Lactococcus lactis subsp. lactis CV56: CVCAS_0129
Help
Entry
CVCAS_0129 CDS
T01964
Symbol
ybeF
Name
(GenBank) Colossin-A
Organism
llt
Lactococcus lactis subsp. lactis CV56
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SpaA
Collagen_bind
CarboxypepD_reg
bMG3
Big_8
Gram_pos_anchor
GBD_IRG7_N
DUF3188
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADZ62797
LinkDB
All DBs
Position
130314..136265
Genome browser
AA seq
1983 aa
AA seq
DB search
MKSRKKVISIILGLMLLLQYVITPVGAIAGAINEETNDSDIILSQFKIDESESNADLMTF
DLSLKINQSILKSKTTIIELDKSIKINEPNEANRQKSTASYTADENRLTIDLNSLNTSEV
KVNFSISKELLKNFERLTAKLNDSQVDVLLPKTSSTSETPSQSTSTVTQNTVIPEIKEKE
SSTTKHSEQAIKTVESQDIRKLLEDSGISPATIIDSAKVIYLDKEGKPYPDQTDVPIDAE
VQIDYTWSIPEDILPLKSGDYFDFKLPDGVTIEQATSSLGDYGTYTINADGTVRFVFNEK
VETYHDIKGTFHYDAHFDKTIVPGEVVVDTPTEENFLPSEIHVRPTYDQAIDKSGHFDKT
PNPSKVIWEININRPLNTMENATLTDPMPEGTTYGSVEIYPETVGKNGEIISIDKEHPLV
KGTDYTVDSNGKITFIGKYATTDQAFNVVYTTTIDESSFPEKEGSVSFKNTATLNDGKTD
TNASASVTAQYKGPIKKNGPFTTGNDQIYNWNIEYNYNEKNHKAGSFIEDTMSDAIELVN
GSVKLYKITFDSNGKEIKGAQLKEGEDYKLVQDPDNPQKFKIEFITDIDYAVKVEYQTKV
KDIVDGNATIDNSVTTDTGDNSESGGNATQQGIVKNIDGDIDYENREIPWKIDINSAGYW
MENWSLEDKMSEGLTFLENTFQIIDKTAGNKVLSPTEYTLIKTTAGFSVSFNSPLKEGTD
HKYQIKYKTKFDTSVIDNGSGHEGDIKFVNDASMTWKDKNGGDHTNNDHKEFKPIPPFQY
NGQKSGSYNATSKKITWTIAANFNQQELSNASITDPISDDQNYVSGSAKVYEATINKNGT
YTLGAEVTSDMGIKIVESKGSVKVELPDGSTKAYVLIFETSLEGNLINQKEYKNKATFTN
KDISHDLSASVTPAHQGEFVTKDGSQSSTDSNYVNWKLTVNASQSTLKNVEVTDNPSSNQ
YIVAKDILIYGTSIDASGNITENKNIILEQGKDYSVDIQTDNSTGAQTVKIKFLSEINTA
YVVEYRALITSDKANDVVTNQAHITGDNEKTIEQDVEKDVPVTNHNGSANGSKGSVTLEK
VGPGKAKLAGAHLQLWSIGTDGKKDKLIREGDTDKNGDLKLGNLRVTDYLLIETKAPTGY
TLDEELVKGKKITVAKDGEVSNFPIQDVENEPTKVILKKVGLTIENGKEVKNPLQGAEFK
VLDSNGQVVSGYEKLTSDSSGNVTIEKLTPGKYSLVETKAPAGYILDPTPIDFELKANEE
GIIPDINLEKVNYQGSAQLIKHNSNGQALSRAIFKVIDKDGNTIQTNLSSDKDGKVTATG
LSPGDYSFVETKAPTGYILNTIPVHFTISAEEEGQPQMVIASDNFINYQGSAELIKQDNE
GQPLSGAVFKIVDKAGKTIQANLTSGKDGKVVVDGLAPGEYSFVETKAPTGYILNTIPVD
FTILAEEEGQPSLIIASDNFVNYQGSAQLIKKDSEGQPLAGAIFKVVDKNGKTVKEGLTS
DKDGKVSIDDLAPGEYSFVETQAPTGYILNTIPTHFTILAESEGQPQLVVASDNFINYQG
SAELIKHDINGQALSGAIFKVIDADGKTIKEGLTSDETGKVLIEGLAPGDYSFVETKAPE
GYILNTLPVNFSISGEEEGKVKVVMASDNFINYQRSAELIKHDSQGQALEGAIFKVVDSK
GKIIKEDLASDKTGKVLIDNLAPGDYSFIETKAPSGYILNTSKVDFTISTKEEGQPKVVM
ASDNFINYQGSAELIKHDSQGQALEGAVFKVIDSKGKSIKENLVSDKEGKVLIENLVPGD
YSFVETKAPSSYILNTSKVDFTISTKEENKPKIVMASENFINYQGSAELIKVDENGKSLS
GAVFNVTNSETHEVVIKGIKTDANGVIKANHLKPGKYTFVETEAPAGYQLSQETRAFEIK
ASAENKPQVVNTGKFVNKRLPITPKKPELPKTGEERNTFLPIVGVGLLMVGANLYVFFKR
RKM
NT seq
5952 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagtagaaaaaaagttatttctataattttaggtttaatgctgcttttacaatat
gttattaccccagttggagcaattgcaggagcaataaatgaagaaacaaatgattcggat
ataatattaagtcaatttaaaatagatgaatccgaaagtaatgctgatttaatgacattt
gatttaagtctcaagattaatcagtcaatattgaaaagtaaaacaactattattgaatta
gataaatcaattaaaattaatgaaccaaatgaggctaacagacaaaagtcaacagcatct
tatactgctgacgaaaatagattgacaatagaccttaattcactaaatacaagcgaagtg
