Lysinibacillus louembei: R6U77_03710
Help
Entry
R6U77_03710 CDS
T09574
Name
(GenBank) S-layer homology domain-containing protein
Organism
llb
Lysinibacillus louembei
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SLH
fn3
Big_13
G5
Big_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WPK12822
LinkDB
All DBs
Position
complement(773358..777764)
Genome browser
AA seq
1468 aa
AA seq
DB search
MKNKYKKLSKAAVATVLASSGILVALPPAANAYVFKDLNPNADYYKPVLDLVNRGVISGY
SDGTFRPSEAVTRGEAAKILAIAMGLNVARQQNPGFKDVPQSHPYYAYIAAIANEGVIDG
FNDKSFKPNELITRGQIAKALTLGFQLEVASKINHNFKDVTSQNANEAYIQTLYNLNIAK
GTTANTFEPFGTVTRAQLATFIWRAEKADKGNPSYKVGDIRGDVIYINGVQYTIGSSLKA
FVNEGNAAALKGAVIDGTFSGKTLTGIRELTLNASGTANRLIALDGGGANFNGNLTINGT
YLRVKNMKLNGRTTIAEVPRKTLADYTQRIESLNVASISGVGFIDWSQPNVPDDDGYLNP
KDNEVLKPVPDKNAKPNTRYSARMSKADGYVDFEDAYVSNLFIERNYTFVSADDTLSRVT
IARDTEQVEIYADMTTMYIETARNLVLYGVHNIETIYKNNEKSVYLNTDSFIDFLYVDNS
SGWIDLGEHVYIDRVVLPKDKKPNQIFDDFENDDDKMGNITDPDGKPIDREEEDKEIPDE
TRPVATITSVDTAGVTATATFTSNEDGTYYWVALEATKKAPTIREILQQNAEKRGTVKAN
TPTSFTITGLDEETEYVLYLVVVDNAGNASEKEEYEFTTKDGTPPIVRDLTAKDLHGGQR
IEFEFTPSEPGDYYYYIRRATTAPDPTTADIMANPSGTGKANTKDKVKVIVGDLEPNTPY
DIYVVMKDKSGNISEDPAEKTKNPVETSDLDYENPFVVNGRLERISSTQFELTVNEKLDF
ESANNKNNYLLTGTVIVNGPNDKGIIPSEVVYKEGSTKVLLTIPSDTGFVNNDTLRVTVL
PGVKDLAGKPFENNNTVPPGSTVRNYAEYVHEDKVSPTITIENVINKADESDGFRRAEVE
FKPNKAGSYYYMILPNTVKTTSGDIVTLQQYLTDNNITERDFINEWASSSTDRSGKFQIG
GENIYVLTGTGPANLEAKTQKLPPISIEQNKLNPFNSYSIYMVLRDRGGELSKIAGPSEI
FGDVKAPLIRNLEIKPEENVDNKAIFSFETNETVKLHYWFVEKRIEDTDGNIIENPDAKL
TAPADERRLETELKRRPSVEKTGNGLSGALKANITLKPHTEYIVYVGAEDTYGNFTIYKA
NSNYTDHDRTSSGFMWQDFYSDGKAPEIGMTSPVGKDSKSKPGEPILKPTYYSGLIYRNH
DDTFTITFSEAIRRNVEGKSNLVSTGDTVIIDLPEILTITDSTGADVTNKYEAVRYTVGS
DTTKSSQLVIKAKLPADVNKTITVTMKDELVNGSRDFIISGYEGHKFVNTGKYAYRKLDA
MLEEVKLSYLNTLGDDKKVEATFVLLSSAQQSYDNGEVLKYYYLSDAWGTDETTIIDRTA
AQVVESVVNGTDSSLAKGTGVVETSGESGAARITINLTHPYKFFGQDLDAPPPGPRMHGD
WITIVLEDKYGNLNKIYGTVYDPSKRTQ
NT seq
4407 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaataaatataaaaaattaagcaaagcagcagttgcgacagttttagcatctagc
ggtattcttgttgcgttgccaccagcagccaatgcatatgtatttaaagatttaaatccc
aatgcggattattataaaccagtattagatttagtgaaccgtggtgtgataagcggctat
agcgatggcacgttcagaccaagcgaggctgtgactagaggtgaggcagcaaaaattctt
gcaattgcaatggggttaaatgtcgcacgtcaacaaaatccaggctttaaggatgtacca
caatcgcacccgtactatgcatacattgcagcgattgccaatgaaggcgtaattgatggc
tttaatgataaatcattcaagccgaatgaattaattacacgtggtcaaattgcaaaagcc
cttacacttggcttccagctcgaagtggcatcaaagattaatcacaactttaaagatgta
acaagtcaaaatgcaaatgaagcatatattcaaaccttatataatttaaatatcgcaaag
ggtacaactgcgaatacttttgagccatttggcacagtgacgcgagcacagctagcgaca
tttatttggcgcgcagaaaaggcagacaaaggtaatccatcttataaagtgggcgatatt
cgtggggatgtcatttacattaacggtgtccagtacacaattggctcgtcactaaaggct
tttgttaatgaaggaaatgcagccgcattaaagggtgctgttattgatggaacgtttagt
ggaaaaacattaacaggcattcgtgagctaacgttaaatgcctctggtacagcaaaccgt
ctaatcgcattagatggcggtggtgcaaactttaatggcaatttaacaattaacggtact
tatttacgtgtgaaaaatatgaagctaaatggtcgcacaacgattgctgaggtgccacgt
aaaacgttggctgattacacacagcgcatcgaaagcctaaatgttgcaagcatttcaggt
gtaggctttatcgattggtcacagccgaatgtaccagatgacgatggctatttaaatcca
aaagataatgaagtattaaagcctgtaccagataaaaacgctaagccaaatacacgttac
tcagcacgtatgagcaaagcagacggttacgtagactttgaggatgcatatgtatcaaat
ctattcattgaacgtaactatacatttgtatcagctgacgatacgttaagtcgtgtaacg
