Linepithema humile (Argentine ant): 105669322
Help
Entry
105669322 CDS
T04898
Name
(RefSeq) NBAS subunit of NRZ tethering complex-like
KO
K20473
neuroblastoma-amplified sequence
Organism
lhu
Linepithema humile (Argentine ant)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lhu00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
lhu04131
]
105669322
Membrane trafficking [BR:
lhu04131
]
Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
Retrieval pathways
NRZ (DSL1) complex
105669322
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Nbas_N
Sec39
ARM_KNTC1_1st
WD40_WDHD1_1st
Beta-prop_WDR35_TULP_N
E7
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105669322
NCBI-ProteinID:
XP_012217633
LinkDB
All DBs
Position
5:18064234..18071814
Genome browser
AA seq
1918 aa
AA seq
DB search
MSNLNETPNEPILYELLEYFVRKQEPELIKCKTDAAILPTSGTIKNALRYLNNRYSLPES
ISQQVSLTLPWKFAVGDHGRVLAILQENVIEIRKAKDEYSSIIGKASAPKDAFPQWRKLA
WSPDGMILVLASSSGYTSFYNALGNNIFNISPKTMSQNPHILEAGDAIASMLFLKPRVKH
EKWAYEFILISYSGLLRSYHISTNAFSANYDFSFGNFYKNGINAVAYDEKHNLFYVAGNI
ITQKLTSTASESGLTSWRLLNDYPYCKLSFTFEDSAINKSRFSVWNLIPVFNFQPGSIIF
MIKISPNGEFLACLHTDGSVSLWGLPNLILQKKWKLSEQPEYNTLNPIGPKSKKFPPGFT
EFHPIDIGWWSDQAIIIARYSGSTSVCSTWNLKNLLGVSPEFLAGQPQVCELGLEKGCLC
LDCETFITSKKRSRDTNDGHLSEASSESEKDDDESEPVTIFNYTTNLVQSTLYSITDIET
FQPKRKKSKVLHRTYRILGLKSTTPEELYSRKIDIEEYEEALTLANTYNLDTDLVYQTQW
RKSELSLNAISEHLSKISKRSWVLNECVLRVPDTIEAARELLNFGLKGANLETLIAIDTC
DNDKFITPDTDEDWPDESTANLRQVQKVNEMLEKIEIKNLSEAQKNLIKYRRQLLRHLDK
LLTYEIILEPPLKYKKKFYEEFRRLSAVENAVRFAKDGDCRSVQIMFTYYGESLLPHWLA
IISFFPETLNPSDYEKLLPECDSENQLFLLDQRELRQKDWSEKYQFNELINQDLIDEEYE
ILYELDPSLLIYRNVQLTPDLLEKWYKRRAYEIEKNCSMVDNALQLIKIAKSHNINGVED
LLLDLETLDDLVYKVYLEDMSLDKLEKLSNLNKIKLLMSTSTETNFVENIRNLLLPFIKR
RHQYLGGDLQKDLLSDYLICLSKDDLTFPVKFFEHLKQVQDVEMVKMIDDIATLALNCIY
ACDDLNMYEKARNILDSILKDHDGSRANAISDLLDELEGELDCMRLLSKYGVKTTLKFIR
NNKTNPDVARSLLTQMSRNLSKRLLPPDEKEWAQLLNDMLDVHGLIFSCVAVETCFEICV
SARLVSGIKSTIQNCATLIETKKNEKSLLKVFYEKAINLILEATKEYFNGSKTLTDPNME
LAKTCLHLIEDDNAKIKEEYDLIKSLQILNEFNVDILPLQVRLTVDRLILIEHCLNNQRD
AYKNRQRLLTLASYLRVEGNNNRLREGKVLELIAKKALETEDYNTCATICMQLTQNNYLP
AWETCLNLGRCDDYQDLNIRKKCLWFAINNGSNDILGNALEHIHLIETQILHKNLELWMP
SVEFESLKDEESDESEDDFTDAMTTPQVEVKEFVPKMLETSTEIVKSSANIMKESTFGLI
KNISDTNFWKSRLRFNFTNNSNTQHEAEGEQSEEDVDLQSFPCYYESLHEMCRISNNETR
YNKYSMADIQNIRLKCCRALLRITILSESSCYGLEVSDINHLLLECAKHTMQDDWLLGMT
YLLSLNKDRVLDAQAIFMDLPQTELYIQTALYYYSLELHKKLYTDCEKLYLYSPLDLMKN
MMAAAQKSEKCDIVKALQYWQHCLLGGTQIDKTEHLVTKDTSTLEQDGACVDFGKITNKE
QETVEDIDVNVPLVTSTTDENPKKIASDDVDVVEWTDDWGDFSDDDTEATSDKKNKIGSK
EILQAQTVLPFDHGIDECVTEEDRFNLFQTLLNRTDNLQQYQRLKEIISEWPQFNMPNHI
TVDNHPILKMMKTIILLIPKTDIIDSEKRILQEHEELIGLLASKEILKQFLELERDNINL
VQNVYIRLCSEDSSMHKEAVDFIKQQQAIILPSLVLEKLFLNDLTALFKPDHDVYNQIIE
HVFINESLTNVEKNAKVLVHELKKQKYILEALNIIRLMEKIPSAMCTFDTCFELLMKE
NT seq
5757 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaatttaaatgaaacaccgaatgaaccaatattgtacgaattattagaatatttc
