Lactobacillus johnsonii DPC 6026: LJP_1462c
Help
Entry
LJP_1462c CDS
T01960
Name
(GenBank) putative cell-wall-anchored protein (LPXTG motif)
Organism
ljh
Lactobacillus johnsonii DPC 6026
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Gram_pos_anchor
PITM1-3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEB93782
LinkDB
All DBs
Position
complement(1570812..1575857)
Genome browser
AA seq
1681 aa
AA seq
DB search
MQKVWFHIMYMVLPRVSEVSNYAIANGTSSYGGGSYTFNVNGQAIEVVKNSTGINNQQGS
INYSLNNTVELPQFTGVASFGNLNSSGAFVSGNSINYTSNTPQSQIPTLSVRLSTLGNST
VNNPQFIVMIPKGFTSSTTDFSLIDKNVGNYFGGQFNGSNQYSPSNYSIEDLGKVGPNGE
QLFKIQLDFNPGWNVAQNFGGQFKLTLDPTQTGTYSYGSNGAPIVSELASDAKPSASTDA
NYTFVANGQNIAVVKSSASSIINYAINTNLLPTFTGTAILDANGKTYSGDSVPTYSFRLS
TTGESTVQNPKFIVMIPDGFTATTDDFSFDTGGYSGAASVKELGNYGPNGEQLFEVSLTG
TTPNFTTNSVMGSVKLSPNFNGKTGGSHTYSNATGPLVAEVSNYSNTTYGTYTFNTSDGA
ITVVKSPQTVNWTDPSNQAANSSGSVTYTIQVGKEQLPTTAYTISNIKVTPVAGETSSDA
GYEQLAFSITPKQTLQDGQYIDVHLGLPDSNGNIENYDSKLAANLPLMTPNGVQIATAYN
MGTYYRIVFNSEAAAYTSGNNKLTLNPILRWGNPQSQQPSISINQGSDNTTNLGKVYVYQ
YTDDESKNGTLFAYTPTNDVTINGQHYASGLHIQGQYVYDKQYLDCNNTTTAGIFYNNNR
VWGPNNSVSINTNWANAIGFKIATSGAATSEANTGSNFDIAITVGNSKEFTYTWLTDSQM
EDRIKSIYAWYVNNELSNEVAGSSPTNVYLKNEINKVSQMTSPVTVTHEETTTANGEIEM
VYHVKIADSSIRLKGLIIPLTVSANGFTMPDDIKSYQEDLDKSPTVDKNNYENTPNMGAA
TSNTALQAALQNTAHPVMTITNNVTGDTVPLPNTIDWNTWKAGIAYGVNGDVTNSSDSTN
TRTATLEFINDTNPSNPITLTQATNNFQGPAEGTIIFSDATATLEGLESEGYILEKVVDN
QTGQVLTPPDGVSISDLSKYVYGSLGDGPNKFTVYLRKIDTASISASQSESIVISHSESM
SNSLSNAVSMSESLSNSVSMSESSSNSVSMSESLSNSVSMSESLSNSVSMSESLSNSVSM
SESISNSVSMSESLSNSVSMSESLSNSVSMSGSMSNSVSMSESLSNSVSMSESMSNSVSM
SESLSNSVSMSESLSNSVSMSESLSNSVSMSESLSNSVSMSESLSNSVSMSESLSNSVSM
SESLSNSVSMSESLSNSVSMSESLSNSVSMSESLSNSVSMSESLSNSVSMSESLSNSVSM
SESLSNSVSMSESLSNSVSMSESLSNSVSMSESLSNSVSMSESMSNSVSMSESLSNSVSM
SESLSNSVSMSESLSNSVSMSESLSNSVSMSESLSNSVSMSESLSNSVSMSESLSNSVSM
SESLSNSVSMSESMSNSVSMSESLSNSVSMSESLSNSVSMSESLSNSVSMSESMSNSVSM
SESLSNSVSMSESLSNSVSMSESMSNSVSMSESLSNSVSMSESLSNSVSMSESLSNSVSM
SESLSNSVSMSESLSNSVSMSESLSNSVSMSESMNNSVSMIESLSNSVSMSERVSESTSF
STSITSKSMRSTNTSESLSTSNVSASQSLIPSEIPANSLRSETGQANSVTPIASEKRLSS
NRRNSESIGIIKVNKTNRMAKRPRNQKLPQTGTKNNSSLLGIIAASLGALLGLRSRKNNK
K
NT seq
5046 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaaggtgtggtttcatataatgtatatggtactcccccgtgtttctgaagtatcc
aactatgccatagcaaatggaacaagttcctatggaggtggctcatatacgtttaatgta
aatggccaagcaattgaggttgttaaaaactctactggtattaataatcaacaaggctcg
attaattatagtcttaacaacactgtagaattacctcaatttacaggagttgcttctttc
