Lactococcus lactis subsp. lactis KF147: LLKF_1216
Help
Entry
LLKF_1216 CDS
T01141
Symbol
pksC
Name
(GenBank) PKS biosynthesis protein
Organism
llk
Lactococcus lactis subsp. lactis KF147
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
KR
Ketoacyl-synt_C
PKS_DH_N
KAsynt_C_assoc
CurL-like_PKS_C
PS-DH
PP-binding
RhiE-like_linker
Beta-ketacyl_N
adh_short
Thiolase_N
Epimerase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADA64915
LinkDB
All DBs
Position
1250544..1255259
Genome browser
AA seq
1571 aa
AA seq
DB search
MDTIQKYILNQVSEQKLPLEKAKKMLIELKDNKNDDIAIVGMACKFSKTKDIEAYWENLL
GMEECRVEFPKERLEFIRSISTNKSFTQFLGCHPVTEEELYDTRKSGYLSEVGKFDAEFF
NISPNEAKAIDPDQRLMLEMVQDALTDAGYTRKALNNSRTAVYIGKDATNDTLYRYITEE
ESSSMTGNWASLIAGRINYLMNLKGSSLLLDSACSSGLVGVHLACKSLQRKENELAIVGG
VSLSSFPYFNKFPHSLMESEDDTIRPFDERANGTSFCEGAATVILKPLKKALEDKNNIYA
VIKGTAFNNDGNTNGITAPSAIAQEDAIIDAWKDAEVDPETIQYIETHGTGTKLGDPIEI
KGLTKAFRKYTQNNQFCGIGSVKGNLGHTVAASGLASLIKVVLSLKNEKIPATRNFSAPN
PFVNFSNSPVYVVNKNKNWKKQGNNPRRAGISSFGFTGTNCHIVLEEAPDVEVQNENFEK
EYLIVLSALNEKSLLSTVRDNLSFIKRHLNYRLKDISYTSTVGRDHYNYRLGIIATDVDD
LIAKFEIILNDYPKIKNDSIYSGYHKLIPSGRDAITIGEITQQEQNDLTIKAEKILKNRS
LNNNLNREQVEKYSQLFVLGATVDWQEFQKNNDGQIVSLPKYAYTKKMYWGVPKVGTSSS
SNEKKQLHPLVSMVKADSIDHIIFESKFTSDSSWVLTDHKMKGKSIIPGTAYVEMARKVA
SHFLNKEEVTLINITFYTPVVVSEGEEITLQIVLNKKDCSFVICSEQAGHWLTHVEGKFK
AIESVSQPTYDVERFYSDPTVVTKENSYVSETLENDVFAFGPRWLNFQTSAIKKNDGIIG
EIVAEIRLNDKFAKDLDEHYLHAAMLDNAVNLFIDEVPNEVYLPFCYGKINIFGRMPQHF
YSHVTKTSDGYETKKFDIQLLDLNGGVFMTLEDYVIKRVNNPLAVVGSKSKFYQIGWQET
EKIKDKLPPKGVRVVIYREESKNSARDIFVNDTKRTIYLILGKEFKRISETEFEVGEDLT
DYQKILQKISEENITEFVDMSSLDQQELGNPKQGRNSLIHLFRLFKAFNSSGIKTNFRFN
LLVKNANLINQTEKISPSAAALIGFTKVVDEEFPNMEVQMVDVDENTSREQILQQLSTSK
PKYLIAYRKDRAYIPVMNEKVFQAENGFGLKIQPQGTYLITGGLGGLGLEMAQYIASKSQ
ARIILVNRSVFPSRSDWEDIKDEGIREKIKILKQIEKSGSSLVIKQLDITSETEISQLAK
FVGNLSGIFHCAGLAGDGFIYNKDEKEFATVVSPKTYGLELIDKYLVSPKLDFCVLFSSM
VAWFGGAGQSDYASANAYMDAYADKLRSKGTATFAIDWPAWSEVGMAKRHGINDEHTLFR
SVGSEKAKQLIEAIVREDVSHIIPGELNYLLLSQSHEGLNLRFSETINQQLEKLNKVSSR
KSKKAEDEISIIGKTGEISRVEQLVAHAYANVLELEEIDLYSSFSTLGGDSITATKLLKE
LNQEFPNIVEISDIFSYATVLELSKYIEGELGEGQQEAQASETDDDLLQMMNNLAAGGAD
VDETLLQLSGL
NT seq
4716 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatactattcaaaaatatattttgaatcaagtttcagaacaaaaacttccacttgag
aaagcaaagaaaatgcttattgaactgaaagataataaaaatgacgatattgctattgtc
ggtatggcttgtaagttttcaaaaacgaaagatattgaagcttattgggagaatctactg