gttcgcaaacaagaaccagaattgataaaatgtaagactgatgcagctattctcccaact
tctggcacaataaaaaacgctctcagatatctcaataataggtattccttacctgagagc
atctcacagcaagttagtctcacattaccatggaagtttgctgttggagatcacggtcgt
gtacttgctattctacaagaaaatgttattgaaatacgaaaggctaaagatgaatattcc
tctattataggcaaagcatctgccccaaaagatgcatttcctcaatggcgtaaacttgca
tggagtccagatggaatgatcttagtattagcatctagtagtggttatacatctttttat
aatgcattaggaaacaatatttttaatataagtccaaagacaatgtcacaaaacccacat
attcttgaagcgggtgatgcaatagcatctatgttgtttcttaaaccaagggtaaaacat
gaaaaatgggcctatgaatttattttaatttcatacagtggattgctcagatcctatcac
atttctacaaatgcctttagtgcaaattatgacttctcttttggcaatttttataaaaat
ggtattaacgctgtagcctatgatgagaagcacaacttgttttacgttgctggaaatata
atcacacaaaaattgacttcaactgcatcagaatctggattaacctcatggcggttgttg
aatgattatccatactgcaaattgtcgtttacatttgaggactctgctataaacaaatca
cggttttctgtgtggaatttaattcctgtctttaattttcaaccaggatcaatcatattt
atgataaaaatttcacccaatggtgaatttttggcatgcttgcatacagacggttcagtc
tcactatggggtttgccaaatttaatattacaaaagaaatggaaattatctgaacagccg
gaatataatacactcaatcctataggaccaaaatccaaaaaatttccaccaggttttaca
gaatttcatccaatagatattggctggtggtctgatcaggctatcataatagctcgatat
tcagggtccacatcagtctgctccacatggaacttaaaaaacttattaggtgttagtcca
gaattcttagcagggcaaccacaagtatgtgagcttggtttagaaaaaggatgtttatgt
ttagattgtgaaacctttattacaagcaaaaaacgaagcagagataccaacgatggtcat
ttatcagaagcgtcgtcggaaagtgagaaggatgatgatgaatcagaacccgttactata
ttcaattatacgactaatttggtgcaaagtacgttgtattcaataactgatattgaaaca
tttcaaccaaaaagaaagaagtcgaaagtattacatcgaacttatagaatcttgggctta
aaaagtacaaccccggaagagctttattctagaaaaatagacattgaggaatacgaggaa
gctttaactttagcgaacacgtataatttagatacagatcttgtatatcaaacacaatgg
agaaaatcagaattatctttaaatgccatctctgaacatttaagtaagataagtaaaaga
tcttgggtattaaatgaatgtgtgttacgtgttcccgataccatagaagctgcaagggaa
ctattgaattttggattgaaaggtgccaatctggaaactttaatagcaattgatacttgc
gataatgacaaattcataacacctgatacagatgaagattggccagatgaaagtactgca
aatttacgacaggtacagaaagtaaatgaaatgcttgagaagattgaaataaaaaactta
tctgaggcccagaagaacttgattaagtaccgaagacaacttttgcgtcacttagataaa
ttactcacatacgaaattatactggagccaccactaaaatataaaaaaaagttttacgag
gaattccgaagactctcagctgtggaaaatgctgttaggtttgccaaagacggcgattgc
cgaagcgtgcagataatgtttacatattatggagaaagtttactacctcattggctagca
attattagctttttcccagaaactttaaatccatcggattatgaaaaacttttgccagaa
tgcgattcggaaaatcaattatttttgttggatcaacgtgaattacgacaaaaagattgg
tcagaaaaatatcaatttaacgaactaataaatcaggacttaatagatgaggaatacgaa
atattgtatgaattagatccttcgttattaatatatagaaatgtgcagcttacgccagac
ttgttggaaaaatggtataaaagacgtgcttacgaaatcgagaaaaattgttctatggtg
gataacgctttacaattaattaaaatcgcaaaatctcataatatcaatggcgtggaggac
ttattactagatttggaaactttggatgatcttgtgtacaaagtctatctggaggatatg
tcattagataaattagaaaaactgagtaatttgaataaaataaaacttttaatgagtaca
tctactgaaacaaactttgtcgagaatataaggaatcttttattgccttttattaaacga
agacatcaatatttgggtggagatcttcaaaaggatttattaagtgattatctaatctgc
ttaagcaaagacgatttaacttttccagttaaatttttcgaacatttgaaacaagtgcag
gatgttgaaatggttaaaatgatagatgatattgctactttagctttaaattgtatatat
gcttgtgatgatctgaacatgtatgaaaaagcgagaaatatcttggactcgattttaaaa
