Lactobacillus iners: GYK47_02255
Help
Entry
GYK47_02255 CDS
T08045
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
lid
Lactobacillus iners
Pathway
lid03030
DNA replication
lid03430
Mismatch repair
lid03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lid00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
GYK47_02255
03430 Mismatch repair
GYK47_02255
03440 Homologous recombination
GYK47_02255
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
lid03032
]
GYK47_02255
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
lid03400
]
GYK47_02255
Enzymes [BR:
lid01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
GYK47_02255
DNA replication proteins [BR:
lid03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
GYK47_02255
DNA repair and recombination proteins [BR:
lid03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
GYK47_02255
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
tRNA_anti-codon
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIC18404
LinkDB
All DBs
Position
complement(503173..506295)
Genome browser
AA seq
1040 aa
AA seq
DB search
MEIAGLQNISSFTLLKSPISVEQLIGSAKKRGYKAIALTDINFTYGLIDFYKIAKSEGIK
PLLGMQLRINGLINENQNFDLIVIAKNNVGYQNIMRLSSAVNLITENGKKEIDVTLNKLQ
KYLGNLHIITTANQHSELRDLFYHNFDLMPDYIRKLVKILPQSSNLYLGVFADKSESNYI
NSVKSLSEQFNLKLVAVEDVQYIDPHDIFLQEVLQSIDDNQSIRDGYELTLKHVGNHYLK
TKDKLCESYNSLGILEALRNTKQVFDDSNVEIKFTMPQLPKFIQHKFDTSYEFLHHLAMT
GLQAKFNKHDIPAKYLNRLKYELKIIDEMGFNDYFLIVWDVINYCHSIGILTGPGRGSAA
GSLVAYCLNITRVDPLRYDLLFERFLNPARHQMPDIDLDIPDNRRNEVVLYMFHKYGMDH
VAQILSFSTFAAKQVLHDVGNAFSFNKITINSWQNAIPKSKSKITLSDAYKLSKDFRMLV
NATESNKLFFEVAKKIEGLPRHYSIHAAGLVISDMSIAKTVGLQNGSLGIPVTQQTKKYV
EALGLLKIDFLGLCNLTILDNALNEVKMSGIKLDMDKIPLDDPATIKLFQKGKTDDIFQF
ESQGIRNALKKMQPNSFDDIVAMNALYRPGPIKNIDSYIRRKNKEEKVVYPDPILINLLK
PTYGIIIYQEQVMKTAQIYAGFSLGEADLLRRAISSKDSMEMKKIGVDFVNRAVQQGHSA
SAASSIFEYILKFSNYGFNKSHSVAYSKMSYLLAYLKVHYPKQFYVALLNSNIYDKQKVT
KYIMDLKMDNIKITLPDINYSKRNFYISDKGEIVTGLDSIIGLRMDFVEQIMNLQRPIKS
LTDFLWKIDTKYLSPDMIGNLIKSGAFDKLHKNRSALLASYEDLLICIKMSGGNNVLFQA
LEPKELDIKMPSNAQKEEWETSVLGFSPQIDPILAAQIYAKKYGFKPFSDFTFYDEGVSV
GKMMDIKVITTKNNKKMAFAKFNDLHETVDFVIFPAVYESIKSILSVGKVYLLKIETQTD
KFNANKFKFILLSVKQIDLK
NT seq
3123 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaattgctgggttacaaaatatttcaagtttcacattattaaaaagcccaataagt
gtcgaacaacttataggttcagctaaaaaaagaggctataaggctatagctttgacggat
atcaactttacttatggtttaatagatttttataaaatagcgaaatctgagggtattaag
ccattattaggtatgcaattgcggattaatggtttaattaatgaaaatcaaaattttgat
ttaattgttatagctaaaaataatgttggttatcaaaatataatgcgattatctagtgcg
gtgaatttaattacagaaaatgggaaaaaagagatagatgttaccttaaataagcttcaa
aaatatttaggtaatttacatattatcactactgccaaccaacatagtgagttgcgtgat
ttgttctaccataactttgatttgatgcccgattatatcagaaagttagtaaaaatattg
