Lactococcus cremoris subsp. cremoris KW2: kw2_1093
Help
Entry
kw2_1093 CDS
T02848
Name
(GenBank) collagen triple helix repeat-containing cell surface protein
Organism
llw
Lactococcus cremoris subsp. cremoris KW2
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGV73051
LinkDB
All DBs
Position
complement(1124503..1134915)
Genome browser
AA seq
3470 aa
AA seq
DB search
MEDNFSKGKKIIDSRKNHTQNKNFRTWKSKKAWLYSSSALALLLAGGGGLATSVTVKADE
VAQVSTTSTTSATPPATTGDTSATAAATPAVTTPTDDSATTQTAAPQTAATTAATTTSDS
STTTPAATSATDASTATTAAATTSNSSTTTPAATSATDASTATPAATTSDSSTTTPAATS
ATDASTATTATTTASDSSTTSPAATSATGASTATQAATSATGASTATQATTSATGASTTT
PATTSATSTTSTTATVTPKVAVKSLAAAVPTAAQTSLTVNAMPDNTQDALTSASENNTSP
TTVKVADPLTSAALSSAYAAANTAGTLAPVSTAAQFQAAYNNSAITYIQLVPNTTLTLAA
ALNSRTSNLIIDGNGGVINLGNYNLPLGSTVGHTPQTFSVNNITLNTTQTGSDDGQGNNS
SVINANAYGGSGDWNINVKDTTAGSTGIGLVIAASYSQITLSGKDTFSADTHMVATGTFY
VANGATVNYTENGTWSPIYFTSTGTAGNPNRTTTGTGAQPNAYFGDGSSISITTNANGYA
AFAGLNNLTTGDNVTFNVQGSTNFISDAAGNNGSNPGANYSATEKHTYVFGQYNKISANT
SQTGIILNNASDSLTLNHGVTLTLAPTGNAYYAIQNNGTANILSPATMTLSGGDAYVAIT
GSGTTNLSNVNVTTTPSTNKLNGTVSTLLTDKNGTWNGYLDSTQTVTNVSNTGLTSIVMV
PGTPGNITINYVDATSASGKVVGTFTVPVSSTSSNLAGDNLNTGTPLPGDSLQAIIAAYA
VNPMPKGYVLATGTEVNSTLAAALQSNSTYSGNVSLYGINAYDTTGQLEYMVVPVTGSAA
TTYYMMVYPAPNNSVTYNYVDAGTGAVVATGSTQGGLEGTGTYSSLPTANVGNNIDFTNS
YYTTTNAPAGYHYVTSAQNATIGATQPTTVQVTSAASNTTLYVLSNTQADTLTAPSAATV
VAGGSVNLLTGVSGTDSNLNSFTGASASAAKTLVVTVDGTTVIPDANGNVSYNPSTATPA
GTHNVVYTFTDPFNSAQLTATQVITVTPLATPTLSVTPSSTINAGDTINYINAPANLTGT
DAYGKTISYSTSSPYITITLSTQVGSAAPTNPTTLPAGQVSLATKASDPTTVYTFNYTYT
DPATNVAATAKYVVTENTLAAPVLTANSTTNISAGGSVNLLTGLTGTDSSLNSLDFTNAQ
TLANLQLSVVNSAGITGTISGTTYNSKVTDASGTATVTYKYTDPNSQKTATATQVINIGK
LASPALNVQSQTVSAGQTVQLVGSPASLAGTDSNGNAIDFTQAAQIGNLAISVTNNRTSV
TSTLPSGTTSFVTSVKDPNTTYTVNYVYTDPTTGYTGKATSTVTENALAAPVLNVLKSNT
VTAGTNYELVANPSNLAGTDATGTAIDFILPSQLANLAITMDGTAVTGTQYQFAANATSG
QHVVNYIYTDPTTGVKATAQQLITLSALAQPELSVTASQTINAGQSVQLFGSPSSLTGTD
SEGNTINFADAKQLANLTITIDGKALPTGTTVLATNVKDGNATHTVNYTYIDPTTGFSTG
TTQIINEVALAAPTLSVAPSQNVTAGQTVQLVNSPAGLTGTDANGQTINFSNSQQLANLT
ISVDGTPLSSGVTTWAVPQKTASGSHTVTYTYVDPTTGVSTATTETINVSALAAPALSIT
PNTQTAQAGTNVNLLTGLAGTNALGNNIDFSNTTEDARLTVTVDGVSTNGGTNWAIPANA
AVVGPHTIRYTYTDPTTGVTASTSQVITVTALTPNYTTNSSNLVGSPYATTGQALSNLVT
LSGGAGAVNTTAPVTGILYAGTTQVGTTTTTAVFDSNGNSTVSLNYSGLDLSKYAGKTLT
SVATVGSTQITSNAVPITAMPLKGDTGATGATGATGNTGATGATGDTGATGATGATGSTG
ATGATGNTGATGKTGYTPEIGTDGNWWTWVLDNSNNTYTLTDTGIPATGATGATGATGAT
GTSGADGHSPYVGSNGNWMVWNDVSGRWEDSGTPATGATGATGATGTTGTSGTTPTIGSN
