Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363: llmg_2319
Help
Entry
llmg_2319 CDS
T00475
Symbol
snf
Name
(GenBank) SWI/SNF family helicase
Organism
llm
Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2_assoc
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
DEAD
SWIM
Acyl-CoA-dh_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAL98882
UniProt:
A2RNJ2
LinkDB
All DBs
Position
complement(2269664..2272768)
Genome browser
AA seq
1034 aa
AA seq
DB search
MSRMMPARVRSEGIALYSKGFLNDPIETDFKLTAEIDGEEVSYDLDGAQDSCTCSIFQQN
HRYCKHIAAIEEYLKNQDKGSLETKDKETKGAERGLYNENIAFLDAVNGETQLNFSTDQY
SIEVQIEDNSQLYDYFSMDYFLYFDLKLKSKNLGRSYVIKDIPYFLRALKNYSQYSLGSL
HYIDLFFDNFDESSQEFLSFLLKIDGKSDEALTKSLFIKNGRYLNIPFLFLEEAMDLVSA
LEVYQLKIIGRTVNYFTFIPLDNDSEIFKFKVESQQDYIELSLFSEDYHNFYDYSLLYDN
NVFYKLNQEQRRLLLVLDKQFAQKSKIKFSYSEKDKLAQALQQLSTLGKIEAPEHFVVKP
FDAKFTFDLLDEKMLSLAMKFDYGTFSIDSFHDLETLEFSRDLRKEQKIFALMERLQFAK
AFNSTLEITEHLSENFFLKILPSFQKLGQIELSPTLRNMRMDEVPEIHIDSQGGLLDISF
DIPHVEDGEFANVIAKLQENAEFYISESGKFYHFNEKFDRLKAALHELDDQFVIQGSSLH
VNINRSFQISKIFEKISGASFSEKFKSLYQHLTHPEEFPYEKPEHIKASLRSYQETGVRW
MSMLSHYNLGGILADDMGLGKTVQAITFILSNLKKDESVLITAPASLTYNWASEFEKFTD
EIDFVVIDGNKADRTKEIQENHQIYITSYGSFLKDFEDYQDKKLNYLLLDEAQVVKNYSS
KTNKSLSALNVEHTFALSGTPLENRIEEIWAIFQVVMPGFLPKREKFNKMEPSVISRLIQ
PFIMRRKKGDVLEELPDKMEITVYNQLADDQKVIYLAQLELMQKQVLEMDNAALSRSRIE
ILAGITRLRQICNTPALFMDDYKGSSGKLERLRELLAQIKDSGHRPLIFSQFTKVFPHIE
KLMEEQEMTAYKLTGSTPIKDRLSMVQAFNAGSRDAFLVSLKAGGVGLNLTSADVVILVD
LWWNPAVEEQAIARAHRMGQKNTVEVIRLITQGTIEEKIMEIQERKKDLIANVLEGDTVD
KVLSEAEIREILGV
NT seq
3105 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtagaatgatgccggcacgagtgcggagtgagggaatcgccctctattcgaaaggc
ttcttaaatgatccgattgaaactgattttaagttaactgcagaaattgatggtgaagaa
gtaagttatgatttagatggagctcaagatagttgtacttgttcaatttttcaacaaaat
catcgctattgcaaacatattgcagcgattgaagagtatttgaaaaatcaggacaagggc
agtctagagacaaaggataaagaaactaaaggagccgaaagagggctttataatgaaaat
attgcttttctagatgcagtaaatggagaaactcaactaaatttcagtacagatcagtat
tctatcgaagttcaaattgaagataacagtcagctttatgattatttttcaatggactac
tttttatactttgatttaaagttgaaaagtaaaaatttaggacgttcatatgtcattaaa
gatattccctattttttacgagcgcttaaaaattacagccagtattcattaggctcgtta
cactacattgatctcttctttgataattttgatgagtccagtcaggaatttttgagtttt
ctactaaagattgatgggaaatcagacgaggctctgaccaaatccttatttatcaaaaat
ggacgctatctcaatatccccttcttgtttttggaagaagccatggatttagtctctgct
ttagaagtttatcagcttaaaattatcggaagaacagttaattattttacatttattcca
