Lotus japonicus: 130717630
Help
Entry
130717630 CDS
T04348
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
lja
Lotus japonicus
Pathway
lja03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lja00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
130717630
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
lja03019
]
130717630
Messenger RNA biogenesis [BR:
lja03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
130717630
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RRM_PARP14_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
130717630
NCBI-ProteinID:
XP_057423925
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(40821266..40824683)
Genome browser
AA seq
479 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWDTNEDKLKEHFSNYGDVLNTSVMREKNTGKPRGFGFVVFSDPAVL
DAVLEDKHVIDGRTVDAKRAFSREDQQISVTSRAGNPNSGMNSGNGGNVRTKKIFVGGLP
PTLTEEKFRQYFESYGHVTDVVVMYDQNTGRPRGFGFISFDNEDAVDRVLHKSFHDLNGK
QVEVKRALPKDANPGASGRMMGGAGGGGAGIGGYQGYGASGGSQNAYDGRMDSSRYMQPQ
SAAGGFPPYGSSAYSAPGYGYGSANNGIGYGAYGSYGGATAGYGGPAAATYGNPNVPNAA
YAGAPPGGPRSSWPAQAASGYGSMGYGNTAPWGAPTGGAGSGGGGPGSATAGQSPSGATG
YGNQAYGYGGYGGYGGSDSSYGNPGVYGAVGGRTGSTPNSNASGPGGSELQGSGGSGSYM
GSGYGDANGNSGYGNAAWRSEQAQATGNYGTPQGNGSHGGQVGYGGGYGGAQSRQAQQQ
NT seq
1440 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcagggcaagcttttcatcggtgggatttcatgggacacgaatgaggac
aagctcaaagagcatttcagcaactatggtgatgttttgaacacttctgtcatgagggag
aagaacactggaaaacctagaggatttgggttcgtcgtgttttcagatcctgctgttctc
gatgctgttcttgaagacaagcacgttatcgatgggagaacggttgatgccaagagggca
ttctcaagagaggatcaacagatttctgtcacttccagagctggaaatcctaattctggt
atgaattctggaaatggtggtaatgttaggaccaaaaagatatttgttggagggttgccc
ccgaccctgactgaagaaaaattccgtcagtactttgagtcttatggacatgtaactgat
gtagtagtgatgtatgatcagaatactgggcgaccacgaggatttggctttatttcattt
gataatgaggatgcggttgatagggttttgcacaagtcatttcatgatttaaatggtaaa
caggtagaggtaaagcgtgcacttcccaaggatgctaatcctggtgcaagtggccgtatg
atgggtggtgctggaggtggtggtgctggaattggtgggtatcaagggtatggggcttct
ggtggcagccaaaatgcatatgatggtcgtatggattctagtaggtatatgcagcctcaa
agtgctgccggtggattcccaccttatggttcttctgcctatagtgctcctggatatggg
tatggttcagctaacaatggtattggttatggtgcatatggaagttatggtggcgccact
gctgggtatggtggacctgctgctgcaacttatgggaacccaaatgtccctaatgctgct
tatgctggtgctccaccaggtggccccaggagttcatggcctgctcaggctgcctctggt
tatgggtctatgggctatgggaatactgctccttggggcgctccaactggtggtgctgga
tctggtggtggtggccctggttcagcaactgcaggtcaatcccctagtggagctactgga
tatgggaatcaagcttatggatatggtgggtacggtgggtatgggggaagtgatagttct
tatggaaatccaggtgtgtatggtgctgttggagggcgcactgggagtaccccaaatagt
aatgccagtggtcctggtgggagtgagctacaaggtagtggtggcagtggtagttatatg
ggtagtggctatggggatgcaaatggaaattcaggttatggaaatgcagcttggagatct
gaacaagctcaagcaactggaaattatgggactcctcagggaaatggctcccatggtggg
caagttggttatggtggaggctatggcggtgctcagtctcgacaagcccaacaacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