GDWWIGSVDTGIKAQGTTGATGATGATGATGQSGATPTIGSNGDWVINGQDTGIQAQGAT
GATGATGATGLNGAQGVKGDTGATGATGATGATGQTGATGTSGTTPTIGSNGDWWIGSVD
TGIKAQGTTGATGATGATGATGTSGATPTIGSNGDWVINGQDTGIQAQGATGATGATGNT
GAQGVKGDTGATGATGATGATGQTGATGASGTTPTIGSNGDWWIGSVDTGIKAQGTTGAT
GATGATGAAGKDGLTPYIGTNGDWYVNNQDSGIHAQGNTGATGAQGIQGNTGATGATGNT
GATGAAGKDGLTPFVGSNGDWWIGSVDTGITAKGDTGMTGATGATGQNGADGQTPYIGVN
GDWFVNGTDTGIHAQGATGATGQTGAQGVKGDTGASGATGATGATGATGATGATGTTPTI
GSNGDWWIGSWDSGVKAQGATGATGATGQNGKDGSTPYIGVNGDWFVNNQDTGVHAQGAT
GQNGETGPTPEIGVNGNWWTWNWNATTNQYELFDTGIPAQGATGATGATGDTGASGADGH
SPYINTATGNWMVWNNDLGQFVDTGHPATGATGATGDTGAAGTNGTNGTDGLTPQIGVNG
NWWIGGTDTGVKAEGTTGATGATGATGATGKTGDTPFIGVNGNWWVSGIDTGVHAQGATG
ATGATGDTGAQGIKGDTGATGQTGLEGDTGATGATGKDGQSPFIGSNGDWWIGNVDLGIK
AKGDTGATGATGATGAAGKDGATPYIGANGDWYINNKDSGIHAQGPTGATGATGKNGITP
EIGDNGNWWIGSYDTGESALGATGATGATGPTGATGKDGDTPYVGPDGNWWIGDTDTGHS
AKGTTGATGATGATGPKGDTGATGATGVQGRPGNDGATGATGATGATGPKGPQGIQGPTG
PTGPKGDTGATGPTGDTGTTNTPGDGQWTGNASGILTLDATHPLADKPNQQVNEVVAVAD
LRDGDGKIVTGNQIVKVYLYANDKLLTQTSGVISLNNTGFGQIAIPITFDATGLSHAVLT
AGFCIGDPIGTNTPDGDVTGGTQTGSLVIPGDDTVAATTVGSTSNATNVASPTTIGTNTP
DGSVTGGTQTGSLVIPGDSNSSQTATTDNTDSSKSTDFVMPTITAPANVTVTVGDSFIPS
AGDAIVTDTDYTADSGYRMILSNNVNTAVPGTYQVVYTYNYIDPTTQGAASTTATQEVTV
VAAAAGTSSSDTDTSVGSTSATGATSGIGANTPNGDLNNGSQTGDLTVPGTGDTGSTGDT
GSTGSTGDTGSTSNPSGSGIGANTPDGNYNNGSQTGELEVPGEPTGPTNPTSPTGPTGST
GNTGATGSTGATGATGATGATGSTGPSGSTGTSGQNGTNGTNGTNGTNGQSVLNGTPQAL
NYQTVPMAPQSTSLPVTGGSSLDETFVEIGATMLALGASIEVLRRKMKKS
NT seq
10413 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagataatttctccaaagggaaaaagattattgattctagaaagaatcatacccaa
aacaagaatttccgaacctggaaatccaaaaaagcttggctctattcatcaagtgcatta
gctttactccttgccggtggaggaggacttgcaacctctgttacagtaaaagctgatgag
gtggcacaagtctcaacgacgtcaactacatcagcaacgcctcctgcaacaactggtgat
acctctgctactgctgcggcaacacccgcggtaacgactccaactgatgattctgctaca
acacaaaccgcagcgcctcaaacagccgctaccacagcagcgacaactacatctgatagt
tcaactactactccggcagcaacttcggctacggatgcttcaacagctacgacagcagcc
gcaactacatctaatagttcaaccactacgccggcggcgacttcagctactgacgcgtca
acagccacgccagcagcaactacatctgatagttcaactactactccggcggcgacttca
gctactgacgcgtcaacagctacgacagcaaccacaactgcatctgatagttcaaccact
tctccagcggcaacatcagctactggtgcgtcaacagctacccaagcggctacttcggct
actggtgcatcaacagctacccaagcgactacttcagctactggtgcgtcaactacgact
ccagctacgacaagtgcaacttctacaacctctacaactgcgactgtcacaccaaaagta
gctgttaaaagtcttgctgcagcagttcctacagcagctcaaacaagtctgacagtaaat
gcaatgccagacaatacgcaagacgccctcacctcagcatctgaaaacaacacatctcca
