Lactobacillus johnsonii NCC 533: LJ_0641
Help
Entry
LJ_0641 CDS
T00158
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
ljo
Lactobacillus johnsonii NCC 533
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Muc_B2
MucBP_2
DUF4573
Gram_pos_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAS09580
UniProt:
Q74HW0
LinkDB
All DBs
Position
1721279..1725970
Genome browser
AA seq
1563 aa
AA seq
DB search
MTVPTNQTNNLNEETNQNESTVSITGAKTNDSLIAGVTQGAINVHINNHATTPLTINHGE
QVNVSINDKNNLLSFNVNPTKTSEFDMNRTDTAANKEFTFTYTGSDDGILSGFDATFPFN
ADTTATTQYYEKYGTYPDLTLPVTVTLPNKQSFTQNLPIKINPYEDKVINEEILHGFIIG
PKVIWTPGEDGNPGANGVYTEYGANYTGPEPSAKADIPVAQQKDARLMQYAIDWNYGSST
NPSLKPLLNVLAHIKFSSGQRILPSTIKVFKIPSNIKVVASDGQRISINDYYSKISTLSE
DTNFENFLRNSISNDGREIVIDQKGNFTVNGEDYSKNGPYFIQLDTQLDINKIPDWINTP
SSGPSISTPTTNENDWNPSGSGSTANTFTQTYTNFKLDPTVDRIIKIRFIDENTNQEIPN
SAKNIITATNSSVPNPTMDIIKDLEERHYVLDQEATEGKNGSHSENLTNYNIATQNFKLD
SLNNSYNSEEINVKNTSPKYYVYLYHETKPQSQTSSVTETINYVCANGTKKGELAALPYT
HTVTYTRNGIEDLVTNYIDWNSWMPDSTFNAVNSPIASDSAYSLIDPLVVPAIETNISEN
GEITTQNSIPLSYTVNYYAPEKATLHFYDDTDKQDLTAYLLQNNQTAVINDIYDKADNNS
TKQAISFAGVDKVIDFLNSKHYVFSGVSGIGSTSSSDYSKISYGNFDDDETQDQNFVLHF
KHETEPISDTKEVTETIHYLYEDNSQAANDVKHSVTFTKTGTKDLVTGKENSKWSAVQTF
PEVVSPVISGYTPTQSKIAPISVDHTSNDIDKTVIYTANKQQATLRFYDDSSKKFIDFAK
DLIVTGSSSSPILFTIPKSYDFSNYNFVAVNKGDNPTQTTDSLSGTTLNDVTYGKFDTDN
TTNQYFIAHFTHKISPVNENKSISEKAILYAENGPRKDNIFKTLNLGNINFIRTGQKDLV
NQQITWDAWNVENKAQNISISEIIFNVYKLNSQNISQPSSTLKKFELNGHEISPIEFDKK
QDQALIITLPNNFEFLIKVPYVLTENITVIYKDDTTNEILERQVLSGQPDTSSQYSTKNT
ITKYLAKNYLLVSDPTNQQTLSFDNTEDPDDQTYVVHFKHQFEEINNSKSIKETINYIYD
NGTEAAPSYTNSIQFVQSGEVDLVTNIRKIKDWTPSISSFSAVKSPIINGYTTDHKQIDQ
QFITPNSKDLVFNVVYTAEPVKPTKPVQPIKPMQPTKPVQPTKPVQPTKPVEPTKPVQPT
KPVQPTKPVEPTKPVQPTKPVEPTKPVQPTKPVQPTKPIEPTKPVKPTKPVEPTKPVKPT
KPVKPTKPVEPIKPVKPTKPVQPTKPVEPIKPVKPTKPVQPTKPVEPIKPVKPTKPVQPT
KPVKPTKPVEPTKPVQPIKPVQPTKPVQPTKPVEPTKPVEPTKPVRPTKPVEPTKPVKPT
KPVEPTKPVQPTKPIEPTKPVEPTKPVQTTKPVEPTKPVQPTKLTISTSLHKSSDKLTQL
THQSYQNSKVSRQNTNNISVQKKKILPQTGTKTTDIGILGLALATAASLLGLISDKVNRK
KHN
NT seq
4692 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgactgtcccaactaatcaaactaacaatcttaatgaagaaacaaatcagaatgaatcc
acagtaagcattactggagctaaaactaatgattctcttatcgctggcgtaactcaaggt
gccattaatgtgcatatcaataatcatgcgactacaccactcactattaatcatggtgaa
caagttaacgtttcaattaacgataaaaataatctgttgagctttaatgtaaatccaact
