KEGG   Listeria ivanovii WSLC3009: AX25_00230
Entry
AX25_00230        CDS       T03045                                 
Name
(GenBank) peptidoglycan-binding protein
Organism
liw  Listeria ivanovii WSLC3009
SSDB
Motif
Pfam: InlK_D3 Bact_surface_Ig-like SdrD_B Big_13 DUF4625 He_PIG PKD_4 Big_3_3 Y_Y_Y Big_3_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: AHI54619
LinkDB
Position
45763..51591
AA seq 1942 aa
MIRKILASILAISIIAQTVMLPTYIIANALNTEIQQTTIQMLTNPDLNNNEIIIHGMEKE
KEYKLILPKPLQLDTQKVDKNIAYNKSKNEVIITGTGSSVSLFLIASKEGSYQLELKEGT
SVEAVLNLVIKQSGDISSRNKNMLKSNLLRTEPLTMKASIPDKLLLQAEASKATLNNYTE
QMTISYSINFLDSSSTLKDGKLVIDFKSSGMEPVNYPKNITANVNVKSADYNATTGKLTI
NLVDNILSGAPFDIPIVVRASYDAESGKPTDLKATLSGSKNTDETYAPVEKAITVTLVKD
SSINEYEPITLNDNSWDFSSTKNIYFLSMEGGYNITWPTLVKKSIGNKSFKNLRLEYLKE
NGAGTFTVRMADLSIAKPGESFWSSLSSINGKSNQTINTTEKQVVEFGPVNANIYNQIQL
TVSSTIPKNAVPGTIYTGKVNVYDENILISTLNLNSEVAAAKTDIRVDTEVSKTSISEND
IIEWAFTPRISSAITGINDLQIVAPIPEGLETLSFTPNDNMLSLIKKLEYYQNNEWHTLT
SNTSNGWDLTKINGQASYRIEKLRITYKDNIVDIKDFPSHSPGIIKLHNTGIKAGDSFIL
QPESITYTDFDQTNQSIDTTTNSFKEIIQIVNTPPDPPKINGMVFFPSVVTSYGEGFNNT
IFFNGDTIAQSVRLASYANELKNPYIFVVVPKGISVTTIRNYIQQPYNGLLGYTYAPSSG
INAIYPKSSADISGEETLADGSTLLYWEAPDTSLSPGIKNCEMLTLDLMFKLDKVNSGEN
RVEFGMGSMTESDWNIEGTGNTGLVTKTLSSELQAKLPGVSSSKYLSTTMTANVGISNSI
ATTMKIKGSQDEELVNVNSKTATTIPGKKVAYNLEFKNNGTKSMNNLEIIDILPFVGDQY
VLGTGNRGSEFSVIPTSEIEVLVNGKKSDTATVEYSTSTTPTRFDINGEDVPGATWQMTA
PTNMSTVKSFRIKLPNTEFKVGDQIVLNFEGIVPIDSPRNGEISYNSVAYRVDKETASGI
TKLASEPPRGGVKSTTPATDLSLSGKSFTDFNKNGVQDTNEKGLNSVELDLYKEKNNEFE
KIETIFTSPDSSNQNNGLFDFNGLGNGNYKIAAHLPNKNAEFITTGINKVVVDSKDDTIG
WLTKNGSTEFAIDDLANGNLKSITNIQLPIYMPTPVQGAVIFMNKDGERKITYYGEGYQV
TLLDEDDKEVKSAVTANNKGIFSFSDVIIQNPVNYKLKVTAPSKTEFVYAPQNTLFNSTT
GEYELNNLTPDVGSISEIYITDTGLPSTVIKLDRAITPEAITIDSKDAATQVTNKWTIED
SNNKLIYSGTGKTIRIPNDEGTYTAKNTVTDEAGNTASDEKTFDIDNSAPVLSVNQDASM
EVNSTATNINWVNPLIISATDAHDGNLTPTIDYSQVLWNELGTYPVKVTATDTSDNKVTE
TFNVKVVDTIAPNLIVTNNTLNYTVESMRMLTEQDLFTAAGLVGIDNYDLVPGQTPQLNK
LPMIFTSDFSTVFNDISKVKKGQYQVQVNLVDSSNNQAIPQSISIIVKDTKAPVIIADDV
IYHVNSSKTETDFLQDSNIKTTDNNDETDDLKITTNFTSKVDLTKPGKYEVTVQAVDTSS
NTTTKTIQVQVAKDKPVISADKKISYQGKTSVTETDFLADIQAEVTDELDGNIAIKSDFT
EKVNLNKVGKYEVTLNSEDSYGNKANPVIIEVTVYNQISPIFQNVLNQTIEATNKLPSLS
TIFNIKSIDYMTGAKIKVTYTSEQPIKGNVPGKYSVKVTTKDTAGNTAETTVTLTIVDTT
LPVLIINKEKISYTKGKTISEKQLFQDIGVSAVDNNGTVEVTSNIAKVVNWNKVGDYKLT
ITATDSSGNITKNTIILTIKDSEKSLHIVPSNQKNGNQTPSPAKEKNMPKTGDDWNTEFI
LIGVMLLLTGIWLFCRKDTKTK
NT seq 5829 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgattagaaaaattctcgcaagtatattagccatttcaatcatagcgcaaacagtaatg
ctacccacttatataatagcgaatgcactaaatactgaaattcaacaaacaactattcaa
atgctaacaaatcctgacttaaataataatgagataataatccatggtatggagaaagag
aaagagtataagctaatattaccaaagcctctccaattagatacacagaaagtagataaa
aatattgcttacaataaatccaaaaatgaagtaataattacaggcactggcagcagtgtt
tccctattcttgattgcatccaaagaagggagctaccagctagaactcaaagaaggaact
