Lysinibacillus louembei: R6U77_13455
Help
Entry
R6U77_13455 CDS
T09574
Name
(GenBank) S-layer homology domain-containing protein
Organism
llb
Lysinibacillus louembei
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SLH
Cadherin-like
fn3
Ig_DSCAM-DSCAML_C
Pur_ac_phosph_N
PhoD_N
NDNF
NPCBM_assoc
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WPK13994
LinkDB
All DBs
Position
2700204..2705411
Genome browser
AA seq
1735 aa
AA seq
DB search
MISSVNYMPIKEVQAAANGTADGTYDFGGVVGIPNSAEIGFTTFSDKFAISNGFAVDGTQ
LYKENGVQGEEALLIIKSRWASTCKTFTFKDLGVSLYFQTPKTKLTKFSLVIKDINGDVL
GTHEISNHDGIEGYGVITQLSTLLNNGTQFNYTGVANLEIKYQLGTDSNSNLIDSSSLNF
ENITIANVSTCDTQPPIVSNGVISSSNISTTGVTLGWTKATDNVTAQGDLEYLVYQSSSN
NINTVSNIEANGTPLGSGFTKDIATFNVTGLSPSTTYYFNVIVKDAMGNKTAYTMQSVTT
AIPASAPTVTTSTPASNITTTEAMVGGNVIADGGAAITERGIVYATTTNPTTSNDKRTTT
GSTGAFTANLSGLSPNTTYHYRAYATNSVGTSYGDNQSFTTVALSNNSNLSNLTLSTGVL
TPSFASATVGYTVNVATNVESIQVTPTVADSTATVTVDGVTVTSGQASGSIPLNVGSNPI
TILVTAQNNTTKTYTITVNRAAPTYTIEAIGNQTFTALTAGYPNNTQETKTLTITNTGTG
SLTDVAVALSGANANAFEITQPSLASLPSTGSTTFEVKAKDGLATGTYTATVTVNAASLT
SVTFTVTQVVNPAPTYTIDEISNQTFTALTAGYTSGSQETKTVPITNTGTGSLSGITVGL
SGTNASDFEITQPTLTSLPSTDSTAFTVKAKDGLAEGTYTATVTVNATNLTTPVTFTVTQ
VVNPVPTYTIDAISNQTFTGLTEGYPNDTQEIKSMTITNTGTGNLANLGVTLSGPNASDF
EITQPLVTNLASASNTAFTVKAKNGLAEGTYTATVTVNATNLTTPVTFTVTQIVDPAPTH
TIDTINDQTFPVLTEGYTSGTQETKAVPITNTGTGSLLNLDVALSGPNASDFEITQPLVT
NLASAGNTTFTVKAKDDLTAGTYTATVTVNATNLTPVTFTVTQVVNPASTYTIDTISDQT
FSVLTEGYASNTQEMKSISITNTGTGILSNVDVALSGSNASDFEITQPLITNLLSADSTT
FTVKAKDDLAAGTYTATVTVTATNLAPVTFTVTQVVSPASMYTIDPIGNQSFTALIAGYP
SNTQETKLLTITNTATGDLANIEVALSGSNANDFTITQPLVTNLTSADSTTFTVKAKDGL
AAGTYTATVTVSATNLTPMTFTVTQVINPISVTTPGVPTNVRATAGNGFVTVSFDAPTSN
GGDPITGYTVKVYINGVEQPMLAKTGTSSPIVVNGLANGTAYTFKVVATNGVGSSGESLV
SNIVTPVAAIAPYPLPGPIQTPSIVNPSTTITKIKVALEVDGVNPLETVMVEIERTKHAN
GEITDYVALSEADTKQAIEKAKQSGNNIVRIIIPDVHDEVTKVTVEIPKQSLQLLRENRL
SLEITTENGRIMTPYSSMDGINDNFYFNLVPVKKESERQIIEERARTERVVRDALQSNDV
HVIGRPMVIETNMPSRPVQLTLPLKGVEIPTDTITREAFLKQLAIFIEHSDGEKKVVIPE
VVTVAKGTLGLRFTVEKFSTFTIIQVETKEEQNMYHHEAYIKGFPDGTFGPDKNVTRVQV
ATMIARILGYTGETVDTAPFKDIPSDHYAAGAIAFVKERGIMNGDNGYFRVGENMTRAQM
AAVVAKFKQLPIAENVALTFNDTKGHWAQWIIEANRTAGIINGREDGSFAPNEPLTRAQA
VAMLNRMFERGPLQGITMPSFPDVKATHWAFGEIEEAARSHTYFIDENRQEIFTK
NT seq
5208 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatttcttcagtgaactatatgcctattaaagaagtgcaggctgctgcgaatggaact
gccgatggtacgtatgattttggtggagttgttggaatacctaacagtgcggagataggc
tttacaactttttcggataagtttgctattagtaatggttttgcagtggatggaacacaa
ctgtataaagaaaatggtgtgcaaggagaagaggctcttctcatcattaaatcaaggtgg
