Lutra lutra (Eurasian river otter): 125083153
Help
Entry
125083153 CDS
T08100
Name
(RefSeq) vacuolar protein sorting-associated protein 13A isoform X1
KO
K19525
vacuolar protein sorting-associated protein 13A/C
Organism
llv
Lutra lutra (Eurasian river otter)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
llv00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
llv04131
]
125083153
Membrane trafficking [BR:
llv04131
]
Endosome - Golgi transport
Rab GTPases and associated proteins
Rab associated proteins
125083153
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
VPS13_N
VPS13_M
VPS13_VAB
VPS13_C
RRM_fung
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
125083153
NCBI-ProteinID:
XP_047555111
LinkDB
All DBs
Position
13:18157280..18394061
Genome browser
AA seq
3173 aa
AA seq
DB search
MVFESVVVDVLNRFLGDYVVNLDTSQLTLGIWGGAVALKNLEIKENALSQLDVPFKVKVG
HIGNLNLTIPWKNLYTQPVEAFLGDIYLLIVPSSKIKYDPLKEEKQLLEAKQQELKRIEE
AKQKIFAIVDKLRVEKQDTFTEKLITQIIKNLQVKISNIHIRYEDDITNRDNPLSFGISL
QNLSMQTTDQNWVPCLHDETEKLFRKLIRLDNLFAYWNVKSQLFYLNDYDESLDSLRKGI
VYRNIVPEGYDFVFRPISANAKLQMNRRSDFDFSAPKINLEVELHDIAIEFNKPQYFSVM
ELLESIDMMTQNLPYRKFKPDVPLHYHARDWWAYAIHGILEVNVCPRLRMWSWKHIREHR
QKMKQYKELYKKKITTKKPAGEILISLEELEKTLDVFNITISRQQAEVEVKKAGYRIFRE
GAKDSEENKGWFSWLWTWSEPKSKEQPDVKPGILEEMLTSEEKALLYEAIGYSETAVDPT
LPKTFEAMKFFVHLKSMSVVLREKRGTPELLDIVVEEFSTLIVQRPGAQAIKFETKIDSF
HVTGLPDNSTKPRLLSSLDDAASLFQIIFEINPLDETVAQRCIIEAEPLEMIYDARTVNS
IVDFFRPPKEVNLAQLTSATLTKLEEFRDKTATGLLYIIETQKVLDLKINLKASYVIIPQ
DGIFSPTSNLLLLDLGHLKVTSKNRSELPDMKPGGASLEEIMQRAYDSFDVQLTSIQLLY
STVGDNWREARKLNVSTQHVLVPMHFNVELSKAMVFMDIRMPKFKIFGKLPLISLRISDK
KLQGILELIESIPKPTPATETYAPAKPFQMQRSTSVGTTQISQKMLPFLELPCVDDDSEE
EFFDAPCSPLDEPPQSPFELQSYQPKKFQKLYCSKNMIQCKIRFEVPEVLIQFYHLVGDC
ELPVVEVDVLGLGTDVEFRTFDLKANAFLKEFCLKCPEYFGANKKPIYLITTLDNTMEDL
LTLEYVKAEKNLPNLKSAYNNALQLIKVNFSSLDIHLHTEALLNTINYFNNILPQLEEKP
APVSVAETEDKGEVIKKMSLKLSKNEDIITLQILAELSCLQIFIQDQKRNIAEIKIEGLD
SEIIMRPAATEINAKLRNIIVLDSDKTAVYKKAVYITGKEVFSFKMISFVDATAGSAYTD
MNVVDIQVNLTVGCIEVVFVTKFLYSILAFIDNFQAAKQALAEATAQAAGMAATGVKELA
QRSSRMALDVNIKAPVVVIPQSPVSENVFVADFGLITMTNTFHIIAESQSNPPPVIDLIT
IRLSEMRLYRTQFIDDAYQEVLDLLLPLNLEVIVERNLSWEWYQEVPCFNINAQLKPMEF
ILSQEDMTTIFKTLYGNIWYKEGGGASPAGVKEQNSVNSGATNASHHLEGTTVVTAAVVE
IHSQASQVKTTLNMSFRTDYLTMVLYSPGPDQTSFMDVRDPSLKLAEFKLENIISTAKMY