aaagtcaatttctcaatctctaaagaacttttgaaaaactttgagcgattaacagccaaa
ttaaatgatagccaggttgatgtattgttgccaaaaacgagttcaacttcagaaactcca
agtcagtcaacttccactgtgactcaaaatactgttatacctgaaatcaaagaaaaagaa
agtagtacgactaaacattcagagcaagctataaaaactgtggaaagtcaagatattcgt
aaacttctagaagactcaggaatttcaccagcgactattatcgactcagctaaggtcata
tatcttgataaagaaggaaaaccttatccagatcaaacagatgttccgatagatgcagaa
gttcaaatcgattatacctggagtattccagaagatattttaccattgaaatcaggagat
tactttgattttaaacttcctgatggtgtaacaattgagcaagcgacatcgtcactggga
gattatggaacctatacaattaatgcagatggaaccgttcgtttcgtcttcaatgaaaaa
gttgaaacctatcatgatattaagggtacctttcattatgatgcacatttcgataagaca
attgttccaggagaagttgtagttgatacaccaacggaggaaaattttctcccttcagaa
attcatgttcggccaacctatgaccaagcaattgataaatcaggacattttgataaaact
ccaaatcctagtaaagttatttgggaaataaatattaaccgtccattaaatacaatggaa
aatgctacacttaccgatccaatgccagaaggaacaacttatggatccgtcgaaatttac
cctgagacagttggaaaaaatggagaaatcatttccattgataaagaacatcctttagta
aaaggtacagattatactgttgattcaaatggaaaaattacttttattggtaaatatgct
actaccgatcaagcgttcaatgttgtctatacaacaactatcgatgaaagtagttttccg
gaaaaagagggatctgtaagttttaaaaatacagcgacattaaatgatggaaaaacagat
accaatgcaagtgcctctgttactgcgcaatataaagggccaattaaaaaaaatggacca
tttacaacagggaacgatcaaatttataattggaatatagaatacaattataatgaaaaa
aatcataaagcagggtcatttattgaagataccatgagtgatgccatcgagctggtgaac
ggaagtgttaaactttataaaattacttttgatagtaacggaaaagaaattaaaggtgct
caattaaaagaaggggaagattataaacttgtacaagaccctgataatcctcaaaaattt
aaaattgagtttattactgatattgattatgcagtaaaagttgaatatcaaacgaaggtt
aaagatatcgtagatggaaatgctaccattgataactcagtaacaactgatacgggagat
aacagcgagtcaggtggtaatgcaactcaacaaggaatcgttaaaaatattgatggagat
attgattacgagaatagagaaattccatggaaaatagatattaatagtgcaggctattgg
atggaaaactggtcacttgaagacaaaatgtctgaaggtttgactttccttgaaaatact
ttccaaattattgataaaactgctggaaataaagtactctccccaacagaatatacactg
ataaaaacaacagcaggcttttcagtttcctttaattccccacttaaggaagggacagat
cataaatatcaaattaaatacaaaacaaaatttgatactagtgtaattgataatgggtct
ggtcatgaaggagatatcaaatttgtaaatgatgcttcaatgacttggaaggataaaaat
ggaggagatcatactaataatgatcataaagaatttaaaccaatacctccgttccaatat
aatggacaaaaatctggttcatataatgcaaccagcaaaaaaattacctggacaattgca
gcaaatttcaatcaacaagaattaagcaatgcctcaataactgatccaatctctgatgat
caaaactatgtttctggaagtgctaaagtatatgaagctacgattaataaaaatggtact
tatactttaggtgctgaagttacttcagatatgggaataaaaatagtagaaagcaaagga
agtgttaaggtagaactaccagatggaagcacaaaagcctatgttctaatatttgaaaca
agtctagaaggtaacctcatcaatcagaaggagtacaaaaacaaagcgacatttacaaat
aaggacatttcacatgatttaagtgctagtgttactccagcacatcaaggagaattcgta
acgaaagatggttcacagtcaagtacagattctaattatgtaaattggaaacttacagta
aacgcctcgcaatctaccttaaaaaatgttgaagtcactgataatccttcctcaaatcag
tatattgtagcaaaagatattcttatttatggaacaagtattgatgcttctggtaatatt
actgagaacaaaaatattattcttgaacaaggcaaagattattctgttgatatccaaact
gacaattctacaggggctcaaacagttaaaattaaatttttatcagaaattaacacagca
tatgttgtagaatatcgtgcattaattacttctgacaaagctaatgatgtggtaactaat
caagcccatattactggagacaacgagaaaacaatagaacaagatgttgaaaaagatgta