acaactgtgaaagttgctgaccctctcacaagcgctgccttgtcttcagcttatgcagca
gcaaatacagctgggactttggcccctgtttctacagcagcacagttccaagccgcttac
aacaattcagcaattacctatattcaattggttccaaacacaaccttaaccttggcagct
gcgctgaatagtcggacttctaatcttattattgacgggaatggcggcgtcatcaacctt
ggcaactataacttgcctcttggctcgacagtcggtcatactccccaaaccttcagcgta
aataatattactttgaacaccactcaaacaggttctgatgatggacaaggaaataactct
tctgttatcaatgctaacgcttatggtggttccggtgactggaacatcaatgtcaaagat
acaacggcaggttcgacaggaatcggtcttgttattgctgcttcttattctcaaatcaca
ctgtctggtaaagataccttctctgccgatacccacatggttgccacaggtactttctat
gtggcaaacggtgcaaccgtcaattatacagaaaatggtacatggtctcctatttacttt
acctctacaggaactgcaggaaatccaaaccgcacaacaaccggaactggagcacaacca
aatgcttactttggtgatggttcaagtatttccatcacaactaacgccaatggttatgca
gcttttgccggattgaataacttaacaacaggggataatgttacctttaatgttcaaggt
tcaacgaacttcatctctgatgctgctggaaataatggttcaaatcctggagcaaattat
tctgcaaccgaaaaacatacttatgtttttggtcagtataataaaatttctgcaaatact
tcacaaactggaattatcctcaacaacgcttctgatagcttaacactcaatcacggtgtt
acattaactcttgctcctactggtaatgcttactacgcgatccagaataacgggaccgct
aatattctttcgccagccacaatgaccctcagtggcggtgacgcctatgtcgcaattaca
ggttccggtacaaccaatctgtctaacgttaatgtaacaactactccatcaacaaataaa
cttaatggaactgtttctacacttttaactgacaaaaatggaacttggaatggttatctc
gacagtactcaaaccgtaacaaacgtttcaaacactggtttgacttctatcgtcatggtc
ccaggtactcctggtaatatcaccattaattatgttgatgctacttctgctagcggaaaa
gttgttggaacatttactgttccagtatcatcaacaagcagcaatctcgcaggtgataac
ctgaacacaggcacaccacttcctggcgatagcttacaagcaattattgcagcctatgcc
gttaacccaatgcctaaaggctatgttttagcaacaggtaccgaagttaattcaacactt
gcagcggctctccaaagcaactcaacttattcaggaaatgtttcattatacggtatcaat
gcctatgatacaacaggtcaacttgaatatatggttgttcccgttactggttcggcagca
accacatattatatgatggtttaccctgcaccaaacaacagtgtgacttataattatgta
gatgctggaacaggtgccgttgttgcaactggcagtactcaaggtggacttgaaggaaca
ggaacttatagttctcttccaacagctaacgttggcaacaacatcgatttcacaaatagc
tactacaccactactaatgcacctgcaggttatcactatgtgacaagcgcacaaaatgca
acgattggtgctactcaacctacaacagtccaagtaacttcagctgcctcaaacactaca
ctttatgttttatcaaacacacaagcagatacattaacagcacctagcgcagcaacagtt
gtcgctggtggttcagttaatcttttgacaggcgtttcaggaactgattctaacttaaac
agttttactggcgcatctgcttccgctgcaaagacactcgtggtcactgttgatggcaca
accgttatcccagatgcaaatggtaatgtttcttataacccatcaacggcaacacctgct
ggcactcacaatgtagtctataccttcacagacccattcaatagtgcacaactcacagca
acacaagtgattaccgtgactccgcttgctacgccaacattgagcgtcacaccatcatct
acaataaatgccggtgatacaatcaactatatcaatgctccagcaaatctgactggtaca
gatgcttatggaaaaacaatcagttacagcacttcttctccatacatcacgataacatta