TDDSTFSSFSLKNCILDDKRPHVKKATPRMIGLTVGFDKKDMMDVKYRKVRDGWTTDLVL
QEMYICASVEFLLTVANVFLEAYTTGTAVETSVQTWTAKEEVPVQESDKWEVNIIIKNPE
IVFVADMTRSDAPALVLTTQCEICWKGDLENNTMTAAIKDLQVRACPFLPVKRKGRITTV
LQPCDLFYQATQISTDPQVIDISVKSLTLKVSPVIINTVITITSALYTSKDTSPRETTSS
AAHLWEKKDTKNLKMWFLEEPNETENKAPTTELVLKGEMIKVNVDSIFIVLEAGIGHRTV
PMLLAKSRFSGEGKNWSSLINLYCQLELEVHYYNEMFGVWEPLLEPLEIDQTEDFRPWNL
GIKMKKKAKKAIVESDTEEENYKVPEYKTVITFHSKDQLNITLSKCGLVMLNNLAKAFTE
AATGASTVFIRDLAPFMILNSLGLTVSVSPSDSFSVLNVPLAKSYVLKNEESLSMDYVGT
KDNDHFNAMTSLSSKLFFILLTPANHSTADKIPLTRVGRRLYTVRHRVSGVERSIVCQVD
GVEGSKKITIRSPVQIKNHFSIPLCVYEGNTLLGTASPGSEFNLPLTSYRSPLSLKPEDE
DYQGCERMDFEEIIKSDGTFLKRKCRSKNAAKKPFIIHVVPEKDDLASLSVYSEDGWDLP
YIMHLWPPILLRNLLPYKIAYYIEGIEHKVYTLNEGHSAHICTVQLEKAKLHLKLLDYLN
HDWKSEYYIKPNQQDISFINFTCVTEIEKTDLDIAIHMTYNTGQTVVAFHSPYWMVNKTS
RMLQYKADGIHRKHPPNYKKPVLFSFQPKHFFNNNKVQLMVTDSELSDQFSIDTVGSHGA
VKCKGLKMDYQVGVTIDLSSFNITRIVTFTPFYMIENKSKYHISVAEQGNDKWLSLDLEQ
CIPFWPEDASNALLIQVERNQGPPKKIHFNKQANCILLRLDNELGGIIAEVNLAEHSTVI
TFSDYHDGAAPFLLINHTKSDIVQYNQSSLSEIEDSLPPGKAVFYTWADPVGSRKLKWRC
GKSHGEVTQKDDMMTPINSGKKTIYLVSFFEGLQRIILFTEDPRVFKATYESEKAELAEQ
EIVLALQDVGISLVNNYTKQEVAYIGITSSDVVWETKPKKKARWKPMSVKHTEKLEKEFK
EYTESSPAEDKVIELDTNIPVRFTPSGTNMKILQPHVIAIRRNYLPALKVEYSTSAHQSS
FRIQVYRIQIQNQIHGAIFPFVFYPIKPPKSVTMDSAPKPFTDVSIVMRSAGHSQISRIK
YFKVLIQEMDLRLDLGFVYALAELMTEAEVTEKTEVELFYKDIEAFQEEYKTASLADSSQ
VSLYEYFHISPIKLHLSVSLRSGREEAKDSEQQEGLVAVRSLNLLLKSIGATLTDVQDVV
FKLAFFELNYQFRTASELQSEVIRHYSKQAIKQMYVLILGLEVLGNPFGLIREFSEGVEA
FFYEPYQGAIQGPEEFVEGMALGLKALVGGAVGGLAGAASKITNAMAKGVAAMTMDEDYQ
QKRREAMNRQPAGLREGITRGGKGLVSGFVSGITGIVTKPIKGAQKEGAAGFFKGVGKGL
VGAVARPTGGIIDMASSTFQGIKRATETSDEVESLRPPRFFNEDGVIRPYRLRDGTGNQM
LQVMENGRFAKYKYFTHVMINKTDMLMITKSGVLFVTKGTFGQLTCEWQYSFDEFTKEPF
IVHGRRLRIEAKERVKSVFHAKEFGKIINFKTPEDARWILTKLEEAREPSPRF
NT seq
9522 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtgttcgagtcggtggtcgtagacgtgttgaaccggttcttgggggactatgtggtg
aacctggatacgtcccagctcactctgggcatctggggaggagctgtggccttgaagaat
cttgaaattaaagaaaatgctctgagtcaactggatgtaccttttaaagttaaagttggt
catataggtaatctcaatcttacaattccgtggaaaaacctgtatactcaaccagttgaa
gcttttctgggagacatttatttactcatagtgccttcttctaaaataaaatatgatcct
ttaaaagaagaaaaacaactcttggaagcaaaacaacaagaacttaaacgaatagaagaa
gcaaaacaaaaaatatttgctattgtagacaaacttcgggtggaaaaacaggacactttt
acagaaaaattaattactcagatcataaaaaatcttcaagtgaaaatttccaacatccat
