Listeria innocua (serotype 6a): lin1328
Help
Entry
lin1328 CDS
T00067
Name
(GenBank) internalin like protein (LPXTG motif)
Organism
lin
Listeria innocua (serotype 6a)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
InlK_D3
InlK_D2
LRR_4
LRR_8
LRR_14
PKD
Bact_surface_Ig-like
Trypan_PARP
LRR_EndoS
LRR_R13L1-DRL21
PKD_4
LRR_Zer-1
Gram_pos_anchor
MBG
LRR_At5g56370
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAC96559
Pasteur:
LIN01328
UniProt:
Q92C63
LinkDB
All DBs
Position
1323226..1325088
Genome browser
AA seq
620 aa
AA seq
DB search
MSIKSKIMKVGICSAMVMVPLSQVSLPSFAAEEQGLQASQDVVNIPDPELKKQLNSHMSK
PATADITEDEMSRLDNVSLSSGITDLTGLEYAKNITRISFRGINASYDVVTKLPKLNNLT
ITGSNITSDKIPNLNSMTNLENLYLYESNFDNSLLPKINALPNLKTLNIGYNKQITNISS
LKSLPNLTDLVVMGCQIDDFRGIADFPKLENFNGTYQRFEDEASKSLKSSELTFNEAEQT
LFIPFKILEKQTIYNYDGTILPYDTNPANLMIEIDSGYEFTDDKTTISQEGVTLKNFSKE
NYDGMEMLYIVAMFDGINIATPPNLANGTYNITGNLSGGLYDVDHSVSIEADDNVSYTQG
QTVTPEQFLKDINASANGGTITSDFADKVDFSTPGTYTVTLNASNSVGLTADPVQVTVTI
VEQTVITAETEVSYNMNDAKTEAEFLADINAVTNNSAAITTDFDTVVDLTTAGEYTVTLN
AGTAKQKATPFKVTVKVVDPTPAPAPDPTPTPDPTPSPDPTPTPDPASDPDPSNDPAPAE
DPGTSIDSTGSMDSTDPANSTSEDSSSSTPKASKKANSGNSTLVTASKASLPKTGDSLPV
TGVAVGFLVLGLGVLIARKK
NT seq
1863 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcgattaaatctaaaattatgaaagtcgggatttgtagtgccatggttatggtacca
ctatctcaagtttctttacctagttttgccgcagaagaacaaggattacaagcaagtcaa
gatgtagtaaatattccagatccagaactaaaaaaacaattaaattctcatatgtcgaaa
ccagctactgctgatattacagaagatgaaatgagtaggctagataatgtttcattaagt
tcaggtattactgacctaactgggttagagtatgcaaagaatattactagaatatcattc
cgtggtataaatgcttcctatgacgtagtaacaaaacttcctaaacttaataatttaact
atcacaggttctaatattacttctgataaaattcctaatctaaatagtatgactaattta
gaaaatttatatttatacgaatcaaattttgacaattcgttacttcctaaaattaacgcg
cttcccaatttaaaaacccttaatataggttataataagcaaataactaatattagttca
ttaaaaagccttcccaatttaaccgatttagtagttatgggctgccaaattgacgatttc
agagggattgcagattttccgaaattagaaaattttaatggtacttatcaaagatttgaa
gatgaagcaagcaagagtcttaaaagtagtgagctaacatttaatgaagcagaacaaaca
ctatttatcccatttaaaattttggaaaaacaaacgatttataactacgatggaaccatt
ttaccctacgatacaaatcctgctaatttaatgattgaaatagattctggttatgaattt
acggatgataaaactactatttcacaagaaggcgttacactaaagaatttttccaaagaa
aattatgatggcatggaaatgttatatatagtcgctatgttcgatggaattaacattgca
acaccaccaaatttagctaatggaacatataatataactggaaatctttctggtggatta
tatgacgtcgatcattctgtaagtattgaagcagatgataatgtatcttatacgcaagga
caaaccgtaacaccagaacaattcttaaaagatattaatgcaagtgccaatggtggaaca
attacaagcgactttgcagataaagtagatttctccacaccgggaacttatacagttact
ttaaatgcatcaaattcagttggtttaacggctgatccagtgcaagtaaccgttactatc
gttgaacaaacagtgattactgcagaaacagaagttagttacaatatgaatgacgcaaaa
acagaagctgaatttttagcggatattaatgctgtaacgaacaatagtgctgcgattacg
acagactttgatacagttgttgatttaacaacagctggtgaatatacagttacactaaat
gcgggaacagcgaaacaaaaagcaacaccatttaaagttactgttaaagttgtagatcca
acaccggcgccagcaccagatccaacgccgacaccggatccaacaccgtcaccagatcca
acaccaacaccagaccctgcatctgaccctgatccatcaaacgatccagcgccagcagaa
gatcctggaacatccattgactcaacgggttcaatggactcaactgatccagctaattca
acatcagaagattcaagttcttctactccgaaagctagtaaaaaagctaactctggtaac
tcaacattagtaacagccagcaaagcaagtttaccaaaaacaggtgattctttacctgta
actggagtagcagtaggattcttagttttaggattaggcgttctaattgctcgtaaaaaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system
