Lactobacillus johnsonii DPC 6026: LJP_1635c
Help
Entry
LJP_1635c CDS
T01960
Name
(GenBank) putative cell surface protein
Organism
ljh
Lactobacillus johnsonii DPC 6026
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Muc_B2
MucBP_2
YSIRK_signal
Gram_pos_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEB93951
LinkDB
All DBs
Position
complement(1779892..1786776)
Genome browser
AA seq
2294 aa
AA seq
DB search
MVSKNNYSEKMRKIRPQKQRFSIRKFTVGAASVLIGLTFMGVNNQEAQADTTVAPEESVK
VESSTASDITETMDNVVNTEEQSISTTDNQTEVMSAEENNEVENDVTASGETGNEEVKND
RSISSVETDNVDKQATNEVVTYNAESINGDTAVKNQNTNTTETNLVENTTPVEEAQAVED
VEKNAASVDVQPVESVESNTVSVEETQPAEKVENNTVSVEADQPIEAETKVENEASPIEE
SVVKENTTIQSNAKEVQSKAAVTILGTDADNYPKKAGDLIGDNRYIYQILNLNGTSFVSS
DNKKLILSVNRNNLSDDNLYAYVTDNSFTEILSTHTIQAGHFKNIEVVNGWHTVKFLVVN
SGKSNISINGSETPVGNASTVVGSTRIEYCLGNSTSIDASSIGEIIPVYTEQSVIKYYYN
QNGNLIEIPDTDKYPNVNVSGWTGQGFIVDNVDQYKQLINGFYLDASKLPTGSFTGTLSQ
FGDGSYYKKVYYSAGDKDEGTIDQLKVDFTVVYRQIDAIGKMEVLMYDGKDMTKVIESHT
VEAGKSVNFSHNNYTARNPFVTDSAHEVQFVYKELGSLILVDENGKEIHPSVKFNNDKDD
PTKAGLTYTPVIEGYIADIEFVTPEDPGKDIKVVYRLREDAKATITIVDLDNLENNGGKV
AELNATGKVYSVINFVDLSTTLQDLIDRGYVVISNDFKPGTKFDVKDLEFKIELKHGLEE
INESQSVDKIINYVDGVGNKLHDSVTQTAIFKTNGYRDKVTGKIVEVTEVEHDDGYLIAI
EITNKDASLQWTSKTDVFESIKSPDIVGYTTTQKWSTADKVDQDVKHRVENIVYDKKAQV
GTITFWDETSNKQLGSTINIAGNYREVINYQIIENVLNSIKDYENNNYILVSNPLTYATT
FGDAEYNPGCNDFRVILKHKIAENTQNKEVNRVITYVYADGPNKGQEAANSVTQKVTFIG
TGQYDFVDKAWIGDIVWTTEAGDMNYTFAPVESPKVTGYGADRGIVEAKIVSGSSDNITE
EVLYYANQTGASIQYIDDVTGLVIGRDDVYGKVDHQIIWGQNHENVLNLFIESGYKFVSS
DYEFGKDYYYSADEAKNIFTVHLTRDVIIIDPTNPDSPAYGSEDYIKEVIQEIQYVFANG
DTAAESNKQSIKFTAYGVVDKTTGKYVVLDENGKIVVDENKQPIEGTLTWKADVTDPKFA
EVVSPTINGYTPNKDLISASSVTENTPNKVIVVTYTANAAKAEIIYVDETTGKQLETAVV
DGKYNDTINYSTADKIKYYESLGYELVKDSYVGGEFSEDTKTFYVTFKHGVVHVHPDNPG
KPGENINPGGDVKYPTDSGVLNKDVTHTVHYIYADGTTAKPSHTQTLTFTGSGHINKVTG
EYVEVDEEGNIKLDSDGKPIPGKLNWMSALGNSFLAVPSPIITGHTPSHTEINGVENVAH
DSENYVYTVTYTANAAKAEIIYVDETTGKQLETAVVDGKYNETINYSTADKIKYYESLGY
ELVKDGYVGGEFGEDTKTFYVTFKHGTVVVNPETPGKPDEPINPDNPDGPKYPADSANLN
KDVTNTIHYVYADGTTAKPSHTQTLTFIGSGVIDKVTGQYVEVDENGNVKLDENGNPIPG
KLTWTASDGTTFIEVVSPTIVGYTPDKGVVNAVEGINQDSKNLETTVIYTANAAKAEIIY
VDETTGKRLETAVVDGKYNETINYSTADKIKYYESLGYELVKDGYVGGEFGEDTKTFYVT
FKHGTVVVNPETPGKPDEPINPDNPDGPKYPADSANLNKDVTNTIHYVYADGTTAKPSHT
QTLTFVGSGVIDKVTGQYVEVDENGNVKLDENSNPILGKLTWTASDGTTFIEVVSPTIVG
YTPDKGIVNAVEGINQDSKNLETTVIYTANAAKAEIIYVDETTGKQLETAVVEGKYNETI
NYSTADKIKYYESLGYELVKDGYVGGEFGEDTKTFYVTFKHGTVTVTPDDKFTEEDPINP
DNPDGPKYPFDSIALDKTITRTIKYVYADGTKAKDDVVQKLRFRGTAIIDKVTGEVIILD