agtacgcaagttggttcagccgcccctacaaatccaacgactttaccagctggacaagtt
tcattggcaacaaaagcctctgaccctacaactgtctatactttcaattacacttatact
gacccagcaacgaatgttgcagcgacagccaaatatgttgtgactgaaaatacattagca
gctcctgtcttgactgccaattctacaacaaatatttcagccggtggttcggtaaacctc
ttaacaggacttacaggcacagattcaagccttaacagccttgatttcactaatgctcaa
acacttgctaatcttcaactttctgtcgtaaattctgctggtatcacaggtacaatcagt
ggaacaacttacaactctaaggttacagatgcaagtggtacagcaaccgttacttacaag
tacaccgacccaaatagtcaaaaaacagcaactgccactcaagtcattaacattggtaaa
ttagcaagccctgcacttaacgttcaaagtcaaaccgtttctgctggacaaaccgttcaa
cttgtcggttctcctgcaagtttggccggtacagactcaaacggtaatgcgattgacttc
acacaagccgctcaaatcggtaatcttgctatctcagtgacgaataatcgtacctcagta
acaagcacacttccatcaggcacaacaagcttcgtaacaagtgtgaaagacccgaataca
acttatacagttaactatgtttatacagaccccacaactggctatacaggtaaagcaaca
tcaactgtaactgaaaatgctcttgctgctcctgtattgaacgtcttgaaatcaaataca
gtaacagctggcacaaattacgagttggttgcaaatccatcaaaccttgcaggaactgat
gctactggtactgcgattgacttcattttgcctagtcaacttgctaaccttgcgattaca
atggacggcacagccgtaactggtactcaatatcaatttgcggcaaatgctacttctggt
caacacgttgttaattatatctacacagatcctacgactggtgtgaaagctacggctcaa
cagttgattactctttctgcacttgctcaacctgaactttcagtaacagcttcgcaaacc
attaatgcaggtcaaagcgttcaactctttggtagtccatcaagcttaactggtacagac
tctgaaggaaatacaattaactttgcagacgctaaacaattggctaacttgacgattact
attgatggcaaagcactcccaactggtacgacagtattagcaacaaatgttaaagacggc
aacgctacacatacagttaactatacttatattgaccctacgactggtttctctacaggc
acaacacaaatcatcaatgaagttgccttagcagcaccaaccttatcagtagcaccttct
caaaacgtgactgctggtcaaaccgttcaactcgtgaattcaccagctggcttgacaggc
accgatgccaatggtcaaaccatcaacttctcaaatagtcaacaattggctaacttgaca
atttctgtagatggaacaccactttcatcaggcgtaacaacttgggcagtaccacaaaaa
acagcttctggttcacatacagttacttatacttatgtcgaccctacgactggtgtatca
acagcaactactgaaacaattaatgtctcagcactcgctgctcctgcccttagcatcaca
ccaaatacgcaaaccgctcaagcaggtacaaatgttaaccttttgacaggtcttgctgga
actaacgctttaggcaacaacattgacttttcaaatactaccgaagacgctcgtttaaca
gtaacggttgatggcgtttcaacaaatggtggtacaaactgggcaattccagcaaatgca
gctgttgttggtccacatacaatccgttatacctacacagacccaacaacaggcgtgact
gcttcaacttcacaagtcattaccgttacagcattgacgccaaactatacaacaaattct
tcaaatcttgttggctctccttatgctacaactggtcaagctctttctaaccttgtgact
cttagcggtggtgccggtgctgtcaatacaacagcgccagtcactggaatactctatgca
ggaacaactcaggttggcactacaacgaccactgcagtcttcgactcaaatggtaattca
actgtttcactcaactactctggacttgatttaagtaagtatgcaggtaaaacattgacc
agcgttgcaacagttggttcaacacaaatcacttcaaatgcagtacctattactgcaatg
ccacttaagggtgacacgggtgcaactggagcaactggcgctacaggtaatactggggct