attcgttacgaggatgatatcacaaatcgagacaacccgctgtcatttggtatttccctt
caaaatctcagcatgcagacaactgatcaaaactgggttccatgtttacatgatgaaact
gagaaactgtttcgtaagttaatccgattggacaacctttttgcctattggaatgtgaag
tctcagttgttttatcttaatgattatgatgaatcattggacagcttgaggaagggcatt
gtctatcgaaatattgttccagaaggttatgattttgtgtttcgccccatatctgctaat
gccaaacttcagatgaatcggcgatcagattttgacttctctgcccccaagataaacctg
gaagttgagttacatgacatagcaattgaatttaataaaccacagtatttcagtgttatg
gagcttcttgaatcaattgatatgatgacgcaaaatctgccatacaggaaattcaaacct
gatgtacctcttcactatcatgccagagactggtgggcttatgctatacatggtattctt
gaagtaaatgtctgcccccggttacggatgtggtcatggaagcatattagagaacacagg
caaaaaatgaagcagtataaagaactgtataaaaaaaagataacaactaagaagccagct
ggtgaaattctcatctctttggaggagttggaaaagaccttggatgtatttaatataact
atatcaagacaacaggcagaagttgaggtaaagaaagctggatataggattttcagggaa
ggagcaaaagattcagaggaaaacaaaggatggtttagctggctgtggacttggtcagaa
ccaaaaagtaaagaacaaccagatgttaagcctggaattcttgaagaaatgttgacatct
gaagaaaaagctttactctatgaagcaattggctatagtgaaacagcagttgatccaacc
ttgccaaaaacatttgaagccatgaagttctttgttcacttgaaaagtatgtctgttgtt
ctaagagaaaaacgagggacgcctgagctgttagatattgtagtagaagaatttagcact
ttgattgtgcaaagaccaggagcacaagccattaaatttgaaaccaaaattgattcattt
catgttactggcttaccagataattcgacaaaaccccgcctcctgtcttcattggatgat
gctgcatcactcttccaaattatatttgagataaatcctttagatgaaactgttgctcag
aggtgtatcatagaagctgaacctttagaaatgatatatgatgcaagaacagtaaatagt
atagtggacttcttcagacctccaaaagaggtaaatctagcacagctcacatcagcgact
ttgacaaaacttgaagaatttcgtgacaagacagcaacaggtctactgtatattattgaa
acacagaaagttcttgatctcaaaattaatttgaaggcttcatatgttattatcccacaa
gatggaatttttagccctacatcaaatcttcttcttttggatcttggtcatctaaaggtg
acaagtaaaaatcgttcggaattgccagatatgaaaccaggtggggccagtcttgaagag
atcatgcagagagcttatgattcctttgatgttcagcttacaagcatacagctgctttac
agcacagttggtgataattggagagaagcacgaaaactcaatgtatctacacagcatgtt
ttggtacctatgcactttaatgtggagctctcgaaggccatggttttcatggatataagg
atgcccaaattcaagatttttggaaagttaccactgatttctctacgaatctcagataaa
aaactgcaaggaattctggaattgattgaaagcattccgaaacccacacctgcaactgaa
acatatgcccctgccaaaccatttcagatgcaaaggtccacctctgtgggaacaacacag
atttcacagaaaatgcttcctttcttggaacttccatgtgttgatgatgattcagaggaa
gaattttttgatgcaccgtgtagtcccttggatgaacctcctcaatctccctttgaactt
caaagttatcagccgaagaagtttcaaaagctgtattgttcaaaaaatatgattcagtgt
aaaataagatttgaagtgccagaggttttgattcagttttatcaccttgttggagattgt
gaactacctgtggtagaggttgatgttttagggttgggcacagatgtggaatttagaaca
