Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00: LI0102
Help
Entry
LI0102 CDS
T00354
Symbol
polB
Name
(GenBank) DNA polymerase I-3'-5' exonuclease and polymerase domains
Organism
lip
Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol_A
5_3_exonuc_N
5_3_exonuc
HHH_2
HHH_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAJ54158
UniProt:
Q1MS67
LinkDB
All DBs
Position
complement(128189..130795)
Genome browser
AA seq
868 aa
AA seq
DB search
MNIKEFFSEDPIYLMDGSAFIYRGFYANQSMQRSDGFPTSALFNIGRIFLKILREEQPKY
FVFVLDGPGTNFRHTLFPLYKAQRSPAPEALIKQIEPIKRLVISLGLCLTVASNSEADDC
LASIAHRYRDNYPIVLIASDKDLKQCLDKNVLMWDPASKAEKITTLKSFKEDEGLLPSQW
PDVQAIIGDSSDNIPGIPGIGLKTAKKIFQDFPSLESIKDNFSSLPLPVQKKFDGHLDAM
FLYRQLTTLSTTECIDLQIDTIKVGPINVQETLTILREFELVSLEREFMAVVHQKKLIDP
KGIIESGTSSHGQLSLFGSSKPINKIYCSTASDLPSVKGKIVALLTDKHEVTLAVENTEY
FYTGPLLPLTKALNQSRHVVTPDLKSLLRTNGIWRTIPNTHWIDLGLATYLLDPEERDYS
WPKLVARWGSVFGLSAGNPGLIALKVWEQLRNKLKTAQLLELMDSLELPLIPVLADMEAV
GVVLDDQNLKIFLVEVQNSLDHLTETIYHEAGGSFNIRSAQQLGDILFNQLELPAAKKTR
GGQASTSQEVLEKLSGQHPIIDTILEYRKLEKLRSTYLEPLPRLIGKDGRVHTTFNQLAT
ATGRLSSSNPNLQNIPIRGSLGQRMRSCFTASQGNLLISADYSQVELRVLAHYSKDPTLL
TAFLEGADIHTRTASLLYEKSQEEVTADERRNAKTINFGLIYGMGPQKLAQELNTTLNEA
KKFIQRYFEHLQAIKKFYDQVEHSAKEYGYVTTIAGRRRLLPDIHSENIQLQALARRQAI
NTIIQGSAADIIKIAMLTVHGDTTLAKMDAQLILQVHDELVVEAPEDNAKEVGKRIAMLM
SNVTPGGKPLIVPLVTQWSIGYDWGSAH
NT seq
2607 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatattaaagaattcttttcagaagaccccatttacttgatggatggctcagctttt
atttataggggattttatgcaaatcaaagcatgcaacgctctgatggatttcctacaagt
gcactttttaatattggtagaattttcttaaaaatattacgtgaagaacaaccaaaatat
tttgtatttgtcttagatggccctggaacaaattttagacatacacttttccctctttat
aaagctcaacgtagccctgctcctgaagcacttataaaacaaattgaacctataaaacgc
ttagtaataagtttaggactatgtttaactgttgctagtaatagcgaagctgatgattgc
cttgcatcaattgcacaccgctatcgtgataactaccctattgtacttattgcttctgat
aaagatttaaaacaatgtctagataaaaatgttctgatgtgggatccagcaagtaaagct
gaaaaaattactacactaaaaagctttaaagaagatgaaggattattaccttctcaatgg
ccagatgttcaagcaataataggtgactctagcgacaatattccaggaattccagggata
ggactcaaaaccgcgaaaaaaatttttcaagactttccttcattagaatctataaaagat
aatttctcctcactacccttacctgttcaaaaaaaatttgatggccaccttgacgccatg
tttctttacagacaacttacaacattatcaacgactgagtgtatagatcttcagattgat
acaattaaagttggcccaattaacgtacaagaaacattgactattcttcgtgagtttgaa
cttgtttctttggagcgagaatttatggctgttgtacatcaaaaaaaactcatagaccca
aagggtattatagagtctggaacatcttctcatggacaactatctctttttgggtcttct
aaaccaatcaataaaatatattgctctacagccagtgatcttccatcagttaaagggaaa
attgtagcactattgacagataaacatgaagtaacattagctgtagaaaatacagaatat
ttctatacaggaccattactaccactaactaaagctcttaatcaatcgcgacacgtagtt
actcctgatttaaaatcgttgctgagaacaaatggaatatggagaactatccctaataca
cattggattgatttaggtcttgctacttaccttcttgatcccgaagaaagagattatagc
tggcctaaacttgttgcacgttggggctcagtttttggattatccgcaggaaacccaggt
ctcattgctctaaaagtatgggaacaacttcgtaataaacttaagactgctcaactatta
gaactaatggactcattggaactaccccttattcctgtccttgctgatatggaggcagta
ggtgtggttctagatgatcaaaatttaaaaatatttcttgtggaagtacaaaatagttta
gatcatctcactgaaacaatttatcatgaggctggtggttcctttaatatccgctcagct
cagcaacttggagatattcttttcaatcaacttgagcttcctgcagctaaaaaaactcgt
ggggggcaagcatccacatctcaagaagtccttgaaaagctatcaggacaacaccctatc
atagatacaatcctagaatatcgtaaacttgaaaagcttcgctctacttatctagaacca
ttaccacgacttattggtaaagatggacgtgtacatacaacatttaaccaacttgctaca
gctacaggaagactttcttccagtaaccctaacctacaaaatattcctatacgaggctca
ttaggacaacgtatgcgttcatgttttacagcttctcaagggaacctcttaatttctgct
gactactcccaagttgaactacgtgtcttagcccactattcaaaagatcccacacttctt
actgctttccttgaaggtgcagatattcatacacgtacagcaagccttctttatgaaaaa
agtcaggaagaagtaacagcggatgaaagaagaaatgctaaaactatcaattttggttta
atttatgggatgggaccacaaaaacttgcccaagaacttaatacaacattaaatgaagca
aaaaaattcatacaacgatattttgaacaccttcaagccataaaaaaattttatgatcaa
gtagaacactcagctaaagaatatggatatgtaactactattgctggacgtagaagacta
ttaccagatattcactcagaaaatattcaattacaagctttagcacgccgccaggctatc
aatactattatccaaggaagtgctgcagatattataaaaattgcaatgttaactgttcat
ggtgatacaacattagctaaaatggatgctcagcttattcttcaggtacatgacgaactt
gtcgtagaagcaccagaagacaatgcaaaagaagtaggtaaacgtatagccatgttaatg
tcaaatgtaacgccaggtggtaaacctcttatagtaccacttgtaactcaatggagtata
ggctatgattggggaagtgcacattag
DBGET
integrated database retrieval system
