Lentilactobacillus laojiaonis: LHL71_00175
Help
Entry
LHL71_00175 CDS
T08206
Name
(GenBank) PD-(D/E)XK nuclease family protein
KO
K16899
ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
llao
Lentilactobacillus laojiaonis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
llao00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
llao03400
]
LHL71_00175
Enzymes [BR:
llao01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
LHL71_00175
DNA repair and recombination proteins [BR:
llao03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
LHL71_00175
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ADDB_N
PDDEXK_1
RecC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UDM32192
LinkDB
All DBs
Position
35114..38665
Genome browser
AA seq
1183 aa
AA seq
DB search
MTLQFVLGKASQDHQAVLIDILKNKQKDFPNDTYFYIVPNHIKFETEIQVIKQLNEENSK
ITAQSQLQVFSFSRLSWYFLRDTPQYQRQRISPAGTNMLLYQIINRRADDLYLFGKDANK
PGFLQKLARQINEVQLGNIQPNDLFEILETQKVSDSLSDKLHDFSIIYQEYIDQISQQYF
DNSNGIQLLNDYLVNADLQNYHFIIDGFNKLSAQEMQILNILIQKSASVTISLNLDREYR
LELPNATNIFYQPAKLFNYLYKFASANQVPYLAAQYASNSKNYHDLEKLEDYWIQSNSLL
PITVDHKIHPQSIKIIKAENKYSELLQITSKIRQLVATGNYRYTDFLILTRHLDGYRNII
EAVFKMQNIPYFMDIQKQMIDHPFVEFLAALFEIDGPNLEHRSYRYQDMMRLLKSELLIP
IDENGQPMELKKYRRAVNLLDNAVLKNGYLKSQWLQTADWQGLPGDPNEDEIQLINYLRH
FVKDTLPQFYNKLFSSSTNQMALTTLYQFLNQTGVLAQLKQWQKMALEQADLNTTNQIEQ
IWNTFCQISDEFANILGDQPFMADTFWPLIQAGFQGANYSQIPSTLDQVAISESGMVQAN
THKVTIMIGSTNEQMPAMAVEEQLFGDDDKNQLEANLRDDQYLNDRAQLQVSGEVYLNYL
AFMSGRERLIFSYALSEGDEQSIKISPYVERIQDYFKIKEINHPAIPNNDQPIEAYLGTK
QTTLHHLIQIAQNSFQQNQALSPIWQYVYNLLINDANYKSKTKTLISSINYRNIPTKLLT
ENVINLYGQNLKLSISQLEKFYSNPYEYFLRYGLKLHERDEFGLSSQSTGNFFHEALDMI
FKLVNNQNVDLVNLDEQALGELINEAVYKMIEADDSQYYILKSSNRMKYLAQKLQATIKR
MLKIMQKQQTFTGMRPKKTEINFGVDGLKPLTYKVSDQHKVSVRGRIDRIDTMIDSKSGQ
RYVGIVDYKSSQHEFDFVDAYNGISMQLPTYLQVVQDNLAQLSSVDTKLAGALYLHLKNS
KLSFEKLKSQENLESTLLRDNKYDGLIVKEDDDDYLLPLLDQVIQPTESSLIFPFGINKD
NSLKKASKVISDKALDNLLAHNQRLIIEAGQRIYDGDISLEPYRKNQESKIMQYSPYKSI
MNFDPLLGENNYRDGDIYQDGENIEKLNANLVKKLLEQENRND
NT seq
3552 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacactgcagtttgtgctaggcaaggccagccaagatcatcaggccgttttaatcgat
attcttaaaaataaacaaaaagattttcctaatgatacttatttttatattgttccaaat
cacattaaatttgaaactgaaattcaagtgatcaaacaattgaatgaggaaaacagtaaa
ataactgcgcaaagtcaactgcaagtattttctttttccagattgagttggtacttttta
agagatacccctcaatatcaaagacaacgaattagcccggcgggaactaatatgttactg
tatcaaatcattaaccgccgcgctgatgatttatatttatttggtaaagatgctaataaa
ccaggatttttgcaaaagttagctcgccaaattaatgaagttcaactaggtaatatccaa
cctaatgatctatttgagattttagaaactcaaaaagttagtgatagtttatccgataaa
ctccacgattttagtatcatttatcaagaatatatcgatcaaatttctcagcaatatttt
gataattcaaatggtattcaactattaaatgattatttagttaatgccgatttacaaaat
tatcattttataattgatggatttaataaattatccgcacaagaaatgcagatactaaat
attttaattcaaaaaagtgctagtgtgacgatttcactgaatttagaccgcgaatatcgc
ttagaattacctaacgcaactaacatattttatcaaccagccaaactatttaattactta