tttgatttgaaagcaaatgcctttttgaaagagttctgcctaaaatgcccagaatacttt
ggtgcaaacaagaaaccaatttatttgattacaacactggataatactatggaagatctg
ctaaccttggaatatgtgaaggctgaaaagaatctacccaacttgaaaagtgcttacaac
aatgctctgcaactgattaaggtgaatttttcctctttggatattcatttgcataccgaa
gcacttctgaatacaataaattattttaataatatacttccacaattggaagaaaaaccg
gccccagtgtctgtcgcagagactgaagacaaaggagaggtcattaaaaaaatgtcttta
aaactatccaagaacgaggatattattaccttgcagattttagcagaattatcttgttta
cagatctttattcaagatcagaaacgtaacattgctgaaattaagattgaagggcttgat
tctgagatcattatgaggcctgctgcaactgaaataaatgcaaagctaaggaatataatt
gttttggattctgataagacagctgtgtacaaaaaggctgtttacatcactggaaaagaa
gtgtttagcttcaaaatgatttcttttgtggatgcaactgctggttcggcatacacagat
atgaatgtggttgacattcaagttaatttaactgttggttgcattgaagtagtttttgtc
acaaaatttctttattctatattggcttttatagataactttcaagcggctaaacaagcc
ttggctgaggctactgctcaggcagcaggaatggctgctactggtgtaaaagaattggct
cagaggagttctagaatggcattggatgttaacatcaaagccccagtggtggtcatccca
cagtctccggtttctgaaaatgtttttgttgctgattttggactaataacaatgacaaac
acattccatataatagcagagagccagagtaaccccccacctgttattgatctgataaca
ataaggctgagtgaaatgcggctatacaggactcaatttattgatgatgcataccaggaa
gtactagatctgctattaccattaaatcttgaggtgattgttgagcgaaatttatcttgg
gagtggtaccaggaagttccttgttttaatataaatgctcagctaaagcccatggagttc
attcttagtcaagaagatatgacaactatttttaaaacattatatggcaatatatggtac
aaagaaggtggtggtgcctcacctgcaggagtaaaagaacagaatagtgttaatagtggg
gctactaatgcttcacaccatttagaaggaacaactgtagtgactgctgctgtggtagaa
atccattcacaggcctctcaagttaagacaacactgaatatgagcttcagaaccgactat
ctcaccatggtcctgtacagtccgggtcccgaccagacttcctttatggatgttcgtgat
ccttctctgaaacttgctgaatttaagttggagaatatcataagcactgcaaaaatgtat
acagatgactcaacattttcttccttttcattaaaaaactgtattttagatgataaaagg
cctcatgtcaagaaggcaactcctagaatgataggactgacagttgggtttgacaaaaag
gacatgatggatgtaaagtacagaaaagtcagagatggttggacaactgatttagtcctt
caagagatgtatatttgtgcaagtgtggaatttctgctgacagttgcaaatgtctttctt
gaggcctacaccacaggcactgctgtagaaaccagtgttcaaacatggactgctaaggaa
gaagtacctgtacaggagtcagacaaatgggaagttaatattattattaaaaatcccgaa
attgtgtttgtggctgatatgacaagaagtgacgctcctgccttagtccttacaacacaa
tgtgaaatttgttggaaaggtgaccttgagaacaatacaatgactgctgccattaaagat
cttcaagtgagagcatgcccattccttccagtcaagagaaaaggcagaatcactacggtt
ttgcaaccctgtgacttgttctatcaagctactcaaataagtacagatccacaagtgatt
gatatatcagtaaagtccctcacactaaaggtttctccagttatcataaatactgtgatt
accataacatcagcactttatacatccaaggataccagcccacgagaaactacttcttct
