Lotus japonicus: 130717564
Help
Entry
130717564 CDS
T04348
Name
(RefSeq) piezo-type mechanosensitive ion channel homolog isoform X1
KO
K22128
piezo-type mechanosensitive ion channel component 1/2
Organism
lja
Lotus japonicus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lja00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
lja04131
]
130717564
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
lja04040
]
130717564
Membrane trafficking [BR:
lja04131
]
Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
Others
Others
130717564
Ion channels [BR:
lja04040
]
Other channels
Mechanosensitive channel (Piezo)
130717564
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Piezo_cap
Piezo_THU9_anchor
THU_Piezo1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
130717564
NCBI-ProteinID:
XP_057423804
LinkDB
All DBs
Position
5:56793451..56819766
Genome browser
AA seq
2486 aa
AA seq
DB search
MAEFLTGFVLPSLLLTASLINWSLISLIDLIAFLLILYNVSQLGFHFRRRFLLLWSIVIF
SVVAILSQVTYLVIWAVKQTSWSISDVWWAKLIGFMTIQSWKYPYVIYFLVIQLLALLVA
LFDIYGKRHFLNTWQDSRWGHFLSIVEHLGSHLRVASCLLLPAVQLIVGISLPSWASLPF
FIGSCVGLVDWSLTSNFLGLFRWWRLLQLYAGFNIFLLYVYQLPVEQPSVIHRMADLIGL
YKISSNSQWPEICSCLSLVFYYIMLSFTKSDLEEMNFIISRTDCSLTEQLLPSRHSFFIR
ESRSGVRHTNVLLRGAVFQTFSINFFTYGFPVSLFALSFWSFHFASLCAFGLLAFVGYII
YAFPSLFRLHRLNGLLLVFILLWAVSTYIFNVAFTFLNWKLGRDMKIWEMVGLWHYPIPG
FFLLAQFCLGILVALGNLVNNSVFLYLSDEGGQSSNDNVSVKAEGETKALIVATIAWGLR
KSSRAIMLALIFIIAIKPGFIHAVYMIFFLMYLLSHNVSRKMRQALILLCEIHFSLLYVL
QIDLISAALEKKGSVSMEVVMQLGLLEEDSAWDFLEVALLACFCAIHNHGFEVLFSFSAI
IQHAPSPPIGFGILKAGLNKSVLLSVYASSSVRNSDESFSNERRIASYLSAIGQKFLSIY
RSCGTYIAFLTILFTVYMVRPNYISFGYIFLLLLWIIGRQLVERTKRQLWFPLKVYAILV
FIFIYTLSSFSSLEMYLSKLIDLYFYLGYDSKASSFHNVWESLAVLVVMQLYSYERRQSK
QIRQEQNQLDSPEPGILGFIRRFLIWHSQKILFIALFYASLSPISAFGFLYLLGLVFCSI
LPKTSSVPSKSFSAYTGFLVTAEYLFQMWGKQAEMFPGQKYSDISLFLGFHVFQPGFWGL
ESGLRGKVLVIVACTLQYNVFRWLERMPNTVLCEGEWEEPCPLFVSTEDAFDDATPCNME
SKTSCNSYPPSSIQENVSSKSLKITTSGFSQARDISSSKTGGSDSNSRKYSFGFIWGSNK
ESHKWNKKRIVALRKDRFETQKTVLKVYLKFWMENLFNLFGLEINMISLLLASFALLNAL
SMLYIALLAACILLNRQIIRKVWPIFVFLFASILILEYFVIWKDMSPLSSHDPSEIHCHD
CWEISTLHFGFCEKCWIGLVVDDPRMLISYFSVFMLACFKLRADRLSSFLGSSTYRQILS
QRRNTFVWRDLSFETKSMWTFVDYLRLYCYCHLLDLVLVLILITGTLEYDILHLGYLAFA
LVFFRMRLEILKKKNKIFKFLRIYNFSVIVLSLAYQSPFVGGPSSKTGKCETANYIFEMI
GFYKYDYGFRITARSAIVEIIIFVLVSLQSYMFSSQEFDYVCRYLEAEQIGAIVHEQEKK
AAWKTDQLQQIRENEEKKRQRNMQVEKMKSEMLNLQIQLHSMNTSTNCIDGFSHPGEGLR
RRRSTSITSNIGFGIPDKEDQGLGRLDYAIREDSVFPIERHESSTCPNVETPLTEEYMKY
SVDSPCCEITEIDIDTSSSDSGKKEKVIGQAKENPLKSAVQLIGDGVSQVQSIGNQAVNN
LVSFLNISQEDSDSNEHTNIEDQIYDEMESQKTQHIFVERSSSLQSDKSSDAASLQLGRI
FRYIWYLMRSNNDVVCYCCFVLVFLWNFSLLSMVYLGALFLYALCVNTGPSYIFWIIMLI
YTEVYILLQYLYQIIIQHCGLNIDPSLLRELGFTTHKITSSFVVSSLPLFLVYLFTLIQS
SITPKDGEWMSSTDFKFKRNGLHTKDNPTRYNWQERAWALLNQMTNMVMWIIRCFYRYWK
SLTQEAESPPYFVQVSMDVNFWPEDGIQPERIESGVNQFLRVVHSDKCKEKNPNVCSSSS
