Fructilactobacillus lindneri: AYR59_04400
Help
Entry
AYR59_04400 CDS
T04666
Name
(GenBank) exodeoxyribonuclease V subunit alpha
KO
K03581
exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
lle
Fructilactobacillus lindneri
Pathway
lle03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lle00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
AYR59_04400
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
lle03400
]
AYR59_04400
Enzymes [BR:
lle01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
AYR59_04400
DNA repair and recombination proteins [BR:
lle03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
AYR59_04400
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_30
AAA_19
HHH_RecD2
OB_YrrC
UvrD_C_2
SH3_13
AAA_11
Viral_helicase1
UvrD_C
AAA_22
RsgA_GTPase
nSTAND3
SLFN-g3_helicase
AAA
AAA_12
UvrD-helicase
PIF1
NPHP3_N
AAA_7
TIP49
cobW
AAA_28
TsaE
YabA
NTPase_1
T2SSE
DEAD
Zeta_toxin
HTH_IclR
AAA_17
AAA_16
AAA_14
AAA_29
KAsynt_C_assoc
Oxidored_nitro
ABC_tran
IMS_HHH
HHH_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ANZ59295
UniProt:
A0AB33BTR5
LinkDB
All DBs
Position
889215..891647
Genome browser
AA seq
810 aa
AA seq
DB search
MSNSISLFDDEQVNNNQTKPSLTGKVITTFFEGADSFYKVLLVKVEKTNFNWDEEEIVVT
GNFADIADDTSYRFVGKLVDHPKYGKQFQAENYERTNQSSKEGLVKYLSGADFPGIGQKT
AKKVADELGTNLIEKIIADPMVLNKVGLKPKQRDTIIDSLKKNNGAEQVIVGLNSYGFGS
SLSAAIFKKYREKSLEVIQNNPYQLVEDIKNISFKRADQIAAKIGIEYNSPARLRAGLLT
TLTNLSIKNGNTYSNSQELINDSFSVLDTDYQQQIDNEKLAQELKELVKDKKVEVDEGKI
YLRSLYDDEWKISENAHRIFTAQSSKQLDDYFKIIHKVEKKIGIKYDDSQLNAINSALKN
QIFILTGGPGTGKTTIINGIVQTYAKANNLSLDINKYKEDTYPVLLAAPTGRAAKKMSES
TGIPASTIHRLLGLNGTDDEDGNAIDGDLLIIDEMSMVDTELFTKLMKAIPRGMKVILVG
DKDQLPSVGPGQVFFDLIRSKTIPKMELNQIHRQGNGSTIIELAHDIKNGIMPTNLLQKE
QDRSFIQCNTKQVVGLIDQIVSKAKDKGFSATDIQVLAPMYRGEAGIDKLNFDVQNILNP
RQDASQKEVKFRDTKYRIGDKVLQLVNDPDSNVFNGDVGKIVGIEINRDNKHYLDKLIIA
FDQTEVTYSRNDWNQITLAYCTSIHKAQGSEFEMVILPIVPQYRRMLERNLLYTAVTRAS
KKLIMVGDVNSFQECIGHESSNRKTTLNERLQQVFKIDGSTNDEKESLKSNNSASTDYIL
TETAIVNHSIDPMIGMDGITPTDFVDEKLS
NT seq
2433 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgtctaattcgattagtctttttgatgacgagcaagttaataataaccaaactaaacca
tctttaactggaaaagtaatcacgactttttttgaaggtgcagacagtttttataaagtt
ttacttgtaaaagttgaaaaaacaaattttaactgggatgaagaagaaattgtggtaact
ggtaactttgctgatattgcggatgatactagttatcgttttgtaggtaaattagttgat
catccaaaatacgggaaacagtttcaagcagaaaactatgagcgaactaaccaaagctct
aaagaaggattggttaaatatctttctggggctgattttccggggattggacaaaaaact
gcaaaaaaagtagctgatgaattaggaaccaatttgattgaaaaaataattgctgatcca
atggttcttaataaagttggtttaaaacccaaacaacgtgatacaattattgactcattg
aaaaagaataatggagccgaacaagtaattgttggcttaaatagctatggttttggaagt
tctttatcagcagcgattttcaaaaaatatcgggaaaaatcattggaagtaattcaaaat
aacccatatcaattagttgaagacatcaaaaatattagttttaaacgtgctgatcaaatt
gctgcaaaaattgggattgagtataattccccagcaaggcttcgagctgggctattgaca
acccttactaacttatcgattaaaaatggtaatacctattccaattctcaagaattaatt
aatgatagttttagtgttttagatacagattatcagcaacaaattgataatgaaaaacta
gctcaagaactcaaagaattggttaaggataaaaaagttgaagtagacgaaggtaaaatt
tatcttagaagtctctatgatgatgaatggaaaatttctgaaaatgcgcatagaatcttt
accgcccaaagtagtaagcagctagatgattattttaaaattatccataaagttgagaaa
aaaattggtattaaatacgatgattctcaacttaatgcgattaatagtgcattaaaaaat
cagattttcattttaactggtgggcctggaacggggaagactaccattattaatggaata
gttcaaacttatgctaaagccaataatctttctttagatattaataaatataaagaagat
acttatcctgtattactagctgctccaactggacgagctgctaaaaaaatgagtgaatca
actggcattcctgctagcactattcacaggttgttaggtttaaatggtacagatgatgaa
gatggaaatgcaattgatggtgatttgttaattattgatgaaatgtcaatggtagatact
gaattattcacaaagctgatgaaggcaattccaagaggaatgaaagttattttggttgga
gataaagatcagctaccatcggttggtccgggacaagttttttttgatttaattagatca
aaaactattcctaaaatggaattaaatcaaattcatcgtcaaggaaatggttcaactatt
attgaacttgctcacgacattaaaaatggaataatgccaacaaatttacttcaaaaagaa
caggatcgaagctttattcaatgtaatactaaacaagttgttgggttaattgatcaaatt
gtctctaaagcaaaagacaaaggattttcggctactgatattcaagtacttgctccaatg
taccgtggggaagctggaattgataaattaaattttgatgtacaaaatattttaaatccc
aggcaagatgctagtcaaaaagaagttaaatttcgtgatactaaatatcgaattggcgat
aaagtacttcagttagttaatgatcctgatagtaatgtatttaatggtgacgtaggtaag
attgttggaattgaaattaatcgtgataataaacattatttggataaattaattattgcg
tttgatcaaactgaggtaacttatagtcgaaatgattggaatcaaattacgctggcttac
tgtacatcaattcataaagcacagggaagcgaatttgaaatggtaattttacccattgtt
ccgcagtatcgacggatgttagaaagaaatttattgtatacggcagttactagagcttcc
aaaaagttaataatggtgggagatgttaattcttttcaggaatgtattggccacgaatca
agtaatcgtaaaacaaccttaaatgaaagattacaacaggtttttaaaattgacggaagt
actaatgatgaaaaagaaagtttaaaatcaaataattctgcgtcaacagattatattttg
acagaaacagctattgttaatcattcaatagatcctatgattggaatggatggaattaca
cctacagattttgttgatgaaaaattgagttaa
DBGET
integrated database retrieval system