gccagcacgtgcaaaacattcacgtttaaagatttaggagtaagtctttattttcagaca
cctaaaacgaaattaactaaattttctttggtcataaaagacataaatggagatgtactt
ggaacacatgaaatttcgaatcacgacggaatagaaggatatggagttatcactcaatta
agtacgcttttgaataatgggacacaatttaattacacaggagttgcaaacctagaaatt
aaatatcaattaggaacagacagtaatagtaatcttatagattcaagtagtttaaacttc
gaaaacatcacaattgccaatgtaagtacttgtgatacgcaacctcctatagtatcaaat
ggagtgattagttcttcaaatatcagcacaacaggtgtcacactaggatggacaaaggca
acagacaatgtgacagcacaaggcgatttagagtatcttgtctatcaatctagcagcaat
aatattaatacggttagcaatatcgaagcaaatggaacaccattaggaagcgggtttacc
aaagatatcgctacgtttaatgtaacgggcttatcacctagtacgacttattattttaat
gtcattgttaaagatgcaatgggaaacaaaactgcctatacaatgcagtcagtgacaaca
gctattcctgctagtgcgccaactgttacgacaagcacaccagcatcgaatataacaaca
acagaggcaatggttggtggaaatgtgatagcggatggaggggcagcgattacagagcgt
ggaatcgtctatgcaacgactacaaatccgacgacaagtaatgataaaagaacgacaaca
ggatcaacaggtgcctttactgctaatctaagtgggttaagcccaaatacaacataccat
taccgagcttatgcaacaaactctgtaggtacgagctatggagataatcaatcttttacg
acagtagcgctaagtaataattctaatttaagcaatttaactctttcgacaggagtgctg
accccaagttttgcatcagcgacagtaggttatacagtaaatgttgctacaaatgtagaa
agtattcaggttacaccaacagtagctgatagtactgcaacagtaacagtggatggtgta
actgtaacaagtggtcaagcgagtgggagcattcctttaaatgttggatccaatcccatc
acaatacttgtaacagcacaaaataacacaacaaaaacgtatacgattacagtgaataga
gcagcaccaacgtacacgattgaagccataggaaatcaaacctttacggcactgacagca
ggttatccaaacaacacacaggaaacaaagacattaacaattacgaatacaggaacaggc
agcttgacggatgtagcagtagcattaagtggtgccaatgcgaatgcgtttgaaataaca
caaccatcattggcaagtttaccaagtacaggtagcaccacatttgaagtgaaggcaaag
gacggcttagcgacaggtacctatacagcaacagtgacggtcaatgcagcaagcctaaca
tcggtaacatttactgtgacacaggttgtcaacccagccccaacgtatacaattgatgag
attagcaatcaaacgttcacggcactgacagcgggttatacaagtggttcacaagaaaca
aaaacagtgccaattacgaatacaggaacaggcagcttgtcgggtataacagtagggtta
agtggcaccaatgcgagtgattttgaaattacacagccaacgttgacaagcttaccaagt
acagatagtaccgcctttacagtgaaggcaaaggatggattagcggaaggtacgtatacg
gcaacagtaacagttaatgcgacaaacctgacaacaccagtgacgtttactgtgacgcag
gttgtcaatccagtgccaacgtatacaattgatgccattagtaatcaaacattcactggc
ttaacagaaggttatccaaatgatacacaagaaatcaagtcaatgacgattaccaataca
ggaacaggcaatttggcgaatctaggtgtaacattaagcggtcctaatgcaagtgatttt
gagattacgcaaccactagtgacaaacttagcaagtgcgagcaatacagcatttacagtg
aaagcaaagaatggattagcggaaggcacctatacagcaacggtaacagtcaatgcgaca
aacctaacgacgccagtgacatttaccgtgacgcagatagtcgatccagctccaacgcat
acaattgatacgattaatgaccaaacgttccctgtcttaacagaaggttatacaagtggc
acacaagaaacaaaagcagtgccaattacaaatacaggaacaggcagtttgttgaatcta
gatgtagcattaagcggtcctaatgcaagtgattttgaaattacacagccattagtgaca
aacttagctagtgcaggcaacacaacgtttaccgtgaaagcgaaggatgacttaacagca