RVNVQRIERSQENPNVALVVLEVVYASPVLDCSSAEWNKSLTPAADVAKEILKAQHAGFV
EEVGFPYRILSVIGGGKREIDLYAYIFCADLIVFFLVAIFYQSVLKNKSEFLEVYQLVDQ
FPKEYVFVLMAIFFLIVLDRIIYLCSFATGKVIYYISNLIIFTYSVTVYDWQLEPSQQHA
ARLALRAIYLAKAVSLGLQAVQIHYGIPHKSTLYRQFLTSEVSRINYLGYRAYRAVPFLY
ELRCVLDWSCTTTSLTMYDWLKLEDINASLYLVKCDSVLNRATHKPGEKQTKCTKCFNGI
LLFFVLICVIWAPMLMYSSGNPTNIANPIKDASFHVDIKTEGGRLNLYETTLCERIRWDS
LNSDVNPDPYGYLDAYNKNDIQLICCQADASTLWLVPHVVRTRLIQSLEWYTDMEIFFTW
MLSRDRPKGKEAVKYEKAVDPQYLPAKSDVQKVLNGSMNSFRIYNVYPRYFRVTGSGDVR
PLDEDRDVSADLIINHDQFDWWSFKDINPSNLSGFCGGLTGPMAIIVSEETPPQGILGDT
LSKFSIWGLYITFVLAVGRFIRLQCSDLRMRIPYENLPSCDRLIAICEDIYAARAEGELG
VEEVLYWTLVKIYRSPHMLLEYTNPD
NT seq
7461 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcggaattcctcaccggcttcgtgcttccttcgctgcttctaacagcttctttaatc
aactggagtttgatctctcttattgatttgatagcctttcttctcattctgtataatgta
tcacaattaggatttcatttccgaaggaggtttttgttattgtggtcaattgttatattt
tctgttgttgcaatactttctcaagtgacttatctggtaatatgggctgttaaacaaacg
tcttggagcatatcagatgtttggtgggcaaagctgattgggtttatgacaattcagtct
tggaaatatccttatgtaatttatttcttggttatacaactgctcgcacttcttgttgct
ttatttgatatatatgggaagaggcattttctaaatacatggcaagactcacgttggggt
cattttctatcaattgtcgaacatttaggttctcatcttcgagtggcgtcttgcttgctg
ttgcctgccgttcagctaattgttggaattagccttccgtcatgggcctcactgcctttt
ttcattggtagttgtgttggccttgtggattggtctttaacgagcaactttcttgggctt
ttcaggtggtggaggcttcttcagctgtatgcaggttttaatattttcttgctttacgtg
tatcaacttccagtggaacagccaagtgtgattcatcggatggctgatttaattggtctt
tacaaaatatcctcaaattctcagtggcccgaaatttgttcttgcctttctctcgtattt
tactatataatgctctctttcactaaatctgatttggaggagatgaattttattatttcc
aggacagattgtagcttgacggagcaacttctaccctctaggcattcatttttcatccgt
gaatcaaggtctggtgtgaggcacacaaatgttttactcagaggagctgtttttcagact
ttcagtatcaactttttcacgtatggtttcccggtttccttgtttgcactttccttttgg
agctttcattttgcgagtttatgtgcatttgggttacttgcttttgttggctacattatc
tatgccttcccttccttatttcgtctgcaccgattgaatgggctacttctcgtcttcatc
ctcttgtgggctgttagcacctatatatttaatgtggcatttacatttctgaattggaaa
cttggacgggacatgaaaatctgggagatggtcggtctgtggcactatccaatacctggg
ttttttcttctggcacaattttgtcttggaattttggttgcattgggtaatcttgtgaac
aattctgttttcctctacttgtctgatgaaggtgggcaatcttcaaatgacaatgtatca
gtaaaagctgagggtgagactaaggcattgatcgtggcaacaatagcctggggattgcgc
aagagctctcgagctatcatgctggcattgatctttatcattgctataaaacccggtttc
attcatgcagtatatatgatcttcttcttgatgtatcttttgagccacaatgtcagcaga
aaaatgagacaagcactgattcttctatgtgagattcatttttccctgttgtatgttctt
caaattgatttgatctccgcagcattggagaaaaaaggttctgttagcatggaagttgta
atgcaattaggcctccttgaagaagatagtgcttgggatttcttggaagtagctttactt
gcatgcttttgtgcaattcataaccatggttttgaggtgttattttcattttcagcaatc
atacagcatgcccccagccctcctattggatttggcatcttgaaagctggtcttaacaaa
tctgttcttttgtctgtatatgcttcctcctctgtgagaaacagtgatgaaagtttctct
aatgaaagaagaatagcatcttacctgagtgcaattgggcagaagttcctttctatatac
cggtcttgtggcacctacattgcttttctgactattcttttcacagtgtacatggtgaga
