Listeria innocua (serotype 6a): lin0661
Help
Entry
lin0661 CDS
T00067
Name
(GenBank) internalin like protein (LPXTG motif)
Organism
lin
Listeria innocua (serotype 6a)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_4
LRR_8
Flg_new
LRR_adjacent
Internalin_N
LRR_9
LRR_1
Gram_pos_anchor
Flg_new_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAC95893
Pasteur:
LIN00661
UniProt:
Q92E00
LinkDB
All DBs
Position
690411..692201
Genome browser
AA seq
596 aa
AA seq
DB search
MINKQHFYKVIQAFIGVLLIGSVFIWLGSNNDVNAEEQSITEPTPINEIFPDAKLAEVMR
NYLSKTNVTDTVTQEELNNITIVGATSTGIESLEGIQYLPNVTTFNFNGEKIQDISFLSN
STKLENLDLSGNPIKDFSPIANLTKLHTLNLMNCEISDISFITNLTELKSLYLSNNRITN
ISPLANLTKLDYLIIENNQITDLTPLKNMKNLNNLVISGNQINDITTIAELTSLQNLSIS
DNQIVDISPLANLNNLNSLAIHKNNIVDTSPLANLTQLKFINIRDNQIDDITGLTNLTNL
TNLHLGGNEISDLTPLANLTNLNLLDLTNNQISEVIPLANLTNLSNLWLNGNNIIDISPL
KDLKGLKNLSLSDQRIQKNPELFKTNFTLTNNIKDLDGGLVEITDISHNGTYDNPIVTWE
LPRYVNEISYKYTQHVQIGNSKTDYDVTVRQPLSLPSHTVNFIVDDVLKTSLEVKEEALI
TQPAAPKKAGYTFTGWYDAKTGGDKWDFETAEMPRNDMTLYAQFSENEVIPVDEDVDLIV
EESGPVQESNDDVPPVTEPTKNIVMLPKTGDSNNMLFVGLGLLLFGTGVVISKKLR
NT seq
1791 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaacaaacaacatttttataaagtaattcaggcttttattggggttcttttaata
gggagtgtttttatatggcttgggtcaaataatgatgtaaatgctgaagaacagagcatt
accgaacctacaccaataaacgaaatttttcccgatgctaaattagcagaagtaatgaga
aactatcttagcaagacgaatgtcactgatactgttacgcaagaagaactgaataacata
actattgtaggtgcaacttcaactgggattgagtcgcttgagggaatacaatatctgcca
aatgtgacgacttttaactttaacggagaaaaaatacaggatattagctttttatcaaat
tctacaaagttagagaatctggacctgtcagggaatccaataaaagattttagtccgatt
gcaaacctaacaaaattgcacactcttaatttaatgaattgtgagataagcgacattagt
tttatcacaaatttaaccgagttgaaaagcctttatcttagtaacaatcgcataactaac
ataagcccattagctaatttaactaaattagactatttaattattgaaaataaccaaatt
actgatttaactccgcttaaaaatatgaaaaacctcaataatttagttataagtggaaat
cagataaatgacatcacaacaattgctgaattaacgagtttgcagaatttatctattagt
gacaatcaaattgtggatattagcccattagctaatttaaacaacctaaattctttagct
atccataagaataatattgttgatacaagtccattggctaatttgacgcaattaaagttt
ataaacatacgagataatcagatagatgatattaccggattaactaatctaactaattta
accaatctacatttaggtggaaatgaaatatcagatctaacgccacttgcgaatttgact
aatttaaaccttttggatttaactaataaccaaataagtgaggttatacctttagctaat
ttaacgaatctatccaatctttggttaaatggaaacaatataatcgatattagtccattg
aaagatttaaagggtttaaaaaatttaagtttgtctgatcagcgaatacagaaaaatcct
gagttgtttaaaaccaattttaccttaactaacaatataaaagatttagacggtggatta
gttgagataacagatattagtcataatgggacctacgataacccgattgttacttgggag
ttgcctagatatgtaaatgaaattagttataaatatacacaacatgtgcagattggtaat
tctaagacggattacgatgtgacggtcagacaacctttaagcttaccatcgcatactgtg
aactttatagtagacgatgttttaaaaacaagtttagaagtaaaagaagaagcgttgatt
acacaaccagccgcaccgaaaaaagcagggtacacatttacgggatggtatgacgcgaaa
acaggcggagacaaatgggattttgaaacagctgaaatgccgagaaatgatatgacttta
tatgcgcagtttagcgaaaatgaagttatcccagttgatgaagacgttgatcttattgtt
gaagaaagcggaccagtgcaagaaagtaatgatgacgtaccaccagttactgaaccgaca
aaaaatatcgtaatgcttccgaaaacaggagacagtaacaacatgttatttgttggatta
ggtttgttattgttcggaacaggggttgttattagtaaaaaactccgctaa
DBGET
integrated database retrieval system