ggtaatttaaattcatctggtgcttttgtttctggtaatagtattaactacacgagtaat
acgccacagtcacaaataccaacactttctgttcgtctttctacacttggtaattctaca
gttaataatccacaatttattgtaatgattcctaaaggttttacgtcgagtacaactgat
tttagtttaatagacaaaaatgttggtaattattttggtggtcaatttaatggatctaat
caatattcgccaagtaactattcaattgaagatttaggaaaagtcggaccaaatggagag
cagttgtttaaaatccagttagactttaaccctggctggaatgtggcacagaattttggt
ggacaatttaaattaacactagatccaactcagacaggaacctatagctatggaagcaat
ggggctccaatagtttcagaacttgcaagtgatgcgaaaccaagtgcatcaacagatgct
aattatacttttgtagctaatggacagaatatagccgtagtaaaaagtagtgccagttcg
attattaactatgcaataaatacaaatttgcttcctacatttacagggactgcaattctt
gatgcaaatggaaaaacgtacagtggagattcagtgccaacttatagtttccgtttatcg
acaactggggaatctaccgttcaaaaccctaaatttattgtaatgatacccgatggattt
acagctactacagatgacttcagctttgatactggtggatattctggtgcggcatcagtt
aaagagttaggcaattatggaccaaatggagagcaactctttgaagtatcattaactggg
acgacgcctaactttacaacaaattcagtaatgggatcagttaaactgagtccgaacttt
aatggaaaaaccggtggtagtcatacttattcaaatgcaactgggcctttggtagcagaa
gtttctaactattctaatacaacctatggaacttatacttttaatacaagtgatggagcg
atcactgttgtaaaaagtccacaaactgttaattggactgatccaagtaatcaagctgct
aatagtagtggaagtgttacttatacaatacaggtagggaaagagcaattaccgactact
gcctataccatcagtaatattaaagtgacaccagttgctggagaaaccagtagcgatgct
gggtatgaacagctcgccttttcaattactccaaaacaaactttgcaagatggtcaatat
attgacgtccatttgggactacccgatagtaatgggaatattgaaaattatgatagtaaa
ttagcagctaatctccccttaatgactcctaatggagttcaaatagctactgcatataat
atgggtacgtactatagaatagtttttaattcagaagctgcagcttataccagtggtaat
aataagttaactcttaatccgatattaagatggggaaatccacagtcccaacaaccatcc
attagtattaatcaaggtagtgataataccactaatttaggaaaagtttatgtttatcaa
tatactgatgatgaatctaaaaatggaactttatttgcttatactcctaccaatgatgtg
acaataaatggacaacattacgctagtggccttcacattcaagggcaatatgtctatgac
aagcaatatcttgattgtaacaatactactacagcaggtattttttataataacaatagg
gtatggggaccaaataatagtgtctccataaatactaattgggccaatgctataggcttt
aagattgctactagtggagcagctacttctgaagctaatacgggctctaattttgatatt
gcgattactgtagggaatagtaaagaatttacttatacttggcttacggacagccagatg
gaagaccggattaagagcatctatgcatggtatgtaaataatgaattaagcaatgaagtt
gctggaagttctcctacaaatgtttatttgaagaatgaaataaataaagttagtcaaatg
acttcgccagttacagtaacacatgaagaaaccactacagctaatggtgaaattgaaatg
gtttatcatgttaaaattgctgactcttcaattagattaaagggattgattattccttta
acagtaagtgcaaatggttttacaatgccagatgatatcaagtcatatcaggaagatctt
gataaatcacctactgtagataagaataactatgaaaatactcctaatatgggtgcagct
acaagtaatacagccttacaagcagcattgcaaaatacagcacacccggttatgactatt
acaaataatgttacaggagatacagttcctttaccaaatactatcgattggaatacttgg
aaagctggtattgcctatggtgttaatggagatgttaccaactcaagtgattctactaat