gcagctcatttatgggaaaagaaggatacgaagaatttaaaaatgtggtttcttgaagaa
ccaaatgaaactgaaaacaaagctcccacaactgaattggtactcaaaggagagatgata
aaagtgaacgttgattctatttttatagttcttgaagctggaattggtcatagaacagtg
cctatgctgttggcaaagtcacgtttttcaggggaagggaaaaactggagttccttgata
aatctctactgtcagcttgaactagaagtgcattattacaatgaaatgtttggtgtttgg
gagcctttgcttgaacccttagaaattgatcagactgaggattttagaccatggaatctt
ggaatcaagatgaaaaagaaagcaaaaaaggccattgttgagtcagatactgaagaagaa
aattacaaagtgccagaatataaaactgttataactttccattcaaaagaccagctaaac
attacattatccaaatgtggccttgtaatgttaaataatttagccaaggcatttacagaa
gctgccactggagcttcaaccgtcttcatacgggatctagcgccatttatgattttaaat
tctcttggacttactgtctctgtttcaccaagtgattcatttagtgtacttaacgttcca
ttggcaaagtcatacgtattgaaaaatgaggagagtttaagtatggactatgtgggaact
aaagacaatgatcatttcaatgcaatgaccagcctaagcagtaaactcttcttcattctt
ctcacacctgctaaccactctactgctgataaaattcctttaacaagagtgggacgacga
ctgtacactgtaagacacagagtgtctggagttgaaagatctattgtttgtcaagtcgat
ggagtggaaggaagtaagaagataacaattcgctccccagtgcagattaaaaatcatttt
tcaatcccactttgtgtttatgaagggaacactttattgggaacggcttcacctggaagt
gaattcaacctaccattaacatcttaccgatcacccctttctctgaagccagaagatgag
gactatcaagggtgtgaaagaatggactttgaagaaattataaaaagtgatggcactttt
ctaaagaggaaatgtagatctaaaaatgctgctaagaaaccgtttatcattcatgttgtc
ccagaaaaagatgatttggcttctctgtcagtgtattcagaagatggctgggacttacca
tacataatgcatttgtggccacctatcctgctccgaaatcttcttccttataaaattgct
tattatatagaggggattgaacataaagtttatactctaaatgaaggacattcagcccat
atttgtactgtgcagttggaaaaagccaaactacatttaaaattacttgactatcttaat
catgattggaaaagtgaatattatataaaacctaaccagcaagatattagtttcatcaat
tttacctgtgttacggaaatagaaaagactgatttagatattgctatccatatgacttat
aataccggccagacagttgtggcatttcatagtccttactggatggtcaataaaaccagt
cggatgttacagtacaaggcagatggaattcaccgaaagcatccacctaattataagaag
ccagttctgttttcttttcaaccaaagcacttttttaataataataaggttcagcttatg
gtaactgatagtgaattgtcagatcagttttcaattgatactgttggtagtcatggagct
gttaaatgtaaaggcctgaaaatggactatcaagttggtgtcactatagacctcagcagt
tttaacattaccagaattgtgacatttactcctttttacatgattgaaaacaaaagcaaa
tatcatatatcagtggctgaacagggaaatgataaatggctctctcttgatttggagcag
tgtatccccttttggccagaggatgcttctaatgcacttcttattcaagttgaaagaaat
caaggccctcccaaaaagatacattttaacaagcaagcaaattgtattttattgcgtctg
gataatgagcttggaggtattatagcagaagttaatttggctgagcattctacggttatt
acattttcagattatcatgatggagcagctcccttcctattaataaatcacactaagagt
gacattgttcagtacaatcaaagttccctcagtgaaatagaagattccctccctcccgga