agcgtcgaagcagtattaaatttagttatcaaacaatctggagacatatcctcaagaaat
aaaaatatgttaaaaagcaacctgttaagaactgaacctttaactatgaaggcttctatt
ccagacaaactattactccaagcagaagccagcaaagctactctaaataactacaccgag
cagatgactattagttactctattaatttccttgatagttctagcacactaaaagatggt
aaactggtcattgattttaaatcttctgggatggaaccagtcaattatcctaaaaatata
actgctaacgtcaatgtgaaatcagccgactacaatgcaactactggaaaactaaccatt
aatttagtagataatatcttaagtggagcaccatttgatattcctatagttgttcgtgct
agttatgatgcagagtctgggaaaccaacagatttaaaagcaactctttcaggcagtaaa
aatacagatgaaacttatgcaccagttgaaaaagctataacagtcacgttagtcaaagat
agttctattaatgaatatgaaccaattacattaaatgataatagttgggacttttcttct
actaaaaatatatactttttgagtatggaaggcgggtacaatattacatggccaacgctt
gtcaaaaaaagtattggaaataagagctttaaaaatttgagattagagtatcttaaagaa
aatggagcaggcactttcactgttagaatggctgatcttagtattgctaaaccaggtgaa
tcgttttggtcttcgcttagttctatcaatggtaaatcaaatcaaaccattaatactaca
gaaaaacaagtggttgaatttggaccagttaatgcaaatatatataatcagatacaatta
acagtatcctcaaccattcctaaaaatgcagtcccaggaactatttatacagggaaagta
aatgtatatgatgaaaatattttgattagtaccctcaatttaaattctgaagtagctgct
gcaaaaacagatatacgcgtagatactgaagtgtctaaaacaagtatttcagaaaacgac
attatcgaatgggcttttacacccagaatatcctcagcaataactggaattaatgatttg
cagattgtagcgcctattccagaagggctcgaaacattatcgttcactccgaatgataat
atgttaagtttaattaaaaaattagagtactatcaaaataatgaatggcacacgttgacg
tccaatactagtaacggatgggatttaacaaagattaatggacaagccagctatcgaatt
gaaaaattacgaattacttataaagacaatattgtagatataaaagattttccatctcat
tcaccaggaatcattaaattacacaatacaggtataaaagcaggagattcatttatacta
caaccagaatctattacctatactgactttgaccaaacaaaccaaagtattgatacaacc
acaaattcatttaaagagataatccaaatagtgaatactccaccagatcccccaaaaata
aatggaatggttttctttccgtcagttgtaactagttatggagaaggatttaataacacc
atcttttttaacggagatacaattgcccaatctgttcgtttagcttcttatgctaatgag
ttaaagaacccatatatcttcgttgttgtaccaaagggaataagcgttacaacaataaga
aactatattcaacaaccttataatggtttgcttggttatacgtacgctccaagttctggg
attaacgctatctatccaaaatcctccgcagatatcagcggggaagaaacattagctgat
ggctccaccttattatattgggaagcaccagacaccagtttatcaccaggtatcaaaaat
tgtgagatgttaacactggatttaatgtttaaattggataaagtgaacagcggtgaaaac
cgtgtggaatttggaatgggctcgatgacagaatccgattggaatatagaaggaactgga
aatacaggactagtaactaaaacactatcaagcgaactccaagctaaattacccggagtt
tcatctagcaaatacctttctacgacgatgacagctaatgtaggtatttctaacagtata
gcaaccacaatgaaaatcaaaggtagccaagatgaagaacttgtaaatgtaaattctaaa
actgccactaccattccaggaaaaaaagtggcgtataatcttgaatttaaaaataacggc
actaaaagtatgaataatttagagattattgatatcctcccttttgttggtgatcaatac
gtccttggaacaggaaatcgaggttccgaattctcggttatcccaactagtgaaattgaa
gtacttgtcaatggaaagaaaagtgatacagcgactgtagagtattctaccagcactacc
ccaacacgttttgatataaatggagaagatgttccaggggctacttggcaaatgacagcc
ccaactaatatgtcaaccgtgaaaagctttcgaatcaaattgcccaacacagaatttaaa
gtaggagatcaaattgtcctcaacttcgaagggattgtaccaatagattccccacgtaat
ggcgaaatttcctacaactctgtggcttatcgagtagataaagaaacagcatctgggata
accaaattagcttctgaaccgccacgtggaggagtgaaaagcactactccagcaacagat