ENGRKISDGIKWTALDGTTFIEVISPDIAGYTPDRKEIGSLENVDSNTDDIIETVVYNKD
IVDPEEPKDPVDPEEPKDPVDPEEPKDPVDPEDPVDPEEPKDPVDPEEPKDPVDPEEPKD
PVDPEEPKDPVDPEEPKDPVDPEEPKDPVDPEEPKDPVDSENPEDSKVPVQAETPTESPN
DAPILPDQLSTNTTIKEVATVETKESGKAEAATTEDVSLPQTGHKHSNAGLIGLGLATIA
SILGLAGTRKRKKD
NT seq
6885 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtttccaagaacaattatagtgaaaaaatgcgaaaaattagaccgcaaaagcaacgc
ttctctattcgtaagtttactgtaggggctgcttctgtattaattggtttaacctttatg
ggggttaataatcaggaagctcaagctgacactacagttgctccagaggaaagcgtaaaa
gtcgaaagtagtacagctagtgacataacagagacgatggataacgtagtaaatactgag
gaacagagtatatctactactgacaatcaaacagaagttatgtcggcagaagaaaataat
gaagtagaaaatgatgtaactgcttctggtgagactggtaatgaagaagtaaaaaatgat
cggtcgatttcttctgtagaaacagataatgtagacaaacaagcaactaacgaagtagta
acttataatgctgagtcaattaatggagacacagcagtaaaaaatcaaaatactaataca
actgaaactaatttagttgaaaatactactcctgtagaagaagctcaagcagttgaagac
gtagagaaaaatgctgcttctgtagatgtacagccagttgaaagcgtagaaagcaataca
gtttccgtagaagaaacacaaccagctgagaaggtagaaaacaatactgtatctgtagaa
gcagatcagcctattgaagctgaaactaaggttgaaaatgaagcttctccaattgaagaa
tcagtagttaaagaaaatacgactattcagtcaaatgctaaggaagttcaaagtaaagct
gctgtaactattctgggaacagatgcggataattatccgaaaaaagcgggagatttaatt
ggtgataataggtacatttatcaaattttaaacttgaatggtacaagttttgtgagtagt
gataacaaaaagcttatcttgtctgtaaatcgaaataatctatccgatgacaatctttat
gcatatgtaactgacaatagttttactgaaattttgtctacccatactattcaagcaggc
cattttaagaatattgaggtagtcaatgggtggcacactgtaaaatttttagtagttaac
agtggtaaatctaatatttctattaatggaagtgaaacgcctgttggaaacgctagtaca
gttgtgggaagtacaagaattgaatattgtctaggcaatagtactagcatagatgcgagt
tcaattggtgaaattatcccagtttatactgaacagtctgtgattaaatactattacaat
caaaatggcaatttaatagaaattccagacactgataaatatccaaacgttaacgtatct
ggttggactgggcaaggatttattgttgacaacgttgatcaatacaaacagctaattaat
ggcttttacttagatgcttcaaaacttcctactggttcatttactgggactctttctcaa
ttcggagatggtagttactataagaaagtttactatagtgctggagataaagatgaaggc
actattgatcaattaaaggtggattttacggtagtttaccgtcaaattgatgctatcggt
aagatggaagttctgatgtatgatggcaaagacatgactaaggttattgaaagccatact
gtagaagctggtaaatcagttaacttctctcataacaactacacagctagaaacccattc
gtaactgactcagctcatgaagtacagtttgtttataaagaattaggttctttaatttta
gttgatgaaaacgggaaagaaattcatccatctgtaaaatttaacaatgataaagatgat
ccgactaaggctggtctaacctatacaccggttattgagggatatattgctgatattgaa
tttgtaactccagaagatccgggtaaagatatcaaggttgtatatcgtttacgtgaggat
gctaaagctacaattaccattgttgatttagataatttagagaataatggtggtaaagtt
gcagaattaaatgcaactggaaaagtatattctgtaattaattttgttgacttaagtact
acactccaagacttgattgatagaggatatgtagttattagcaatgattttaaaccagga