ggaatggaagaatgtcgtgttgaatttccgaaagagcgcttagaatttattcggagcatt
tcaacaaataagagttttactcagttccttggatgccatcccgttacagaagaagagctt
tatgatacacgaaaaagtggttatctttctgaagtgggaaagtttgatgcagagttcttt
aatatttcccctaatgaggctaaagctattgatccggatcaacgtttgatgctagaaatg
gtacaagatgccttgacagatgcaggctatacgcgaaaagcactcaataatagtagaaca
gctgtttatattgggaaagatgcgacaaacgatacgctctaccgttatattactgaagaa
gaatctagtagtatgacgggaaattgggcgagtcttatagctggtaggattaactatttg
atgaatctcaaaggaagttcactacttttagattctgcctgtagttcaggcttagttggt
gttcatcttgcctgtaaatctcttcaaagaaaagaaaatgagcttgcaattgttggtggc
gtgtcactaagttcttttccgtattttaacaagtttcctcattcccttatggaatctgaa
gatgataccattcgtccgtttgatgaaagagccaatggtacaagcttttgtgaaggagcg
gcaacagttatcttaaagcctcttaagaaggcgttggaagataaaaacaatatttatgct
gtcatcaagggaacagccttcaataatgatggaaatacaaatggtatcacagctccaagc
gctattgctcaagaggatgctattattgatgcatggaaagatgcagaagttgatccagag
acgatccaatacatagagactcatggaacaggtacaaaactaggagatccaattgaaata
aaaggattaacgaaagcttttaggaagtatacccaaaataaccaattttgtgggattggt
tctgtaaaaggtaatcttgggcatactgttgcagcttctggcttagcttcactcataaaa
gttgtactttcattaaagaatgaaaaaattccagcgaccagaaactttagtgctccaaat
ccatttgtgaatttttctaactcaccagtttatgttgtcaacaaaaataaaaattggaaa
aagcaagggaataaccctcgccgtgcaggtatcagctcctttggctttacggggacaaat
tgtcacatcgtcttagaggaagcgcctgatgtagaggttcaaaatgaaaattttgaaaaa
gaatacctaattgttttgtcagcattgaacgagaaatctttacttagtacagtacgtgac
aatttgtccttcattaagcgccatttaaattatcggttaaaggatatcagctatacttcg
acagttggacgggatcattataattacagattgggaatcattgcaaccgatgtagatgat
ctgatagccaagtttgaaattattctaaatgattatccaaaaattaaaaatgattctatt
tattcgggctatcataaactgattccttctggtcgtgatgcaattacgattggagaaata
actcagcaagagcaaaatgatttgacaatcaaagcagagaagattcttaagaaccgttcc
ttaaacaataaccttaatcgagaacaggtagaaaagtattctcaactttttgtacttgga
gcaacagttgattggcaagaattccaaaaaaataacgatggccagattgtaagccttcca
aagtatgcttatactaaaaaaatgtattggggagttcccaaagttggtacttctagtagc
tccaatgaaaaaaagcagttgcatcctttagtgagcatggttaaggcagactctattgat
catattatattcgagtcaaaatttaccagtgattcatcctgggttttaactgatcataag
atgaagggaaaaagtattattccgggtacagcttatgtagaaatggctcgcaaagttgct
tctcatttcttgaataaagaagaggtaactttaattaacattactttctatacaccagtt
gtggtaagtgaaggggaagagataactctccaaattgtactcaataaaaaggactgtagc
tttgtgatttgtagcgagcaagctgggcactggttaacacatgttgaagggaaatttaag
gcgattgaatctgtaagtcagccaacctatgatgtggagagattttactcagatcctaca
gtcgtgactaaagaaaactcttatgtctcagagactttagaaaatgatgtatttgccttt