aaagcagtattttatacttgggctgatccagtgggctctagaaagctgaagtggagatgt
ggaaaaagccatggtgaagtaacacaaaaggatgatatgatgacacctataaattcaggg
aaaaagacgatttatttagtttcattctttgaaggcttacagcgcattattttattcact
gaagatccaagggtattcaaagcaacatatgaaagtgagaaagcagagttagcagagcaa
gaaattgtgttggccttacaagatgttggaatttctctcgtcaacaactacacaaagcag
gaggtagcctatattggcattacaagttctgatgtggtttgggagacaaagcccaagaag
aaggcaagatggaagccaatgagtgtaaagcacactgagaagttagagaaggaatttaag
gaatatactgaatcttcacctgcagaagataaggttatcgaattggacactaacattccg
gttcgcttcacacctagtggtactaacatgaaaattctgcagccacatgtaatagctata
agaagaaattatcttccagcattaaaagtagaatatagcacatctgcacatcagtcatca
tttagaattcaagtttacagaatacagatccaaaaccagatacatggtgctatatttcca
tttgtgttttatccaattaaacctcccaagtcggtcaccatggattcagctccaaagccc
tttacagatgtcagtattgtcatgagatctgcagggcattcccagatatcacgtattaag
tatttcaaggtgttgatccaagaaatggacctcaggttagatcttggatttgtctatgct
ttagcagaacttatgacagaagccgaagtgactgaaaaaactgaggttgaacttttttat
aaagatatagaagctttccaagaagaatataaaacagcttcattagcagattcatcacaa
gtcagtctctatgaatacttccatatatctcctatcaagttgcatttaagtgtttcactg
aggtcgggcagagaagaagctaaagattcagaacaacaggaaggactcgtggccgttcgc
tctttaaatcttctcctgaagagtattggtgccacccttaccgatgtacaagatgtagtt
tttaagcttgcattttttgagctgaactatcagttccgtacagcatctgaactacagtct
gaagtaataagacactattcgaaacaggccattaagcaaatgtatgtactcattcttgga
cttgaagttttgggaaatccctttggcttgattagagaattttctgaaggtgtggaagca
tttttttatgaaccgtaccagggagccatacagggtcctgaagagtttgtggaggggatg
gcactaggactgaaggcattagttggtggagctgttggtggattagccggtgctgcctcc
aaaatcaccaatgctatggctaaaggggtggcagctatgaccatggatgaagactaccag
cagaagaggagagaagccatgaataggcagccagccggtcttagagaaggcatcactcgt
ggaggaaaaggcttagtttctggttttgtaagtggcataacaggaattgttacaaaaccg
atcaaaggagctcaaaaagaaggagcagctggtttctttaaaggtgttgggaagggttta
gttggagcagtggcaaggccaactggaggcatcatagacatggccagcagtacatttcag
ggaataaaaagagctacagagacttctgatgaagtggagagcctgcggcccccgcgattc
tttaatgaggatggagtcatcagaccttacaggttgagggatgggactggaaaccagatg
ttacaggtcatggaaaatggaagatttgcaaaatataagtattttacccatgtcatgatc
aataaaacagatatgctaatgataactaaaagtggtgtattgtttgtaacaaaaggaaca
tttggacagcttacctgtgagtggcagtatagttttgatgagtttaccaaagagccattc
attgttcatgggagaagattacgcattgaagcaaaggagcgggtgaagtctgtgtttcat
gccaaggagtttggaaaaataattaacttcaagaccccagaggatgctaggtggatcctt
acaaaactagaagaggcaagagaaccttccccgagattctga
DBGET
integrated database retrieval system
