Listeria ivanovii subsp. ivanovii PAM 55: LIV_0541
Help
Entry
LIV_0541 CDS
T01623
Name
(GenBank) Internalin protein, putative peptidoglycan bound protein (LPXTG motif)
Organism
liv
Listeria ivanovii subsp. ivanovii PAM 55
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
InlK_D3
InlK_D2
LRR_4
Bact_surface_Ig-like
Gram_pos_anchor
PKD
PKD_4
CopC
LRR_EndoS
LRR_14
NOMO_5th
LRR_At5g56370
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBW85018
UniProt:
G2ZCE4
LinkDB
All DBs
Position
complement(584732..586504)
Genome browser
AA seq
590 aa
AA seq
DB search
MIKLGIKISLCAFLIVPLLAAPLSSNVSAEENSNVQAAQDIVNIPDLAFKSYLNSLLSQP
STSDITEAQMDTITNITINGGTVADITGIDYAHNLTSVRLANTQVTDFSLLASLSKLTNI
SLAGSNITSNSIPDLNGLQELTNLNISPANLTNDALTKINKIPNLTYLNLDSNHSLTDIM
PLKSLPNLVTLFVQFCGINDYRGIEDFPSLKNLSAYGQNVGRTVLINSSIKSSALNYDEA
NQTIFVPFTLMTERTVNFNGDLIPFSTSTSGSSTYFTLNEQQITGSRLSIDDTGITVSGI
TKDDFDAITKMEYNAVYNNPAGSYAAPPNITSYTISGGTYDHYFDIDHSLTITNDDTISY
REGNPVTEAQFLSDIHAETDDGTPVTSDFDSVVDLSMPGVYTVTLNAENAAGLKATPKTV
TVTVLAKPIITADKTITYTTGDSKTSEQFLKDISATTNDGSPVTNDFDSVVNLNKSGTYE
VTLRAVSADGIEADPVKVLVTVENREEPPGPPTPPTPPGPDPTPTPDSSPNPDGSNDSSA
NNGTTSPNHQNSTNQASLPATGDSNLDTMILIGIVLAGVTVFSFRKRKQH
NT seq
1773 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaacttgggataaaaattagcttatgtgcttttttaatagtaccacttttagcc
gccccattatctagcaatgtttcagctgaagaaaatagcaacgtccaagcggcacaagat
atcgtaaacattcctgaccttgcattcaaaagctatttaaatagtcttctcagtcaacct
agtactagtgatattaccgaagcacagatggacacgattactaatattactattaatgga
ggtactgtagcagatataaccggcatagattatgcacataatttaacttctgtgcgtcta
gccaacacgcaagttaccgatttttctttactcgcatcattatcaaaattaacaaatatt
agtttagctggtagtaatattacctccaactccatcccagaccttaatggtttacaagag
ctaacaaacttaaatattagtcctgcaaatcttaccaatgatgctttaactaaaatcaat
aaaatccccaacttaacttacttaaatttagatagtaaccattctttgaccgatattatg
ccacttaaatcattacctaatttagttactttatttgtacaattttgtggaattaatgat
tatcgtggaattgaagatttccccagcttaaaaaatctatccgcttatggtcaaaacgtt
ggccgaacagttttaataaatagctctattaaaagttccgcattgaattatgacgaagcg
aaccaaactatttttgttccctttacgttaatgacagaacgtaccgtgaattttaacggt
gaccttattccattttcaacatctacaagtggatctagcacttatttcactttaaatgaa
caacaaattactggcagtcgcttaagcattgatgatactggtatcactgttagcgggatt
acaaaagatgattttgatgctattactaaaatggaatataatgctgtttataataatcct
gctggaagttacgcagctcctccaaatatcacttcctatacgatttcaggagggacatat
gaccattactttgacattgatcattccttgacgattacaaatgatgacacaataagttat
agagaaggaaatcctgtcacggaagcacagttcttatctgatattcacgctgaaacagat
gatgggaccccagtgacaagcgattttgatagtgtggtagatttaagtatgccaggagtt
tatacagtgacacttaatgcagaaaacgctgcaggtctaaaagcaactcctaaaacagtg
acagtaaccgtcttagctaaaccaataattacggctgataaaacaatcacttatacaacc
ggcgattccaaaacttccgaacaattcttaaaggatatttcagctactaccaatgatgga
agtcccgtgacaaatgactttgatagtgttgttaacttaaataaatctggaacgtatgag
gtgaccttgcgtgcggtaagtgcagatggtatagaggctgatccggtaaaagttctcgta
acagttgagaaccgtgaagaaccacctggtccaccgactcctcctacacctcctggacca
gacccaactcctacacctgattcaagtccaaatccagacggtagtaatgattcttctgct
aacaacggaaccacatcacctaatcatcaaaacagtaccaatcaagcttccttacctgct
acaggtgattctaatctagacactatgattttaattggtatcgttttagctggagtgact
gttttttctttccggaaaagaaaacaacattaa
DBGET
integrated database retrieval system