ttaagcctttctggaaagtcctttactgattttaataaaaatggcgtccaagatactaat
gaaaaaggtttaaactctgtagaattagacttgtataaagaaaaaaataacgagtttgaa
aaaatagaaacaatttttacatctccagactcctctaatcaaaataatggcttatttgat
tttaatggtttaggaaatggaaactacaaaattgcagctcatctaccaaataaaaatgcc
gagtttataacaactggcataaataaggtcgttgttgattcaaaagatgataccattggc
tggttaaccaaaaatggttcaaccgaatttgctattgatgatttagcgaatggaaatttg
aaatccattacaaatattcaactaccaatctatatgcctactcctgtacaaggtgcagtt
attttcatgaataaagatggggagcgaaaaatcacttattacggcgaaggatatcaagtg
actttgttagacgaagatgacaaagaagttaaatcagctgttacagcgaataataaaggg
atattttcctttagtgatgttattattcaaaacccagtcaattataaactaaaagttacc
gctccctcgaagactgaatttgtgtatgccccacaaaacaccttatttaatagtactact
ggtgaatatgagttaaacaacctaacacctgatgtaggtagtatatccgaaatttacatt
acagatacagggctaccaagtacggtaatcaagctagaccgagctattacacctgaagcc
attactatcgattcgaaagatgcagcaacacaagtgacgaacaaatggacgatagaagat
agcaacaacaagttaatctattctggcacaggaaaaactattcgtattcctaatgatgaa
ggaacttatactgccaaaaataccgtaactgatgaagctggtaatacagcctccgatgaa
aaaacatttgatattgataattcggcacctgtcctttctgtgaatcaagacgcttctatg
gaggtaaatagcaccgcaaccaatattaattgggtcaatcctttaattataagcgcaacc
gacgcacacgatggcaaccttacaccaacgattgattacagccaagtcttgtggaacgaa
ttaggaacttatccagtgaaggtaactgcaacagatacctctgataataaagtaacagag
acttttaatgtaaaagtagttgataccatcgcacccaatttaatcgtaacaaataataca
ttaaactacacagttgaaagtatgcggatgttaactgaacaagatttattcacagcagct
ggtcttgttggcattgataattatgacttagtacctggtcaaacaccacaactaaacaaa
ttaccaatgatcttcacgagtgattttagtacagtttttaatgatatttcaaaagtgaaa
aaaggccagtatcaagttcaagtaaaccttgtagattctagtaacaatcaagcaatacca
caatcaatttctattatcgtaaaagatacaaaagctccagtaatcatagcggatgatgtg
atataccatgtaaattcgagtaaaaccgaaactgatttcttacaggattccaacatcaaa
acgaccgataataatgatgaaaccgatgatttaaaaataactaccaattttacttcaaaa
gtagatttaacaaaaccaggaaaatatgaagttacagttcaagcagtagatacttcaagt
aacacaacaactaagacaatccaagtccaagtagcaaaagataaaccagttatctctgca
gataagaagattagttatcaaggaaaaacttctgtaaccgaaactgatttcctagcagat
attcaggcagaagtaacagatgaattagacggaaatattgctattaaaagtgactttacg
gaaaaagttaatttaaacaaagttggcaaatatgaagttactttaaactctgaagattcg
tatggaaataaagctaatcctgtaataatcgaagtaactgtatataatcagatttcccca
atattccaaaatgtactcaatcaaaccattgaagcaaccaataaactaccgtctctatcc
actatttttaatattaaatcaatagattatatgactggagcgaaaataaaggttacgtat
acctcagagcaacctattaaaggaaatgttccaggtaaatattctgttaaagtaacaaca
aaagatacagccggaaacacagcagaaacaaccgttacattaacaattgtcgacacaacg
cttccagtattaatcataaataaagaaaaaataagttatacaaaaggaaaaactatttca
gaaaaacaattatttcaagatattggagtgagtgctgtagataataatggcacagtagaa
gtcacatccaacatagctaaagttgtgaattggaataaagtaggcgactataaattgaca
atcacagctactgattcatctggaaatattaccaaaaacaccattatactaactataaaa
gatagcgaaaaatcgctccatatcgtaccaagtaaccaaaaaaatggtaatcaaactccc
tctcctgcaaaggaaaaaaacatgccaaaaacaggagatgattggaatactgagtttatt
ctaatcggtgtaatgcttcttttaacaggaatttggttattctgtagaaaagatacaaag
acaaaataa

DBGET integrated database retrieval system