ttggataatgattcagaaatttttaaatttaaagttgagagccaacaagattatattgaa
ttgagcttattcagcgaagattatcataatttttatgattattcgcttctttatgataat
aatgtattctataaactgaaccaagaacaacgtcgcttactccttgtcttagacaaacaa
tttgctcagaaatcaaaaataaaattctcatattcggaaaaagacaaacttgctcaagca
cttcaacaattatcaactttaggaaaaattgaagcaccagaacattttgttgtcaaacca
tttgatgcaaagttcacttttgatttattagatgaaaaaatgcttagtttggcaatgaaa
tttgattatggaactttttctattgatagctttcatgacttggaaaccttagaattttca
agggatttgcgtaaggaacaaaagatttttgctttaatggagcgactacaatttgccaaa
gcttttaattcaactttagaaattacggagcatttgtcagagaatttctttttaaagatt
ttaccttcttttcaaaagcttggtcaaattgaattatcaccaactttaagaaatatgaga
atggatgaagtcccagaaattcatattgatagccaaggaggcttgttagatatctccttt
gatattccgcatgttgaggatggcgaatttgcaaatgtgattgctaaattgcaagaaaat
gctgagttttacattagtgaaagtgggaaattttatcatttcaatgaaaaattcgatcgc
ctaaaagcggcattacatgaacttgatgaccaatttgttattcaaggaagtagtttgcat
gttaatattaatcgtagtttccaaatttctaaaatttttgaaaagattagtggtgcctct
ttttctgagaaatttaaatcactttatcaacatttaactcaccctgaagaatttccctat
gagaaacctgagcatattaaggcttctttgcgttcttatcaagaaacaggtgttcgttgg
atgagtatgttatcccattacaatctaggaggaattcttgctgatgatatgggattgggg
aaaaccgttcaagctattacttttatcctctcaaatctaaaaaaagacgaaagtgtatta
attactgccccagccagtcttacttacaactgggcaagtgagtttgaaaaatttactgac
gaaattgattttgtcgtgattgatggtaataaagctgaccggactaaggagattcaagag
aatcaccagatttatattacgagctatggtagctttttgaaagattttgaagattatcaa
gataaaaagttaaattacttacttttagacgaagcgcaagttgtaaaaaattatagtagt
aaaacgaataaatctctttcggctcttaatgttgagcatacttttgctctttcagggacg
ccacttgaaaatcgaattgaagaaatttgggcaattttccaagttgtaatgccaggcttt
ttaccaaagcgtgaaaaatttaataagatggaaccttcggtcatctcaagattgattcaa
ccatttatcatgcgtcgtaaaaaaggggatgtacttgaggaacttccagataaaatggaa
attacggtttacaatcagttggccgatgaccaaaaagtgatttatcttgcacaacttgaa
ttaatgcaaaaacaagttttagaaatggataatgcagctttatcgcgttcaagaatcgaa
attttagcaggaattaccagattaaggcaaatttgtaatacaccagctttattcatggat
gattacaagggaagttcaggtaagcttgaacgcttaagagaactactggctcaaattaaa
gattctggacatcgtcctttgattttctctcaatttacaaaagtttttccacatattgaa
aaattaatggaagaacaagaaatgactgcttataaattgacaggctctactccgattaaa
gaccgactttccatggttcaggcatttaatgctggaagccgtgatgctttcttagtttct
ttgaaagctggtggtgttggtcttaatttgacaagtgctgatgttgtgattttagtcgat
ttgtggtggaatccggcagtagaagaacaggcaattgcgcgtgcccatcgtatgggacaa
aaaaatacagttgaagtgattcgcttgattacacaagggacaattgaagagaaaattatg
gaaatccaagaacgtaaaaaagacctgattgcaaatgttttggaaggcgatacggttgat
aaagttcttagtgaagcagaaattcgggaaattctcggagtatag
DBGET
integrated database retrieval system