acaaaatttgatgtaaaagatttagaatttaagattgagttaaagcatggtcttgaagaa
attaatgaatcacaatctgtagataaaattatcaactatgtagatggggttggtaataag
ctacatgattcagttacacaaacagccattttcaagacgaatggttatcgtgataaagtg
actggaaagattgtagaagtaacagaagttgaacacgatgatggttacttaattgctatt
gaaattaccaataaggacgctagtttacagtggacttctaagacggatgtctttgaatcg
atcaaatctccagatattgttggttacactactacacaaaaatggagtactgcggataaa
gtagatcaggatgtaaagcatagagtagaaaatattgtttatgataaaaaagctcaagtt
ggtacaattactttttgggatgaaacttctaacaagcaacttggatcaactatcaatatt
gcgggtaattaccgggaagtaattaactatcaaataattgaaaatgttttaaatagcatc
aaagactatgaaaataataactatatactagtaagtaatcctttaacttatgccacaaca
tttggggatgcagagtacaatcctggctgtaatgattttagggttattttaaaacataaa
atcgctgaaaatacacaaaataaagaagtaaaccgagtgattacttatgtttatgcggat
ggacctaataaaggccaagaagctgcaaattctgttactcaaaaagttacatttattgga
acgggccaatatgactttgttgataaagcttggattggtgatatcgtttggacaactgaa
gccggcgatatgaactatacttttgctccagtagaatcaccaaaggttacaggatatggc
gcagatagaggaattgtagaagctaagatagtaagtggaagctctgataatatcactgaa
gaagttctttattatgcaaatcaaacgggagctagcatccaatacattgatgacgtaact
ggactagttatcggtagggatgacgtatatggtaaagttgatcatcaaattatctgggga
caaaaccatgaaaatgtccttaacctatttatagaaagtggatacaaatttgtaagtagt
gactacgaatttggtaaagattactactattctgcagatgaagctaagaatatctttaca
gttcatttaactagagacgtgatcattattgatccaacgaatccagatagcccagcttat
ggatcagaagattacattaaagaagtaattcaagagattcaatatgtttttgcaaatgga
gatactgctgctgaaagtaataagcaaagcatcaagtttacagcgtatggtgttgtagat
aaaacaactggaaaatatgtagttcttgatgaaaatggcaaaattgttgttgatgaaaat
aaacaaccaattgagggcacacttacttggaaagcagatgtaacagatccgaaatttgct
gaagtagtatccccaactatcaacgggtacacaccaaataaggacttgatctctgcaagt
tctgtaactgaaaatactccaaacaaggtaattgtggttacttatactgcaaatgcagct
aaggcagaaattatctacgttgatgaaactacaggtaagcaattagaaactgcagtagtt
gatggtaagtacaacgacacaattaactacagcacagctgataagattaaatactacgaa
agcttaggttacgaattagtcaaagacagttatgttggtggagaattcagtgaagacaca
aagactttctatgtaacgttcaagcatggtgttgttcatgtgcatccagataatcctgga
aaacctggtgaaaatatcaatccagggggagatgtgaaatatccaactgattcaggtgtt
ttaaataaagatgtaactcacactgttcactatatttacgcagatggaacaacagctaag
ccgagtcacacacaaactttaacttttacaggttctggtcacattaataaggtaactgga
gaatatgtagaggttgatgaagaaggaaacattaagctcgattcagatggaaaaccaatt
ccaggtaaattaaactggatgtcagctcttggaaatagtttcctagctgttccatctcca
ataattactggccacacacctagtcatacagaaattaatggcgtggaaaatgtagctcat
gatagtgagaattatgtttatactgttacttacacagctaatgcggctaaggcagaaatt
atctacgttgatgagactacaggtaaacaattagaaactgcagtagttgatggtaagtac
aacgaaacaattaactacagcacagcagataagattaaatactacgaaagcttaggctac
