Lactobacillus johnsonii N6.2: T285_04755
Help
Entry
T285_04755 CDS
T02941
Name
(GenBank) ATP-dependent helicase
KO
K16899
ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
ljn
Lactobacillus johnsonii N6.2
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ljn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
ljn03400
]
T285_04755
Enzymes [BR:
ljn01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
T285_04755
DNA repair and recombination proteins [BR:
ljn03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
T285_04755
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ADDB_N
PDDEXK_1
F5_F8_type_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHA97351
UniProt:
A0A7D9N6M8
LinkDB
All DBs
Position
964127..967603
Genome browser
AA seq
1158 aa
AA seq
DB search
MINVITGRQVDNLQNEIIDQAVKSYYQDKRHDVFIIVPNHIKFTTEVRALSKLSVLTNKK
QVAVNKLHILSFSRLAWYFLRDEAIKLPQILDDAASVMLLEQIVKDHQDELKLFQNQTQV
TSGALRQMYEAILSVRAGNIELDNIDEKKLNEETSYKIHDLRIIYDEFIERLSEKFATKD
EMQLLLNEFLAKSNNLSTMEFYFSDFSHFSLQELTSVRLISKKAKNTTLAFKTKIGKIDN
NAEPGDYDYVVQRTIGQLEHFWQNQQLDYQTQEYPLTQTSPSSLLNGVWTKTSGFDERLS
KFLQPVKADSRYAEAYFVARTIYQQVALNNYRYQDFLVLAPNLSEYETYLTPILRQNQIP
FFNDLQREMKYHPLVVAVENLQQIFKRGFQTDNVIALMKTQLFIPGWYKNSAHYQNDVDL
LENFVLAHGIKGKLWTKSLKNFVDAEVIALDNSEKEVEDLDRLRKYFIDTLTKFFEQLDK
EEDPQAGVTVFWNFLIKNRVAKRLESWRKEANDAGDLQLAQQPEQVWSTLTDLLKDYLLV
ANKFSLDQFFDLLISGFSEANFSQIPSTLDAVNISELGMVQGQGYKQVFIIGATSSNLPQ
IEKIPGFFSSENLEQLNEGNEANGYLEDQQKINNLDQNYQFGNALSLASDKIYISYPVIN
TANEQLEPSIFYKQLLKLTRADEFAQHDLPQNNGEVLTFITNPEASLGYLTYLKNKAATD
VDFLLKITEEKIGEIAKNVLEGSNFKNIPENLSPELAQQLYGDRIETSVSQLETYYQNSF
EYFLNYGLHLKKRFENELDVIQAGNYYHETFDYLVKRIKEKKLNFADLTEEKLGKLLIEV
REELKEKGRYRQLLNDPFNKYLFHKLDQTTANVAHYWHSNVNKTTFRPQYSELSFGKNQK
VSGLSYSWKDDNNKKKIVDLRGKMDRVDLAQVNDRVLGEVIDYKSSAKKFDLGLFANGIS
MQMISYLEVLKNNNKFFAQGKDLDVLGAFYQNITSSLERLNSEKMILSNYQIKDLAKEST
KKLMYNGILIADEEMLDLIEPGMEKDRAVSDLYTSVKRKVNGDISWPQNQSFTPDQLDLL
LAYNSYLIKNAGNEILSGKIELDPYSYGQQTSLTYSDFKDIFFFDAMLKENNYHKIRSID
KKTLLNLIKEKLDLDGEE
NT seq
3477 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaatgtaattactggtagacaagtagacaacttgcaaaatgaaataattgatcaa
gctgttaagtcatactaccaagataaaagacacgatgtttttattatcgtgccaaaccat
attaagtttaccacagaagtacgcgcacttagcaagctctctgttttaacaaataaaaaa
caagttgcagtaaataaattgcacatcctttctttttcacggctagcttggtatttcttg
agagatgaggcaattaaactaccacaaattctagatgatgccgctagtgtcatgctacta
gagcaaattgttaaagatcatcaagatgaattaaaactatttcagaatcaaactcaagtt
acatccggtgccttaagacaaatgtatgaggctattttatctgtacgagccggtaatatt
gaactagacaatattgatgaaaagaaattaaatgaagagaccagctataaaattcatgac
ttaagaattatttatgatgagtttattgaacgtttatcagaaaaatttgctaccaaagat
gaaatgcaattattgcttaatgagttcttagcaaaaagcaataacttgagtacgatggaa
ttttatttttctgatttttcacatttttctttacaagagttaacctcggttcgtttaatt
tcaaaaaaagcaaaaaatacaactttagcttttaagacaaaaattggcaaaattgataat
aacgctgaaccaggtgactatgactacgtagtgcaacgtacaatcggccaattagagcat