ccccaatcaagtaatctttatctaggtgtttttgctgataaaagtgaatcaaattatatt
aattcagttaagtcattgagtgagcagtttaatcttaagttagtggctgtggaagacgtt
caatatattgatccacatgatatttttttacaagaagttttgcaatctatagatgataat
cagtctattagagatggctatgaattgacgttaaaacatgtgggcaaccattatttaaaa
accaaagataaattatgtgagtcttataattctttaggtattttagaggccttaagaaat
actaaacaagtttttgatgattcaaatgttgagattaaatttaccatgcctcaattacct
aagtttattcagcataaatttgatacgtcttatgagttcttgcatcatctagctatgaca
ggactacaagctaaatttaataagcatgatatcccagccaaatatctgaatagattaaaa
tatgagttaaaaattattgatgaaatgggatttaatgattattttttgattgtatgggat
gttattaattactgccacagtataggtatattaactggtccaggaagaggatcagctgct
ggtagtttggttgcatattgtttgaatattacgcgagttgatcctttgaggtacgatttg
ctctttgaacgatttcttaatcctgcacgtcatcaaatgccagatatagatttagatatt
ccagataataggcgaaatgaagttgttttatatatgttccataagtatggtatggatcat
gttgcacaaattttatcatttagtacttttgcagcaaaacaagttttacacgatgttggc
aatgcattttcttttaataaaattactattaatagctggcaaaatgctatacctaaaagt
aagtcgaaaatcactttatctgatgcatacaaattatctaaagattttcggatgttggtt
aatgctacagaaagtaataaattattttttgaagttgcaaagaaaattgaaggtttgcca
cgacattattctattcatgcagctggacttgttattagtgatatgtctattgctaaaacg
gttggcttgcaaaatgggtcgttaggcattccggttacgcagcaaaccaaaaaatatgtt
gaagccttaggacttttaaaaatagattttttaggattatgtaatttaactattttggat
aatgcactcaatgaagtaaaaatgtcgggtataaaattagatatggataagataccctta
gacgatccagccactatcaaactttttcaaaaaggtaagacagatgatatttttcaattt
gaatctcaaggcattagaaatgccttgaaaaagatgcagcctaatagttttgatgatatt
gtcgctatgaatgctttatatagacctggtcctattaaaaatatagatagttacattaga
agaaaaaataaggaagaaaaggtggtatatccagatcccatacttattaatttactaaag
ccaacttatggcattattatttatcaagagcaagttatgaaaactgcacaaatttatgca
ggattttcattaggtgaagctgatttattaagaagagctatttccagtaaagattctatg
gaaatgaagaaaatcggtgttgactttgtgaatagagctgtacagcaggggcattcagct
tctgcagcgtcatcaatatttgaatatattttgaaattttcaaattatggatttaataag
tcgcactctgttgcttatagtaaaatgtcctatttgcttgcttatttaaaagtacattat
ccaaagcaattttatgtggcattgctgaatagtaatatttatgataaacagaaggtcaca
aaatatattatggatctgaaaatggataatattaaaattaccctgcctgatattaattat
tcaaaaagaaatttctatatatcagataaaggtgaaattgttacgggattggattctatt
ataggcttgcgaatggattttgtagagcaaattatgaacttgcaacgacctattaaatcc
ttaactgattttttatggaaaattgatactaaatatttatcacctgatatgattggcaat
ttgattaaatctggtgcttttgataagttacataaaaatcgctcggccttgttagctagt
tacgaggatttacttatttgcattaaaatgtcaggtggtaataatgttttatttcaagct
ttagaacctaaggaattagatataaaaatgccttctaatgctcaaaaagaagagtgggag
acatctgttttggggtttagtccgcaaatcgatcctattttagctgcacagatatatgct
aaaaagtatggttttaagcctttctcagacttcactttttatgatgaaggtgttagtgtt
ggaaagatgatggatattaaagtaattactaccaaaaataataagaaaatggcttttgca
aaatttaacgatttgcatgaaactgttgattttgttatttttccagcagtttatgaatct
attaagtctattttgtctgttggaaaagtttatttgttgaaaattgaaacgcaaactgat
aagtttaatgctaataaattcaagtttatattgctatcagttaaacaaattgatcttaaa
tag
DBGET
integrated database retrieval system