aaaactagtgaatttgatatgaatagaactgatacagctgctaataaagaattcactttt
acttacacaggaagtgatgacggcatcttatccggttttgatgcaacttttccatttaat
gccgatactactgctactacccaatactatgaaaaatatggtacttaccccgatttaact
cttcctgttacagttactttgcctaataaacaatcatttacccaaaatcttccaattaaa
attaatccttatgaagataaagttatcaatgaagagattctccatggttttataattggt
ccaaaagttatctggacgcccggagaagacggcaatccaggcgcaaacggagtttataca
gaatatggtgctaactatactggtccagaacctagtgcaaaagctgacattccggttgcc
caacaaaaagatgctcgtctaatgcaatatgccattgattggaactacgggtcatctacc
aatccaagtttaaaaccactgcttaatgttcttgctcatattaaatttagtagcggtcaa
agaattcttccatcgactattaaggtattcaaaattccttccaatataaaagtagttgct
tctgatggacaaagaatcagtattaatgattattattcaaaaatctctacgctttcagaa
gatactaactttgaaaactttttaagaaattctatttctaatgatggcagagaaatagtt
attgaccaaaagggtaactttactgttaatggtgaagattattctaaaaatgggccttac
tttattcagctagatactcaacttgatataaataagattcctgattggattaacactcct
agctccggtccatctattagtactccgactacaaatgaaaacgactggaacccatctggt
tctggtagtactgctaatacttttacgcaaacctatactaactttaaactagatccgaca
gtagacagaattattaaaattcgttttattgatgaaaacactaatcaagaaattccaaac
agcgctaaaaatataattactgcaactaatagttcagttcctaatcctacaatggacatt
attaaagatcttgaagaaagacattatgttttagatcaagaagcaactgaaggaaaaaat
ggtagccatagtgaaaatttaactaactataacattgctactcaaaactttaagcttgat
agtttgaacaatagctacaacagtgaagaaatcaacgttaaaaatacttcaccaaagtat
tacgtttatctttatcatgaaacaaaacctcaatctcaaactagttcagtaactgaaact
attaattatgtttgtgctaatggaacgaaaaagggcgaactagctgctttaccatatact
catacagttacttatactcgtaatggtatcgaagatcttgttactaattacatagactgg
aatagttggatgcctgattctacctttaacgcagttaattcaccaattgcttctgattcc
gcctatagtctaattgatcctctagtagttccagcaattgagaccaatattagtgaaaat
ggagaaattactactcaaaatagcattccactatcttatactgttaactactacgctccc
gaaaaggccactctccacttctacgatgacactgacaaacaagacttaacagcatactta
cttcaaaacaatcaaacagctgtaataaatgatatttatgataaagcagataataattca
actaaacaagcaatttcatttgcaggtgtagataaagttattgactttttaaatagtaag
cactatgtattcagtggagttagtggaatcggatcaactagtagtagtgactattcaaaa
atttcctatggaaattttgatgacgatgaaacccaagatcaaaactttgtgcttcatttc
aaacatgagactgagccgatttcagatactaaagaagtaacagaaacaattcattatctg
tatgaagataattcacaagctgctaatgacgtaaaacattcagttacctttacaaaaact
ggtactaaagatttggtaactggtaaggaaaacagtaaatggtctgccgtccaaacattt
cctgaagtagtatcaccagtaatttctggctatactccaactcaaagtaaaattgctcca
attagcgttgatcatacgtctaatgatatagataaaactgtcatttatactgctaataaa