cccgtaactaatcataacggaagtgcaaacggatcaaaaggttcagttactttggaaaaa
gttggtcccggcaaagcaaaacttgcgggagctcatcttcaactttggtctatcggtaca
gatggtaaaaaagataaattaattcgtgaaggagataccgacaaaaatggtgatttaaaa
cttgggaatttgcgtgttactgattatcttcttattgaaactaaggccccaacagggtat
acacttgatgaagaactagtcaaaggtaagaaaataacagttgcaaaagacggagaagtt
tctaatttcccaattcaagacgttgaaaatgaaccaacgaaagtaatcttgaaaaaagta
ggactgaccattgaaaatggtaaagaagtaaaaaatccacttcaaggtgcagaatttaaa
gtactagacagcaacggtcaagttgtttcaggttacgaaaaacttacttctgacagttct
ggaaatgtaacgattgaaaaactaacacctggtaaatattcacttgttgaaaccaaagcc
ccagcgggttatattttggacccaaccccaattgactttgagcttaaagccaatgaagaa
ggaatcatcccagatatcaacttggaaaaagttaactatcagggttcagcacaactcatt
aaacataacagtaatggtcaagctttatcacgtgctattttcaaagttattgataaagat
ggtaatacaatccaaactaatttaagctctgataaagatggtaaagttacggctactggt
ttatcccctggagattattcctttgttgaaaccaaagctccaacaggatatattttaaat
acaataccagttcattttacaatttcagctgaagaagaaggtcaaccacaaatggttatt
gcctcggataattttatcaattatcaaggttcagccgaattaattaagcaagataacgaa
ggtcagccactttctggtgcagtttttaaaattgttgataaagctggcaagacaatccaa
gctaatttaacttctggtaaagatggtaaagtggtagttgatggattagcccccggagaa
tattcctttgttgaaaccaaagctccaacaggatatattctaaatacaataccagttgat
tttacaattttagctgaagaagaaggtcagcctagtctaataattgcttcggataatttc
gttaactatcaaggttcagcacaattaatcaaaaaagatagtgaaggtcaaccccttgcg
ggcgctatcttcaaagtagttgataaaaatggaaaaacagtcaaagaaggcttgacttcc
gacaaagatggtaaagtaagtattgatgatttagcccccggagaatattcttttgttgaa
acacaagctccaacaggttatattttaaatacaattcctacccattttacaatcttagct
gagagtgaaggacaacctcaactggttgtcgcttcagataactttattaattatcaaggg
tcagctgaattgattaagcatgatatcaacggtcaagctttatcaggtgcaatctttaaa
gtgattgatgcagatggaaaaaccataaaagaaggtttaacttctgatgaaactggtaaa
gtattaattgaaggtttggctccaggtgactattcatttgttgagactaaagcccctgaa
ggatatattttgaatactctgccagttaactttagcatctcaggtgaagaagaaggcaaa
gtaaaagtagtcatggcttcagataactttattaattatcaaagatcagctgagttgatt
aaacatgacagtcaaggtcaagctttagaaggtgcaatctttaaagttgttgattcaaaa
ggaaaaataatcaaagaagatttggcttccgataaaactggtaaagtattaattgacaat
ttggcaccaggagattattcatttattgagacaaaagctccaagcggctatatcttaaat
acttcaaaagttgattttactatttcaacaaaagaagagggtcaacccaaagtagtcatg
gcttccgataatttcatcaactatcaaggatctgctgaattaattaaacatgacagccaa
ggtcaagctttagaaggcgcagtctttaaagttattgattcaaaaggaaagagtatcaaa
gagaacttggtttctgataaagaaggaaaagttttaattgaaaatcttgtaccaggagat
tattcatttgttgagacaaaagctccaagtagctatatcttgaatacttcaaaagttgat
tttactatttcaacaaaagaagagaataaaccaaaaatagttatggcttcagagaacttt
atcaattatcaaggatctgctgaattaattaaggtagatgagaatggtaaatctctttca
ggtgcagtctttaatgttactaatagtgaaactcatgaagtagttattaaggggatcaaa
actgatgcaaatggagtaattaaggcaaatcatctaaaaccaggtaaatacacttttgtt
gaaacagaggctccagcaggttatcaattaagtcaagaaactagagcttttgaaattaaa
gcaagcgcagaaaacaaaccacaagttgttaatactggaaagttcgtcaataaaagactt
ccaattacacctaaaaagccagaattacctaagacaggagaagaacgaaatactttcttg
cctatagttggtgttggactattaatggtgggtgctaatttatatgtattttttaaaaga
cgtaaaatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
