Lactobacillus johnsonii NCC 533: LJ_1685
Help
Entry
LJ_1685 CDS
T00158
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
ljo
Lactobacillus johnsonii NCC 533
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PRD
HTH_11
Mga
HTH_DeoR
HTH_24
HTH_17
PTS_IIB
YfeC-like
Xre-like-HTH
HTH_29
HTH_26
HTH_Crp_2
HTH_28
HTH_7
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAS09458
UniProt:
Q74I81
LinkDB
All DBs
Position
complement(1561353..1562852)
Genome browser
AA seq
499 aa
AA seq
DB search
MMSKNSSKIISILVKSGRFMTSQELAQIIGVSSKTIYRAVNKINQTYDFPIIKSERGKGY
LLDYEKYLELSDGFHEKPHLMIQSPLERRNEIIIKLLFSAPLSVNVKDVYASYYVSTELI
RQDLLTISELLKKYSLKLAHEGNYVVIKGEEENIRRAINNALIQSKAMNMESISDLANEF
EDLSSYDNQFLTTQIEWIQKSLHTTVPYPYNVNIFSHLYILIKRFRRGKTVQYKDKINIG
NKYHHLKEHNSIFWKVSNDVIHNTADYVHREIPTAEIYYLLEYLISMRYNHDFAIDDKIS
ADSKRLANYYIAGFNLDVNNPKTKALKSDLISHIRPMYNRLNNHIIIANKLLDDIKSEYR
ETFSKLKTLSSKAYSNKYLPWKISDDEIGFLTLYFAKYFEETNFTKKAIVMCASGIGTSK
LLYAKIHRNFPDLDLIGTISKNEYEKNSTQYADLDLIISTIPVLPQNNEQVILSSAMFNA
QDKNRLSRYLNENKVSETK
NT seq
1500 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgtctaaaaatagcagtaaaattattagcattttagtaaagtctggacgttttatg
acgtcacaagaattggcccaaattattggtgtttcatctaaaaccatttatcgagcagtg
aataaaataaaccaaacttacgactttccgattattaaatctgaaagagggaaaggatat
cttttggattatgaaaagtatctggagctaagtgatggttttcacgaaaagccccactta
atgattcagtcacctttggaaagacgaaatgaaataatcattaaattgctttttagtgca
ccattgtcggttaatgtcaaagacgtttatgcttcatattatgtaagtaccgagttgatt
cgccaagatttacttacaatcagcgaattattaaaaaaatatagcttaaaattagcccat
gaaggtaattacgtagttataaaaggtgaagaagaaaatatacgtagagcaattaataat
gcacttattcaaagtaaagcaatgaatatggaaagtatcagtgatttggcaaatgaattt
gaagatttgagtagctatgataatcaatttttaactacacaaattgaatggattcaaaaa
tcacttcatactactgttccttatccctataatgtaaatattttttctcatttatatatt
ttaatcaaaagatttagaagaggaaaaacagttcagtataaagacaaaataaacattgga
aataaatatcatcacttaaaagaacataattctattttttggaaagttagtaatgacgta
attcataatactgctgattatgttcaccgagaaatacctactgccgaaatctactattta
ttagagtatcttatctctatgcgttacaatcatgattttgccattgatgataagatttct
gcagattcaaaacgtctagctaattattacattgcaggttttaacttagatgtgaataat
ccaaaaacaaaagctttaaaaagtgatttgattagtcatattcgtccaatgtataaccgt
ctaaataatcacattataattgctaacaaattacttgatgatataaaaagcgaatataga
gaaacatttagtaaattaaagaccttaagctctaaagcttatagcaataaatatttacca
tggaaaattagtgatgatgaaattggttttctaactttgtatttcgctaaatactttgaa
gaaactaactttacaaaaaaagctatcgtaatgtgtgctagtgggataggcacttcaaaa
ctactatatgcaaagattcatcgaaattttcccgatttagatttaataggaactatttct
aaaaatgagtatgaaaaaaattctactcaatacgctgatcttgaccttattatttcaacc
attcctgtccttcctcaaaataatgaacaggttattctttccagtgctatgttcaatgct
caggataaaaatagattgagtaggtatttgaatgaaaataaagttagtgaaactaaataa
DBGET
integrated database retrieval system