acgggtgcgaccggtgataccggtgcaactggagctacaggtgccactggtagtactggt
gcgactggagctacgggtaataccggtgccacaggtaaaactggttatacaccagaaatc
ggaacagatggtaactggtggacatgggttcttgataattctaacaacacttacactctg
actgatacaggtatccctgcaacaggtgccactggtgcgactggggctacaggtgcaacc
ggtacttctggtgcagacggacattctccatacgttggctcaaatggcaactggatggtt
tggaatgatgtttctggacgttgggaagattctggtacacctgcgacaggtgcaactgga
gcgaccggggcgacaggcacgactggtacaagcggaactactccaacaatcggatcaaat
ggcgattggtggattggttctgttgatactggtatcaaagctcaaggaacaactggggcg
accggggcgactggagctaccggcgctactggacaaagcggagccactccaacaatcgga
tcaaacggtgactgggtcatcaatggtcaagatactggaattcaagcccaaggagcaacc
ggcgcgacgggcgcaactggggctacgggtctaaacggcgcacaaggtgttaaaggtgac
actggagcgactggggctacgggcgctacgggtgctacgggtcaaactggtgctactggt
acaagtggaactactccaacaatcggatcaaatggcgactggtggattggttctgtcgat
actggcatcaaagctcaaggaacaactggagctacaggggcaactggggccacgggcgct
accggcacaagcggagccactccaacaatcggatcaaacggtgactgggtcataaatggt
caagatactggcattcaagcccaaggagcaaccggagccacaggtgcgacaggtaatact
ggagcacaaggtgttaaaggcgacacaggtgcgactggggcgactggcgctacaggtgcg
actggtcaaactggggctacgggtgcaagtggaactactccaacaatcggctcaaatggc
gactggtggattggttctgtcgacactggcatcaaagctcaaggaacaactggagcgact
ggcgctacaggtgctacgggtgcagctggtaaagatggcttaactccttacatcggtact
aatggcgattggtatgttaacaatcaagactctggtattcacgcacaaggtaacacagga
gcaacgggcgcacaaggtattcaaggaaataccggtgctactggtgcgacaggtaatacc
ggtgctactggtgcagctggtaaagacggtctcactccgtttgttggctcaaatggtgac
tggtggattggttctgttgatactggtatcacagccaaaggtgacactggtatgactgga
gctactggagctactggacaaaatggggcagacggtcaaactccttatattggagttaac
ggcgattggtttgtaaatggtacagatactggtatccatgcacaaggtgcgactggagca
actggtcaaactggagctcaaggcgtcaaaggtgatactggtgcaagcggggcgactgga
gccacgggtgccacaggagcaacaggtgcgactggtgcgactggaactactccaaccatt
ggttcaaatggcgattggtggattggttcatgggatagcggtgtgaaagcacaaggtgct
actggcgctactggggcgactggtcaaaatggtaaagatggttcaactccttatattggt
gtaaatggcgattggtttgtaaataatcaagataccggtgtccatgctcaaggggctact
ggtcaaaatggcgaaactggtcctactccagaaattggcgttaatggcaactggtggaca
tggaactggaatgcaaccactaaccaatatgaactcttcgatacaggtattcctgcccaa
ggcgctactggggcgaccggagcgacgggtgacactggagcatctggtgccgatggacat
tctccatatatcaacacagctactggtaactggatggtttggaataatgacctaggtcaa
ttcgttgatactggtcatcctgctactggggcaaccggtgcaacgggtgatactggagct
gccggcacaaacggtacaaatggtacagacggtcttactccacaaattggtgtcaatggt
aactggtggattggcggtactgatactggagttaaagcagaaggtactacaggtgcgacc
ggggccactggtgcaacgggtgcgaccggtaagactggtgacactccatttatcggagtc