gatcatgatggatcaagagcaaatgcaataagcgatttattagatgaactggaaggagaa
cttgattgtatgagacttctaagcaagtacggagtgaagacaacattaaaatttattcgg
aacaacaaaaccaatcccgatgtcgctcgatcactattaactcaaatgtcaagaaatttg
agtaaaaggctgctacctccagatgaaaaagaatgggcacaattattgaatgatatgtta
gacgtacatggattaatcttttcttgtgtcgctgtcgaaacctgcttcgaaatatgcgtt
tctgctcgcttggtgtcggggatcaaatctaccattcagaattgtgccactttgatagaa
accaagaaaaatgagaaatctttattaaaagtattttatgaaaaggcgattaatcttata
ttagaagcgacaaaagaatattttaacggttcaaaaactcttaccgatccaaacatggaa
ttggctaaaacttgtcttcatcttattgaagatgacaatgcgaaaattaaagaagaatat
gatcttatcaagtcgctccaaattttgaacgaatttaatgtcgacatattacctctgcaa
gttagattaacagtagatagattaattttgattgaacactgtttaaataatcagcgagat
gcttataaaaatcgacagaggttattaacgttagcatcttatttacgagtcgaagggaat
aataataggcttcgcgaaggaaaagttttagaattaatagctaaaaaggcacttgagact
gaagattataatacatgtgctacgatatgtatgcaattaacacaaaataattatctccct
gcctgggaaacttgtttaaacttaggacgttgcgatgattatcaggatttaaatattaga
aaaaaatgtttatggtttgcgataaataacggttctaatgatatattgggcaacgcttta
gaacacatacatctgatagaaacgcaaatcctacataagaatttagaattgtggatgcct
tccgttgaatttgaaagtttaaaagatgaagaaagtgatgaaagtgaggatgattttaca
gatgctatgacaacgccacaagtggaagtaaaagagtttgtccctaaaatgttagaaact
tcaacggaaatagtaaaaagttcagcgaatattatgaaagaatctacgttcggtctgata
aaaaatattagtgatactaatttttggaaatctagattgaggtttaactttacaaataac
tcgaacacgcaacacgaagccgagggagaacaaagcgaggaagacgtcgatcttcaaagt
ttcccgtgctattacgaatctttgcacgaaatgtgcaggataagtaataatgaaacaaga
tacaataaatattctatggcggatatacaaaatataagattaaaatgctgtcgggctctt
ttgagaataaccattttgagcgaatcctcttgttatggattagaagtaagcgacattaat
catttacttctagaatgcgcaaaacataccatgcaagacgattggttacttggtatgaca
tatttattgagtttaaataaagatcgtgttctggatgctcaagcaattttcatggattta
ccgcaaactgaattatatatacaaactgcgctttattactattcgttggaattacataaa
aaattgtacactgattgtgaaaaattatacttatacagtccgttagatttaatgaaaaac
atgatggctgcagcacaaaagtcggaaaaatgtgatattgttaaagcattgcaatattgg
cagcattgtttgcttggtggaacacaaattgataaaaccgaacatctagtaacaaaagat
acaagtacgctggaacaagatggtgcttgtgtggattttggaaaaatcacgaataaagaa
caagaaactgtcgaagatattgatgttaatgttccacttgtaacttctacgacagatgag
aatccgaagaaaattgcctctgatgacgttgatgttgtagaatggacagacgattgggga
gatttttctgacgatgacacagaagcaactagtgataagaaaaataaaattggatccaaa
gaaattttgcaagcacaaactgtccttccatttgaccatggcattgatgagtgcgtaaca
gaggaagatcgatttaatttatttcaaacgttgctcaatcgaaccgataatttacagcaa
tatcaaagattgaaggaaataatatcggaatggccgcaatttaatatgccgaatcacatt
acagtggacaaccatccgatattaaaaatgatgaaaacgataattttgttaatacccaaa
acggatataattgattctgaaaaaagaatattacaagagcatgaagaactcataggatta
ttagcatctaaagagattcttaagcagttcttggagctcgaacgcgataacattaatctt
gtacaaaatgtttacataagattatgttccgaggattcgtctatgcacaaagaagcagta
gattttattaaacaacaacaggccatcatattaccatcattagtgctagagaaacttttc
ctgaatgatttaacagcattatttaaaccggatcacgatgtatacaatcagataatcgag
cacgtatttataaacgagtctttaaccaacgttgagaaaaatgcaaaagttctcgtacat
gaattgaagaagcagaaatatatattggaggctttgaatattataaggctgatggagaaa
ataccatcggctatgtgtacgtttgacacttgttttgaactattaatgaaggaataa
DBGET
integrated database retrieval system