acaagaactgctacacttgaatttattaatgatactaatccttcaaatccaattacactt
acgcaagctacgaataatttccaaggacctgctgaaggaacaattattttttcagatgct
actgcgacattagaggggttagaaagtgaaggatatattcttgagaaagttgtcgataac
caaactggtcaagtattaactccaccagatggtgtatctataagtgacttaagtaaatat
gtatatggatcattaggagatggtcctaataaatttactgtttacttacgtaaaatagat
acggcaagtattagtgcttcacaaagtgagagtatagtaatatctcatagcgaaagcatg
agcaacagcctaagcaacgcagtatcgatgagcgagagcttatctaactcagtatcaatg
agcgaaagctcaagtaactcagtaagcatgagtgaaagtctaagcaactcagtatcaatg
agcgagagtttgagcaactcagtaagcatgagtgaaagcctaagcaactcagtgtcaatg
agcgaaagcataagtaactcagtgtcgatgagtgaaagtctaagcaactcagtatcaatg
agcgagagtttgagtaactcagtatcgatgagtggaagcatgagcaactcagtaagcatg
agtgaaagtttaagcaactcggtatcaatgagcgagagtatgagcaactcagtgtcgatg
agtgaaagcttaagcaactcagtgtcaatgagcgaaagtttaagtaactcagtaagcatg
agtgaaagcctaagcaactccgtatcaatgagcgaaagcttaagtaactcagtaagcatg
agcgaaagtttgagtaactcagtatcaatgagtgagagcttgagtaactcagtaagcatg
agtgaaagcctaagcaactccgtatcaatgagtgaaagcttaagtaactcagtatcgatg
agcgaaagcctaagcaactcagtatcaatgagcgaaagcttaagtaactcagtaagcatg
agcgaaagtttgagtaactcagtatcaatgagcgagagtttgagtaactcagtatcaatg
agtgaaagtctaagcaactcagtgtcgatgagtgaaagcttaagcaactcagtgtcgatg
agtgaaagcttaagtaactcagtgtcaatgagcgaaagcttaagcaactcagtgtcaatg
agtgaaagcatgagtaactcagtatcaatgagcgaaagcctaagcaactcagtatcaatg
agcgaaagcttaagcaactcagtaagcatgagtgagagcctaagcaactcagtgtcaatg
agtgaaagtctgagcaactcagtatcgatgagcgagagcttatctaactcagtaagcatg
agtgagagcctaagcaactcagtgtcaatgagtgaaagtctaagcaactcagtgtcaatg
agtgagagcttgagcaactcagtatcgatgagtgaaagcatgagtaactcagtgtcaatg
agcgaaagcttaagcaactcagtgtcaatgagtgaaagtctgagcaactcagtatcgatg
agcgaaagcttaagcaactcagtgtcaatgagtgaaagcatgagtaactcagtatcaatg
agcgaaagcttaagtaactcagtaagcatgagtgaaagcctaagcaactcagtatcgatg
agtgaaagcatgagtaactcagtgtcaatgagcgaaagcctaagcaactcagtgtcaatg
agtgaaagtctgagcaactcagtatcgatgagcgagagcttatctaactcagtaagcatg
agtgaaagcttaagcaattcagtatcaatgagcgaaagcttaagcaactcagtatcgatg
agcgaaagtttaagtaattcggtctcaatgagtgaaagcatgaacaactcagtatcgatg
attgagagcttatctaactcggtaagcatgagcgaaagagtctctgaatccactagtttc
tctacttctattacttctaaatctatgcgttcaacaaatactagtgaaagcttaagtacc
tcgaatgtttcagcttctcaaagtttgataccttctgaaattcctgcaaattcactaaga
agtgaaacaggacaagcaaactcagttacacctattgctagcgaaaagcgtctatcttca
aatagaagaaattccgaatcaattggaataattaaagtaaataagactaatagaatggca
aagcggcctcgtaaccagaagcttccacaaacgggtactaaaaataattccagtttgtta
ggaataattgcagctagcttgggagcattattagggttaagatccagaaaaaataataaa
aaatag
DBGET
integrated database retrieval system
