtatcacagagatgtatatggggcattttgttttcatgaacaaaacagaatac
cagcgagtctttaaacgtaatttcaaatctaatgcctatctggttaatttaaagaattcg
agtcgcaagaacacgagaaaaatggccgcacaatttatggcactaaacggcgtggcagga
gttgtccaaaatacagcagttagccaagaattagacgttgtagtgcaatctttaaacttg
attatggttgttttaatagtggttgcaggtctgctagcaattgttatccaatataattta
actaatatcaacattgctgaaagaatacgtgaactttcaactattaaagttttaggtttc
tacgataatgaagttaccatgtatatctaccgtgaaaccattttgttaacagtaattggt
attttggtaggctatttgactggtgatttgctctatcgctatattctttatgttgttcca
cctgataatgtcatgtttaatccagcattatcaacgtctagttttctttggccactggga
gttatcgggacaattactattgttttaggctttatcgtgaatagaaaacttaagaatttg
gacatgctggaagctttaaagtcagtggattaa
DBGET
integrated database retrieval system