tacaaatttgcaagtgcaaatcaggtgccatatttagcggcacaatacgctagcaattct
aagaattatcatgacttagaaaaattagaagactactggattcaatcgaacagtttatta
ccaattacggtagatcataaaatccatccgcaaagtattaagattattaaagccgaaaat
aaatattctgaattgttacaaattaccagtaaaattcgtcaattagtagctacgggaaat
tatcgttataccgactttttaattttaactaggcacctagatggttatcgaaatattatc
gaagctgtttttaagatgcaaaatatcccgtattttatggatattcaaaagcaaatgatt
gatcatccatttgtggaatttctagcagctctttttgaaatcgatggtccaaatttagaa
catcgcagttatcgctatcaagatatgatgcgattattaaaatcggaattattaattcca
atcgatgaaaatggccaaccgatggaattaaaaaaatatcgtcgcgctgtaaatttatta
gataatgcagtattaaaaaatggctatctaaaatctcaatggttacagactgctgattgg
caaggactaccaggtgacccgaatgaagacgagattcaactaataaattacttaaggcat
tttgttaaagatacgttgcctcaattttataataaattatttagtagctcgactaatcaa
atggcactaacgactttgtaccaatttttaaatcaaacgggagtcctagcccaacttaaa
caatggcaaaaaatggctttagagcaagctgatttaaatacgaccaaccaaattgaacaa
atttggaataccttttgccaaattagtgatgaatttgccaatattttaggagatcagccg
tttatggccgatactttttggccgttaattcaagcaggctttcaaggcgctaattattca
caaattccatctacgttggatcaagtggccatttcagaaagtggaatggtccaagctaat
acgcataaggtaaccataatgattggctcaacgaatgaacaaatgccggcaatggctgtt
gaagagcagttatttggtgacgatgataaaaatcaattggaagctaatttacgtgatgat
caatatttaaatgatcgagcacaactccaagttagtggagaagtatatttaaattattta
gcctttatgagtggtcgagaacgtttgattttttcgtatgcgcttagcgagggagacgaa
caaagcattaaaatttcgccttatgtggaacggattcaagattattttaaaattaaggaa
attaatcatccggccattccaaataatgatcaaccgattgaggcctatctaggcactaag
caaactactttacatcatttgattcaaattgctcagaatagttttcaacaaaatcaagca
ttatcgccaatttggcaatatgtttataatttattaattaatgatgctaactataaatca
aaaacgaaaaccttaattagtagtatcaattatcggaatattccgaccaagttactaact
gaaaatgtaattaatttatatggacagaatttgaaattatcgatttcgcaattagaaaaa
ttctatagcaatccctatgaatactttttaagatatgggttaaaacttcatgagcgggat
gaatttggattatcatcgcaaagtactggaaattttttccatgaagctttagatatgatc
tttaaattagttaataaccaaaacgtagatttagttaatttagatgagcaagcactaggg
gaactaattaatgaagccgtgtataaaatgattgaagccgatgatagccaatattatatt
ttaaaaagttccaatcgtatgaaatacttggcgcaaaaattacaggcaaccattaagcga
atgcttaaaattatgcaaaaacaacagacctttactggcatgcggccgaaaaaaacggaa
attaattttggcgttgatggcttaaaaccactcacttataaggtatctgatcaacataag
gtctcggtacgcggtagaattgatcgaattgataccatgatcgattcaaaaagtggccaa
cgatatgtaggtattgtggattataaatcgagccaacatgaatttgattttgtagatgcc
tataacggaatttctatgcagttaccgacttatttgcaagtcgttcaagataatttggcc
caattaagttcggtggatactaaattagcgggcgctttgtaccttcatttaaagaattct
aaattatcatttgaaaaattaaaaagtcaggaaaacttagaaagtactttattacgcgat
aataaatatgatggactaattgttaaagaagatgatgatgactatttacttccattattg
gaccaagttattcaacctaccgaatcttcactaatttttccctttggaatcaataaagat
aatagccttaaaaaagctagtaaggtaattagtgacaaggcgttagacaatttgttagct
cataaccagcgattaattattgaagccggtcaacgaatttatgacggagatatttccctt
gaaccatatcgtaaaaaccaagaatctaaaattatgcaatattctccttataaatcaatt
atgaattttgatccactgctaggagagaataattatcgagatggcgatatttatcaagac
ggtgaaaatattgaaaaattaaatgcgaacttagttaaaaaattattagaacaggagaac
cgcaatgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
