Lactobacillus iners: GYK47_02705
Help
Entry
GYK47_02705 CDS
T08045
Name
(GenBank) ABC transporter ATP-binding protein
KO
K18890
ATP-binding cassette, subfamily B, multidrug efflux pump
Organism
lid
Lactobacillus iners
Pathway
lid02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lid00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
GYK47_02705
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
lid02000
]
GYK47_02705
Transporters [BR:
lid02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
GYK47_02705
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
MLKL_N
AAA_29
RsgA_GTPase
AAA_23
MMR_HSR1
AAA_22
SbcC_Walker_B
AAA_16
DUF87
AAA_15
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIC18459
LinkDB
All DBs
Position
complement(585956..587752)
Genome browser
AA seq
598 aa
AA seq
DB search
MTNNKQESIWAHSIPVKEQLKIFVRLLYFVRPYKLEMILALVGAFLVSVINMLLPFVLQY
FIDKYLIKSHPALKLILFFALLFAMGTIMKAIIQFIYEYFYAVGSEKTLENVRRCLYKKM
HSLGMRYFDQTPAGSIVSRITNDTMTLSRFLSVWASAVIGIFSLVTSFVAMYCTNKPASL
IVLAFLPILLFIIWFYSRNSSRLYRKFREYLSDINTNLNEAIEGVSLIQQFKQEKRMMSL
FEKKNIALMKTRQRMILLNAFLLSPLTSLLYSLALIASLLYFGYPLRETFIPAGVVYAFS
QYIATFFNPIAMVMDTMTLFQDGIVAGKRIFALLDNPELEPKQSANAKDDNIIFNGKVEF
KHVSFSYDGKNEILHDISFSIDPGKTLGIVGHTGSGKSSIINVMLRFYEFYQGQILIDGV
DIKNYSKSELCKKIGLVLQEPFMFYGDIASNIRLYNKDITDEELVNAAKNVQADGFIQKM
ADGYKTRVLEGGEGLSQGQKQLISFARTLVTNPKILVLDEATANVDTETETLIQQGLDKL
RQGRTTLAIAHRLSTIANADKIIVLDKGRIIESGTHESLLAKKGYYYDLYTLQTNSEN
NT seq
1797 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgacgaataacaagcaagaatctatctgggcacattcgatacccgttaaagagcagtta
aaaatatttgttagattgttatactttgttagaccttataagctagaaatgatattagca
ttagttggtgcttttttagtcagtgttattaatatgttgttaccatttgtattgcagtat
tttattgataaatatttgattaaatcacaccctgcattaaagctaattctattttttgca
ttgctttttgctatgggaacaatcatgaaagcgatcattcaatttatctatgaatacttt
tatgccgttgggtcagaaaagactcttgagaatgtgcgtcgctgtttatacaagaaaatg
cacagtttaggtatgagatattttgaccaaactccagctggttcgatagtttctagaatt
accaatgatactatgactttaagtcgtttcttatcagtttgggccagtgcagttatcgga
attttctccttggtaacatcctttgtagcaatgtattgcacaaataagccagcttcttta
atcgttttagcatttttaccaattttgctgtttattatttggttttattcaagaaatagt
tccagattatatcgtaagtttagagaatatctaagtgatattaatactaatttgaatgaa
gctattgaaggtgtatctcttattcaacaatttaagcaagaaaagagaatgatgtcatta
tttgaaaaaaagaatatagcattgatgaaaacacgtcaaagaatgattttattaaatgca
tttcttttatcacctttaactagtttgttatattctttggctttaatagcatcattacta
tattttggttatcctttgcgtgaaacctttatccctgctggtgtagtttatgcattctca
caatatatagctacattttttaatccgatagcaatggttatggatactatgacattattt
caagatggtattgttgcaggtaaaagaatctttgctttacttgataatcccgaattggag
cctaagcagtcagcaaatgctaaagatgataatataatttttaatggtaaagtagaattt
aaacatgttagtttttcatacgatggaaaaaatgaaattttacatgatatttcctttagt
attgatccaggtaaaaccttaggtattgttggtcataccggttctggtaagagttccatc
atcaatgttatgcttagattttatgaattctatcaaggtcaaattttgatagatggtgta
gatattaaaaattattctaagagtgaattatgtaaaaaaataggacttgtgttgcaagaa
ccatttatgttttatggtgatatagcatctaatatcagactttataataaagatattact
gatgaagaattagttaatgctgccaagaatgttcaagcagatggctttattcaaaagatg
gcagatggttataaaactagagtattagaaggtggcgaaggattaagtcaaggacaaaaa
caacttatttcttttgctagaaccttagtaactaatcctaaaattttagttttagatgaa
gctacagccaatgttgatactgaaacagaaactttaattcagcaaggattagataaatta
agacaaggtcgaacaactttggctattgctcaccgtttatcgacgattgctaatgctgat
aaaattatcgttttagataagggacgtattattgaaagtggtacgcatgaaagtttgttg
gctaaaaaaggttattactacgacctatatacgctacaaactaatagtgaaaactaa
DBGET
integrated database retrieval system