ggtcctcgttggttaaattttcaaacttcagcaataaagaaaaacgatggcataattggt
gagattgtcgctgaaatcaggcttaacgataaatttgccaaagatttggatgaacattac
cttcatgcggcaatgctagataatgcagtgaatcttttcattgatgaagtacctaatgaa
gtatatcttcctttctgctatggcaaaataaatatatttggaagaatgccccagcacttt
tattctcacgtgacgaaaacatcagatggttatgagaccaaaaaatttgatatccaactt
ttagatcttaatggcggagtatttatgaccttggaggattatgtgattaaacgtgtaaat
aatccattggcagtcgttggctcgaagtcaaaattttatcaaataggttggcaagaaaca
gaaaagattaaggataaactacctccgaaaggtgtccgagtagttatttatagggaggaa
tcaaagaattcggctagggacatttttgtgaatgatacaaagcgcacgatttaccttatt
ctgggtaaagagttcaagagaatttcagaaacagaatttgaagttggtgaagaccttacg
gactatcaaaagattctccaaaaaatctccgaagaaaatattacagaatttgttgatatg
agttcgctggatcagcaagagcttggaaatccgaaacaagggagaaattctttaattcat
ttattcagattgtttaaagcgttcaatagctcagggattaaaacgaatttccgatttaat
ctgcttgttaagaatgcaaatcttatcaatcaaacagagaagatatctccaagtgcagct
gctttaattggttttactaaagtcgttgatgaagaatttccaaatatggaagtacagatg
gttgatgttgatgaaaatacaagtagagaacagattttacaacaactctctaccagtaaa
cctaaatatcttattgcttatcggaaggatagagcttatatcccagttatgaatgaaaag
gttttccaagcagagaatggctttggtctaaagattcaaccacagggaacttacctcatt
actggtggacttggtggattaggactagagatggcgcaatacatcgcttccaaatctcag
gcgagaatcattctagtcaatcgttcagtttttccgtctagatcagattgggaagatatt
aaagatgaagggattagagaaaaaattaaaattctcaaacaaattgaaaaatctggttct
agccttgttatcaaacaattagatattacaagtgagacagagatttctcagctcgcaaaa
tttgttggaaacttaagtgggatcttccactgtgcgggacttgcgggtgatggatttatc
tacaacaaggatgaaaaggaattcgcaaccgttgttagccctaaaacttatggtctagaa
ttaattgacaaatatcttgtcagcccaaaacttgacttctgtgtactcttttctagtatg
gtagcttggtttggcggtgcgggtcaatctgattatgcctcagccaatgcttatatggat
gcttatgctgataaattaagaagtaaaggaacagctactttcgcgattgattggccagct
tggtcggaagtcggaatggccaaaaggcatggtattaacgatgaacatacattatttaga
tcagtaggttcagaaaaagccaagcagcttatagaggctatcgtaagagaggatgttagc
catattattccaggagaactaaattatttgctcctgtctcagtcacatgagggcttgaat
cttcggttctctgagaccatcaatcaacaattagagaagttaaataaagtaagctcacga
aagtctaaaaaagcagaagatgaaatttctattattggtaaaacaggtgaaatttctaga
gttgagcagcttgtagcccatgcttacgcaaatgtactggaattagaggaaatagattta
tacagctccttcagtaccctaggaggcgattctattacagcgacaaaattgcttaaagag
cttaaccaagagtttcctaatattgtagaaatctcagatattttctcctatgcaacagtc
ctcgaactttcaaaatatattgagggagaattgggagaaggccagcaggaagctcaagcg
tcggaaacggatgatgacttgttacagatgatgaacaatcttgcagcaggtggagcggat
gttgatgagactttattgcaactgagtgggttgtga
DBGET
integrated database retrieval system