cctaattacatatcatttggctacatattccttctccttctatggattatcggaagacaa
cttgttgagagaacaaaaagacagctttggtttccattgaaagtgtatgcaattttggtg
tttatcttcatatatactttgagcagtttctcaagccttgagatgtatttgtccaaatta
atagatctctatttttatctgggatacgactctaaagcatcttcatttcataatgtttgg
gagtctttggcagtcttggttgttatgcaactttatagctatgagagaagacagagcaag
cagatcaggcaggaacaaaatcaactggattcaccagagccagggatacttgggtttatc
aggcgatttcttatctggcacagccagaagatcttgtttattgctctgttttatgcatct
ttgtccccaattagtgcatttggcttcttgtatcttcttggcttagtcttctgctccatt
ttacctaaaacttctagtgtcccgtccaaatcattctcagcatacacaggttttctggtg
acagctgagtacctttttcagatgtggggcaagcaagctgaaatgtttcctgggcagaag
tactctgatatatctctttttttgggtttccatgtattccagccaggcttttggggtctc
gaatcaggactgaggggaaaagtgttggtcattgtggcctgtacccttcaatacaatgtc
ttccgttggttggaaaggatgccaaatacagttctatgcgaaggagagtgggaagagcct
tgtcctctatttgtgtccacagaagatgcatttgatgatgctactccatgcaatatggaa
agtaaaacatcatgcaattcatatcccccttcttcaatacaagaaaatgtgtctagcaag
tcattgaaaattacaacttctggtttttctcaagcacgtgatatttcatcctctaaaact
ggaggttctgacagtaacagcagaaaatattcatttgggtttatctggggaagcaacaag
gagagtcataagtggaacaagaagcggattgttgctttgagaaaagatcgatttgaaaca
caaaaaactgtcttaaaagtatatttgaaattttggatggagaatctgtttaatctgttc
ggtctagagataaacatgatatcattactactggcaagctttgccttattgaatgcacta
tccatgctgtatattgcactgcttgctgcttgtattctacttaatcggcaaattatacgg
aaagtctggcccatatttgtctttttgtttgcttccattctcatcctggaatattttgtc
atctggaaggacatgtcgcctttaagttcccatgatccaagtgagattcattgccatgac
tgctgggaaatttcaactctgcattttggtttttgtgagaaatgttggattggacttgtg
gtcgatgatcctcggatgttgattagctacttttcagtattcatgctggcttgcttcaaa
cttcgtgctgatcggctgtctagctttttaggatcatcaacatatcgtcagattctgtct
caacgtagaaacacatttgtctggagagatctctcttttgaaactaaaagcatgtggaca
tttgttgactatttgaggctttactgctactgccatctgttagatcttgtgctggtatta
atattgattactggaacactcgagtatgacattttgcatcttggttatcttgcctttgct
ctggtattttttcgcatgagacttgaaatactgaagaagaagaacaaaatattcaagttc
ttgcgcatatacaacttctctgttattgttctttctcttgcttaccaatctccttttgtt
gggggaccaagttctaagactgggaagtgcgagacagcaaattacatctttgagatgatt
ggtttttataaatatgattacggttttcggattactgcaagatctgcaattgtagagatt
atcatttttgtgctggtatcacttcagtcatatatgttttcctcgcaagagtttgattat
gtatgtcgctacctggaagcagagcaaattggtgcaattgtacatgagcaagagaaaaaa
gctgcatggaaaactgatcaactacaacaaattcgtgaaaatgaggagaaaaaaagacag
cgaaacatgcaggtggagaagatgaaatctgaaatgctcaacctgcaaatacaactccac
agcatgaacacatccactaattgcattgatggattttctcaccctggtgagggtctaaga
aggaggaggagtacttctattacatcaaatattggctttggaattcctgataaagaagac
cagggtctgggaagactagattatgcaataagagaggattctgtttttccaattgaacgg
catgaatcgtctacttgcccaaatgtggaaactccattaacagaggagtacatgaagtat
tcagtggattctccgtgttgtgaaattactgaaatagatattgatacttcttctagtgat
tcaggaaaaaaggagaaagttatagggcaagcaaaagaaaacccactgaagtctgctgta
caactaataggtgatggtgtttcccaggtgcagtccattggaaatcaggcagtcaataac
ctagtgagctttctgaatatttcacaagaagattctgattcaaatgagcacacaaacatt