attgcacgtgatacagagcaagtagaaatatatgcggatatgacaacaatgtatatcgaa
acagctcgcaacttagtcctttacggtgtgcacaatattgaaacaatctataaaaacaat
gagaaaagcgtctaccttaatacagatagctttatcgacttcttatatgtagataatagc
tcaggctggattgatttaggtgagcatgtttatattgatcgcgttgttttaccaaaggac
aaaaagccaaaccaaattttcgatgacttcgaaaacgatgacgataaaatgggcaatatt
acagaccctgatggcaagcctattgaccgtgaagaagaggacaaggagatcccagatgaa
acgcgtccagttgcaacaatcacctcggtagatacagcgggtgttacggcaactgctacg
tttacgtcgaatgaggatggaacgtattattgggttgcattagaagcaactaagaaggca
ccgacgatacgtgaaattttacagcaaaatgcagaaaagcgcggtacagtcaaagcaaat
acaccaacatctttcacaattacaggcctagatgaagaaacagagtatgttttatattta
gttgttgtcgataatgcagggaatgcttcggagaaggaagaatatgagtttacgacgaag
gatggcacgccgccaatagtgcgcgatctaacagcaaaagatttgcacggtggtcagcga
atcgaatttgaattcacaccatctgagccaggggactactactattatattcgccgagct
acaacagctcctgatccaacaacagcagatattatggcaaatcctagcggcacaggcaaa
gctaatacaaaagacaaagttaaagtgattgttggagatttagaaccaaatacaccatat
gatatttatgttgtaatgaaagataaatcaggtaatatttcagaggatccagcagagaag
actaaaaatcctgttgagacatctgatcttgattatgagaatccatttgttgttaacggg
agattagaaagaataagtagtacgcaatttgaattaactgtaaatgaaaaattagatttt
gaaagtgcaaataataaaaataactatttattaacaggtacagttattgtcaatggtccg
aatgataaagggattataccttctgaggtagtatataaagaaggtagtacaaaggtttta
ttaacaattccatcagatacgggatttgttaataacgatacactacgtgtaacagtacta
ccaggtgttaaagatttagcagggaagccgtttgaaaataataacaccgtacctccagga
agtactgttcgtaactatgcagaatatgtgcatgaagataaggtttctccgacgattact
atagaaaatgttatcaataaagcagatgaatctgatggcttccgccgagcagaggtggaa
ttcaagccaaataaagcaggttcttactattatatgatattaccaaatacagtaaagaca
actagtggagatatagttacactacaacaatatttaacagataataatattacagagcga
gattttatcaatgaatgggcaagtagtagcacagatcgctctggtaagttccaaataggt
ggagagaatatttatgttctaacaggtacaggcccagcgaatttagaagcaaaaacacaa
aaattaccaccaatttctattgaacaaaataaattaaacccattcaatagttattctatt
tatatggtattaagagaccgtggtggcgagctttctaaaattgcgggacctagcgaaatt
ttcggagatgttaaagcacctttaatccgtaacttagagattaagccagaggaaaatgtc
gataacaaggcaatctttagctttgaaacgaatgaaacagtaaaactacattactggttt
gtggaaaaaagaattgaagatacagacgggaatataattgaaaatccagatgctaaatta
acagctccagcagatgaaagacgtttggaaacagaattgaaacgtagacctagtgttgag
aagacaggaaatggactttccggagcattgaaagcaaacattaccttaaaaccacataca
gaatatatcgtatatgtaggtgcagaggatacgtatgggaatttcacaatttataaggca
aatagtaattatactgaccacgaccgtacaagctcaggctttatgtggcaagatttctac
tcagatggcaaagcaccagagataggtatgacttcaccggtaggaaaagattcgaaatcg
aagccaggagaaccgatactcaagccaacatattattcaggtctgatttaccgtaaccat
gatgatacgtttacaattacatttagtgaagcgattagacgaaatgtggaaggtaaatcg
aatcttgtaagtacaggagatacagtcattatagatttaccagaaattctaacaatcaca
gatagtacaggtgcagatgtaacaaataaatatgaagctgtaagatatacagtgggctca
gatactactaaaagtagtcaactggttattaaggcgaaactacctgctgatgtaaataaa
acaatcactgtaacaatgaaagatgaactagtaaatggctcacgagactttattatttca
ggttatgaggggcataaatttgttaatacaggtaaatatgcttaccgaaagttggatgcg
atgctagaggaagtgaagcttagttacttgaacactctaggagatgacaaaaaagtagaa
gcaacattcgttctattgtcatctgctcagcaatcctatgacaatggtgaagtactgaaa
tattactatctatccgatgcatggggaacagatgagacaactattatagatagaacagca
gcacaagtggttgagtcagttgtgaatggcacagatagttcattggcaaaaggaacagga
gttgttgaaacgagtggagaaagtggagcagcgcgtataactataaatctaacccaccca
tacaaattctttgggcaagatttggatgcaccaccacctggacctcgtatgcacggggat
tggataacgattgttttagaggataaatatgggaatttgaataagatctatggtacagta
tatgatccaagtaagcgaactcaataa
DBGET
integrated database retrieval system