aatggcaactggtgggtgagcggtattgatactggcgttcatgcacaaggtgcaacgggc
gcaacaggagctactggtgatactggtgctcaaggcattaaaggtgatacgggtgcaact
ggtcaaactggactcgaaggtgacactggggcaacaggagctactggtaaagatggtcaa
tctccattcatcggttcaaacggcgactggtggattggcaatgtcgacttaggtattaaa
gccaaaggcgatactggtgcgaccggagctactggtgctactggtgctgctggtaaagac
ggggcaaccccttatattggcgctaatggcgactggtatatcaacaataaagatagcggt
atccatgctcaaggcccaactggagcaacaggagccactggtaaaaatggtattactcca
gaaattggtgataatggcaactggtggattggttcttatgatactggcgaatcagcatta
ggcgcaacaggggcaacgggtgccactggacctacgggtgccactggtaaagatggtgat
actccttatgttggacctgatggtaactggtggattggtgatactgataccggacacagc
gctaaaggaacgaccggtgcaacaggagcgactggcgcaactggtcctaaaggtgataca
ggagcaacgggagcgactggggttcaaggtcgtccagggaatgatggcgcaactggagcg
actggggcgactggcgcaactggtcctaaaggacctcaaggtatccaaggacctactgga
cctaccggtcctaaaggtgatacgggtgcgactggtcctacgggagacactggtacaacc
aatacacctggtgatggacaatggacaggaaatgcttcaggaatcttaactctcgatgca
actcatcctttggcagataaaccaaatcaacaagtcaatgaagttgttgctgttgctgat
ttacgagacggcgatggcaaaattgtcacaggaaatcaaatcgtcaaagtttacctctat
gcaaatgataaattgcttacccaaacttctggtgttattagcttaaataatactggtttt
ggccaaattgcaatcccaatcacttttgatgccactggactttctcatgctgtattaact
gctggcttctgtattggtgacccaatcggaacgaatacacctgatggtgatgtaactggt
ggaacgcaaacgggtagtttggtaatccctggagatgataccgttgctgctacaactgta
ggttctacatcaaatgcaacaaatgtagcaagtcctacaacaatcggcacaaacacgcct
gatggtagtgtaacaggtggaacgcaaacaggtagtttggtaattccgggggatagtaat
tctagtcaaacagctacaacagataataccgactcttctaagtcaactgactttgtaatg
ccaacaattactgcccctgcaaatgtgacagtaaccgttggagatagctttattccatct
gccggtgatgcaattgtaactgatacagactatacagcggacagtggttatcgtatgatt
ctttcaaataatgtgaacactgcggttcctggtacatatcaagttgtctatacttacaat
tacatcgacccaacgacacaaggagctgctagtactactgccactcaagaagtgactgta
gtcgcagctgctgctggaacaagttcttctgatactgatactagcgttggttcaacaagt
gcaacaggtgcaacttctggaattggggcaaatactcctaacggagatttgaacaatggc
tcacaaactggtgatttaactgttcctggtactggtgatacaggttcaacgggagatact
ggatctactggttctacaggagacactggctcaacttctaacccttctggttctggaatt
ggagcaaatactcctgatggcaactataacaatggttcacaaactggtgaattagaagtt
cccggagaacctactggtccaactaatcctactagccctactgggcctactggttctaca
ggaaatactggggcaactggttctacaggagcgactggggcgactggggcgactggggcg
actggctcaactggccctagcggttctacaggtacaagtggtcaaaatggaacaaacggc
actaatgggactaatgggactaacggtcaaagcgtattaaatggtacgccacaagcactt
aattaccaaacagtacctatggctccacaatcaacatcattgcctgtaactggtggatca
tcacttgatgaaacatttgtcgaaattggcgcaactatgttagctttaggcgcttctatt
gaagttttacgtcgtaaaatgaaaaaatcataa
DBGET
integrated database retrieval system