gaggaccagatatatgacgagatggagagtcagaaaacgcagcatatattcgtggagcgt
tcttcatctttgcagtctgataagagttctgatgctgcgagtctgcagttaggaaggatc
tttcgttatatatggtacctaatgcgttccaataatgatgtagtatgttactgttgcttt
gttctggtcttcttatggaacttcagtttgctatcaatggtgtatcttggggctctcttc
ttgtatgctctatgtgtaaatacgggcccaagttacatcttctggattattatgttgatc
tatacagaagtttatattttacttcagtatctgtatcaaattatcatccagcactgtgga
ctgaatattgatccctctctgctgagagaattaggttttacaacccacaaaatcacgtct
tcatttgttgtcagttcattacctctctttctggtgtatttgtttaccctcattcaaagc
tctataacacctaaagatggtgagtggatgtcttctactgacttcaaatttaagaggaat
ggtctccacacaaaagataaccccactcgatacaattggcaagagagagcatgggctttg
ctaaatcagatgactaatatggtaatgtggataatcagatgcttttataggtactggaaa
tcactcacacaagaagcagagtctcctccttattttgttcaggtgtctatggatgtcaac
ttctggcctgaggatgggattcagccagagaggattgaatcaggagttaatcagtttctc
agagttgtccatagtgataagtgcaaggaaaagaacccaaatgtttgctcttcttctagt
agggttaatgttcaaaggattgaaagaagccaagagaaccccaatgttgctctagttgtt
ttggaggttgtgtatgcatcacccgttcttgattgttcttcagcagaatggaataagtcc
ttaactccagcagctgacgtagccaaggaaatcctcaaagctcagcatgcaggttttgtg
gaagaagtgggattcccttaccgtattctttctgtaattggtggaggcaagagagaaatt
gatctgtatgcctacatattttgtgcagatctaattgtattctttcttgttgccatcttc
taccagtctgtcctaaaaaataaaagtgagttcctagaagtttatcagcttgtagaccag
tttccgaaagaatatgtctttgttttgatggctatcttcttcttgattgttcttgatcgt
ataatatacctctgctcatttgccacggggaaagtgatttattatatttccaacctcatt
atcttcacatattcagttacagtgtatgattggcaattggagccatcccagcaacatgca
gctcggttagctctccgtgccatatatcttgcaaaagcagtttctcttggactgcaggct
gttcaaatccattatggcattcctcacaagagcacattgtatcggcagtttttgaccagt
gaagtttcacgaatcaattacttagggtacagagcttatcgtgctgtgccattcctttat
gaattacgatgtgtacttgactggtcatgcacaactacatccctcaccatgtatgactgg
ctaaagcttgaggacataaatgcaagtttgtaccttgtcaaatgtgattcagtcttgaat
agagctacacacaaaccaggagagaagcaaacaaaatgcaccaaatgcttcaatggaata
ttgctgttctttgtattaatttgtgttatatgggctccaatgctgatgtacagcagcggt
aaccccacaaatattgcaaacccaattaaagatgctagctttcatgttgatatcaagaca
gagggtggaaggttgaatttgtatgaaactactctatgtgaaagaatccggtgggactca
ctaaattctgatgtaaatcctgacccctatggctatttggatgcatataacaagaatgat
atccagttaatatgctgtcaagctgatgctagtacattgtggcttgttccgcatgttgtt
cggaccagattgattcagtcccttgaatggtatactgacatggaaatttttttcacttgg
atgctttcaagggacagaccaaaaggaaaagaagctgtgaaatatgaaaaggctgttgat
cctcaatatcttccagcaaagtctgatgttcaaaaggttcttaatggatctatgaacagc
tttaggatttataatgtttatccaagatatttccgtgtcactggttcaggtgatgttaga
ccattggacgaggaccgtgatgttagtgctgatctcattataaatcatgatcaatttgac
tggtggtccttcaaagatattaatccatcaaatctaagtgggttttgtggaggtttgacg
ggacctatggctatcattgtatccgaggaaacaccaccacagggtattcttggtgacaca
ctgagcaagttcagcatatgggggctttacataacctttgttctagcggttggacgcttt
atcagactccagtgctctgacttaaggatgagaattccctatgagaacctaccttcctgt
gacaggttgatagcaatctgcgaggatatatatgctgcaagggctgagggtgagcttgga
gttgaagaggtcctttattggacactagtgaagatatatcggtccccgcacatgctgctt
gagtacaccaaccctgattaa
DBGET
integrated database retrieval system