ggaacctatacagcaacggtaacagtcaatgcaacaaatttaacacctgtcacatttact
gtgacacaggtggtcaacccagcctcaacatatacaatcgatacgattagtgaccaaacg
ttttccgtattgacagaaggttatgcaagtaacacacaagaaatgaagtcaatatcaatc
acgaatacgggaacaggtatcttgtcgaatgtagatgtagcgttaagtggtagtaatgca
agtgattttgaaataacacaaccgttaataacaaacttactaagtgcagacagtacaaca
tttacggtgaaagcgaaggatgatttagcggcaggcacctatacagctacagtaaccgta
acagcaacaaatctagcaccagtgacatttacagtaacacaggtggtcagcccagcgtca
atgtacacgattgatccaattggcaatcaaagcttcaccgcattgatagcaggttaccca
agcaacacacaggaaacaaagctattaacaattaccaacacagcaacaggtgatttagcc
aatatagaggtagcattaagtggcagtaacgcgaatgattttacaattacccaaccgtta
gtgacaaacttaacaagtgcagatagtacgacatttacggtgaaagcgaaggatggatta
gcagcaggcacctatacagccacagtaacagtaagtgcgacgaacctaacacccatgaca
tttacagtaacgcaggtgattaaccccatttctgtaactactcctggcgtgccaacgaat
gtgcgagcaacagcagggaatggtttcgtaactgtaagctttgatgctccaacaagtaat
gggggcgatccgattactggatatacagttaaagtgtatataaatggagtagagcagccg
atgttagcaaaaacaggaacatcaagtcctatcgtagtaaatggtttagcgaacggaacg
gcatatacatttaaagtagtcgcaacgaatggggtaggaagtagcggggaatccttggta
tcaaatatagtgacgccagtagctgctatagctccatatccgctaccaggtccaatccaa
acgccatcaatagttaacccaagcacgacaataacgaaaatcaaagtggcattagaagtt
gatggtgttaacccactggaaacagtaatggtagaaattgaacgcacaaaacatgccaac
ggtgaaatcaccgactatgtagcactatcagaagctgatacgaagcaagcgatagaaaaa
gcgaaacaaagtggtaataacattgttcgtattattattccagatgtccatgatgaagta
actaaagtaacggtagaaattccaaagcaatctctacaattattacgtgaaaatagatta
tcattggaaattactacagagaacgggcgtatcatgacaccttatagctcaatggatggt
attaatgataatttctatttcaatttagtaccagtgaaaaaagaaagtgaacgccaaatt
attgaggagcgtgcacgtacagagcgtgtagtacgtgatgcacttcaaagtaatgatgta
catgtaataggacgtccgatggtaattgagacgaatatgccaagtcgacctgtacagcta
acattgccattaaaaggcgtggaaatcccaacagatacaattacgcgtgaggcatttctg
aaacaactagctatctttattgaacattccgatggggagaaaaaagtggtcatccctgag
gtcgtaacagtggcaaagggtacgctagggttacgctttacagtggagaaattcagtaca
tttacaattattcaagtagaaactaaagaagagcagaatatgtatcatcatgaagcctac
attaaaggtttcccagatggcacatttgggccagataaaaatgtgacacgtgttcaagta
gcaacaatgattgcgcgtattttaggctatacaggtgagacggtagacacagcaccattc
aaggatattccaagcgatcattatgcagcaggcgctattgcctttgtgaaagagcgtggc
ataatgaatggagataatgggtacttccgtgtaggtgaaaatatgacacgtgctcaaatg
gcagctgtcgttgcgaagtttaagcaactgcctatcgcagaaaatgttgcacttacattt
aatgatacgaaaggtcattgggcacaatggattatcgaagcgaatcgcacggcgggcatt
atcaatggacgagaggatggtagtttcgcacccaatgagcctttaacacgtgcgcaagct
gtagcaatgttaaaccgtatgtttgagcgcggaccattacaaggtattacaatgccaagc
ttcccagatgtaaaagcaacacactgggcatttggtgaaattgaagaggcagcgagatct
cacacatattttattgatgaaaatcgtcaggagatttttacaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