caacaagctacacttagattttatgatgatagtagtaagaaatttattgattttgctaaa
gatttaattgtgactggatcaagcagcagccctattttattcactattccgaaaagttat
gacttttcaaattataacttcgttgctgtcaacaaaggtgataaccctactcaaactact
gatagtttatcggggactacattaaatgatgtaacttatggcaagtttgatacagataat
acaacgaatcaatattttattgctcactttactcataagatcagtccagttaatgaaaat
aaatctatttcggaaaaagcaattctatatgcagaaaatggcccacgaaaagataatatt
tttaagaccttgaatttaggaaatattaactttattagaactggtcaaaaagacttagtt
aatcagcaaattacgtgggatgcttggaatgttgaaaataaagcacaaaatatttccatt
tctgaaataattttcaatgtttataagctcaattcacaaaatatttcacagccttcttca
acacttaaaaagtttgaacttaatggtcatgaaatttcacctatcgaattcgataaaaaa
caagatcaagctttaattattactcttccaaataactttgaattcttaataaaggtacct
tatgttcttaccgaaaatataactgtaatttataaggatgatacaactaatgaaatttta
gagcgccaagtgttatccggccaacctgatactagttctcaatattctactaagaataca
ataactaagtatctggctaagaactatttactagtatccgatccaactaaccaacaaaca
ctttcattcgataacacagaagatccagacgatcaaacttacgtggttcattttaaacat
caatttgaagaaataaataattcgaaaagtattaaggaaacaattaactatatttatgat
aatggtacagaagcagcccctagctacactaattcgattcaatttgttcaatctggagaa
gtagatttagtaactaacattagaaaaataaaagattggacaccaagtataagtagtttt
tctgctgttaaatcacctattattaatggttatactaccgatcacaaacaaattgaccaa
caatttattactccaaatagtaaggatttagtatttaacgtagtctatactgctgagccg
gtgaaacctactaagccggtgcagcctatcaagccgatgcaacctactaagcctgttcag
cctaccaagcctgtgcaacctaccaaaccggtcgagcctaccaagcctgtgcaacctact
aaacccgttcaacctaccaagccggtcgagcctaccaagcctgttcaacctactaagccg
gtcgagcctaccaaacccgttcaacctaccaaaccggttcaacctactaaaccaattgaa
cctactaagccggtgaaacctaccaaaccggtcgagcctactaaaccggttaaacctact
aagccggtgaaacctaccaaaccggttgaacctattaagccggtgaaacctactaagcct
gttcagcctactaaaccggttgaacctattaagccggtgaaacctactaagcctgttcag
cctactaaaccggttgaacctattaagccggtgaaacctactaagcctgttcagcctact
aaaccggtaaaacctaccaaaccggttgaacctactaaaccagtgcagcctattaagcct
gttcagcctaccaagcctgttcaacctaccaaaccagtcgagcctactaaaccggttgaa
cctactaagcctgttcggcctactaagccggtcgagcctactaaaccggtcaaacctact
aaaccggtcgagcctactaagcctgttcaacctactaaaccaattgaacctaccaaaccg
gtcgagcctactaaaccagtgcaaactactaaaccggtcgaacctactaagcctgttcaa
cctactaaacttactatctcgacttcactccataaatcatctgataaacttactcaacta
actcatcaatcttatcagaattctaaagtgagccgtcaaaacactaataatatatcagtt
caaaagaaaaagattttacctcaaactggtacaaaaacaacggatataggcattctcggt
ttagcccttgctaccgcagcctctctgcttggacttattagcgataaagttaacagaaaa
aagcataattaa
DBGET
integrated database retrieval system