gaattagtcaaagacggttatgttggcggagaattcggtgaagacacaaagactttctat
gtaacattcaaacatggaacagtagttgtaaatccagaaactccaggtaagccagatgag
ccaattaatccagacaatccagatggaccaaaatacccagctgattctgctaacttgaac
aaggatgtaactaatactatccactatgtttacgcagatggaacaacagctaagccaagt
catacacaaactttaactttcattggttcaggtgtgattgataaggtaactggtcaatat
gtagaagtcgatgaaaatggtaatgttaagcttgacgagaatggtaacccaattccaggt
aaattaacttggacagctagtgatggaacaacatttatcgaagtagtttctccgacaatt
gtaggctacactccagataaaggagtagttaatgcagttgaaggaattaaccaagatagt
aagaacctagaaacaacagttatctacactgcaaatgcagctaaggcagaaattatctac
gttgatgagactacaggtaagcgattggaaactgcagtagttgatggtaagtacaacgaa
acaattaactacagcacagcagataagattaaatactacgaaagcttaggttacgaatta
gtcaaagatggttatgttggtggagaattcggtgaagacacaaagactttctatgtaacg
ttcaagcatggaacagtagttgtaaatccagaaactccaggtaagccagatgaaccaatt
aatccagacaatccagatggaccaaaatacccagctgattctgctaacttgaacaaggat
gtaactaatactatccactatgtttacgcagatggaacaacagctaagccaagtcacaca
caaactttaacttttgttggttcaggtgtgattgacaaggtaactggtcaatatgtagaa
gtcgatgaaaatggtaatgttaagcttgacgagaatagtaatccaattctaggtaaatta
acttggacagctagtgatggaacaacatttatcgaagtagtttctccaacaattgtaggc
tacactccagataaaggaatagttaatgcagttgaaggaattaaccaagatagtaagaac
ctagaaacaacagttatctacactgcaaatgcagctaaggctgaaattatctatgttgat
gagactacaggcaagcaattagaaactgcagtagttgagggtaagtacaacgaaacaatt
aactacagcacagcagataagattaaatactacgaaagcttaggctacgaattagtcaaa
gacggttatgttggcggagaattcggtgaagacacaaagactttctatgtaacattcaaa
catggaacagttacagttactcctgatgataaatttaccgaagaggatccgattaaccca
gacaacccagatggaccaaaatatccatttgattcaattgctttagataaaacaattact
cgtacaattaaatatgtttacgcagatgggactaaagcaaaagatgacgtagttcaaaag
ttaagattccgtggtacagccattattgataaagtaactggtgaagttattatcttagat
gaaaatggcagaaagatttccgatggaattaaatggacagcacttgatggaactacattt
atcgaagtcatttctccagatattgccggctacactccagataggaaagaaattggtagt
cttgaaaatgtagatagtaatactgacgatatcattgaaactgtagtttacaataaggat
atcgtagatccagaagaaccaaaggatccagtagatccagaagaaccgaaggacccagta
gatccagaagaaccgaaggatccagtagacccagaagatccagtagatccagaagaaccg
aaggacccagtagatccagaagaaccgaaggacccagtagatccagaagaaccgaaggat
ccagtagatccagaagaaccgaaggatccagtagacccagaagaaccaaaagatccagta
gatccagaagaaccgaaggatccagtagatccagaagagccgaaggatccggtggactca
gaaaatccagaggattcaaaagttccagttcaagctgaaactccaactgaatcacctaat
gatgctcctattcttccagaccaactttccactaatactactattaaggaagtagcaact
gtagaaaccaaagaatctggtaaggcagaagcagctacaactgaggatgtttcattacct
caaactggtcataaacattctaatgcgggacttattggactaggattagcaaccattgcg
tcaattttaggcttagcaggtactagaaagcgcaagaaagattaa
DBGET
integrated database retrieval system
