Limnohabitans sp. INBF002: LINBF2_08090
Help
Entry
LINBF2_08090 CDS
T09962
Name
(GenBank) mechanosensitive ion channel protein
Organism
limi
Limnohabitans sp. INBF002
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MS_channel_2nd
MS_channel_1st
MS_channel_3rd
HAS-barrel
Pox_P21
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDU52574
LinkDB
All DBs
Position
803297..804541
Genome browser
AA seq
414 aa
AA seq
DB search
MNDLQELLLDLQSPAIALELAGLALCLALAWGLSWALGRRFTSPNSILFGRRLMDGVLFP
ALALVLTYGLKLVLMKTQRVAVLKMALPVLMSLVLIRLIARVLAAVFPNSRGARILEQVV
SWLAWGLAVLWITGWWGPMMDELDGLQFMLGKTRISVTHVLEVVFTSGFVLVLALWLSAT
LEQRVLNRAFEDLSMRKVAANAMRVLLLIIGTLFALSSLGFDLTALSVLGGALGVGIGFG
LQKLAANYVSGFVILLERSLRIGDFVRVDGFEGRVTDIKTRYTLVRASNGSEAVVPNELL
LTQRVENLSLESRHLLQTCTFWVGLESDVARVQDVLVQAALSAEWVLSSPMPQALLGEVA
PQGLRFNLNFWMEDPVNGQSLTRSRVNIAALSALRAAGVVLVHSPQEVVLRHPA
NT seq
1245 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacgatttacaagaactgttgctggacctgcaaagtccagcgattgcgttagaactc
gccggtttggcgctgtgtttggctttggcttggggtttgagctgggccttggggcgtaga
ttcacgtctcccaactcgattttgtttgggcgtcgattgatggatggcgtgctgtttcca
gcgctggccttggtcttgacctatggcttgaagctggtactgatgaagacgcagcgtgtg
gcagtgctgaagatggctttgcccgtgctgatgtcgctggtgctgattcgcttgatcgcg
cgtgttttggctgcggtgttccccaattcgcgcggtgcgcgcatcttggaacaagtcgtg
tcttggctggcttggggtttggctgtgctgtggatcacgggctggtggggcccgatgatg
gatgagctggatggcttgcaattcatgctcggtaagacacgcatcagcgtgacgcatgtg
ctggaagtggtgtttacctctggctttgtcttggtgctggcgctgtggctgtcggccacc
cttgagcaacgtgttctcaaccgtgcgtttgaagatttatccatgcgcaaggtggcagcc
aatgccatgcgcgtgttgttgttgatcatcggcactttgtttgccttgtcttcgctgggc
tttgatttgacggccttgtcggtcttgggtggtgccttgggtgtgggtattggttttggt
ttgcaaaagctagccgctaactatgtgagcggctttgtcatcttgctagaacgctcgctg
cgtattggcgactttgtgcgtgtggatggctttgaaggccgcgtgaccgacatcaaaacc
cgctacaccttggtgcgtgccagcaatggcagcgaagcggtggtgcccaatgaattgctg
ctgacgcagcgtgtcgagaacttgtcactcgaaagccgccacttgctgcaaacttgtacc
ttctgggtggggctggaaagcgatgtggcccgcgtgcaagacgtgttggtacaagctgca
ctgagcgctgagtgggtgctgtccagccccatgccccaagccttgctgggcgaggtggcg
cctcagggcctgcgtttcaatttgaatttctggatggaagaccccgtgaatggccaatct
ttgacgcgctcgcgcgtcaacatcgcggcgctgagcgctttgcgtgcggctggcgtggtg
ttggtgcattcgccccaagaggtggtgttgcgccatcctgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