ttttggcaaaatcagcaattagattatcaaactcaagagtatccacttactcaaacaagt
cctagctctttactaaatggggtttggacaaaaacgagtgggtttgatgaacgtttaagt
aagtttttgcagccagtcaaagcagactcgcggtatgcagaagcctattttgttgcgcgg
acaatttaccaacaggtagccttaaataactatcgctatcaggattttctagttttagca
cctaatttaagtgaatatgaaacatatttaactccgattttaaggcaaaaccaaattcct
ttctttaatgatttgcaaagagaaatgaaataccatcccctagtagttgctgttgaaaat
ctacagcaaatttttaagcgtggttttcaaacggataatgtaattgctttaatgaagacg
cagttattcatccctggctggtacaaaaattctgcgcactatcaaaatgatgttgaccta
cttgaaaattttgtcttagcccatggtatcaaagggaagctatggactaagtcattaaag
aattttgtagatgcagaggtaattgctttagataactctgagaaagaagtagaagatctc
gatcgactacgaaagtactttattgatactttaactaaattttttgagcaacttgataaa
gaagaggatcctcaagctggagtaacagttttttggaattttctaattaaaaatcgtgtt
gcaaaacgtttagaaagttggcgcaaagaagctaatgatgcaggcgatttacaattggca
cagcagccagaacaagtttggtcaactttaactgatttattaaaagactatttactagta
gctaataaattttctttagatcaattttttgatcttttaatcagtggctttagcgaagcc
aatttctcacaaattccatctactcttgatgcagtcaacatttctgaattaggtatggtg
caaggtcaaggatataaacaggtgttcattattggggcaactagtagtaacttgcctcaa
attgaaaaaataccaggtttctttagctctgaaaacttagaacagttaaatgaaggaaat
gaagctaatggatacttagaagatcagcaaaagatcaataacttagaccaaaattaccaa
tttggaaatgctttgagcttggccagtgataaaatttatatttcttatccagtaattaat
actgcaaatgaacaattagagccttcaattttttataagcagttattaaagttaacccgc
gctgatgaatttgcccaacatgatttacctcagaataatggagaggttttaacttttata
actaatccagaagcaagtttaggttacttaacatatttaaaaaataaagcagctactgat
gtagactttttattgaaaataactgaagaaaaaattggtgaaatagcgaaaaatgtgctt
gaaggaagcaactttaagaatataccggaaaacctttcccctgagctagcacaacagcta
tatggcgatcgaattgaaacttctgtttcacaactagaaacgtattatcaaaattctttt
gaatacttcctaaattacggcttacatttgaagaaaagatttgaaaatgaacttgatgta
attcaggcgggaaactactaccatgaaacttttgattatctagttaaaaggattaaagaa
aagaagttaaattttgctgatttaacagaggagaagttaggcaagcttttaattgaagta
agagaagaactaaaagaaaaggggagataccgtcagcttttaaatgatccattcaataaa
tacctattccataagttagaccaaactacagctaatgtggctcattattggcatagcaat
gtaaataagactactttcagaccacaatattccgaattaagttttggtaaaaatcaaaag
gtaagtggtctttcatatagctggaaagatgataataataaaaagaagattgtagatctt
cgcggaaagatggaccgagttgatttggctcaagtaaatgatcgagttttaggtgaggtg
atcgattataagtcatccgcaaaaaaatttgacctaggtttatttgcaaacggaatttca
atgcagatgatttcctacttagaagttttaaaaaataataataagttttttgctcaaggt
aaggatttagatgttttaggcgcattttaccaaaatattactagtagtcttgaacgtttg
aacagtgaaaaaatgatcttaagcaattatcaaattaaagatttggctaaagaaagtact
aagaagttaatgtataacggaatcttaattgcagatgaagaaatgctagatctaatagaa
cctggaatggaaaaagatcgtgctgtctctgatctatataccagtgttaaacgaaaagta
aacggcgatattagctggccacaaaaccagagttttactccggatcaactagatttgcta
ttagcttataactcctacttaataaaaaatgctggtaatgagattttgtcaggaaagatt
gaattagatccttattcttatggtcaacaaacatcccttacttattctgactttaaagat
atcttcttctttgatgcaatgctcaaagaaaataactatcataagattagatccattgat
aaaaagacgcttttgaacctaataaaagaaaaattagacttggatggtgaagaatag
DBGET
integrated database retrieval system
